MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 27650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017591	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017591	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017591	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017591	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017591	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387625544
7	NC_017591	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
8	NC_017591	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625544
9	NC_017591	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625544
10	NC_017591	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625544
11	NC_017591	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
12	NC_017591	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625544
13	NC_017591	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625544
14	NC_017591	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625544
15	NC_017591	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625544
16	NC_017591	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625544
17	NC_017591	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625544
18	NC_017591	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625544
19	NC_017591	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017591	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017591	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625545
22	NC_017591	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625545
23	NC_017591	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
24	NC_017591	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
25	NC_017591	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625545
26	NC_017591	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
27	NC_017591	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625545
28	NC_017591	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625545
29	NC_017591	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
30	NC_017591	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625545
31	NC_017591	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625545
32	NC_017591	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625545
33	NC_017591	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625545
34	NC_017591	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625545
35	NC_017591	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017591	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625546
37	NC_017591	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625546
38	NC_017591	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625546
39	NC_017591	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625546
40	NC_017591	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
41	NC_017591	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
42	NC_017591	CGA	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
43	NC_017591	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387625547
44	NC_017591	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
45	NC_017591	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625547
46	NC_017591	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
47	NC_017591	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
48	NC_017591	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
49	NC_017591	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
50	NC_017591	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625547
51	NC_017591	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
52	NC_017591	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387625547
53	NC_017591	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625547
54	NC_017591	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625547
55	NC_017591	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
56	NC_017591	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625547
57	NC_017591	CAT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625547
58	NC_017591	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017591	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625548
60	NC_017591	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625548
61	NC_017591	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
62	NC_017591	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625548
63	NC_017591	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625548
64	NC_017591	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625548
65	NC_017591	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625548
66	NC_017591	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
67	NC_017591	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
68	NC_017591	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625549
69	NC_017591	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
70	NC_017591	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
71	NC_017591	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387625549
72	NC_017591	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625549
73	NC_017591	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
74	NC_017591	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625549
75	NC_017591	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
76	NC_017591	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
77	NC_017591	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
78	NC_017591	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
79	NC_017591	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
80	NC_017591	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
81	NC_017591	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
82	NC_017591	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387625549
83	NC_017591	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625549
84	NC_017591	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387625549
85	NC_017591	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625549
86	NC_017591	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625549
87	NC_017591	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
88	NC_017591	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
89	NC_017591	TGA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
90	NC_017591	GAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
91	NC_017591	GTA	2	6	6796	6801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
92	NC_017591	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625549
93	NC_017591	TGT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625549
94	NC_017591	TGA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
95	NC_017591	TGA	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
96	NC_017591	GAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625549
97	NC_017591	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387625549
98	NC_017591	TAT	2	6	7413	7418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
99	NC_017591	ACA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387625549
100	NC_017591	GAC	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625549
101	NC_017591	TAT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
102	NC_017591	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
103	NC_017591	GTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625549
104	NC_017591	ATA	2	6	8215	8220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625549
105	NC_017591	ATT	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
106	NC_017591	CTG	2	6	8388	8393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625549
107	NC_017591	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625549
108	NC_017591	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017591	AGA	2	6	8467	8472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017591	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017591	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017591	CGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625550
113	NC_017591	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625550
114	NC_017591	GCA	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625550
115	NC_017591	AGA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625550
116	NC_017591	AAT	2	6	8791	8796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625551
117	NC_017591	CGT	2	6	8821	8826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625551
118	NC_017591	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625551
119	NC_017591	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625551
120	NC_017591	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625551
121	NC_017591	TGC	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625551
122	NC_017591	TAT	2	6	9079	9084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625551
123	NC_017591	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625552
124	NC_017591	GAA	2	6	9197	9202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625552
125	NC_017591	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625552
126	NC_017591	AAG	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625552
127	NC_017591	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387625553
128	NC_017591	TTG	2	6	9276	9281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387625553
129	NC_017591	GTC	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625553
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131	NC_017591	TAG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625553
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262	NC_017591	CGT	2	6	19721	19726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017591	AGT	2	6	20179	20184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017591	GTA	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017591	ATG	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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