MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 5047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017591	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017591	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017591	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017591	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017591	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017591	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017591	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017591	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017591	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017591	AGA	2	6	8467	8472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017591	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017591	TAA	2	6	8500	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017591	GAA	2	6	14456	14461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017591	AAG	2	6	14532	14537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017591	TAG	2	6	14563	14568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017591	AGA	2	6	14569	14574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017591	GAA	2	6	14696	14701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017591	GAT	2	6	14747	14752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017591	TAT	2	6	14753	14758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017591	AAG	2	6	14811	14816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017591	AGT	2	6	14953	14958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017591	AAC	2	6	15002	15007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017591	CGG	2	6	15048	15053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017591	TGA	2	6	15106	15111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017591	ACA	2	6	15258	15263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017591	GTA	2	6	15270	15275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017591	GGC	2	6	15372	15377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017591	AGG	2	6	15407	15412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017591	TGG	2	6	15591	15596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017591	CGA	2	6	15615	15620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017591	GCA	2	6	15689	15694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017591	CGC	2	6	15736	15741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017591	TGT	2	6	15775	15780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017591	AGA	2	6	15784	15789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017591	CAG	2	6	15858	15863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017591	TAG	2	6	15965	15970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017591	GGA	2	6	16048	16053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017591	GAA	2	6	16312	16317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017591	GGT	2	6	16386	16391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017591	GTC	2	6	16400	16405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017591	CAT	2	6	16468	16473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017591	TAA	2	6	16503	16508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017591	GGA	2	6	16512	16517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017591	ATC	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017591	CGC	2	6	16702	16707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017591	CAC	2	6	16747	16752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017591	GAT	2	6	16817	16822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017591	CCT	2	6	16873	16878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017591	AGG	2	6	16972	16977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017591	GTA	2	6	17087	17092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017591	TAA	2	6	17094	17099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017591	CGA	2	6	17175	17180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017591	ACG	2	6	17193	17198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017591	GAT	2	6	17226	17231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017591	GAG	2	6	17296	17301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017591	TAG	2	6	17364	17369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017591	AGA	2	6	17451	17456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017591	CGG	2	6	17535	17540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017591	GGA	2	6	17567	17572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017591	ACA	2	6	17685	17690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017591	ATG	2	6	17752	17757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017591	GGA	2	6	17885	17890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017591	ACC	2	6	18151	18156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017591	AAT	2	6	18171	18176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017591	AGC	2	6	18231	18236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017591	GAG	2	6	18381	18386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017591	ACA	2	6	18537	18542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017591	TAG	2	6	18694	18699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017591	GAT	2	6	18941	18946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017591	CGG	2	6	19032	19037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017591	TAC	2	6	19302	19307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017591	CCT	2	6	19390	19395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017591	GGT	2	6	19526	19531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017591	TCG	2	6	19641	19646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017591	CGT	2	6	19721	19726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017591	AGT	2	6	20179	20184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017591	GTA	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017591	ATG	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017591	TAA	3	9	20340	20348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017591	GTA	2	6	20464	20469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017591	ACC	2	6	20554	20559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017591	CTA	2	6	20730	20735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017591	TGA	2	6	20811	20816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017591	TAA	2	6	20873	20878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017591	GAA	2	6	20894	20899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017591	TTA	3	9	21041	21049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017591	GAG	2	6	21097	21102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017591	TCC	2	6	21126	21131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017591	GAA	2	6	21306	21311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017591	TGA	2	6	21400	21405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017591	ATT	2	6	21407	21412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017591	GTG	2	6	21541	21546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017591	TTA	2	6	21590	21595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017591	TTG	2	6	21655	21660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017591	GAT	2	6	21708	21713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017591	ATT	2	6	21878	21883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017591	TGA	2	6	21921	21926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017591	TGA	2	6	21979	21984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017591	TGA	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017591	TTC	2	6	22002	22007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017591	AAG	2	6	22073	22078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017591	ATA	2	6	22119	22124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017591	TTG	2	6	22255	22260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017591	ATA	2	6	22636	22641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017591	TCT	2	6	22708	22713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017591	TAA	2	6	22738	22743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017591	AAG	2	6	24158	24163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017591	CCT	2	6	24165	24170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017591	TTG	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017591	ATA	2	6	24208	24213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017591	ATA	3	9	24269	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017591	ATA	2	6	24805	24810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017591	GGA	2	6	24848	24853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017591	CAG	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017591	AAT	2	6	24923	24928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017591	ATA	2	6	24941	24946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017591	TCT	2	6	26025	26030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017591	AGG	2	6	27358	27363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017591	GAA	2	6	27893	27898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017591	CTA	2	6	27959	27964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017591	AAG	2	6	28089	28094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017591	AGA	2	6	28244	28249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017591	ATT	2	6	28259	28264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017591	ATC	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017591	GTA	2	6	28476	28481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017591	CTT	2	6	28571	28576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017591	TTG	2	6	28675	28680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017591	TGA	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017591	ATG	2	6	28723	28728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017591	CTT	2	6	28750	28755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017591	GGA	2	6	28841	28846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017591	GAT	2	6	29833	29838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017591	TAG	2	6	29875	29880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017591	ATA	2	6	29917	29922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017591	AGA	2	6	29928	29933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017591	TCA	2	6	29948	29953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017591	CAT	2	6	29968	29973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017591	TAG	2	6	30021	30026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017591	TTC	2	6	30080	30085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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