MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 5969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017617	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386577003
2	NC_017617	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386577003
3	NC_017617	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386577003
4	NC_017617	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386577003
5	NC_017617	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386577003
6	NC_017617	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386577004
7	NC_017617	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386577004
8	NC_017617	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386577004
9	NC_017617	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386577004
10	NC_017617	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386577004
11	NC_017617	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386577005
12	NC_017617	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386577005
13	NC_017617	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386577005
14	NC_017617	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386577007
15	NC_017617	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386577008
16	NC_017617	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386577008
17	NC_017617	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017617	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386577009
19	NC_017617	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386577009
20	NC_017617	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	386577010
21	NC_017617	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	386577010
22	NC_017617	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	386577010
23	NC_017617	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	386577010
24	NC_017617	CTTA	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	386577010
25	NC_017617	GATG	2	8	7590	7597	25 %	25 %	50 %	0 %	386577010
26	NC_017617	GCAA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	386577010
27	NC_017617	TCAG	2	8	9162	9169	25 %	25 %	25 %	25 %	386577010
28	NC_017617	ATTG	2	8	9399	9406	25 %	50 %	25 %	0 %	386577010
29	NC_017617	CTTG	2	8	9441	9448	0 %	50 %	25 %	25 %	386577010
30	NC_017617	AAGG	2	8	9720	9727	50 %	0 %	50 %	0 %	386577010
31	NC_017617	GAAG	2	8	9841	9848	50 %	0 %	50 %	0 %	386577011
32	NC_017617	TCTT	2	8	10171	10178	0 %	75 %	0 %	25 %	386577012
33	NC_017617	TGCC	2	8	10186	10193	0 %	25 %	25 %	50 %	386577012
34	NC_017617	CTAT	2	8	10650	10657	25 %	50 %	0 %	25 %	386577014
35	NC_017617	AGTG	2	8	11513	11520	25 %	25 %	50 %	0 %	386577014
36	NC_017617	AGAT	2	8	11821	11828	50 %	25 %	25 %	0 %	386577015
37	NC_017617	GAAG	2	8	12136	12143	50 %	0 %	50 %	0 %	386577015
38	NC_017617	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	386577015
39	NC_017617	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	386577015
40	NC_017617	AGGC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	50 %	25 %	386577015
41	NC_017617	TAAA	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	386577015
42	NC_017617	TCTT	2	8	13589	13596	0 %	75 %	0 %	25 %	386577016
43	NC_017617	CTTG	2	8	14363	14370	0 %	50 %	25 %	25 %	386577017
44	NC_017617	TGTT	2	8	14437	14444	0 %	75 %	25 %	0 %	386577017
45	NC_017617	GTTC	2	8	14463	14470	0 %	50 %	25 %	25 %	386577017
46	NC_017617	GTCG	2	8	14532	14539	0 %	25 %	50 %	25 %	386577017
47	NC_017617	CAAC	2	8	14591	14598	50 %	0 %	0 %	50 %	386577017
48	NC_017617	ATGG	2	8	14610	14617	25 %	25 %	50 %	0 %	386577017
49	NC_017617	CAAC	2	8	14653	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	386577017
50	NC_017617	TTGG	2	8	14718	14725	0 %	50 %	50 %	0 %	386577017
51	NC_017617	AAGA	2	8	14958	14965	75 %	0 %	25 %	0 %	386577017
52	NC_017617	ACAA	2	8	15341	15348	75 %	0 %	0 %	25 %	386577017
53	NC_017617	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017617	ATTA	2	8	16359	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	386577018
55	NC_017617	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017617	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017617	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017617	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017617	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017617	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017617	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017617	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017617	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017617	GCGT	2	8	22433	22440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017617	TTTG	2	8	22962	22969	0 %	75 %	25 %	0 %	386577019
66	NC_017617	CAAA	2	8	23719	23726	75 %	0 %	0 %	25 %	386577019
67	NC_017617	GGTC	2	8	23817	23824	0 %	25 %	50 %	25 %	386577020
68	NC_017617	AACA	2	8	24226	24233	75 %	0 %	0 %	25 %	386577020
69	NC_017617	TCTA	2	8	24370	24377	25 %	50 %	0 %	25 %	386577021
70	NC_017617	ATCA	2	8	24709	24716	50 %	25 %	0 %	25 %	386577021
71	NC_017617	TTTG	2	8	25621	25628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017617	ATTG	2	8	26137	26144	25 %	50 %	25 %	0 %	386577022
73	NC_017617	TTGA	2	8	26348	26355	25 %	50 %	25 %	0 %	386577022
74	NC_017617	TGAT	2	8	26361	26368	25 %	50 %	25 %	0 %	386577022
75	NC_017617	TTTG	2	8	26626	26633	0 %	75 %	25 %	0 %	386577022
76	NC_017617	ATTT	2	8	26688	26695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017617	TGCC	2	8	27098	27105	0 %	25 %	25 %	50 %	386577023
78	NC_017617	GCGG	2	8	27615	27622	0 %	0 %	75 %	25 %	386577023
79	NC_017617	GAAA	2	8	27770	27777	75 %	0 %	25 %	0 %	386577023
80	NC_017617	TGGG	2	8	28709	28716	0 %	25 %	75 %	0 %	386577025
81	NC_017617	TCAA	2	8	28748	28755	50 %	25 %	0 %	25 %	386577025
82	NC_017617	CGTG	2	8	29175	29182	0 %	25 %	50 %	25 %	386577025
83	NC_017617	TCAA	2	8	29428	29435	50 %	25 %	0 %	25 %	386577025
84	NC_017617	AACC	2	8	29477	29484	50 %	0 %	0 %	50 %	386577025
85	NC_017617	CTTG	2	8	29535	29542	0 %	50 %	25 %	25 %	386577025
86	NC_017617	AATT	2	8	29718	29725	50 %	50 %	0 %	0 %	386577026
87	NC_017617	TTTA	2	8	29900	29907	25 %	75 %	0 %	0 %	386577026
88	NC_017617	AAGA	2	8	30161	30168	75 %	0 %	25 %	0 %	386577027
89	NC_017617	TGAA	2	8	30228	30235	50 %	25 %	25 %	0 %	386577027
90	NC_017617	TTCA	2	8	31355	31362	25 %	50 %	0 %	25 %	386577028
91	NC_017617	TACT	2	8	31420	31427	25 %	50 %	0 %	25 %	386577028
92	NC_017617	GTCC	2	8	32429	32436	0 %	25 %	25 %	50 %	386577028
93	NC_017617	TTCC	2	8	32566	32573	0 %	50 %	0 %	50 %	386577028
94	NC_017617	GCAG	2	8	33016	33023	25 %	0 %	50 %	25 %	386577028
95	NC_017617	TACC	2	8	33233	33240	25 %	25 %	0 %	50 %	386577028
96	NC_017617	CCAA	2	8	34098	34105	50 %	0 %	0 %	50 %	386577028
97	NC_017617	GACG	2	8	34225	34232	25 %	0 %	50 %	25 %	386577028
98	NC_017617	AAGA	2	8	34436	34443	75 %	0 %	25 %	0 %	386577028
99	NC_017617	AAAT	2	8	34484	34491	75 %	25 %	0 %	0 %	386577028
100	NC_017617	TGGT	2	8	35357	35364	0 %	50 %	50 %	0 %	386577029
101	NC_017617	CAAC	2	8	35470	35477	50 %	0 %	0 %	50 %	386577029
102	NC_017617	ACCT	2	8	35767	35774	25 %	25 %	0 %	50 %	386577029
103	NC_017617	AGCC	2	8	36342	36349	25 %	0 %	25 %	50 %	386577030
104	NC_017617	GATT	2	8	36405	36412	25 %	50 %	25 %	0 %	386577030
105	NC_017617	CTGG	2	8	36464	36471	0 %	25 %	50 %	25 %	386577030
106	NC_017617	GGCT	2	8	37469	37476	0 %	25 %	50 %	25 %	386577031
107	NC_017617	GTCC	2	8	37961	37968	0 %	25 %	25 %	50 %	386577032
108	NC_017617	CAAG	2	8	38154	38161	50 %	0 %	25 %	25 %	386577032
109	NC_017617	GCAG	2	8	38427	38434	25 %	0 %	50 %	25 %	386577032
110	NC_017617	AACC	2	8	38889	38896	50 %	0 %	0 %	50 %	386577032
111	NC_017617	CGTC	2	8	38903	38910	0 %	25 %	25 %	50 %	386577032
112	NC_017617	CAAA	2	8	39575	39582	75 %	0 %	0 %	25 %	386577033
113	NC_017617	GACC	2	8	40079	40086	25 %	0 %	25 %	50 %	386577033
114	NC_017617	AAAG	2	8	40641	40648	75 %	0 %	25 %	0 %	386577034
115	NC_017617	GCGG	2	8	40735	40742	0 %	0 %	75 %	25 %	386577034
116	NC_017617	TGCC	2	8	41664	41671	0 %	25 %	25 %	50 %	386577035
117	NC_017617	TGAA	2	8	41790	41797	50 %	25 %	25 %	0 %	386577035
118	NC_017617	ATAC	2	8	42552	42559	50 %	25 %	0 %	25 %	386577036
119	NC_017617	AAAG	2	8	42571	42578	75 %	0 %	25 %	0 %	386577036
120	NC_017617	TGAC	2	8	42877	42884	25 %	25 %	25 %	25 %	386577036
121	NC_017617	AATA	2	8	42946	42953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017617	TAAA	2	8	42979	42986	75 %	25 %	0 %	0 %	386577037
123	NC_017617	TTAT	2	8	43669	43676	25 %	75 %	0 %	0 %	386577037
124	NC_017617	GAAG	2	8	43925	43932	50 %	0 %	50 %	0 %	386577037
125	NC_017617	GAAG	2	8	44093	44100	50 %	0 %	50 %	0 %	386577037
126	NC_017617	TTGG	2	8	44268	44275	0 %	50 %	50 %	0 %	386577038
127	NC_017617	CGAC	2	8	44483	44490	25 %	0 %	25 %	50 %	386577038
128	NC_017617	TTGA	2	8	45283	45290	25 %	50 %	25 %	0 %	386577038
129	NC_017617	TCAG	2	8	45410	45417	25 %	25 %	25 %	25 %	386577038
130	NC_017617	AATA	2	8	45546	45553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017617	CTCC	2	8	45572	45579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017617	TTCG	2	8	45673	45680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017617	AAGC	2	8	45795	45802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017617	AAAC	2	8	45997	46004	75 %	0 %	0 %	25 %	386577039
135	NC_017617	ATCA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017617	CTAT	2	8	46870	46877	25 %	50 %	0 %	25 %	386577040
137	NC_017617	TCAA	2	8	46891	46898	50 %	25 %	0 %	25 %	386577040
138	NC_017617	GCTT	2	8	47205	47212	0 %	50 %	25 %	25 %	386577041
139	NC_017617	CCTA	2	8	47291	47298	25 %	25 %	0 %	50 %	386577041
140	NC_017617	GCTA	2	8	47559	47566	25 %	25 %	25 %	25 %	386577041
141	NC_017617	AAGA	2	8	48162	48169	75 %	0 %	25 %	0 %	386577042
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143	NC_017617	TGAT	2	8	48422	48429	25 %	50 %	25 %	0 %	386577043
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