MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 3275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017618	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017618	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017618	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017618	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017618	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017618	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017618	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017618	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017618	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017618	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017618	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017618	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017618	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017618	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017618	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017618	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017618	AAC	2	6	16838	16843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017618	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017618	GGC	2	6	17005	17010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017618	GCA	2	6	17324	17329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017618	CGC	2	6	17371	17376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017618	TGT	2	6	17410	17415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017618	AGA	2	6	17419	17424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017618	AGA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017618	CAG	2	6	17493	17498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017618	GGA	2	6	17683	17688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017618	GAA	2	6	17947	17952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017618	GGT	2	6	18021	18026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017618	GTC	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017618	CAT	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017618	TAA	2	6	18138	18143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017618	GGA	2	6	18147	18152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017618	ATC	2	6	18171	18176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017618	CGC	2	6	18337	18342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017618	CAC	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017618	GAT	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017618	CCT	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017618	TCT	2	6	18544	18549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017618	AGG	2	6	18610	18615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017618	AAC	2	6	18645	18650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017618	GTT	2	6	18655	18660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017618	ATC	2	6	18848	18853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017618	AGT	2	6	18856	18861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017618	ACG	2	6	18986	18991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017618	TAG	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017618	AGG	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017618	GAG	2	6	19192	19197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017618	CTC	2	6	19202	19207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017618	AGA	2	6	19244	19249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017618	TCG	2	6	19347	19352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017618	GGA	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017618	ACA	2	6	19478	19483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017618	ATG	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017618	TAT	2	6	19610	19615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017618	GGA	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017618	ACC	2	6	19944	19949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017618	AAT	2	6	19964	19969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017618	AGC	2	6	20024	20029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017618	AAG	2	6	20161	20166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017618	GAG	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017618	ACA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017618	GAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017618	AGG	2	6	20781	20786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017618	CGG	2	6	20827	20832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017618	TAC	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017618	CCT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017618	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017618	TCG	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017618	CGT	2	6	21517	21522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017618	AGT	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017618	CAG	2	6	21959	21964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017618	AGT	2	6	21985	21990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017618	ACC	2	6	22509	22514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017618	CGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017618	CGC	2	6	22939	22944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017618	GGA	2	6	23043	23048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017618	TCC	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017618	TAT	2	6	23136	23141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017618	AGC	2	6	23152	23157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017618	TCG	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017618	CGG	2	6	23278	23283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017618	TAT	2	6	23326	23331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017618	GGT	2	6	23384	23389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017618	TAA	2	6	24915	24920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017618	GAG	2	6	24976	24981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017618	AGG	2	6	26342	26347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017618	CTT	2	6	27344	27349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017618	TAT	2	6	27372	27377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017618	AAC	2	6	30631	30636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017618	TGT	2	6	30645	30650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017618	TTA	2	6	42787	42792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017618	AGG	2	6	46766	46771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017618	TAT	2	6	46827	46832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017618	TCG	2	6	46845	46850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017618	GTC	2	6	46853	46858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017618	ATT	2	6	46887	46892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017618	ATT	2	6	46930	46935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017618	AAG	2	6	46937	46942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017618	ATC	2	6	46970	46975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017618	CGC	2	6	46988	46993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017618	GTC	2	6	46995	47000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017618	TAA	3	9	52263	52271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017618	TGA	2	6	52282	52287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017618	TAA	2	6	55318	55323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017618	AAG	2	6	55347	55352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017618	GAA	2	6	56339	56344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017618	GTC	2	6	56420	56425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017618	GAA	2	6	56452	56457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017618	ATT	2	6	56462	56467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017618	ATG	2	6	56492	56497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017618	AAT	2	6	56517	56522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017618	ATG	2	6	56588	56593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017618	AGG	2	6	56709	56714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017618	CAA	2	6	57992	57997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017618	GTT	2	6	58011	58016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017618	AGT	2	6	58142	58147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017618	TGA	2	6	58350	58355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017618	AGG	2	6	59491	59496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017618	ATA	2	6	60881	60886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017618	GAA	2	6	60906	60911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017618	AAT	2	6	65561	65566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017618	AGG	2	6	66442	66447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017618	GTT	2	6	68898	68903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017618	TAA	2	6	68946	68951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017618	ATA	2	6	69023	69028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017618	TAA	2	6	69043	69048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017618	AAT	2	6	69517	69522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017618	AAG	2	6	69555	69560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017618	TAT	2	6	72003	72008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017618	AGG	2	6	74018	74023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017618	ATC	2	6	74892	74897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017618	TAG	2	6	74990	74995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017618	AGG	2	6	75400	75405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017618	ACG	2	6	78993	78998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017618	GAA	2	6	79107	79112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017618	CAT	2	6	79185	79190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017618	ACA	2	6	79274	79279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017618	TTC	2	6	79813	79818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017618	ATT	2	6	79844	79849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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