MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017618	AT	3	6	17677	17682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017618	CT	3	6	17708	17713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017618	AC	3	6	18198	18203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017618	AC	3	6	18367	18372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017618	AG	3	6	19272	19277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017618	CT	3	6	19386	19391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017618	TC	3	6	19764	19769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017618	TG	3	6	20155	20160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017618	GA	3	6	20306	20311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017618	GA	3	6	20602	20607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017618	CT	3	6	20718	20723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017618	GA	3	6	20925	20930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017618	GA	3	6	21741	21746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017618	TA	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017618	AT	3	6	23036	23041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017618	AT	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017618	GA	3	6	24957	24962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017618	AT	3	6	26336	26341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017618	TG	3	6	30663	30668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017618	AC	3	6	46564	46569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017618	TA	3	6	52721	52726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017618	TC	3	6	55207	55212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017618	AT	3	6	55375	55380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017618	CT	3	6	56693	56698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017618	CA	3	6	58385	58390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017618	GT	3	6	68887	68892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017618	GA	3	6	78749	78754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017618	CA	3	6	79143	79148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017618	CA	3	6	79225	79230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017618	AG	3	6	84574	84579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017618	AT	3	6	88476	88481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017618	CT	3	6	88507	88512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017618	AC	3	6	88997	89002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017618	AC	3	6	89166	89171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017618	AG	3	6	90071	90076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017618	CT	3	6	90185	90190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017618	TC	3	6	90563	90568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017618	TG	3	6	90954	90959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017618	GA	3	6	91105	91110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017618	GA	3	6	91401	91406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017618	CT	3	6	91517	91522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017618	GA	3	6	91724	91729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017618	GA	3	6	92539	92544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017618	GA	3	6	93630	93635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017618	CT	4	8	93699	93706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017618	TA	3	6	98566	98571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017618	TA	3	6	100188	100193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017618	GT	3	6	110494	110499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017618	TA	3	6	110671	110676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017618	TG	3	6	110697	110702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017618	TC	4	8	118309	118316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017618	AT	4	8	118353	118360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017618	AT	3	6	119133	119138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017618	AC	3	6	126039	126044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017618	AG	3	6	126674	126679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017618	AG	3	6	129203	129208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017618	TC	3	6	135969	135974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017618	AC	3	6	136014	136019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017618	TA	3	6	136063	136068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017618	CA	3	6	139675	139680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017618	TA	3	6	140070	140075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017618	TA	3	6	142848	142853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017618	GT	3	6	150959	150964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017618	AG	3	6	151129	151134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017618	GA	3	6	160038	160043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017618	TA	3	6	162436	162441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017618	AG	3	6	172708	172713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017618	AT	3	6	182264	182269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017618	TA	4	8	186606	186613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017618	TA	3	6	188486	188491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017618	AT	4	8	205203	205210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017618	AT	3	6	206857	206862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017618	AT	3	6	208808	208813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017618	GA	3	6	208846	208851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017618	TC	3	6	208856	208861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017618	GA	3	6	212574	212579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017618	TG	3	6	216623	216628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017618	AT	3	6	218070	218075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017618	CT	4	8	219831	219838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017618	TC	3	6	221956	221961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017618	GA	3	6	222849	222854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017618	TA	3	6	230310	230315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017618	GA	3	6	236186	236191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017618	AT	3	6	242127	242132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017618	AG	3	6	243539	243544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017618	TA	3	6	244377	244382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017618	AT	3	6	252381	252386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017618	AT	3	6	252400	252405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017618	TA	3	6	252416	252421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017618	TA	3	6	255584	255589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017618	TA	3	6	264409	264414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017618	TA	3	6	272776	272781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017618	TA	3	6	280188	280193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017618	GT	3	6	280276	280281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017618	AG	3	6	284478	284483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017618	AT	3	6	288280	288285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017618	GA	3	6	288577	288582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017618	TG	3	6	294837	294842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017618	TA	3	6	325523	325528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017618	TA	3	6	325532	325537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017618	TA	4	8	325626	325633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017618	AT	3	6	325901	325906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017618	AT	3	6	327323	327328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017618	TA	3	6	327658	327663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017618	GA	3	6	327788	327793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017618	AG	3	6	327840	327845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017618	TA	3	6	327890	327895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017618	AT	3	6	328867	328872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017618	CT	3	6	328898	328903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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112	NC_017618	AC	3	6	329557	329562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017618	AG	3	6	330462	330467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017618	CT	3	6	330576	330581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017618	TC	3	6	330954	330959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017618	TG	3	6	331345	331350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017618	GA	3	6	331496	331501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017618	GA	3	6	331792	331797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017618	CT	3	6	331908	331913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017618	GA	3	6	332115	332120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017618	GA	3	6	332930	332935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017618	AC	3	6	335885	335890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017618	GA	3	6	338870	338875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017618	TA	3	6	341378	341383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017618	TG	3	6	342076	342081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017618	TA	3	6	342628	342633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017618	AT	3	6	353843	353848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017618	TA	3	6	358181	358186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017618	GA	3	6	358187	358192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017618	GT	3	6	358389	358394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017618	AG	3	6	359714	359719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017618	AT	3	6	360774	360779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017618	TA	3	6	366842	366847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017618	TA	3	6	380633	380638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017618	AG	4	8	381628	381635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017618	AT	3	6	385695	385700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017618	TA	3	6	385701	385706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017618	AT	3	6	388365	388370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017618	TA	3	6	402202	402207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017618	GA	3	6	405271	405276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017618	TA	3	6	413655	413660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017618	TA	3	6	418869	418874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017618	TA	3	6	422251	422256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017618	AT	3	6	423227	423232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017618	CT	3	6	423258	423263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017618	AG	3	6	424820	424825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017618	CT	3	6	424934	424939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017618	TC	3	6	425310	425315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017618	TG	3	6	425701	425706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017618	GA	3	6	425852	425857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017618	GA	3	6	426148	426153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017618	CT	3	6	426264	426269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017618	GA	3	6	426471	426476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017618	GA	3	6	427286	427291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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