MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius JIM8777

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017595	CTTTT	2	10	8513	8522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017595	GACAA	2	10	14688	14697	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017595	TCGTG	2	10	16030	16039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017595	GTTAA	2	10	16776	16785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017595	GGGAG	2	10	17294	17303	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017595	AGGGA	2	10	19503	19512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017595	TTGAG	2	10	19737	19746	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017595	TTTTA	2	10	24378	24387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017595	GCATA	2	10	33879	33888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017595	TGATA	2	10	39709	39718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017595	CTTTT	2	10	42936	42945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017595	AAGAA	2	10	44178	44187	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017595	CTTTT	2	10	52149	52158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017595	TAGGG	2	10	53992	54001	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017595	GATAA	2	10	65158	65167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017595	GACAA	2	10	65753	65762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017595	TCGTG	2	10	67095	67104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017595	GTTAA	2	10	67841	67850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017595	GGGAG	2	10	68359	68368	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017595	AGGGA	2	10	70568	70577	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017595	TTGAG	2	10	70802	70811	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017595	GGGGC	2	10	82794	82803	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017595	ATAAA	2	10	82825	82834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017595	AAAAG	2	10	83908	83917	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017595	AATAA	2	10	84488	84497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017595	AAGCG	2	10	108938	108947	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017595	GCTTT	2	10	109024	109033	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017595	AAAAT	2	10	113687	113696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017595	AAGTG	2	10	121374	121383	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017595	TCGTA	2	10	121405	121414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017595	TGATA	2	10	122792	122801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017595	GACAA	2	10	124885	124894	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017595	TCGTG	2	10	126227	126236	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017595	GTTAA	2	10	126973	126982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017595	GGGAG	2	10	127491	127500	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017595	AGGGA	2	10	129700	129709	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017595	TTGAG	2	10	129934	129943	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017595	TCGTG	2	10	132030	132039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017595	GTTAA	2	10	132776	132785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017595	GGGAG	2	10	133294	133303	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017595	AGGGA	2	10	135503	135512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017595	TTGAG	2	10	135737	135746	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017595	TATTT	2	10	136025	136034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017595	TAATG	2	10	136699	136708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017595	TAAAC	2	10	137653	137662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017595	TAAAA	2	10	139057	139066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017595	ATTAT	2	10	139945	139954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017595	ATAAA	2	10	147629	147638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017595	AAGGA	2	10	157384	157393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017595	TTTTG	2	10	174110	174119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017595	TTTTA	2	10	176565	176574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017595	TTTTA	2	10	184550	184559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017595	AAAGG	2	10	205716	205725	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017595	CCTTT	2	10	205739	205748	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017595	AAAGA	2	10	227893	227902	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017595	GTTAC	2	10	237125	237134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017595	TATAA	2	10	246709	246718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017595	GAATT	2	10	246739	246748	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017595	CAGGG	2	10	256617	256626	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017595	AATTT	2	10	281858	281867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017595	TTATA	2	10	291080	291089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017595	CATGA	2	10	297837	297846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017595	GCTAT	2	10	303939	303948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017595	CTGGC	2	10	309269	309278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017595	ATATA	2	10	337011	337020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017595	GACAA	2	10	337765	337774	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017595	TCGTG	2	10	339107	339116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017595	GTTAA	2	10	339853	339862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017595	GGGAG	2	10	340371	340380	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017595	AGGGA	2	10	342580	342589	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017595	TTGAG	2	10	342814	342823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017595	AATTA	2	10	387701	387710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017595	AATAA	2	10	389122	389131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017595	TAGCC	2	10	391486	391495	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017595	ATTTA	2	10	396440	396449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017595	AAAAT	2	10	399323	399332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017595	GTCAT	2	10	404529	404538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017595	ATAAA	2	10	407587	407596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017595	TGAGC	2	10	413554	413563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017595	GATTT	2	10	422253	422262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017595	CAAAT	2	10	430630	430639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017595	CTATA	2	10	454552	454561	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017595	TATAA	2	10	461364	461373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017595	ATATT	2	10	464249	464258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017595	ATAAA	2	10	464369	464378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017595	AGAAA	2	10	471236	471245	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017595	ATTTT	2	10	480693	480702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017595	ATTAA	2	10	480954	480963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017595	AAAAC	2	10	493028	493037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017595	TTTCT	2	10	493830	493839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017595	ATAAA	2	10	493948	493957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017595	GATTT	2	10	500962	500971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017595	AAAAG	2	10	506691	506700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017595	ATATC	2	10	513646	513655	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017595	ATGAT	2	10	521832	521841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017595	CTATA	2	10	523158	523167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017595	AAATT	2	10	523346	523355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017595	TTGTT	2	10	525967	525976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017595	TTTAT	2	10	526358	526367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017595	TACAA	2	10	529461	529470	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017595	AAGAT	2	10	536645	536654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017595	GTTCA	2	10	536812	536821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017595	AATCA	2	10	541064	541073	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017595	TAGGC	2	10	542809	542818	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017595	TTTAT	2	10	544235	544244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017595	TCCTT	2	10	546234	546243	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017595	AATAA	2	10	546351	546360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017595	AATAA	2	10	546451	546460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017595	AATAA	2	10	546503	546512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017595	AATAA	2	10	546603	546612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017595	AATAA	2	10	546655	546664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017595	AATAA	2	10	546755	546764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017595	AATAA	2	10	546807	546816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017595	TGTAA	2	10	572979	572988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017595	GTTAA	2	10	573050	573059	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017595	GATAA	2	10	574643	574652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017595	TCATT	2	10	574920	574929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017595	CTTTT	2	10	575029	575038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017595	GTAGA	2	10	579547	579556	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017595	TATAA	2	10	581393	581402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017595	AGCTA	2	10	589891	589900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017595	TCAAG	2	10	593449	593458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017595	AAAAG	2	10	597426	597435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017595	CTTTT	2	10	624004	624013	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017595	ATAAA	2	10	629749	629758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017595	TGAGA	2	10	650851	650860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017595	ATTTA	2	10	667587	667596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017595	CAACT	2	10	669244	669253	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017595	AGGCA	2	10	672585	672594	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017595	CGAAG	2	10	672611	672620	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017595	AGGAA	2	10	687670	687679	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017595	AGGAC	2	10	689586	689595	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017595	ATTTT	2	10	691942	691951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017595	AGTAA	2	10	698510	698519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017595	GAAGA	2	10	698545	698554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017595	TATAA	2	10	722572	722581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017595	TATCA	2	10	743922	743931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017595	AATTA	2	10	753330	753339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017595	TAATT	2	10	753349	753358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017595	TAGCC	2	10	756143	756152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017595	TGATA	2	10	766985	766994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017595	TAAAA	2	10	773887	773896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017595	CTATC	2	10	806059	806068	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017595	AGATA	2	10	830195	830204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017595	TATCT	2	10	835389	835398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017595	TAGTC	2	10	836391	836400	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017595	ATTTT	2	10	837058	837067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017595	ACTTA	2	10	847628	847637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017595	TGTTA	2	10	855103	855112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017595	TTTAA	2	10	859891	859900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017595	GAAGA	2	10	871330	871339	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017595	TTTTC	2	10	899830	899839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017595	ATATA	2	10	919335	919344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017595	AATTT	2	10	972455	972464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017595	TAGCT	2	10	986112	986121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017595	TAGCT	2	10	986272	986281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017595	AATCC	2	10	1011261	1011270	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_017595	AACTA	2	10	1021559	1021568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017595	AGTCT	2	10	1029930	1029939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017595	AAGTT	2	10	1141188	1141197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017595	TAAAA	2	10	1150572	1150581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017595	CCTTT	2	10	1204400	1204409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017595	TATCA	2	10	1204426	1204435	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_017595	GTAGA	2	10	1204460	1204469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017595	AGAAA	2	10	1208555	1208564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017595	ATTTT	2	10	1230264	1230273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017595	TAAAA	2	10	1232596	1232605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017595	TACTT	2	10	1262333	1262342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_017595	CCTTA	2	10	1417146	1417155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
223	NC_017595	TTTTA	2	10	1424844	1424853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_017595	AAGAC	2	10	2118067	2118076	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
331	NC_017595	TTCTA	2	10	2124763	2124772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_017595	TGCTT	2	10	2137153	2137162	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
333	NC_017595	ACTTT	2	10	2146620	2146629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
334	NC_017595	ATATT	2	10	2149348	2149357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_017595	AGATA	2	10	2153414	2153423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_017595	ATATT	2	10	2160233	2160242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_017595	AAATA	2	10	2167737	2167746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_017595	ACTAG	2	10	2177145	2177154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
343	NC_017595	ATCAA	2	10	2184403	2184412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
344	NC_017595	TATCT	2	10	2196430	2196439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
345	NC_017595	ATATC	2	10	2201210	2201219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
346	NC_017595	TTAAA	2	10	2206444	2206453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.