MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625544
2	NC_017591	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
3	NC_017591	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625549
4	NC_017591	TGCTTA	2	12	7703	7714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625549
5	NC_017591	GCTAAC	2	12	7944	7955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625549
6	NC_017591	TTGATT	2	12	8878	8889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625551
7	NC_017591	AGGTTG	2	12	26041	26052	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625562
8	NC_017591	CGATTG	2	12	32291	32302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625565
9	NC_017591	TTCCTT	2	12	35751	35762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625567
10	NC_017591	AGGATA	2	12	41293	41304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625573
11	NC_017591	TCAATC	2	12	42622	42633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625573
12	NC_017591	TTACTG	2	12	53005	53016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625580
13	NC_017591	GTTTCT	2	12	63306	63317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387625586
14	NC_017591	TTCCTT	2	12	64386	64397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625587
15	NC_017591	TTGCAG	2	12	68539	68550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625591
16	NC_017591	TCTTGC	2	12	70164	70175	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387625593
17	NC_017591	GACTTG	2	12	70568	70579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625593
18	NC_017591	GCTTGC	2	12	81924	81935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625603
19	NC_017591	TACAGG	2	12	84149	84160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387625606
20	NC_017591	AAAAAC	2	12	84250	84261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387625606
21	NC_017591	TTTTGA	2	12	91297	91308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625611
22	NC_017591	AAGCAG	2	12	91825	91836	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625611
23	NC_017591	AAAGGA	2	12	96686	96697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625617
24	NC_017591	TTATCT	2	12	108257	108268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387625624
25	NC_017591	TAACAA	2	12	110021	110032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387625625
26	NC_017591	CTCCAG	2	12	114094	114105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387625628
27	NC_017591	TCCAGC	2	12	114188	114199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387625628
28	NC_017591	TCAGGG	2	12	123611	123622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387625637
29	NC_017591	GAAGCA	2	12	134690	134701	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625643
30	NC_017591	GTTTTA	2	12	137840	137851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625646
31	NC_017591	TCAGGT	2	12	149459	149470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625658
32	NC_017591	ATTTTT	2	12	157809	157820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387625666
33	NC_017591	CATTTT	2	12	159942	159953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387625668
34	NC_017591	GATAAA	2	12	161090	161101	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625669
35	NC_017591	AAATTT	2	12	161270	161281	50 %	50 %	0 %	0 %	387625669
36	NC_017591	ATTGAG	2	12	164144	164155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625671
37	NC_017591	TTCGGA	2	12	164274	164285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625671
38	NC_017591	AACAAG	2	12	167897	167908	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387625673
39	NC_017591	GGATTG	2	12	169626	169637	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625675
40	NC_017591	TGCACT	2	12	173396	173407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625680
41	NC_017591	CAATAT	2	12	174876	174887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387625681
42	NC_017591	ACTTGG	2	12	176464	176475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625682
43	NC_017591	ACCACG	2	12	182247	182258	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387625689
44	NC_017591	GCAGAC	2	12	183008	183019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625690
45	NC_017591	ACAAGA	2	12	190482	190493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387625695
46	NC_017591	TAAAGG	2	12	193373	193384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625700
47	NC_017591	GCAATC	2	12	195961	195972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625705
48	NC_017591	ACATCA	2	12	196508	196519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387625706
49	NC_017591	TAAAGG	2	12	200759	200770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625715
50	NC_017591	AAATTA	2	12	201798	201809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625718
51	NC_017591	ACTTGG	2	12	201865	201876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625718
52	NC_017591	TTGAAG	2	12	204806	204817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625722
53	NC_017591	GTAAAG	2	12	205489	205500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625723
54	NC_017591	AAACTC	2	12	206864	206875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387625725
55	NC_017591	AGATAA	2	12	210973	210984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625730
56	NC_017591	TATCTG	2	12	218418	218429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625738
57	NC_017591	CCAATC	2	12	225518	225529	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387625742
58	NC_017591	CGAAAT	2	12	226549	226560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387625742
59	NC_017591	TGTCAA	2	12	235134	235145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625750
60	NC_017591	GATGGT	2	12	235893	235904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625751
61	NC_017591	TGCCTT	2	12	237544	237555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387625752
62	NC_017591	GCTATG	2	12	237653	237664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625752
63	NC_017591	GTTGCT	2	12	241983	241994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387625754
64	NC_017591	GCAAGA	2	12	247074	247085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625758
65	NC_017591	ATTCGA	2	12	248472	248483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625758
66	NC_017591	GTCAGT	2	12	251877	251888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625759
67	NC_017591	CGATAC	2	12	262156	262167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625768
68	NC_017591	TAGATA	2	12	280704	280715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387625784
69	NC_017591	GATAAA	2	12	286053	286064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625787
70	NC_017591	AAAATG	2	12	289998	290009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625789
71	NC_017591	AGAGGA	2	12	292571	292582	50 %	0 %	50 %	0 %	387625792
72	NC_017591	ATGGAG	2	12	293004	293015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387625793
73	NC_017591	CCATAG	2	12	297334	297345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625798
74	NC_017591	TTGATT	2	12	297777	297788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625798
75	NC_017591	AGGAGT	2	12	299523	299534	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387625800
76	NC_017591	AGCGTG	2	12	301157	301168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387625804
77	NC_017591	AACTGT	2	12	303701	303712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625806
78	NC_017591	TCATGC	2	12	313358	313369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625812
79	NC_017591	CAACCT	2	12	322516	322527	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387625817
80	NC_017591	GACCGT	2	12	328491	328502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387625820
81	NC_017591	AAAATA	2	12	332979	332990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387625826
82	NC_017591	GGTGAT	2	12	333473	333484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625826
83	NC_017591	TAGCAG	2	12	337857	337868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387625830
84	NC_017591	AGTTGA	2	12	340676	340687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625831
85	NC_017591	GCTAAA	2	12	347403	347414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387625835
86	NC_017591	GAAAAA	2	12	348714	348725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387625836
87	NC_017591	AGCTAT	2	12	350583	350594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625836
88	NC_017591	AGACAA	2	12	353378	353389	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387625836
89	NC_017591	TTTGAT	2	12	359350	359361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625841
90	NC_017591	GCCAAA	2	12	360148	360159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387625841
91	NC_017591	TCAAGT	2	12	360265	360276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625841
92	NC_017591	TCAAGT	2	12	360289	360300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625841
93	NC_017591	TTCACG	2	12	360513	360524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625841
94	NC_017591	GTGCCA	2	12	362026	362037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387625842
95	NC_017591	GATTTT	2	12	365047	365058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625845
96	NC_017591	TGGAGG	2	12	367377	367388	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387625847
97	NC_017591	CATTTA	2	12	367943	367954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387625847
98	NC_017591	AAGTAG	2	12	369837	369848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625849
99	NC_017591	ATGTCA	2	12	370492	370503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625850
100	NC_017591	TGTCAT	2	12	373003	373014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625853
101	NC_017591	ACTTTT	2	12	378917	378928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387625856
102	NC_017591	AGTATG	2	12	380951	380962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625857
103	NC_017591	TGCTAA	2	12	381641	381652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625857
104	NC_017591	TGAAAT	2	12	382460	382471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387625859
105	NC_017591	CGAACG	2	12	384638	384649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625861
106	NC_017591	ACTTGG	2	12	384773	384784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625861
107	NC_017591	GTCTGT	2	12	385565	385576	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387625862
108	NC_017591	TACCAG	2	12	386833	386844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625862
109	NC_017591	GTGTGA	2	12	389513	389524	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625864
110	NC_017591	AAGTGA	2	12	392299	392310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625867
111	NC_017591	GCCAAG	2	12	392369	392380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625867
112	NC_017591	TGGATG	2	12	393527	393538	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625868
113	NC_017591	TGCAGC	2	12	394096	394107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387625868
114	NC_017591	TCTATC	2	12	395936	395947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387625870
115	NC_017591	GGATGA	2	12	400139	400150	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387625874
116	NC_017591	TGTTGG	2	12	400328	400339	0 %	50 %	50 %	0 %	387625874
117	NC_017591	TTTTGG	2	12	406466	406477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625881
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226	NC_017591	AGGAAG	2	12	730682	730693	50 %	0 %	50 %	0 %	387626161
227	NC_017591	TTGGAA	2	12	735174	735185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387626164
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343	NC_017591	TGAAGG	2	12	1070331	1070342	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387626454
344	NC_017591	AAGCAT	2	12	1071249	1071260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387626455
345	NC_017591	TATCTG	2	12	1072531	1072542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387626456
346	NC_017591	TAAAAC	2	12	1075880	1075891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387626462
347	NC_017591	CTAGAG	2	12	1077567	1077578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387626464
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350	NC_017591	GAAAGT	2	12	1083288	1083299	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387626468
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353	NC_017591	GGAAGA	2	12	1088723	1088734	50 %	0 %	50 %	0 %	387626470
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444	NC_017591	TTTACG	2	12	1318318	1318329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387626669
445	NC_017591	CTTCAG	2	12	1318993	1319004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387626670
446	NC_017591	TGATTT	2	12	1319470	1319481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387626671
447	NC_017591	GGCATG	2	12	1325633	1325644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387626674
448	NC_017591	TAATTT	2	12	1327015	1327026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387626676
449	NC_017591	CACCAG	2	12	1331704	1331715	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387626678
450	NC_017591	AACGAA	2	12	1333603	1333614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387626679
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452	NC_017591	AATTGC	2	12	1337424	1337435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387626681
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