MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae OXC141

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017592	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	387756561
2	NC_017592	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	387756561
3	NC_017592	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	387756561
4	NC_017592	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	387756562
5	NC_017592	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	387756563
6	NC_017592	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017592	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	387756565
8	NC_017592	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	387756566
9	NC_017592	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	387756566
10	NC_017592	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	387756566
11	NC_017592	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	387756566
12	NC_017592	AAACG	2	10	7929	7938	60 %	0 %	20 %	20 %	387756566
13	NC_017592	TTGGT	2	10	8158	8167	0 %	60 %	40 %	0 %	387756566
14	NC_017592	CAATT	2	10	8227	8236	40 %	40 %	0 %	20 %	387756566
15	NC_017592	AGGAA	2	10	9243	9252	60 %	0 %	40 %	0 %	387756569
16	NC_017592	ATTGA	2	10	10661	10670	40 %	40 %	20 %	0 %	387756571
17	NC_017592	ATTCT	2	10	12794	12803	20 %	60 %	0 %	20 %	387756573
18	NC_017592	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017592	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017592	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017592	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017592	TTGAA	2	10	20064	20073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017592	ATGGT	2	10	22450	22459	20 %	40 %	40 %	0 %	387756576
24	NC_017592	CTTTT	2	10	23618	23627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017592	TAGAT	2	10	30898	30907	40 %	40 %	20 %	0 %	387756590
26	NC_017592	CTTAT	2	10	31406	31415	20 %	60 %	0 %	20 %	387756592
27	NC_017592	GAAGA	2	10	33279	33288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017592	CAGAA	2	10	34286	34295	60 %	0 %	20 %	20 %	387756597
29	NC_017592	TTTTG	2	10	34536	34545	0 %	80 %	20 %	0 %	387756598
30	NC_017592	GAATG	2	10	34625	34634	40 %	20 %	40 %	0 %	387756598
31	NC_017592	GAAAC	2	10	38320	38329	60 %	0 %	20 %	20 %	387756603
32	NC_017592	TCTAA	2	10	38663	38672	40 %	40 %	0 %	20 %	387756603
33	NC_017592	CTCTT	2	10	39284	39293	0 %	60 %	0 %	40 %	387756603
34	NC_017592	AGTTG	2	10	40108	40117	20 %	40 %	40 %	0 %	387756605
35	NC_017592	ACAAG	2	10	40486	40495	60 %	0 %	20 %	20 %	387756605
36	NC_017592	GGGTG	2	10	41696	41705	0 %	20 %	80 %	0 %	387756607
37	NC_017592	CCTAT	2	10	42017	42026	20 %	40 %	0 %	40 %	387756608
38	NC_017592	ATGAC	2	10	42743	42752	40 %	20 %	20 %	20 %	387756611
39	NC_017592	AGCTG	2	10	45831	45840	20 %	20 %	40 %	20 %	387756613
40	NC_017592	GGTCA	2	10	47640	47649	20 %	20 %	40 %	20 %	387756614
41	NC_017592	ATTTT	2	10	57712	57721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017592	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017592	AGCAG	2	10	65370	65379	40 %	0 %	40 %	20 %	387756628
44	NC_017592	TTGAT	2	10	72809	72818	20 %	60 %	20 %	0 %	387756634
45	NC_017592	CAGAT	2	10	75004	75013	40 %	20 %	20 %	20 %	387756636
46	NC_017592	TTTAC	2	10	75706	75715	20 %	60 %	0 %	20 %	387756636
47	NC_017592	AGAGG	2	10	76568	76577	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017592	GTGAC	2	10	79337	79346	20 %	20 %	40 %	20 %	387756639
49	NC_017592	GTGAT	2	10	80327	80336	20 %	40 %	40 %	0 %	387756639
50	NC_017592	TGGCT	2	10	83147	83156	0 %	40 %	40 %	20 %	387756640
51	NC_017592	AAATG	2	10	83753	83762	60 %	20 %	20 %	0 %	387756640
52	NC_017592	AGCTA	2	10	84647	84656	40 %	20 %	20 %	20 %	387756641
53	NC_017592	CCTTG	2	10	87537	87546	0 %	40 %	20 %	40 %	387756644
54	NC_017592	TCAAA	2	10	87731	87740	60 %	20 %	0 %	20 %	387756644
55	NC_017592	GCAAG	2	10	89400	89409	40 %	0 %	40 %	20 %	387756645
56	NC_017592	AGTGG	2	10	90098	90107	20 %	20 %	60 %	0 %	387756646
57	NC_017592	GGGTG	2	10	90136	90145	0 %	20 %	80 %	0 %	387756646
58	NC_017592	CTATT	2	10	91112	91121	20 %	60 %	0 %	20 %	387756647
59	NC_017592	GAAGC	2	10	91302	91311	40 %	0 %	40 %	20 %	387756647
60	NC_017592	GCTTG	2	10	91757	91766	0 %	40 %	40 %	20 %	387756648
61	NC_017592	GCTTT	2	10	93186	93195	0 %	60 %	20 %	20 %	387756649
62	NC_017592	TCTGG	2	10	93780	93789	0 %	40 %	40 %	20 %	387756649
63	NC_017592	AGCAT	2	10	94734	94743	40 %	20 %	20 %	20 %	387756649
64	NC_017592	TACCA	2	10	95432	95441	40 %	20 %	0 %	40 %	387756649
65	NC_017592	TTCCT	2	10	96449	96458	0 %	60 %	0 %	40 %	387756649
66	NC_017592	TTATT	2	10	97030	97039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017592	TTGGT	2	10	100405	100414	0 %	60 %	40 %	0 %	387756652
68	NC_017592	CTTCA	2	10	101460	101469	20 %	40 %	0 %	40 %	387756653
69	NC_017592	AATCA	2	10	101572	101581	60 %	20 %	0 %	20 %	387756654
70	NC_017592	ATTCA	2	10	102946	102955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017592	AGCTC	2	10	103790	103799	20 %	20 %	20 %	40 %	387756656
72	NC_017592	TTAAA	2	10	105393	105402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017592	TTATC	2	10	105467	105476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017592	GCTCC	2	10	108025	108034	0 %	20 %	20 %	60 %	387756661
75	NC_017592	GCTGT	2	10	108343	108352	0 %	40 %	40 %	20 %	387756661
76	NC_017592	TATCA	2	10	108667	108676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017592	TCTAT	2	10	109501	109510	20 %	60 %	0 %	20 %	387756662
78	NC_017592	AGAAA	2	10	110426	110435	80 %	0 %	20 %	0 %	387756662
79	NC_017592	GAAAG	2	10	110478	110487	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017592	TGACT	2	10	113472	113481	20 %	40 %	20 %	20 %	387756665
81	NC_017592	AGGGC	2	10	116907	116916	20 %	0 %	60 %	20 %	387756667
82	NC_017592	ATAAA	2	10	119203	119212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017592	TAACC	2	10	119301	119310	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017592	ATTCT	2	10	119476	119485	20 %	60 %	0 %	20 %	387756669
85	NC_017592	TTACT	2	10	123119	123128	20 %	60 %	0 %	20 %	387756672
86	NC_017592	TGGGA	2	10	123773	123782	20 %	20 %	60 %	0 %	387756672
87	NC_017592	TGCTT	2	10	124646	124655	0 %	60 %	20 %	20 %	387756673
88	NC_017592	TGGCT	2	10	124829	124838	0 %	40 %	40 %	20 %	387756673
89	NC_017592	AGATA	2	10	128901	128910	60 %	20 %	20 %	0 %	387756678
90	NC_017592	GTTTG	2	10	129068	129077	0 %	60 %	40 %	0 %	387756678
91	NC_017592	TATTT	2	10	131017	131026	20 %	80 %	0 %	0 %	387756680
92	NC_017592	AAAGC	2	10	133927	133936	60 %	0 %	20 %	20 %	387756682
93	NC_017592	GGCTT	2	10	135351	135360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017592	CACAA	2	10	135690	135699	60 %	0 %	0 %	40 %	387756684
95	NC_017592	GGAAT	2	10	138597	138606	40 %	20 %	40 %	0 %	387756687
96	NC_017592	AGGAT	2	10	139162	139171	40 %	20 %	40 %	0 %	387756688
97	NC_017592	CTTTG	2	10	140471	140480	0 %	60 %	20 %	20 %	387756688
98	NC_017592	GGCTT	2	10	140724	140733	0 %	40 %	40 %	20 %	387756688
99	NC_017592	TCTTT	2	10	143341	143350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017592	ACAGT	2	10	150297	150306	40 %	20 %	20 %	20 %	387756696
101	NC_017592	AATAA	2	10	151041	151050	80 %	20 %	0 %	0 %	387756697
102	NC_017592	GCTTT	2	10	153286	153295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017592	TATTG	2	10	153323	153332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017592	ATTTT	2	10	153421	153430	20 %	80 %	0 %	0 %	387756701
105	NC_017592	CAAAG	2	10	158672	158681	60 %	0 %	20 %	20 %	387756706
106	NC_017592	TAAAA	2	10	159148	159157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017592	TTCTA	2	10	159733	159742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017592	ACTAA	2	10	160676	160685	60 %	20 %	0 %	20 %	387756708
109	NC_017592	ATTAA	2	10	162804	162813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017592	CGTGG	2	10	163629	163638	0 %	20 %	60 %	20 %	387756709
111	NC_017592	GTGAA	2	10	164631	164640	40 %	20 %	40 %	0 %	387756710
112	NC_017592	AAGCA	2	10	168276	168285	60 %	0 %	20 %	20 %	387756712
113	NC_017592	GTTTG	2	10	169548	169557	0 %	60 %	40 %	0 %	387756714
114	NC_017592	ACATG	2	10	169681	169690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017592	GAAAA	2	10	170273	170282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017592	TTGGA	2	10	170558	170567	20 %	40 %	40 %	0 %	387756717
117	NC_017592	GTCTA	2	10	170689	170698	20 %	40 %	20 %	20 %	387756717
118	NC_017592	ATGTT	2	10	180649	180658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017592	ACAAA	2	10	181164	181173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017592	TTTTC	2	10	182576	182585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017592	GAAAT	2	10	183386	183395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017592	TTAGT	2	10	184257	184266	20 %	60 %	20 %	0 %	387756724
123	NC_017592	CTTGC	2	10	184613	184622	0 %	40 %	20 %	40 %	387756724
124	NC_017592	GGCCT	2	10	185567	185576	0 %	20 %	40 %	40 %	387756725
125	NC_017592	CTGTT	2	10	186135	186144	0 %	60 %	20 %	20 %	387756725
126	NC_017592	AGAAA	2	10	187671	187680	80 %	0 %	20 %	0 %	387756728
127	NC_017592	TATAC	2	10	189632	189641	40 %	40 %	0 %	20 %	387756729
128	NC_017592	AGATC	2	10	189937	189946	40 %	20 %	20 %	20 %	387756730
129	NC_017592	TGGTC	2	10	191025	191034	0 %	40 %	40 %	20 %	387756731
130	NC_017592	TTTGT	2	10	191946	191955	0 %	80 %	20 %	0 %	387756732
131	NC_017592	ACTAT	2	10	195952	195961	40 %	40 %	0 %	20 %	387756735
132	NC_017592	TGAAA	2	10	197353	197362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017592	TTGAG	2	10	198532	198541	20 %	40 %	40 %	0 %	387756738
134	NC_017592	ATTTC	2	10	198879	198888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017592	GCCTT	2	10	200506	200515	0 %	40 %	20 %	40 %	387756741
136	NC_017592	AAGTA	2	10	203288	203297	60 %	20 %	20 %	0 %	387756743
137	NC_017592	TTGAT	2	10	204447	204456	20 %	60 %	20 %	0 %	387756744
138	NC_017592	TCACT	2	10	204822	204831	20 %	40 %	0 %	40 %	387756745
139	NC_017592	ATTTT	2	10	205145	205154	20 %	80 %	0 %	0 %	387756745
140	NC_017592	TTAAG	2	10	205497	205506	40 %	40 %	20 %	0 %	387756745
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151	NC_017592	ATGAT	2	10	221353	221362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017592	GTAGA	2	10	221524	221533	40 %	20 %	40 %	0 %	387756762
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174	NC_017592	TGGAT	2	10	243951	243960	20 %	40 %	40 %	0 %	387756797
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262	NC_017592	ACTTC	2	10	346444	346453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_017592	ATACT	2	10	347193	347202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_017592	TGATG	2	10	349533	349542	20 %	40 %	40 %	0 %	387756883
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268	NC_017592	TTCTT	2	10	354995	355004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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