MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	TTACGT	2	12	4970	4981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386361886
2	NC_017596	GATTCA	2	12	6765	6776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386361887
3	NC_017596	ATTTTC	2	12	7011	7022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386361887
4	NC_017596	CTTAAC	2	12	7524	7535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361887
5	NC_017596	TAGATA	2	12	10027	10038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386361891
6	NC_017596	GTATTG	2	12	11100	11111	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386361892
7	NC_017596	AGATTT	2	12	11722	11733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386361892
8	NC_017596	TAAAAT	2	12	14039	14050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361894
9	NC_017596	GAATCT	2	12	14766	14777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386361894
10	NC_017596	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017596	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017596	AGTGTA	2	12	27883	27894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017596	ACTAAT	2	12	27911	27922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017596	CTGCAA	2	12	31777	31788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386361896
15	NC_017596	ACTGAG	2	12	37501	37512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386361902
16	NC_017596	CAGGCG	2	12	37955	37966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386361902
17	NC_017596	ACATCG	2	12	44531	44542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386361906
18	NC_017596	AAAGCC	2	12	47534	47545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386361908
19	NC_017596	AAAAGT	2	12	53418	53429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386361914
20	NC_017596	CGAACA	2	12	55456	55467	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386361915
21	NC_017596	ATAACT	2	12	55875	55886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386361916
22	NC_017596	AAGGAA	2	12	56381	56392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361917
23	NC_017596	GCCTTT	2	12	62384	62395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386361920
24	NC_017596	GGCAAC	2	12	63730	63741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361921
25	NC_017596	TATTTT	2	12	64815	64826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017596	AAAGGT	2	12	65286	65297	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386361923
27	NC_017596	CTTGTT	2	12	66056	66067	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386361924
28	NC_017596	AGCTGA	2	12	66504	66515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386361925
29	NC_017596	CGCAAT	2	12	67907	67918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386361928
30	NC_017596	ATTGAA	2	12	68319	68330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386361929
31	NC_017596	ACATCA	2	12	68455	68466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386361929
32	NC_017596	CAAAGG	2	12	72498	72509	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386361938
33	NC_017596	AAATTA	2	12	73560	73571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361941
34	NC_017596	GCGGTG	2	12	74074	74085	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386361942
35	NC_017596	TAAAGA	2	12	74435	74446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386361943
36	NC_017596	ATTGAA	2	12	76635	76646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386361945
37	NC_017596	AGTGTA	2	12	84783	84794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017596	ACTAAT	2	12	84811	84822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017596	TTCGGG	2	12	85753	85764	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017596	CGAAGG	2	12	99456	99467	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386361960
41	NC_017596	CTGGTA	2	12	101453	101464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386361960
42	NC_017596	ATATTT	2	12	102218	102229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361962
43	NC_017596	CTTTTT	2	12	103427	103438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386361963
44	NC_017596	ATAAAA	2	12	112894	112905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017596	AACCTT	2	12	115048	115059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361980
46	NC_017596	AAAAAG	2	12	116591	116602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386361981
47	NC_017596	CTTTTT	2	12	117195	117206	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386361981
48	NC_017596	AGGAGA	2	12	118419	118430	50 %	0 %	50 %	0 %	386361982
49	NC_017596	ACTTTT	2	12	119939	119950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386361984
50	NC_017596	GGTATT	2	12	120122	120133	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386361984
51	NC_017596	TGGTTT	2	12	120895	120906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361985
52	NC_017596	CCATTA	2	12	122034	122045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361986
53	NC_017596	AGATAA	2	12	123678	123689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017596	TATTGA	2	12	125592	125603	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386361988
55	NC_017596	ATTTTT	2	12	127605	127616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386361990
56	NC_017596	TTTTTA	2	12	128187	128198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386361990
57	NC_017596	AATAGC	2	12	131005	131016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386361993
58	NC_017596	AGATAA	2	12	135123	135134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017596	ATCTTG	2	12	135508	135519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386361999
60	NC_017596	AAAAGC	2	12	137082	137093	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386361999
61	NC_017596	TTTATT	2	12	137268	137279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386361999
62	NC_017596	ATGTCA	2	12	137419	137430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386361999
63	NC_017596	AAAGCT	2	12	138905	138916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386362002
64	NC_017596	AAGGTA	2	12	146737	146748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386362010
65	NC_017596	AAAACT	2	12	149352	149363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386362011
66	NC_017596	TATTGA	2	12	150980	150991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362013
67	NC_017596	CCAATC	2	12	158534	158545	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386362019
68	NC_017596	CTTTAT	2	12	160025	160036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017596	CTCTTT	2	12	161889	161900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017596	GGTGTT	2	12	164955	164966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017596	GATGTT	2	12	165981	165992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386362026
72	NC_017596	AGATCA	2	12	166005	166016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386362026
73	NC_017596	GATGTT	2	12	175329	175340	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386362032
74	NC_017596	TCTTAT	2	12	176812	176823	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386362034
75	NC_017596	GTGGAA	2	12	181681	181692	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386362041
76	NC_017596	TCTTTG	2	12	183732	183743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386362045
77	NC_017596	TGGGAG	2	12	185477	185488	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386362047
78	NC_017596	TGACTG	2	12	185646	185657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386362047
79	NC_017596	TTGACC	2	12	186107	186118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386362048
80	NC_017596	CCTATC	2	12	187113	187124	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386362050
81	NC_017596	TGACAC	2	12	188719	188730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017596	ATCGGT	2	12	192021	192032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386362056
83	NC_017596	TCAACA	2	12	194375	194386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386362057
84	NC_017596	TTTAAA	2	12	195209	195220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017596	CAGCTC	2	12	197604	197615	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386362062
86	NC_017596	TGAAAA	2	12	200078	200089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386362064
87	NC_017596	ATTAGC	2	12	206581	206592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386362070
88	NC_017596	TCATGC	2	12	213508	213519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386362076
89	NC_017596	TCCCAT	2	12	217445	217456	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386362081
90	NC_017596	AAGGCC	2	12	221205	221216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362085
91	NC_017596	TTGAGG	2	12	225713	225724	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386362090
92	NC_017596	TACCCA	2	12	227095	227106	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386362091
93	NC_017596	GATACG	2	12	228123	228134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386362093
94	NC_017596	AGGCAA	2	12	232021	232032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386362097
95	NC_017596	GCAAGA	2	12	236215	236226	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386362100
96	NC_017596	TTCGAA	2	12	237614	237625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386362100
97	NC_017596	TGGCAA	2	12	240247	240258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386362103
98	NC_017596	CCAGAA	2	12	240579	240590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386362103
99	NC_017596	CAGCAA	2	12	241604	241615	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386362104
100	NC_017596	TGGCGG	2	12	244354	244365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386362105
101	NC_017596	GGCTGT	2	12	246967	246978	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386362108
102	NC_017596	AGTGAC	2	12	248842	248853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386362111
103	NC_017596	AGCCAA	2	12	251368	251379	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386362114
104	NC_017596	ACTTAT	2	12	256107	256118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386362117
105	NC_017596	AAAAGC	2	12	257060	257071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386362117
106	NC_017596	GAAACA	2	12	257241	257252	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386362117
107	NC_017596	AGTGTA	2	12	268084	268095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017596	ACTAAT	2	12	268112	268123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017596	TAAAAA	2	12	272620	272631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386362126
110	NC_017596	TCAAGA	2	12	278870	278881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386362134
111	NC_017596	GGGTTA	2	12	283873	283884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386362139
112	NC_017596	GACAAT	2	12	285909	285920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386362141
113	NC_017596	CCAGCT	2	12	287733	287744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386362142
114	NC_017596	TTAAAA	2	12	289766	289777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017596	CCAATT	2	12	296633	296644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362151
116	NC_017596	CCAACG	2	12	296799	296810	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386362151
117	NC_017596	ATAACC	2	12	299243	299254	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386362152
118	NC_017596	GCACCT	2	12	301832	301843	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386362154
119	NC_017596	AGCAGG	2	12	303682	303693	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386362156
120	NC_017596	TTTAAT	2	12	306847	306858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017596	ATGATT	2	12	316923	316934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362174
122	NC_017596	TATCGC	2	12	317156	317167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386362174
123	NC_017596	AAGACC	2	12	317799	317810	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386362175
124	NC_017596	TTTTAG	2	12	318204	318215	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017596	GATAAA	2	12	320827	320838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386362178
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127	NC_017596	TGAGGT	2	12	322662	322673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386362180
128	NC_017596	GATGCA	2	12	342320	342331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386362204
129	NC_017596	CAGCAA	2	12	346464	346475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386362204
130	NC_017596	AGGCGG	2	12	357271	357282	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386362213
131	NC_017596	AGTGAT	2	12	357558	357569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362213
132	NC_017596	GAAGTC	2	12	359247	359258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386362215
133	NC_017596	ACAGCT	2	12	366223	366234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386362223
134	NC_017596	ATTTAA	2	12	369316	369327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017596	TATTGA	2	12	369482	369493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362228
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140	NC_017596	TCATGT	2	12	382902	382913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386362242
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144	NC_017596	GACTTC	2	12	396297	396308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_017596	TTGACA	2	12	398089	398100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017596	TAGAAA	2	12	399982	399993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386362263
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149	NC_017596	GTTAAA	2	12	408966	408977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017596	GAGAAG	2	12	409900	409911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017596	TCCTTT	2	12	411019	411030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017596	ACGCAT	2	12	412402	412413	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386362276
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180	NC_017596	GAGCAA	2	12	495387	495398	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386362362
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235	NC_017596	TTTAGA	2	12	652628	652639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362503
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341	NC_017596	TGACAT	2	12	950603	950614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386362789
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343	NC_017596	CATGGC	2	12	956506	956517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386362795
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350	NC_017596	TTATCA	2	12	965305	965316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386362802
351	NC_017596	ATTGTA	2	12	965463	965474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362802
352	NC_017596	TTAATA	2	12	965722	965733	50 %	50 %	0 %	0 %	386362802
353	NC_017596	TTAATA	2	12	968167	968178	50 %	50 %	0 %	0 %	386362805
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360	NC_017596	CATCTG	2	12	989397	989408	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386362830
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370	NC_017596	TTAAGT	2	12	1021937	1021948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386362878
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377	NC_017596	TTCTGG	2	12	1034151	1034162	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386362889
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426	NC_017596	GCTTTA	2	12	1180615	1180626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386363046
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429	NC_017596	TCAAAA	2	12	1183565	1183576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386363051
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434	NC_017596	TAGAAT	2	12	1189944	1189955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017596	ACCGAT	2	12	1191739	1191750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386363057
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439	NC_017596	TCAAAA	2	12	1198276	1198287	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386363066
440	NC_017596	CCTTCA	2	12	1202212	1202223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386363070
441	NC_017596	GAGATA	2	12	1207845	1207856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017596	ACCACA	2	12	1208497	1208508	50 %	0 %	0 %	50 %	386363076
443	NC_017596	AGCTGA	2	12	1214343	1214354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386363081
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445	NC_017596	CTTTTT	2	12	1222551	1222562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386363089
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447	NC_017596	AGGTTG	2	12	1223697	1223708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386363089
448	NC_017596	CATCTT	2	12	1223799	1223810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386363089
449	NC_017596	ACGGCA	2	12	1224431	1224442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386363089
450	NC_017596	CAAAAG	2	12	1238472	1238483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386363100
451	NC_017596	TAGTCA	2	12	1240832	1240843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386363102
452	NC_017596	AAAAGA	2	12	1243316	1243327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386363104
453	NC_017596	TCATGA	2	12	1244083	1244094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386363105
454	NC_017596	GGCTAG	2	12	1245955	1245966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386363107
455	NC_017596	AATCAA	2	12	1247628	1247639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386363108
456	NC_017596	GCAATG	2	12	1251372	1251383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386363111
457	NC_017596	TCCTTC	2	12	1254960	1254971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
458	NC_017596	ACTTGT	2	12	1256424	1256435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386363113
459	NC_017596	AACAAA	2	12	1259449	1259460	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386363117
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461	NC_017596	TTGGCA	2	12	1262112	1262123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386363120
462	NC_017596	TGATTT	2	12	1263443	1263454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386363122
463	NC_017596	CCGTCA	2	12	1273886	1273897	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386363130
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