MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 2547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017617	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017617	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017617	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017617	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017617	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017617	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017617	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017617	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017617	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017617	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017617	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017617	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017617	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017617	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017617	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017617	GAT	2	6	16623	16628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017617	AGA	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017617	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017617	GGC	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017617	GCA	2	6	17326	17331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017617	CGC	2	6	17373	17378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017617	TGT	2	6	17412	17417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017617	AGA	2	6	17421	17426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017617	AGA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017617	CAG	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017617	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017617	GAA	2	6	17949	17954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017617	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017617	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017617	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017617	TAA	2	6	18140	18145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017617	GGA	2	6	18149	18154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017617	ATC	2	6	18173	18178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017617	CGC	2	6	18339	18344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017617	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017617	GAT	2	6	18455	18460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017617	CCT	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017617	TCT	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017617	AGG	2	6	18612	18617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017617	AAC	2	6	18647	18652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017617	GTT	2	6	18657	18662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017617	ATC	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017617	AGT	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017617	ACG	2	6	18988	18993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017617	TAG	2	6	19159	19164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017617	AGG	2	6	19181	19186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017617	GAG	2	6	19194	19199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017617	CTC	2	6	19204	19209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017617	AGA	2	6	19246	19251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017617	TCG	2	6	19349	19354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017617	GGA	2	6	19362	19367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017617	ACA	2	6	19480	19485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017617	ATG	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017617	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017617	GGA	2	6	19680	19685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017617	ACC	2	6	19946	19951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017617	AAT	2	6	19966	19971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017617	AGC	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017617	AAG	2	6	20163	20168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017617	GAG	2	6	20178	20183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017617	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017617	GAT	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017617	AGG	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017617	CGG	2	6	20829	20834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017617	TAC	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017617	CCT	2	6	21187	21192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017617	GGT	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017617	TCG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017617	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017617	AGT	2	6	21909	21914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017617	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017617	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017617	TGT	2	6	22152	22157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017617	GGT	2	6	22263	22268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017617	CGG	2	6	22331	22336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017617	TAT	2	6	22366	22371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017617	GGA	2	6	22374	22379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017617	TCC	2	6	22457	22462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017617	CTA	2	6	22467	22472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017617	AGC	2	6	22484	22489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017617	TCG	2	6	22498	22503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017617	CGG	2	6	22610	22615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017617	TAT	2	6	22658	22663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017617	GGT	2	6	22716	22721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017617	TAA	2	6	24247	24252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017617	AGG	2	6	25674	25679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017617	CTT	2	6	26676	26681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017617	TAT	2	6	26704	26709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017617	AAC	2	6	29963	29968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017617	TGT	2	6	29977	29982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017617	CGG	3	9	41047	41055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017617	GAT	2	6	41068	41073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017617	GCG	2	6	41123	41128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017617	TCG	2	6	41160	41165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017617	TTA	2	6	42119	42124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017617	AGG	2	6	46098	46103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017617	TAT	2	6	46159	46164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017617	TCG	2	6	46177	46182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017617	GTC	2	6	46185	46190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017617	ATT	2	6	46219	46224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017617	ATT	2	6	46262	46267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017617	AAG	2	6	46269	46274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017617	ATC	2	6	46302	46307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017617	CGC	2	6	46320	46325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017617	GTC	2	6	46327	46332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017617	TAA	3	9	51595	51603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017617	TGA	2	6	51614	51619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017617	TAA	2	6	54650	54655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017617	AAG	2	6	54679	54684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017617	GAA	2	6	55671	55676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017617	GTC	2	6	55752	55757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017617	GAA	2	6	55784	55789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017617	ATT	2	6	55794	55799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017617	ATG	2	6	55824	55829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017617	AAT	2	6	55849	55854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017617	ATG	2	6	55920	55925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017617	AGG	2	6	56041	56046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017617	TGA	2	6	57122	57127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017617	ATA	2	6	59653	59658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017617	GAA	2	6	59678	59683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017617	ATG	2	6	64109	64114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017617	AAT	2	6	64333	64338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017617	GTT	2	6	67670	67675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017617	TAA	2	6	67718	67723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017617	ATA	2	6	67795	67800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017617	TAA	2	6	67815	67820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017617	AAT	2	6	68289	68294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017617	AAG	2	6	68327	68332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017617	GAA	2	6	70587	70592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017617	TAT	2	6	70775	70780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017617	AGG	2	6	72790	72795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017617	ATC	2	6	73664	73669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017617	TAG	2	6	73762	73767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017617	AGG	2	6	74172	74177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017617	ACG	2	6	77765	77770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017617	GAA	2	6	77879	77884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017617	CAT	2	6	77957	77962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017617	ACA	2	6	78046	78051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017617	TTC	2	6	78585	78590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017617	TTC	2	6	78825	78830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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