MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	ATTT	2	8	123	130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017596	ACTA	2	8	149	156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017596	TTTA	2	8	1665	1672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017596	TAAA	2	8	3162	3169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017596	TTGA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017596	GAAC	2	8	8786	8793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017596	ACTA	2	8	15061	15068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017596	TACT	2	8	16579	16586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017596	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017596	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017596	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017596	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017596	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017596	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017596	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017596	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017596	GTAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017596	ACTA	2	8	19167	19174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017596	GAAG	2	8	19207	19214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017596	GCGA	2	8	19281	19288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017596	ATTC	2	8	20147	20154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017596	CTAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017596	TAGG	2	8	21158	21165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017596	TTGG	2	8	21341	21348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017596	AATC	2	8	21350	21357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017596	AAAT	2	8	23022	23029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017596	ACCT	2	8	23196	23203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017596	GTGA	2	8	23477	23484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017596	TAAC	2	8	23560	23567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017596	AGCG	2	8	23648	23655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017596	TGGT	2	8	24313	24320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017596	AGCC	2	8	24530	24537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017596	AGCG	2	8	24876	24883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017596	GTAA	2	8	25126	25133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017596	ACTA	2	8	25168	25175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017596	GAAG	2	8	25208	25215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017596	GCGA	2	8	25282	25289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017596	ATTC	2	8	26148	26155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017596	CTAA	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017596	TAGG	2	8	27159	27166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017596	TTGG	2	8	27342	27349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017596	AATC	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017596	GCGT	2	8	29198	29205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017596	TAAA	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017596	GTTA	2	8	30089	30096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017596	ATTC	2	8	30889	30896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017596	ATTA	2	8	33674	33681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017596	AGAA	2	8	36021	36028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017596	GGAA	2	8	36756	36763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017596	AGAA	2	8	40651	40658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017596	TAGT	2	8	43291	43298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017596	AAAG	2	8	44045	44052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017596	TAAT	2	8	47076	47083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017596	AGAA	2	8	48471	48478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017596	TTTA	2	8	54338	54345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017596	GATT	2	8	55608	55615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017596	GATA	2	8	56127	56134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017596	AAAG	2	8	58398	58405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017596	ATTT	2	8	61452	61459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017596	TATT	2	8	67421	67428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017596	TAAA	2	8	71083	71090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017596	TTAA	2	8	71323	71330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017596	TATT	2	8	75835	75842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017596	ACTT	2	8	77048	77055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017596	AAAT	2	8	79922	79929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017596	ACCT	2	8	80096	80103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017596	GTGA	2	8	80377	80384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017596	TAAC	2	8	80460	80467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017596	AGCG	2	8	80548	80555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017596	TGGT	2	8	81213	81220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017596	AGCC	2	8	81430	81437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017596	AGCG	2	8	81776	81783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017596	GTAA	2	8	82026	82033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017596	ACTA	2	8	82068	82075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017596	GAAG	2	8	82108	82115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017596	GCGA	2	8	82182	82189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017596	ATTC	2	8	83048	83055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017596	CTAA	2	8	83404	83411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017596	TAGG	2	8	84059	84066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017596	TTGG	2	8	84242	84249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017596	AATC	2	8	84251	84258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017596	GCGT	2	8	85480	85487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017596	TGAT	2	8	86821	86828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017596	GTTC	2	8	86833	86840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017596	AAAT	2	8	86860	86867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017596	CAAT	2	8	86995	87002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017596	CAAT	2	8	97838	97845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017596	ATTC	2	8	103114	103121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017596	GTTA	2	8	108154	108161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017596	TAAG	2	8	110616	110623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017596	ATTA	2	8	117438	117445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017596	CTTG	2	8	122214	122221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017596	TGAT	2	8	122274	122281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017596	AAAG	2	8	123715	123722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017596	AAAT	2	8	123763	123770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017596	ATCG	2	8	126156	126163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017596	CTTT	2	8	127037	127044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017596	GTCA	2	8	132347	132354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017596	TATC	2	8	133114	133121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017596	TTAG	2	8	140085	140092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017596	GAAA	2	8	146340	146347	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017596	CCTG	2	8	146560	146567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017596	TAGT	2	8	148054	148061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017596	ACAA	2	8	150139	150146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017596	AAAC	2	8	150175	150182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017596	AAAG	2	8	154518	154525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017596	ATTT	2	8	154539	154546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017596	TAGC	2	8	154631	154638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017596	AAAT	2	8	155436	155443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017596	AAAT	2	8	155505	155512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017596	GGAT	2	8	165072	165079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017596	AGTC	2	8	166891	166898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017596	ATTA	2	8	168481	168488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017596	ATAG	2	8	174464	174471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017596	CGTG	2	8	174945	174952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017596	TAAA	2	8	175465	175472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017596	ATCA	2	8	175589	175596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017596	TTGT	2	8	175606	175613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017596	TCTT	2	8	175632	175639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017596	ATAA	2	8	175959	175966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017596	CCAA	2	8	179520	179527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017596	TTAG	2	8	180866	180873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017596	AACT	2	8	181962	181969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017596	AATC	2	8	182194	182201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017596	ATGG	2	8	183630	183637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017596	AAGA	2	8	187064	187071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017596	TTTA	2	8	190577	190584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017596	AGTA	2	8	191389	191396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017596	TAGA	2	8	191728	191735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017596	GATT	2	8	195129	195136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017596	AGGG	2	8	195257	195264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017596	AGTG	2	8	196355	196362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017596	GCTA	2	8	198502	198509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017596	CTTT	2	8	202684	202691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017596	AGCA	2	8	202708	202715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017596	GGGA	2	8	204134	204141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017596	ACCG	2	8	205594	205601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017596	ACAA	2	8	206309	206316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017596	TAAA	2	8	212521	212528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017596	CAAT	2	8	212556	212563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017596	TCAA	2	8	212571	212578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017596	TTTG	2	8	212660	212667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017596	TAGT	2	8	215068	215075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017596	GTTT	2	8	215113	215120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017596	TAAA	2	8	219678	219685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017596	CATA	2	8	219731	219738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017596	TTTG	2	8	219794	219801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017596	CTAC	2	8	223348	223355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017596	AAAG	2	8	225042	225049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017596	CAAA	2	8	235589	235596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017596	AAAG	2	8	238252	238259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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