MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 = DSM 46488 chromosome

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017586	CCCAAC	2	12	64	75	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017586	CCCCGG	3	18	597	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017586	TACCAG	2	12	2011	2022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017586	TGGGGG	2	12	8744	8755	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017586	ACCCGG	2	12	42046	42057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017586	CGGTGG	2	12	51160	51171	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017586	CCGGCC	2	12	127065	127076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017586	GAACGG	2	12	137134	137145	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017586	CGCACG	2	12	143465	143476	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017586	TCGGCC	2	12	200946	200957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017586	GGACCG	2	12	215832	215843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017586	ACCGTG	2	12	220713	220724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017586	CGCCCC	2	12	243186	243197	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_017586	TGGGGG	2	12	243354	243365	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017586	CGGTGA	2	12	255746	255757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017586	GGCCAG	2	12	255768	255779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017586	GCCGGG	2	12	265719	265730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017586	AACGGA	2	12	270905	270916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017586	CGGCGC	2	12	278616	278627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017586	CCGCGA	2	12	295556	295567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017586	TCGGGC	2	12	299766	299777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017586	CGGGGG	2	12	310206	310217	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017586	GCGCCC	2	12	314173	314184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017586	TGCCCG	2	12	330169	330180	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017586	GGTCGG	2	12	330205	330216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017586	CACCCT	2	12	337610	337621	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017586	TGCCGG	2	12	337828	337839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017586	GTCGAG	2	12	339861	339872	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017586	TGGCGC	2	12	339877	339888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017586	AACCGC	2	12	340162	340173	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017586	GAGGTG	2	12	340594	340605	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017586	TCGCCG	2	12	341070	341081	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017586	ACGAGC	2	12	341151	341162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017586	CGGGCC	2	12	385636	385647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017586	CGGGGC	2	12	389327	389338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017586	CCGGGC	2	12	422871	422882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017586	TCGTCC	2	12	434931	434942	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017586	GCCGGG	2	12	445065	445076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017586	GGAACC	2	12	545850	545861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017586	GGTGGG	2	12	559811	559822	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017586	GCGGGC	2	12	567351	567362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017586	GATCAA	2	12	575479	575490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017586	GGCCCC	2	12	578273	578284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017586	CCGCAA	2	12	597673	597684	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017586	AAGTTC	2	12	635224	635235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017586	GACGCC	2	12	662992	663003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017586	GGGGAC	2	12	679113	679124	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017586	GGCCGA	2	12	681580	681591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017586	CCGGGA	3	18	690294	690311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017586	GCTGGC	2	12	714423	714434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017586	CTGCGG	2	12	714450	714461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017586	CCCGCG	2	12	728907	728918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017586	CCGGAT	2	12	731303	731314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017586	TCCGCT	2	12	738022	738033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017586	GCCGGC	2	12	738248	738259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017586	GCGTCC	2	12	739228	739239	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017586	AGGACA	2	12	739464	739475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017586	GTTTGT	2	12	747652	747663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017586	TTGCGT	2	12	747672	747683	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017586	GCCGGG	2	12	748672	748683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017586	CGGGTG	2	12	760330	760341	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017586	GCCCGC	2	12	760506	760517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017586	GCCGGT	2	12	773921	773932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017586	CCCCCT	2	12	793193	793204	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
65	NC_017586	GATCGG	2	12	804746	804757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017586	CGGCCA	2	12	833943	833954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017586	CGTGGC	2	12	841432	841443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017586	CCGGCC	2	12	860010	860021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017586	CGGGCC	2	12	881734	881745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017586	CCGCTC	2	12	892081	892092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017586	CGCGTA	2	12	894443	894454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017586	GGGCGG	2	12	896541	896552	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017586	GACCCC	2	12	903570	903581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017586	CGGGCG	2	12	910693	910704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017586	CACGGC	2	12	926354	926365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017586	CGGGGC	2	12	949906	949917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017586	GCCGTC	2	12	965135	965146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017586	CGTCAC	2	12	965530	965541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017586	CGCCTC	2	12	965563	965574	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017586	CCGACC	2	12	965707	965718	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017586	GCCTCG	2	12	968890	968901	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017586	CGCCGT	2	12	971599	971610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017586	CGGGCA	2	12	975460	975471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017586	TGCAGG	2	12	992567	992578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017586	GGGACG	3	18	1028183	1028200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017586	CGACCC	2	12	1043715	1043726	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017586	CAGCGT	2	12	1043788	1043799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017586	GTGCCG	2	12	1048319	1048330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017586	CCCGGA	2	12	1087925	1087936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017586	CCCCGG	2	12	1107098	1107109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017586	CCCCGG	2	12	1125787	1125798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017586	CGCGTG	2	12	1155592	1155603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017586	GCCGGG	2	12	1165061	1165072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017586	CTCCGT	2	12	1201448	1201459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017586	CCGGCC	2	12	1220007	1220018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017586	GGCGAG	2	12	1235023	1235034	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017586	CGCTCG	2	12	1252848	1252859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017586	GTGGCG	2	12	1259237	1259248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017586	GCCGGA	2	12	1268391	1268402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017586	GGGGCC	2	12	1323312	1323323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017586	ACGGAA	2	12	1327068	1327079	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017586	CGAGCG	2	12	1340204	1340215	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017586	CCACCG	2	12	1355938	1355949	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017586	TGAGCT	2	12	1356999	1357010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017586	GACGCG	2	12	1401331	1401342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017586	CGGGGC	2	12	1421121	1421132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017586	GGCGTC	2	12	1434379	1434390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017586	TGCGGG	2	12	1434751	1434762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017586	TCGCCC	2	12	1434979	1434990	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017586	GCCCCG	2	12	1437900	1437911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017586	GCCGGA	2	12	1443833	1443844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017586	CGGGCC	2	12	1463977	1463988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017586	TTCCGC	2	12	1464089	1464100	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017586	GCCCCG	2	12	1484618	1484629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017586	CCCGTG	2	12	1504720	1504731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017586	AACGCC	2	12	1504965	1504976	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017586	GTGGCG	2	12	1511774	1511785	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017586	GGTGCG	2	12	1511831	1511842	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017586	CCTGGT	2	12	1553701	1553712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017586	CGGGGC	2	12	1587630	1587641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017586	GGTGGG	2	12	1631470	1631481	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017586	AACCGG	2	12	1632210	1632221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017586	ATCCCG	2	12	1660680	1660691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017586	CTGGCC	2	12	1663992	1664003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017586	CGCCAG	2	12	1666833	1666844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017586	CGGGGG	2	12	1690658	1690669	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017586	GCACCG	2	12	1729385	1729396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017586	CCCGGC	2	12	1732040	1732051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017586	CGCGTT	2	12	1732194	1732205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017586	CGGGTA	2	12	1752794	1752805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017586	GCGGGG	2	12	1765362	1765373	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017586	CGGGCG	2	12	1770316	1770327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017586	ACGATC	2	12	1772429	1772440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017586	GTCGTA	2	12	1772625	1772636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017586	GCTGGG	2	12	1821688	1821699	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_017586	CCGGCC	2	12	1874466	1874477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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141	NC_017586	CCGGCC	2	12	1897135	1897146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017586	GTTCCG	2	12	1921704	1921715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_017586	GCCCCC	2	12	2131560	2131571	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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157	NC_017586	GGACCG	2	12	2164069	2164080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.