MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius 57.I chromosome

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017594	TTTATT	2	12	10299	10310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017594	CTTGTC	2	12	72996	73007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017594	GAAGTG	2	12	194743	194754	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017594	ACTAAT	2	12	194773	194784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017594	TTTTCT	2	12	216706	216717	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017594	CTGAAA	2	12	242331	242342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017594	GAAAAA	2	12	247300	247311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017594	AGAGGG	2	12	291846	291857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017594	GCTTAT	2	12	294661	294672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017594	ATACAA	2	12	321283	321294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017594	GTGGTT	2	12	329777	329788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017594	TTCTTT	2	12	330271	330282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017594	AATAAA	2	12	361688	361699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017594	ACTATA	2	12	407463	407474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017594	GAAAAA	2	12	461117	461128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017594	CCCTAT	2	12	476244	476255	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017594	ATTAAA	2	12	506788	506799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017594	AATCTA	2	12	508945	508956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017594	CTTTTT	2	12	538979	538990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017594	CTTAAC	2	12	585540	585551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017594	TGTTAG	2	12	607318	607329	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017594	TCAGCC	2	12	682759	682770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017594	TCCTAA	2	12	728317	728328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017594	CCTTTT	2	12	823555	823566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017594	ATTTCA	2	12	838431	838442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017594	CTTTTT	2	12	897205	897216	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017594	ATCCTA	2	12	932002	932013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017594	CTAAAT	2	12	941964	941975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017594	ATTTCT	2	12	987874	987885	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017594	TAAGCA	2	12	991056	991067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017594	TAAAAA	2	12	1019719	1019730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017594	CATTAT	2	12	1038468	1038479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017594	AGTTCT	2	12	1041744	1041755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017594	ATATTT	2	12	1132281	1132292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017594	GAATAA	2	12	1167982	1167993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017594	GTTTTT	2	12	1214726	1214737	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017594	TCATAT	2	12	1222914	1222925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017594	AAAGAA	2	12	1246242	1246253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017594	AGATTA	2	12	1293319	1293330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017594	CGATTT	2	12	1311118	1311129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017594	CCGAAG	2	12	1321158	1321169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017594	ATCAAT	2	12	1331842	1331853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017594	AAAAAG	2	12	1337592	1337603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017594	AAAAGA	2	12	1344664	1344675	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017594	AAGCCT	2	12	1346355	1346366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017594	TCATTT	2	12	1348527	1348538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017594	ATTTTC	2	12	1348619	1348630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017594	TATTTT	2	12	1376556	1376567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017594	AAAAAC	2	12	1390725	1390736	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017594	ATGGAT	2	12	1404010	1404021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017594	CATTTT	2	12	1415367	1415378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017594	ATTTTT	2	12	1420555	1420566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017594	TGCGAT	2	12	1428604	1428615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017594	CTTTAT	2	12	1443497	1443508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017594	GTAAAA	2	12	1449927	1449938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017594	TTAAAA	2	12	1463430	1463441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017594	CAAAAA	2	12	1507448	1507459	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017594	CCCGAA	2	12	1537225	1537236	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017594	GAAAAA	2	12	1537636	1537647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017594	AGAAAA	2	12	1576486	1576497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017594	TAAAAA	2	12	1581317	1581328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017594	TTTCAA	2	12	1585720	1585731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017594	ATATCT	2	12	1591667	1591678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017594	AGTCAA	2	12	1591689	1591700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017594	CATTTG	2	12	1605334	1605345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017594	TTTATA	2	12	1617411	1617422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017594	CTATTA	2	12	1617962	1617973	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017594	TTACTA	2	12	1646929	1646940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017594	TATTTC	2	12	1648482	1648493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017594	AACAGA	2	12	1686508	1686519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017594	TAACTT	2	12	1687198	1687209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017594	TATATT	2	12	1692091	1692102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017594	TTTACA	2	12	1740064	1740075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017594	ACATAA	2	12	1742656	1742667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017594	TTCCTT	2	12	1754440	1754451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017594	TATTAG	2	12	1784903	1784914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017594	AAGAGT	2	12	1834559	1834570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017594	ATGATT	2	12	1844316	1844327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017594	TATTTG	2	12	1988333	1988344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017594	TATTAG	2	12	2004609	2004620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017594	TATTAG	2	12	2010413	2010424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017594	CACAGA	2	12	2035365	2035376	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017594	ATGAAA	2	12	2065230	2065241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017594	CCCGAA	2	12	2071754	2071765	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017594	TATTAG	2	12	2072639	2072650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017594	CTTTTT	2	12	2098506	2098517	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017594	ATGAAA	2	12	2100241	2100252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017594	TAACCT	2	12	2116333	2116344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017594	TATTAG	2	12	2121025	2121036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017594	TGTTCG	2	12	2131674	2131685	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017594	GTTGGC	2	12	2138489	2138500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.