MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae OXC141

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017592	TAAGGA	2	12	16883	16894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017592	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017592	ACTAAT	2	12	20001	20012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017592	TCTTGT	2	12	20657	20668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017592	CATCTC	2	12	21202	21213	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017592	AGTTGA	2	12	21321	21332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017592	CAGGCT	2	12	56889	56900	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017592	TAAAAA	2	12	57050	57061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017592	TTGTTT	2	12	61807	61818	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017592	TAAAAA	2	12	73442	73453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017592	AAAAAT	2	12	89591	89602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017592	TTCTAT	2	12	97168	97179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017592	TCCCAT	2	12	103017	103028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017592	TAAAAA	2	12	121325	121336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017592	AGACTT	2	12	142573	142584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017592	CATCTC	2	12	143971	143982	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017592	AGTTGA	2	12	144090	144101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017592	ATAAAA	2	12	159818	159829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017592	TTTGCT	2	12	169380	169391	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017592	ATAAAA	2	12	169759	169770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017592	TGAAAG	2	12	172854	172865	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017592	ATAAAT	2	12	174682	174693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017592	GAAGCA	2	12	180672	180683	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017592	GTTTTA	2	12	183148	183159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017592	TTTTAC	2	12	219612	219623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017592	CATAAT	2	12	248061	248072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017592	TCTTAA	2	12	263823	263834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017592	GGTTGC	2	12	280698	280709	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017592	TCTTTT	2	12	300097	300108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017592	TCTTGT	2	12	305608	305619	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017592	TAGATA	2	12	313254	313265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017592	GATAAA	2	12	318602	318613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017592	GAAAAA	2	12	338366	338377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017592	GAAAAG	2	12	352458	352469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017592	GCAGTT	2	12	371178	371189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017592	CTTTTT	2	12	413155	413166	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017592	TCAACT	2	12	413684	413695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017592	AGAAAT	2	12	419438	419449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017592	ATGAAG	2	12	430095	430106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017592	GCTTGC	2	12	453026	453037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017592	GTTTTT	2	12	473524	473535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017592	TTTTTC	2	12	474330	474341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017592	CTTGAA	2	12	493971	493982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017592	AGGATA	2	12	494165	494176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017592	TGCTTT	2	12	501164	501175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017592	AAAATG	2	12	519647	519658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017592	TCTTTT	2	12	532427	532438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017592	CTGTAA	2	12	578364	578375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017592	AAAGTT	2	12	583347	583358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017592	ACTTCT	2	12	600025	600036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017592	AGAGGA	2	12	670571	670582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017592	AGATTG	2	12	682923	682934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017592	TTTTCA	2	12	725310	725321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017592	GATAGA	2	12	737675	737686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017592	GAAGTT	2	12	750390	750401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017592	TTCGGG	2	12	775771	775782	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017592	CATCTC	2	12	778143	778154	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017592	AGTTGA	2	12	778262	778273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017592	CATATG	2	12	809547	809558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017592	ATCATG	2	12	809850	809861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017592	TTAAAA	2	12	811369	811380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017592	TATAAA	2	12	814873	814884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017592	GCAATC	2	12	821017	821028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017592	AAAAAG	2	12	865700	865711	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017592	ACCAAG	2	12	866563	866574	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017592	ACAAAC	2	12	873087	873098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017592	TTTTTA	2	12	885637	885648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017592	CTATTT	2	12	897115	897126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017592	AAAAAG	2	12	897164	897175	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017592	GATAGA	2	12	904531	904542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017592	TTTTCT	2	12	907449	907460	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017592	TCACTA	2	12	917107	917118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017592	TAAAAA	2	12	937358	937369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017592	TGTCAA	2	12	942976	942987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017592	AAGAAA	2	12	944281	944292	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017592	AATGGA	2	12	954916	954927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017592	CAAAAG	2	12	956950	956961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017592	TGTAAG	2	12	977746	977757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017592	TATGAT	2	12	979883	979894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017592	AGTTGA	2	12	1016413	1016424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017592	AGGAGC	2	12	1042168	1042179	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017592	ACAAGA	2	12	1044971	1044982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017592	TCTATC	2	12	1045599	1045610	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017592	AATTTT	2	12	1077936	1077947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017592	TTTTTG	2	12	1087754	1087765	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017592	GTTTGT	2	12	1096930	1096941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017592	TGAAAA	2	12	1112505	1112516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017592	GTTGAA	2	12	1118051	1118062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017592	CTGGTG	2	12	1150793	1150804	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017592	TAAAAA	2	12	1189979	1189990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017592	ATTATC	2	12	1201670	1201681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017592	TAGGTA	2	12	1222804	1222815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017592	TTGAAA	2	12	1233780	1233791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017592	AGCAAG	2	12	1234023	1234034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017592	TTTCAC	2	12	1234383	1234394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017592	CCCAAG	2	12	1247495	1247506	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017592	AGCAAC	2	12	1247567	1247578	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017592	GATGGT	2	12	1262535	1262546	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017592	TTTTAT	2	12	1274036	1274047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017592	TTTCCT	2	12	1277161	1277172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017592	TGTATT	2	12	1329523	1329534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017592	TGCTTC	2	12	1329966	1329977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017592	ACTAAA	2	12	1331289	1331300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017592	AAATTT	2	12	1346049	1346060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017592	TCAAGT	2	12	1346120	1346131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017592	CTTTTC	2	12	1346648	1346659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017592	CTTTCT	2	12	1442693	1442704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017592	ACTGGC	2	12	1456514	1456525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017592	ATGGTC	2	12	1469636	1469647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017592	CACTTC	2	12	1471396	1471407	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017592	TTAAAA	2	12	1504049	1504060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017592	CCTAAG	2	12	1539348	1539359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017592	AACTTG	2	12	1539471	1539482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017592	ATTTGA	2	12	1562377	1562388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017592	TAATCA	2	12	1570348	1570359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017592	CACTTC	2	12	1583951	1583962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017592	TTACAT	2	12	1588938	1588949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017592	AAAAAT	2	12	1601628	1601639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017592	TCTATT	2	12	1607048	1607059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017592	GAACAT	2	12	1623753	1623764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017592	CTTTCT	2	12	1642859	1642870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017592	TCATTA	2	12	1654192	1654203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017592	TAATCA	2	12	1672948	1672959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017592	TCAACT	2	12	1678772	1678783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017592	GAGATG	2	12	1678891	1678902	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017592	TATTAG	2	12	1699010	1699021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017592	CACTTC	2	12	1699041	1699052	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017592	TCCTTA	2	12	1702129	1702140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017592	CCAGAA	2	12	1730594	1730605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017592	AGGACA	2	12	1774675	1774686	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017592	AAAAAT	2	12	1778179	1778190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017592	TATTAG	2	12	1790400	1790411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017592	CACTTC	2	12	1790431	1790442	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017592	TCCTTA	2	12	1793519	1793530	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017592	ACAAGA	2	12	1802522	1802533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017592	TCTATC	2	12	1803169	1803180	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017592	ATGATT	2	12	1806514	1806525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017592	CCCGAA	2	12	1851433	1851444	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017592	TATTAG	2	12	1852307	1852318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017592	CACTTC	2	12	1852338	1852349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017592	TCCTTA	2	12	1855426	1855437	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017592	TAAATT	2	12	1931769	1931780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017592	TCCAAC	2	12	1937189	1937200	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017592	GATAAA	2	12	1975006	1975017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017592	AAAATC	2	12	1986961	1986972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017592	ACCTTG	2	12	1994516	1994527	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.