MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017617	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017617	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017617	GTGA	2	8	17379	17386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017617	AGCG	2	8	17550	17557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017617	AGCC	2	8	18432	18439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017617	GTAA	2	8	19011	19018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017617	TCAC	2	8	19068	19075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017617	GCGA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017617	ATTC	2	8	20033	20040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017617	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017617	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017617	GCGT	2	8	22433	22440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017617	TTTG	2	8	25621	25628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017617	ATTT	2	8	26688	26695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017617	AATA	2	8	42946	42953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017617	AATA	2	8	45546	45553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017617	CTCC	2	8	45572	45579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_017617	TTCG	2	8	45673	45680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017617	AAGC	2	8	45795	45802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017617	ATCA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017617	GACC	2	8	51567	51574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017617	ATAG	2	8	51635	51642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017617	GAAT	2	8	51875	51882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017617	ACTC	2	8	55948	55955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017617	AAGG	2	8	57165	57172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017617	GTTA	2	8	58198	58205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017617	AATA	2	8	59508	59515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017617	AAGT	2	8	70153	70160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017617	GACT	2	8	73695	73702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017617	TTGA	2	8	73719	73726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017617	AAAC	2	8	76570	76577	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017617	CAAC	2	8	77739	77746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017617	ATCT	2	8	77789	77796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017617	TAGA	2	8	77896	77903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017617	TACA	2	8	80671	80678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017617	GTGA	2	8	86946	86953	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017617	AGCG	2	8	87117	87124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017617	AGCC	2	8	87999	88006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017617	GTAA	2	8	88578	88585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017617	TCAC	2	8	88635	88642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017617	GCGA	2	8	88734	88741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017617	ATTC	2	8	89600	89607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017617	CTAA	2	8	89956	89963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017617	TAGG	2	8	90612	90619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017617	GCGT	2	8	92000	92007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017617	TAGT	2	8	94084	94091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017617	ATGT	2	8	95697	95704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017617	ATGT	2	8	95731	95738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017617	TATT	2	8	97816	97823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017617	TAAA	2	8	97861	97868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017617	GCTG	2	8	99918	99925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017617	TTTA	2	8	100136	100143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017617	TACT	2	8	100247	100254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017617	TTAA	2	8	100319	100326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017617	TCTT	2	8	103851	103858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017617	TCTT	2	8	109576	109583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017617	ATGG	2	8	113291	113298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017617	GAAA	2	8	117159	117166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017617	AACT	2	8	124586	124593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017617	TTTG	2	8	128204	128211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017617	TCTA	2	8	128577	128584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017617	CAAT	2	8	135979	135986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017617	TCTA	2	8	138439	138446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017617	ACCT	2	8	138448	138455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017617	AAAC	2	8	138864	138871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017617	AAAT	2	8	139195	139202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017617	TTTG	2	8	139225	139232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017617	ATAG	2	8	139261	139268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017617	AAAG	2	8	139406	139413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017617	TTTG	2	8	144883	144890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017617	CTTT	2	8	149542	149549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017617	GTCT	2	8	149587	149594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017617	AAAG	2	8	150118	150125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017617	CCTG	2	8	152799	152806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017617	ATAA	2	8	161289	161296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017617	GGTA	2	8	165200	165207	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017617	TAGA	2	8	167908	167915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017617	TGTA	2	8	169327	169334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017617	GAAA	2	8	169400	169407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017617	GTAG	2	8	169408	169415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017617	TTGT	2	8	180118	180125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017617	GTTA	2	8	185473	185480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017617	AAAT	2	8	192677	192684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017617	AAAT	2	8	192739	192746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017617	TAAA	2	8	194619	194626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017617	TAAA	2	8	195361	195368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017617	GTTG	2	8	197254	197261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017617	AAAT	3	12	198558	198569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017617	TAAA	2	8	198592	198599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017617	ATTT	2	8	201917	201924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017617	ATAG	2	8	201948	201955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017617	ATTT	2	8	201964	201971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017617	ATTT	2	8	201985	201992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017617	CTTG	2	8	211480	211487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017617	TTGT	2	8	215235	215242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017617	GAGT	2	8	217871	217878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017617	ATTG	2	8	218056	218063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017617	TTTA	2	8	218102	218109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017617	GAAT	2	8	219288	219295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017617	ATAG	2	8	224316	224323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017617	ACTT	2	8	228929	228936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017617	TTTA	2	8	231754	231761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017617	AACG	2	8	232738	232745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017617	ACTG	2	8	237655	237662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017617	GTTT	2	8	242478	242485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017617	AAGA	2	8	242500	242507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017617	AAAT	2	8	253935	253942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017617	ATAA	2	8	253964	253971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017617	GGAA	2	8	258704	258711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017617	TAGT	2	8	258784	258791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017617	GCTG	2	8	262315	262322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017617	GGAA	2	8	263193	263200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017617	AGAA	2	8	268178	268185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017617	TAGG	2	8	271211	271218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017617	TTGT	2	8	271316	271323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017617	TCTA	2	8	271401	271408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017617	ATTT	2	8	272963	272970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017617	GTTT	2	8	272996	273003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017617	TCTT	2	8	273401	273408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017617	CTTT	2	8	296519	296526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017617	GTCA	2	8	299939	299946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017617	GGTT	2	8	300668	300675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017617	AAAG	2	8	303586	303593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017617	TTAT	2	8	303599	303606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017617	GGCA	2	8	305016	305023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017617	GAAT	2	8	308531	308538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017617	TTGT	2	8	315514	315521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017617	CAAT	2	8	316637	316644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017617	AAAG	2	8	319061	319068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017617	CAAA	2	8	327271	327278	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017617	TTTC	2	8	327311	327318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017617	ATGG	2	8	327465	327472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017617	GTGA	2	8	328844	328851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017617	AGCG	2	8	329015	329022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017617	AGCC	2	8	329897	329904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017617	GTAA	2	8	330476	330483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017617	TCAC	2	8	330533	330540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017617	GCGA	2	8	330632	330639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017617	ATTC	2	8	331498	331505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017617	CTAA	2	8	331854	331861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017617	TAGG	2	8	332510	332517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017617	TTGT	2	8	333761	333768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017617	TTTC	2	8	336836	336843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017617	ACGA	2	8	340302	340309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017617	TTGT	2	8	340406	340413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017617	AGAT	2	8	343460	343467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017617	AATA	2	8	346807	346814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017617	AAGA	2	8	352026	352033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017617	AAAT	2	8	353699	353706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017617	GTTT	2	8	353753	353760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017617	AGAT	2	8	359702	359709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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