MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 6312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017591	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	387625544
3	NC_017591	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	387625544
4	NC_017591	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	387625544
5	NC_017591	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	387625544
6	NC_017591	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	387625544
7	NC_017591	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	387625544
8	NC_017591	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017591	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	387625545
10	NC_017591	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	387625545
11	NC_017591	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	387625545
12	NC_017591	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	387625545
13	NC_017591	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017591	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	387625547
15	NC_017591	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	387625547
16	NC_017591	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	387625547
17	NC_017591	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	387625547
18	NC_017591	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	387625547
19	NC_017591	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	387625548
20	NC_017591	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	387625548
21	NC_017591	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	387625548
22	NC_017591	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	387625549
23	NC_017591	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	387625549
24	NC_017591	TTTA	2	8	7622	7629	25 %	75 %	0 %	0 %	387625549
25	NC_017591	GTCG	2	8	7683	7690	0 %	25 %	50 %	25 %	387625549
26	NC_017591	ATCA	2	8	7736	7743	50 %	25 %	0 %	25 %	387625549
27	NC_017591	GAAA	2	8	8205	8212	75 %	0 %	25 %	0 %	387625549
28	NC_017591	AAGA	2	8	8361	8368	75 %	0 %	25 %	0 %	387625549
29	NC_017591	GAAA	2	8	9344	9351	75 %	0 %	25 %	0 %	387625553
30	NC_017591	TATT	2	8	9380	9387	25 %	75 %	0 %	0 %	387625553
31	NC_017591	TAAA	2	8	9511	9518	75 %	25 %	0 %	0 %	387625553
32	NC_017591	ATCA	2	8	9586	9593	50 %	25 %	0 %	25 %	387625553
33	NC_017591	GAAG	2	8	9729	9736	50 %	0 %	50 %	0 %	387625553
34	NC_017591	TTCT	2	8	9848	9855	0 %	75 %	0 %	25 %	387625553
35	NC_017591	ATCA	2	8	9897	9904	50 %	25 %	0 %	25 %	387625553
36	NC_017591	CAGC	2	8	9922	9929	25 %	0 %	25 %	50 %	387625553
37	NC_017591	TTCT	2	8	10444	10451	0 %	75 %	0 %	25 %	387625553
38	NC_017591	CTAT	2	8	10936	10943	25 %	50 %	0 %	25 %	387625554
39	NC_017591	CTTA	2	8	11091	11098	25 %	50 %	0 %	25 %	387625554
40	NC_017591	ATTT	2	8	11490	11497	25 %	75 %	0 %	0 %	387625554
41	NC_017591	AATT	2	8	11523	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	387625554
42	NC_017591	TTTA	2	8	11629	11636	25 %	75 %	0 %	0 %	387625554
43	NC_017591	AAAG	2	8	12146	12153	75 %	0 %	25 %	0 %	387625555
44	NC_017591	AGAA	2	8	12342	12349	75 %	0 %	25 %	0 %	387625555
45	NC_017591	TTAA	2	8	12380	12387	50 %	50 %	0 %	0 %	387625556
46	NC_017591	ACCA	2	8	12537	12544	50 %	0 %	0 %	50 %	387625556
47	NC_017591	TGCT	2	8	13062	13069	0 %	50 %	25 %	25 %	387625556
48	NC_017591	GATG	2	8	13306	13313	25 %	25 %	50 %	0 %	387625556
49	NC_017591	TTGG	2	8	13415	13422	0 %	50 %	50 %	0 %	387625556
50	NC_017591	TGAA	2	8	13557	13564	50 %	25 %	25 %	0 %	387625556
51	NC_017591	AAGA	2	8	13655	13662	75 %	0 %	25 %	0 %	387625556
52	NC_017591	TCTA	2	8	13831	13838	25 %	50 %	0 %	25 %	387625556
53	NC_017591	TGGC	2	8	13860	13867	0 %	25 %	50 %	25 %	387625556
54	NC_017591	AACA	2	8	14064	14071	75 %	0 %	0 %	25 %	387625556
55	NC_017591	GTTC	2	8	14093	14100	0 %	50 %	25 %	25 %	387625556
56	NC_017591	ATGA	2	8	14300	14307	50 %	25 %	25 %	0 %	387625556
57	NC_017591	AAAC	2	8	14788	14795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017591	TGAG	2	8	15317	15324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017591	GCTT	2	8	15414	15421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017591	CCTG	2	8	15462	15469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017591	GTGA	2	8	15742	15749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017591	AGCG	2	8	15913	15920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017591	AGCC	2	8	16794	16801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017591	GTAA	2	8	17216	17223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017591	GCGA	2	8	17372	17379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017591	ATTC	2	8	18238	18245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017591	CTAA	2	8	18592	18599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017591	GTCT	2	8	18617	18624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017591	TAGG	2	8	19248	19255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017591	CTTT	2	8	21342	21349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017591	ATGT	2	8	22778	22785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017591	GATA	2	8	23419	23426	50 %	25 %	25 %	0 %	387625558
73	NC_017591	CAAG	2	8	23583	23590	50 %	0 %	25 %	25 %	387625558
74	NC_017591	GGTT	2	8	23738	23745	0 %	50 %	50 %	0 %	387625558
75	NC_017591	CTTT	2	8	23795	23802	0 %	75 %	0 %	25 %	387625558
76	NC_017591	CTAT	2	8	23922	23929	25 %	50 %	0 %	25 %	387625558
77	NC_017591	TTGG	2	8	24026	24033	0 %	50 %	50 %	0 %	387625558
78	NC_017591	AACA	2	8	24072	24079	75 %	0 %	0 %	25 %	387625558
79	NC_017591	GAGG	2	8	24342	24349	25 %	0 %	75 %	0 %	387625559
80	NC_017591	AGCG	2	8	24461	24468	25 %	0 %	50 %	25 %	387625559
81	NC_017591	ATGC	2	8	24472	24479	25 %	25 %	25 %	25 %	387625559
82	NC_017591	TGAG	2	8	24509	24516	25 %	25 %	50 %	0 %	387625559
83	NC_017591	AATA	2	8	24909	24916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017591	TTAA	2	8	25189	25196	50 %	50 %	0 %	0 %	387625560
85	NC_017591	ATGT	2	8	25795	25802	25 %	50 %	25 %	0 %	387625561
86	NC_017591	GATT	2	8	25879	25886	25 %	50 %	25 %	0 %	387625561
87	NC_017591	CCAG	2	8	26420	26427	25 %	0 %	25 %	50 %	387625562
88	NC_017591	TCCA	2	8	26445	26452	25 %	25 %	0 %	50 %	387625562
89	NC_017591	TTCG	2	8	27574	27581	0 %	50 %	25 %	25 %	387625563
90	NC_017591	AGAA	2	8	27878	27885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017591	ACGG	2	8	27966	27973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017591	GGGA	2	8	28115	28122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017591	TTGA	2	8	28762	28769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017591	TGGT	2	8	29335	29342	0 %	50 %	50 %	0 %	387625564
95	NC_017591	TTGA	2	8	29514	29521	25 %	50 %	25 %	0 %	387625564
96	NC_017591	TGAT	2	8	29527	29534	25 %	50 %	25 %	0 %	387625564
97	NC_017591	TTCT	2	8	29617	29624	0 %	75 %	0 %	25 %	387625564
98	NC_017591	ATCT	2	8	29685	29692	25 %	50 %	0 %	25 %	387625564
99	NC_017591	TGAT	2	8	29707	29714	25 %	50 %	25 %	0 %	387625564
100	NC_017591	CGTA	2	8	29759	29766	25 %	25 %	25 %	25 %	387625564
101	NC_017591	AATA	2	8	29865	29872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017591	GCTG	2	8	30403	30410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017591	CTTC	2	8	30477	30484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017591	TGAT	2	8	30995	31002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017591	TGGC	2	8	31158	31165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017591	AATT	2	8	31333	31340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017591	CTAT	2	8	31437	31444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017591	TTGA	2	8	31546	31553	25 %	50 %	25 %	0 %	387625565
109	NC_017591	TTGG	2	8	32524	32531	0 %	50 %	50 %	0 %	387625565
110	NC_017591	ACTT	2	8	32779	32786	25 %	50 %	0 %	25 %	387625565
111	NC_017591	AAGA	2	8	33007	33014	75 %	0 %	25 %	0 %	387625565
112	NC_017591	CTTG	2	8	33018	33025	0 %	50 %	25 %	25 %	387625565
113	NC_017591	GCTG	2	8	33081	33088	0 %	25 %	50 %	25 %	387625565
114	NC_017591	AAAC	2	8	34072	34079	75 %	0 %	0 %	25 %	387625565
115	NC_017591	TAAA	2	8	34152	34159	75 %	25 %	0 %	0 %	387625565
116	NC_017591	TTGA	2	8	34663	34670	25 %	50 %	25 %	0 %	387625566
117	NC_017591	CCAA	2	8	35824	35831	50 %	0 %	0 %	50 %	387625567
118	NC_017591	CAAG	2	8	35969	35976	50 %	0 %	25 %	25 %	387625567
119	NC_017591	AGGC	2	8	36145	36152	25 %	0 %	50 %	25 %	387625567
120	NC_017591	AGCG	2	8	36494	36501	25 %	0 %	50 %	25 %	387625568
121	NC_017591	CAGC	2	8	37442	37449	25 %	0 %	25 %	50 %	387625568
122	NC_017591	TTTC	2	8	37996	38003	0 %	75 %	0 %	25 %	387625569
123	NC_017591	GCCT	2	8	38013	38020	0 %	25 %	25 %	50 %	387625569
124	NC_017591	TCAA	2	8	38086	38093	50 %	25 %	0 %	25 %	387625569
125	NC_017591	CAAG	2	8	38147	38154	50 %	0 %	25 %	25 %	387625569
126	NC_017591	TCAA	2	8	38334	38341	50 %	25 %	0 %	25 %	387625570
127	NC_017591	GATT	2	8	38452	38459	25 %	50 %	25 %	0 %	387625570
128	NC_017591	GAAT	2	8	39792	39799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017591	TGCT	2	8	40087	40094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017591	ATTT	2	8	40617	40624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017591	GGGA	2	8	40734	40741	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017591	GAAG	2	8	40757	40764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017591	TGAC	2	8	40871	40878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017591	ATGG	2	8	41121	41128	25 %	25 %	50 %	0 %	387625573
135	NC_017591	AAGG	2	8	41253	41260	50 %	0 %	50 %	0 %	387625573
136	NC_017591	CTTG	2	8	41672	41679	0 %	50 %	25 %	25 %	387625573
137	NC_017591	ATGG	2	8	42228	42235	25 %	25 %	50 %	0 %	387625573
138	NC_017591	CAGA	2	8	42819	42826	50 %	0 %	25 %	25 %	387625573
139	NC_017591	TTGC	2	8	43095	43102	0 %	50 %	25 %	25 %	387625573
140	NC_017591	CAGT	2	8	43460	43467	25 %	25 %	25 %	25 %	387625574
141	NC_017591	GCAG	2	8	43596	43603	25 %	0 %	50 %	25 %	387625574
142	NC_017591	TATT	2	8	44591	44598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017591	GAAG	2	8	45120	45127	50 %	0 %	50 %	0 %	387625575
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