MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV200

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017593	TAAGGA	2	12	16883	16894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017593	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017593	ACTAAT	2	12	20001	20012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017593	AGTTGA	2	12	21888	21899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017593	TTGTTT	2	12	29696	29707	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017593	TAAAAA	2	12	41345	41356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017593	AAAAAT	2	12	57494	57505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017593	TTCTAT	2	12	65074	65085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017593	TAAAAT	2	12	73351	73362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017593	TAAAAA	2	12	89489	89500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017593	ATAAAA	2	12	119375	119386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017593	TTTGCT	2	12	128233	128244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017593	ATAAAA	2	12	128624	128635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017593	ATAAAT	2	12	133535	133546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017593	GAAGCA	2	12	141541	141552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017593	TTTTAC	2	12	187341	187352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017593	TCTTAA	2	12	231447	231458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017593	TCTTTT	2	12	269558	269569	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017593	GAAAAA	2	12	300812	300823	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017593	GACCGT	2	12	309891	309902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017593	CATCTC	2	12	326173	326184	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017593	AGTTGA	2	12	326292	326303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017593	GCAGTT	2	12	343682	343693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017593	AGAAAT	2	12	398670	398681	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017593	ATGAAG	2	12	411100	411111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017593	GCTTGC	2	12	435252	435263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017593	ATAAAA	2	12	454667	454678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017593	AGGAAC	2	12	455127	455138	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017593	TTTTTC	2	12	456585	456596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017593	TAAAAA	2	12	478452	478463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017593	TAAAAA	2	12	480872	480883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017593	TGCTTT	2	12	486548	486559	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017593	GCAATT	2	12	507518	507529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017593	GAAAGA	2	12	507728	507739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017593	AAAATG	2	12	508596	508607	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017593	TCTTTT	2	12	519719	519730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017593	AAAGTT	2	12	570054	570065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017593	ACTTCT	2	12	586649	586660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017593	AGTATT	2	12	629453	629464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017593	GGAGCC	2	12	629466	629477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017593	TCTAAG	2	12	629495	629506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017593	AACATA	2	12	695298	695309	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017593	TTTTCA	2	12	716791	716802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017593	GATAGA	2	12	729149	729160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017593	TCTTGT	2	12	729794	729805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017593	GAAGTT	2	12	742325	742336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017593	TAAAAA	2	12	743055	743066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017593	TTCGGG	2	12	766315	766326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017593	TTAAAA	2	12	804654	804665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017593	TTAGAT	2	12	807533	807544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017593	AAAAAT	2	12	828047	828058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017593	TATAAA	2	12	831244	831255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017593	GCAATC	2	12	837444	837455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017593	TCAAGT	2	12	852507	852518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017593	GATTGA	2	12	885538	885549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017593	TTTTTA	2	12	903629	903640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017593	CGCTTT	2	12	911612	911623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017593	TCAAGC	2	12	911895	911906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017593	CTATTT	2	12	915106	915117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017593	AAAAAG	2	12	915155	915166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017593	GATAGA	2	12	922522	922533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017593	TTTTCT	2	12	925444	925455	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017593	GTTTGG	2	12	939885	939896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017593	TAAAAA	2	12	957050	957061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017593	TGTCAA	2	12	964721	964732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017593	ATTCGA	2	12	971026	971037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017593	AGCCTT	2	12	972300	972311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017593	CCAGAT	2	12	972376	972387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017593	AATGGA	2	12	976661	976672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017593	GATGTG	2	12	980154	980165	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017593	AAATAA	2	12	983321	983332	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017593	CACCAG	2	12	992379	992390	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017593	AACAAA	2	12	1049225	1049236	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017593	AAACAA	2	12	1058412	1058423	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017593	AGTTCT	2	12	1068821	1068832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017593	CTATTT	2	12	1083211	1083222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017593	AATAAA	2	12	1120815	1120826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017593	TTTCAA	2	12	1121160	1121171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017593	ACAAAA	2	12	1181082	1181093	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017593	TTTATT	2	12	1183665	1183676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017593	TTTTTA	2	12	1220110	1220121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017593	TAAAAA	2	12	1222731	1222742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017593	TAGGTA	2	12	1248437	1248448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017593	TTGAAA	2	12	1259413	1259424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017593	CCCAAG	2	12	1273188	1273199	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017593	AGCAAC	2	12	1273260	1273271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017593	GATGGT	2	12	1288228	1288239	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017593	TTTTAT	2	12	1299786	1299797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017593	TTTCCT	2	12	1303013	1303024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017593	TTTTAG	2	12	1333070	1333081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017593	ATGAAA	2	12	1338965	1338976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017593	ATACAA	2	12	1346327	1346338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017593	TGCTTC	2	12	1358991	1359002	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017593	ACTAAA	2	12	1360313	1360324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017593	AAATTT	2	12	1376565	1376576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017593	TCAAGT	2	12	1376636	1376647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017593	CTTTTC	2	12	1377165	1377176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017593	CCATCA	2	12	1377267	1377278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017593	TTAAAA	2	12	1534819	1534830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017593	AACTTG	2	12	1570402	1570413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017593	ATTTGA	2	12	1593226	1593237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017593	TAATCA	2	12	1601197	1601208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017593	ACACGA	2	12	1620764	1620775	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017593	CACTTC	2	12	1641292	1641303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017593	AAAAAT	2	12	1652559	1652570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017593	TCTATT	2	12	1657978	1657989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017593	GAACAT	2	12	1674687	1674698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017593	CTTTCT	2	12	1693780	1693791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017593	TAGGCT	2	12	1694707	1694718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017593	TCATTA	2	12	1705161	1705172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017593	TAATCA	2	12	1723917	1723928	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017593	TAAAAA	2	12	1748216	1748227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017593	TATTAG	2	12	1749968	1749979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017593	CACTTC	2	12	1749999	1750010	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017593	TCCTTA	2	12	1753087	1753098	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017593	TCAACT	2	12	1758930	1758941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017593	TTCATC	2	12	1769485	1769496	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017593	TTTTTC	2	12	1777654	1777665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017593	CCAGAA	2	12	1780492	1780503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017593	AGGACA	2	12	1824590	1824601	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017593	AAAAAT	2	12	1828360	1828371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017593	TATTAG	2	12	1840443	1840454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017593	CACTTC	2	12	1840474	1840485	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017593	TCCTTA	2	12	1843562	1843573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017593	ACAAGA	2	12	1855825	1855836	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017593	TCTATC	2	12	1856471	1856482	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017593	ATGATT	2	12	1859833	1859844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017593	CCCGAA	2	12	1905435	1905446	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017593	TATTAG	2	12	1906309	1906320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017593	CACTTC	2	12	1906340	1906351	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017593	TCCTTA	2	12	1909428	1909439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017593	GTTTTT	2	12	1983777	1983788	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017593	TAAATT	2	12	1989661	1989672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017593	GATAAA	2	12	2029687	2029698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017593	ACCTTG	2	12	2050821	2050832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.