MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 1514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017589	GACCA	2	10	2481	2490	40 %	0 %	20 %	40 %	410683949
2	NC_017589	GTCCA	2	10	6710	6719	20 %	20 %	20 %	40 %	410683954
3	NC_017589	TGTGT	2	10	6784	6793	0 %	60 %	40 %	0 %	410683954
4	NC_017589	GACCT	2	10	9429	9438	20 %	20 %	20 %	40 %	410683956
5	NC_017589	CGCGC	2	10	10071	10080	0 %	0 %	40 %	60 %	410683956
6	NC_017589	TGCGG	2	10	10577	10586	0 %	20 %	60 %	20 %	410683956
7	NC_017589	ATCGA	2	10	11692	11701	40 %	20 %	20 %	20 %	410683957
8	NC_017589	CGGCA	2	10	12253	12262	20 %	0 %	40 %	40 %	410683957
9	NC_017589	CCGCA	2	10	12492	12501	20 %	0 %	20 %	60 %	410683958
10	NC_017589	GCCGG	2	10	12774	12783	0 %	0 %	60 %	40 %	410683958
11	NC_017589	GCCAG	2	10	12983	12992	20 %	0 %	40 %	40 %	410683958
12	NC_017589	CCGGC	2	10	13642	13651	0 %	0 %	40 %	60 %	410683959
13	NC_017589	CGATG	2	10	14609	14618	20 %	20 %	40 %	20 %	410683960
14	NC_017589	GCAGC	2	10	15584	15593	20 %	0 %	40 %	40 %	410683960
15	NC_017589	GATGC	2	10	15618	15627	20 %	20 %	40 %	20 %	410683960
16	NC_017589	AATGG	2	10	19121	19130	40 %	20 %	40 %	0 %	410683963
17	NC_017589	GTGCG	2	10	20998	21007	0 %	20 %	60 %	20 %	410683965
18	NC_017589	CGGCG	2	10	22385	22394	0 %	0 %	60 %	40 %	410683966
19	NC_017589	GGTGC	2	10	25097	25106	0 %	20 %	60 %	20 %	410683969
20	NC_017589	CCAGG	2	10	27883	27892	20 %	0 %	40 %	40 %	410683972
21	NC_017589	GTGCT	2	10	29416	29425	0 %	40 %	40 %	20 %	410683974
22	NC_017589	CTCGC	2	10	32055	32064	0 %	20 %	20 %	60 %	410683975
23	NC_017589	TGTCG	2	10	33809	33818	0 %	40 %	40 %	20 %	410683976
24	NC_017589	CGGCG	2	10	39558	39567	0 %	0 %	60 %	40 %	410683982
25	NC_017589	TCGCG	2	10	39569	39578	0 %	20 %	40 %	40 %	410683982
26	NC_017589	GCGCT	2	10	39593	39602	0 %	20 %	40 %	40 %	410683982
27	NC_017589	CGTGG	2	10	40200	40209	0 %	20 %	60 %	20 %	410683982
28	NC_017589	GGCGC	2	10	40805	40814	0 %	0 %	60 %	40 %	410683983
29	NC_017589	GGGCT	2	10	42030	42039	0 %	20 %	60 %	20 %	410683985
30	NC_017589	GCACG	2	10	42056	42065	20 %	0 %	40 %	40 %	410683985
31	NC_017589	CCGCG	2	10	42650	42659	0 %	0 %	40 %	60 %	410683985
32	NC_017589	TCGTC	2	10	44274	44283	0 %	40 %	20 %	40 %	410683986
33	NC_017589	TCGCC	2	10	44295	44304	0 %	20 %	20 %	60 %	410683986
34	NC_017589	CGAGG	2	10	46075	46084	20 %	0 %	60 %	20 %	410683989
35	NC_017589	CGATG	2	10	49090	49099	20 %	20 %	40 %	20 %	410683993
36	NC_017589	GATTC	2	10	49423	49432	20 %	40 %	20 %	20 %	410683993
37	NC_017589	CCTCG	2	10	50806	50815	0 %	20 %	20 %	60 %	410683995
38	NC_017589	TCATC	2	10	51451	51460	20 %	40 %	0 %	40 %	410683995
39	NC_017589	TGGCG	2	10	52055	52064	0 %	20 %	60 %	20 %	410683995
40	NC_017589	GAAAA	2	10	52961	52970	80 %	0 %	20 %	0 %	410683995
41	NC_017589	TGGGT	2	10	54709	54718	0 %	40 %	60 %	0 %	410683996
42	NC_017589	TGCTT	2	10	55384	55393	0 %	60 %	20 %	20 %	410683997
43	NC_017589	TGCCG	2	10	65341	65350	0 %	20 %	40 %	40 %	410684010
44	NC_017589	TGGCG	2	10	67003	67012	0 %	20 %	60 %	20 %	410684013
45	NC_017589	CGGCG	2	10	71308	71317	0 %	0 %	60 %	40 %	410684015
46	NC_017589	TTCCA	2	10	71517	71526	20 %	40 %	0 %	40 %	410684015
47	NC_017589	TGGCC	2	10	71992	72001	0 %	20 %	40 %	40 %	410684015
48	NC_017589	CGGCG	2	10	72032	72041	0 %	0 %	60 %	40 %	410684015
49	NC_017589	CCGGC	2	10	73836	73845	0 %	0 %	40 %	60 %	410684016
50	NC_017589	ACCGC	2	10	74015	74024	20 %	0 %	20 %	60 %	410684016
51	NC_017589	GCCGC	2	10	74088	74097	0 %	0 %	40 %	60 %	410684016
52	NC_017589	CGGCG	2	10	74415	74424	0 %	0 %	60 %	40 %	410684016
53	NC_017589	GCGCG	2	10	75903	75912	0 %	0 %	60 %	40 %	410684017
54	NC_017589	TCCAG	2	10	76738	76747	20 %	20 %	20 %	40 %	410684018
55	NC_017589	GCGCC	2	10	78500	78509	0 %	0 %	40 %	60 %	410684019
56	NC_017589	GCCGT	2	10	78735	78744	0 %	20 %	40 %	40 %	410684020
57	NC_017589	GCGCG	2	10	79992	80001	0 %	0 %	60 %	40 %	410684021
58	NC_017589	CGGCG	2	10	80933	80942	0 %	0 %	60 %	40 %	410684022
59	NC_017589	CGGCG	2	10	82580	82589	0 %	0 %	60 %	40 %	410684022
60	NC_017589	GCGCA	2	10	89566	89575	20 %	0 %	40 %	40 %	410684028
61	NC_017589	GCACC	2	10	90750	90759	20 %	0 %	20 %	60 %	410684031
62	NC_017589	CGCTG	2	10	92354	92363	0 %	20 %	40 %	40 %	410684032
63	NC_017589	ATCGC	2	10	93832	93841	20 %	20 %	20 %	40 %	410684032
64	NC_017589	TCCGG	2	10	94244	94253	0 %	20 %	40 %	40 %	410684033
65	NC_017589	GCATC	2	10	94806	94815	20 %	20 %	20 %	40 %	410684033
66	NC_017589	CCGGC	2	10	98016	98025	0 %	0 %	40 %	60 %	410684035
67	NC_017589	CGCGC	2	10	98365	98374	0 %	0 %	40 %	60 %	410684035
68	NC_017589	GCGAC	2	10	99820	99829	20 %	0 %	40 %	40 %	410684037
69	NC_017589	CTTTG	2	10	102727	102736	0 %	60 %	20 %	20 %	410684040
70	NC_017589	ACGGC	2	10	103787	103796	20 %	0 %	40 %	40 %	410684041
71	NC_017589	CCTGG	2	10	104793	104802	0 %	20 %	40 %	40 %	410684042
72	NC_017589	GCGCC	2	10	104927	104936	0 %	0 %	40 %	60 %	410684042
73	NC_017589	GGCGC	2	10	105030	105039	0 %	0 %	60 %	40 %	410684042
74	NC_017589	ACCCG	2	10	109513	109522	20 %	0 %	20 %	60 %	410684048
75	NC_017589	AGGTC	2	10	109886	109895	20 %	20 %	40 %	20 %	410684048
76	NC_017589	TGACG	2	10	110586	110595	20 %	20 %	40 %	20 %	410684049
77	NC_017589	TGTGC	2	10	111327	111336	0 %	40 %	40 %	20 %	410684049
78	NC_017589	TGCGG	2	10	112269	112278	0 %	20 %	60 %	20 %	410684049
79	NC_017589	TTTGG	2	10	114556	114565	0 %	60 %	40 %	0 %	410684052
80	NC_017589	CAAGG	2	10	115204	115213	40 %	0 %	40 %	20 %	410684052
81	NC_017589	AGCGC	2	10	120044	120053	20 %	0 %	40 %	40 %	410684055
82	NC_017589	CGGGC	2	10	120075	120084	0 %	0 %	60 %	40 %	410684055
83	NC_017589	CGGGC	2	10	121542	121551	0 %	0 %	60 %	40 %	410684056
84	NC_017589	CGGTC	2	10	123574	123583	0 %	20 %	40 %	40 %	410684057
85	NC_017589	GGGCA	2	10	123751	123760	20 %	0 %	60 %	20 %	410684057
86	NC_017589	CGGGC	2	10	124217	124226	0 %	0 %	60 %	40 %	410684058
87	NC_017589	GCCGT	2	10	125491	125500	0 %	20 %	40 %	40 %	410684059
88	NC_017589	TCGCG	2	10	127699	127708	0 %	20 %	40 %	40 %	410684062
89	NC_017589	CCGGC	2	10	133915	133924	0 %	0 %	40 %	60 %	410684064
90	NC_017589	CCGGC	2	10	135147	135156	0 %	0 %	40 %	60 %	410684064
91	NC_017589	CGCGC	2	10	139587	139596	0 %	0 %	40 %	60 %	410684067
92	NC_017589	GCGCC	2	10	140357	140366	0 %	0 %	40 %	60 %	410684068
93	NC_017589	GCGCG	2	10	141465	141474	0 %	0 %	60 %	40 %	410684070
94	NC_017589	CCAGC	2	10	141838	141847	20 %	0 %	20 %	60 %	410684070
95	NC_017589	ATCGC	2	10	143036	143045	20 %	20 %	20 %	40 %	410684070
96	NC_017589	CCGGC	2	10	144160	144169	0 %	0 %	40 %	60 %	410684070
97	NC_017589	AGCGC	2	10	144348	144357	20 %	0 %	40 %	40 %	410684070
98	NC_017589	AGGCC	2	10	145020	145029	20 %	0 %	40 %	40 %	410684070
99	NC_017589	GGCCC	2	10	146007	146016	0 %	0 %	40 %	60 %	410684070
100	NC_017589	GCGAA	2	10	149664	149673	40 %	0 %	40 %	20 %	410684070
101	NC_017589	CGGGT	2	10	153812	153821	0 %	20 %	60 %	20 %	410684070
102	NC_017589	CGAGG	2	10	155844	155853	20 %	0 %	60 %	20 %	410684071
103	NC_017589	GCGAA	2	10	156032	156041	40 %	0 %	40 %	20 %	410684071
104	NC_017589	ATGAA	2	10	159616	159625	60 %	20 %	20 %	0 %	410684075
105	NC_017589	GCCGC	2	10	160502	160511	0 %	0 %	40 %	60 %	410684076
106	NC_017589	TCGCC	2	10	161962	161971	0 %	20 %	20 %	60 %	410684076
107	NC_017589	CGCAG	2	10	163300	163309	20 %	0 %	40 %	40 %	410684078
108	NC_017589	GCGCG	2	10	164413	164422	0 %	0 %	60 %	40 %	410684079
109	NC_017589	CGCGA	2	10	167990	167999	20 %	0 %	40 %	40 %	410684082
110	NC_017589	TGGCG	2	10	168037	168046	0 %	20 %	60 %	20 %	410684082
111	NC_017589	ACACC	2	10	168715	168724	40 %	0 %	0 %	60 %	410684082
112	NC_017589	GGCAA	2	10	169568	169577	40 %	0 %	40 %	20 %	410684082
113	NC_017589	GCAAG	2	10	169621	169630	40 %	0 %	40 %	20 %	410684082
114	NC_017589	GGGCA	2	10	169790	169799	20 %	0 %	60 %	20 %	410684082
115	NC_017589	CGCCT	2	10	170373	170382	0 %	20 %	20 %	60 %	410684083
116	NC_017589	GGCCC	2	10	172359	172368	0 %	0 %	40 %	60 %	410684086
117	NC_017589	CGAGC	2	10	174293	174302	20 %	0 %	40 %	40 %	410684086
118	NC_017589	CCGCG	2	10	174806	174815	0 %	0 %	40 %	60 %	410684087
119	NC_017589	CAGGC	2	10	176826	176835	20 %	0 %	40 %	40 %	410684091
120	NC_017589	CGGCG	2	10	177239	177248	0 %	0 %	60 %	40 %	410684092
121	NC_017589	CCGCG	2	10	177336	177345	0 %	0 %	40 %	60 %	410684092
122	NC_017589	GATCG	2	10	178755	178764	20 %	20 %	40 %	20 %	410684094
123	NC_017589	CGGCG	2	10	179592	179601	0 %	0 %	60 %	40 %	410684094
124	NC_017589	CGATG	2	10	179604	179613	20 %	20 %	40 %	20 %	410684094
125	NC_017589	CCCAG	2	10	179912	179921	20 %	0 %	20 %	60 %	410684094
126	NC_017589	GAATC	2	10	181615	181624	40 %	20 %	20 %	20 %	410684096
127	NC_017589	TCGAC	2	10	182136	182145	20 %	20 %	20 %	40 %	410684096
128	NC_017589	TGCCA	2	10	182683	182692	20 %	20 %	20 %	40 %	410684098
129	NC_017589	GGCGA	2	10	184055	184064	20 %	0 %	60 %	20 %	410684100
130	NC_017589	TCCCA	2	10	184660	184669	20 %	20 %	0 %	60 %	410684101
131	NC_017589	GCCGC	2	10	185404	185413	0 %	0 %	40 %	60 %	410684103
132	NC_017589	TGTCG	2	10	186437	186446	0 %	40 %	40 %	20 %	410684103
133	NC_017589	GCTGA	2	10	187905	187914	20 %	20 %	40 %	20 %	410684103
134	NC_017589	CTTGC	2	10	188499	188508	0 %	40 %	20 %	40 %	410684103
135	NC_017589	GGCGA	2	10	188637	188646	20 %	0 %	60 %	20 %	410684103
136	NC_017589	CGAAG	2	10	189014	189023	40 %	0 %	40 %	20 %	410684103
137	NC_017589	GCCAG	2	10	190129	190138	20 %	0 %	40 %	40 %	410684104
138	NC_017589	GGGCA	2	10	191141	191150	20 %	0 %	60 %	20 %	410684105
139	NC_017589	GCGCG	2	10	197936	197945	0 %	0 %	60 %	40 %	410684110
140	NC_017589	CGGGC	2	10	197958	197967	0 %	0 %	60 %	40 %	410684110
141	NC_017589	CGAGG	2	10	200556	200565	20 %	0 %	60 %	20 %	410684111
142	NC_017589	TGCCG	2	10	202014	202023	0 %	20 %	40 %	40 %	410684113
143	NC_017589	CGTGT	2	10	202026	202035	0 %	40 %	40 %	20 %	410684113
144	NC_017589	CCCAG	2	10	215839	215848	20 %	0 %	20 %	60 %	410684121
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146	NC_017589	CGTGC	2	10	217918	217927	0 %	20 %	40 %	40 %	410684123
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148	NC_017589	CGCGC	2	10	222633	222642	0 %	0 %	40 %	60 %	410684128
149	NC_017589	GCGCC	2	10	223303	223312	0 %	0 %	40 %	60 %	410684129
150	NC_017589	GCGCA	2	10	224738	224747	20 %	0 %	40 %	40 %	410684130
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152	NC_017589	CGGCC	2	10	229930	229939	0 %	0 %	40 %	60 %	410684132
153	NC_017589	CGTCG	2	10	230453	230462	0 %	20 %	40 %	40 %	410684133
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156	NC_017589	GCCGG	2	10	232201	232210	0 %	0 %	60 %	40 %	410684135
157	NC_017589	CGCGG	2	10	232256	232265	0 %	0 %	60 %	40 %	410684135
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166	NC_017589	TCGGC	2	10	243756	243765	0 %	20 %	40 %	40 %	410684142
167	NC_017589	GGCGC	2	10	243922	243931	0 %	0 %	60 %	40 %	410684142
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169	NC_017589	CGCGC	2	10	245287	245296	0 %	0 %	40 %	60 %	410684142
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173	NC_017589	CGCGC	2	10	248505	248514	0 %	0 %	40 %	60 %	410684143
174	NC_017589	CCGGC	2	10	249035	249044	0 %	0 %	40 %	60 %	410684144
175	NC_017589	CGCGG	2	10	252020	252029	0 %	0 %	60 %	40 %	410684144
176	NC_017589	AACTG	2	10	256997	257006	40 %	20 %	20 %	20 %	410684145
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184	NC_017589	CGGGC	2	10	266270	266279	0 %	0 %	60 %	40 %	410684155
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187	NC_017589	GGCCT	2	10	267480	267489	0 %	20 %	40 %	40 %	410684155
188	NC_017589	GCCGT	2	10	269724	269733	0 %	20 %	40 %	40 %	410684156
189	NC_017589	GCCGA	2	10	270596	270605	20 %	0 %	40 %	40 %	410684156
190	NC_017589	CCGCG	2	10	270811	270820	0 %	0 %	40 %	60 %	410684156
191	NC_017589	GCATG	2	10	271028	271037	20 %	20 %	40 %	20 %	410684156
192	NC_017589	GCGCT	2	10	271911	271920	0 %	20 %	40 %	40 %	410684157
193	NC_017589	GAGGT	2	10	272427	272436	20 %	20 %	60 %	0 %	410684157
194	NC_017589	GGCCG	2	10	275685	275694	0 %	0 %	60 %	40 %	410684161
195	NC_017589	ACGCA	2	10	279978	279987	40 %	0 %	20 %	40 %	410684166
196	NC_017589	CGGCG	2	10	280311	280320	0 %	0 %	60 %	40 %	410684167
197	NC_017589	CGGTG	2	10	280535	280544	0 %	20 %	60 %	20 %	410684167
198	NC_017589	TCACT	2	10	280735	280744	20 %	40 %	0 %	40 %	410684168
199	NC_017589	TGACC	2	10	281477	281486	20 %	20 %	20 %	40 %	410684168
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202	NC_017589	CGCCA	2	10	285869	285878	20 %	0 %	20 %	60 %	410684172
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205	NC_017589	GGTCG	2	10	288986	288995	0 %	20 %	60 %	20 %	410684176
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211	NC_017589	GTACG	2	10	294775	294784	20 %	20 %	40 %	20 %	410684180
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239	NC_017589	GCTCG	2	10	337099	337108	0 %	20 %	40 %	40 %	410684206
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242	NC_017589	CGCGC	2	10	344137	344146	0 %	0 %	40 %	60 %	410684214
243	NC_017589	TGCGA	2	10	345465	345474	20 %	20 %	40 %	20 %	410684214
244	NC_017589	GGGTC	2	10	346226	346235	0 %	20 %	60 %	20 %	410684215
245	NC_017589	CGCTG	2	10	346385	346394	0 %	20 %	40 %	40 %	410684215
246	NC_017589	GCGTT	2	10	347160	347169	0 %	40 %	40 %	20 %	410684215
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249	NC_017589	GCCCA	2	10	351558	351567	20 %	0 %	20 %	60 %	410684219
250	NC_017589	TTGGC	2	10	352480	352489	0 %	40 %	40 %	20 %	410684220
251	NC_017589	CGGTC	2	10	354919	354928	0 %	20 %	40 %	40 %	410684222
252	NC_017589	GCTGG	2	10	355027	355036	0 %	20 %	60 %	20 %	410684222
253	NC_017589	TCGGC	2	10	356120	356129	0 %	20 %	40 %	40 %	410684223
254	NC_017589	CCCGG	2	10	356888	356897	0 %	0 %	40 %	60 %	410684224
255	NC_017589	CGATC	2	10	357429	357438	20 %	20 %	20 %	40 %	410684225
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257	NC_017589	CACGA	2	10	359841	359850	40 %	0 %	20 %	40 %	410684227
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261	NC_017589	TGCGC	2	10	368088	368097	0 %	20 %	40 %	40 %	410684231
262	NC_017589	GCTGC	2	10	368585	368594	0 %	20 %	40 %	40 %	410684231
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388	NC_017589	GCGGG	2	10	528183	528192	0 %	0 %	80 %	20 %	410684394
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392	NC_017589	CGGGC	2	10	541673	541682	0 %	0 %	60 %	40 %	410684405
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