MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 3708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017584	GGCCC	2	10	1562	1571	0 %	0 %	40 %	60 %	386348021
2	NC_017584	ACCAC	2	10	1651	1660	40 %	0 %	0 %	60 %	386348021
3	NC_017584	TGGCG	2	10	3766	3775	0 %	20 %	60 %	20 %	386348023
4	NC_017584	GGCCC	2	10	3896	3905	0 %	0 %	40 %	60 %	386348023
5	NC_017584	ACCGC	2	10	3973	3982	20 %	0 %	20 %	60 %	386348023
6	NC_017584	GCGCC	3	15	4154	4168	0 %	0 %	40 %	60 %	386348023
7	NC_017584	GTGCT	2	10	5166	5175	0 %	40 %	40 %	20 %	386348024
8	NC_017584	GCTAC	2	10	7194	7203	20 %	20 %	20 %	40 %	386348025
9	NC_017584	GGTTG	2	10	7849	7858	0 %	40 %	60 %	0 %	386348026
10	NC_017584	AAGGC	2	10	9619	9628	40 %	0 %	40 %	20 %	386348029
11	NC_017584	AGCGC	2	10	11192	11201	20 %	0 %	40 %	40 %	386348031
12	NC_017584	GATCG	2	10	12260	12269	20 %	20 %	40 %	20 %	386348032
13	NC_017584	GGCCA	2	10	14476	14485	20 %	0 %	40 %	40 %	386348034
14	NC_017584	GGCCG	2	10	15017	15026	0 %	0 %	60 %	40 %	386348035
15	NC_017584	GGCCG	2	10	15542	15551	0 %	0 %	60 %	40 %	386348035
16	NC_017584	TTGCG	2	10	17238	17247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017584	GAAGG	2	10	17340	17349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017584	CGGCG	2	10	17908	17917	0 %	0 %	60 %	40 %	386348037
19	NC_017584	CTCCG	2	10	18417	18426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017584	AGCCA	2	10	18602	18611	40 %	0 %	20 %	40 %	386348038
21	NC_017584	AGGCG	2	10	19068	19077	20 %	0 %	60 %	20 %	386348038
22	NC_017584	GCCGG	2	10	22161	22170	0 %	0 %	60 %	40 %	386348040
23	NC_017584	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	386348040
24	NC_017584	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	386348040
25	NC_017584	GCGGT	2	10	28465	28474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017584	TTTGG	2	10	29687	29696	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017584	CCGAT	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	386348047
28	NC_017584	GGATC	2	10	32849	32858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017584	GGGGA	2	10	35347	35356	20 %	0 %	80 %	0 %	386348052
30	NC_017584	GGGCG	2	10	36312	36321	0 %	0 %	80 %	20 %	386348053
31	NC_017584	GCGCG	2	10	36680	36689	0 %	0 %	60 %	40 %	386348053
32	NC_017584	AAGCC	2	10	37739	37748	40 %	0 %	20 %	40 %	386348054
33	NC_017584	GACCA	2	10	40776	40785	40 %	0 %	20 %	40 %	386348057
34	NC_017584	CGGCG	2	10	41695	41704	0 %	0 %	60 %	40 %	386348059
35	NC_017584	CGGCG	2	10	43026	43035	0 %	0 %	60 %	40 %	386348061
36	NC_017584	GGCGA	2	10	43389	43398	20 %	0 %	60 %	20 %	386348061
37	NC_017584	GCGAA	2	10	44271	44280	40 %	0 %	40 %	20 %	386348062
38	NC_017584	TTGCC	2	10	45222	45231	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017584	TGATT	2	10	45473	45482	20 %	60 %	20 %	0 %	386348064
40	NC_017584	CGGCG	2	10	48692	48701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017584	GCTCT	2	10	48780	48789	0 %	40 %	20 %	40 %	386348068
42	NC_017584	TCATC	2	10	51143	51152	20 %	40 %	0 %	40 %	386348069
43	NC_017584	TGACC	2	10	51290	51299	20 %	20 %	20 %	40 %	386348070
44	NC_017584	GGCGA	2	10	52188	52197	20 %	0 %	60 %	20 %	386348072
45	NC_017584	GCCGC	2	10	53076	53085	0 %	0 %	40 %	60 %	386348072
46	NC_017584	GACCG	2	10	53720	53729	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017584	GCGAG	2	10	54618	54627	20 %	0 %	60 %	20 %	386348073
48	NC_017584	GGAAG	2	10	57646	57655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017584	TGCGG	2	10	57760	57769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017584	TCGGC	2	10	58517	58526	0 %	20 %	40 %	40 %	386348075
51	NC_017584	GCCAT	2	10	60512	60521	20 %	20 %	20 %	40 %	386348076
52	NC_017584	GAGGT	2	10	60644	60653	20 %	20 %	60 %	0 %	386348076
53	NC_017584	TCGTC	2	10	61848	61857	0 %	40 %	20 %	40 %	386348077
54	NC_017584	GATCT	2	10	61874	61883	20 %	40 %	20 %	20 %	386348077
55	NC_017584	CCGGC	2	10	64193	64202	0 %	0 %	40 %	60 %	386348078
56	NC_017584	CGGAA	2	10	64924	64933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017584	GAAAG	2	10	65991	66000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017584	GCCGG	2	10	69376	69385	0 %	0 %	60 %	40 %	386348082
59	NC_017584	GCGAT	2	10	70617	70626	20 %	20 %	40 %	20 %	386348083
60	NC_017584	TCAAG	2	10	71628	71637	40 %	20 %	20 %	20 %	386348084
61	NC_017584	GCAGC	2	10	71650	71659	20 %	0 %	40 %	40 %	386348084
62	NC_017584	AGCCA	2	10	72270	72279	40 %	0 %	20 %	40 %	386348084
63	NC_017584	GCGCC	2	10	73873	73882	0 %	0 %	40 %	60 %	386348085
64	NC_017584	CGCAG	2	10	74451	74460	20 %	0 %	40 %	40 %	386348085
65	NC_017584	GCCCC	2	10	78493	78502	0 %	0 %	20 %	80 %	386348088
66	NC_017584	TGGGG	2	10	78846	78855	0 %	20 %	80 %	0 %	386348089
67	NC_017584	GGGGC	2	10	80151	80160	0 %	0 %	80 %	20 %	386348090
68	NC_017584	CAGAT	2	10	81470	81479	40 %	20 %	20 %	20 %	386348092
69	NC_017584	CGTCC	2	10	85134	85143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017584	GCGCC	2	10	86758	86767	0 %	0 %	40 %	60 %	386348096
71	NC_017584	GGCGC	2	10	87678	87687	0 %	0 %	60 %	40 %	386348096
72	NC_017584	GCCGA	2	10	88338	88347	20 %	0 %	40 %	40 %	386348096
73	NC_017584	CGGAC	2	10	89535	89544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017584	CGGCC	2	10	91908	91917	0 %	0 %	40 %	60 %	386348101
75	NC_017584	CGCCT	2	10	93389	93398	0 %	20 %	20 %	60 %	386348102
76	NC_017584	TCGGA	2	10	94317	94326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017584	AGCGA	2	10	95417	95426	40 %	0 %	40 %	20 %	386348103
78	NC_017584	GGCCG	2	10	95641	95650	0 %	0 %	60 %	40 %	386348103
79	NC_017584	CCTGG	2	10	96966	96975	0 %	20 %	40 %	40 %	386348104
80	NC_017584	ATGCC	2	10	100201	100210	20 %	20 %	20 %	40 %	386348108
81	NC_017584	GGGCG	2	10	100592	100601	0 %	0 %	80 %	20 %	386348108
82	NC_017584	CGGCG	2	10	100782	100791	0 %	0 %	60 %	40 %	386348108
83	NC_017584	ATGGC	2	10	105249	105258	20 %	20 %	40 %	20 %	386348112
84	NC_017584	TGGGG	2	10	105534	105543	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017584	TTCAA	2	10	107082	107091	40 %	40 %	0 %	20 %	386348113
86	NC_017584	CTGGG	2	10	107604	107613	0 %	20 %	60 %	20 %	386348114
87	NC_017584	CGGGC	2	10	107900	107909	0 %	0 %	60 %	40 %	386348114
88	NC_017584	GGGCC	2	10	109438	109447	0 %	0 %	60 %	40 %	386348116
89	NC_017584	GCCCG	2	10	109817	109826	0 %	0 %	40 %	60 %	386348116
90	NC_017584	CAAGG	2	10	110164	110173	40 %	0 %	40 %	20 %	386348117
91	NC_017584	ATCGG	2	10	110239	110248	20 %	20 %	40 %	20 %	386348117
92	NC_017584	GTCTT	2	10	114155	114164	0 %	60 %	20 %	20 %	386348120
93	NC_017584	GCCCG	2	10	114609	114618	0 %	0 %	40 %	60 %	386348120
94	NC_017584	CGCGG	2	10	115648	115657	0 %	0 %	60 %	40 %	386348122
95	NC_017584	CGCTT	2	10	117463	117472	0 %	40 %	20 %	40 %	386348125
96	NC_017584	GCCCT	2	10	117836	117845	0 %	20 %	20 %	60 %	386348126
97	NC_017584	CCCCG	2	10	118901	118910	0 %	0 %	20 %	80 %	386348126
98	NC_017584	CGATC	2	10	121606	121615	20 %	20 %	20 %	40 %	386348126
99	NC_017584	GGGGC	2	10	122990	122999	0 %	0 %	80 %	20 %	386348126
100	NC_017584	GGGCG	2	10	126297	126306	0 %	0 %	80 %	20 %	386348129
101	NC_017584	CCGGG	2	10	127067	127076	0 %	0 %	60 %	40 %	386348130
102	NC_017584	GGGCC	2	10	128355	128364	0 %	0 %	60 %	40 %	386348131
103	NC_017584	CGCTG	2	10	129698	129707	0 %	20 %	40 %	40 %	386348132
104	NC_017584	CGGCG	2	10	129836	129845	0 %	0 %	60 %	40 %	386348132
105	NC_017584	GGCGA	2	10	130328	130337	20 %	0 %	60 %	20 %	386348133
106	NC_017584	GCGCC	2	10	133425	133434	0 %	0 %	40 %	60 %	386348135
107	NC_017584	CCTTG	2	10	134355	134364	0 %	40 %	20 %	40 %	386348136
108	NC_017584	GCGCC	2	10	135177	135186	0 %	0 %	40 %	60 %	386348137
109	NC_017584	CGGGG	2	10	136791	136800	0 %	0 %	80 %	20 %	386348138
110	NC_017584	CCCCG	2	10	136952	136961	0 %	0 %	20 %	80 %	386348138
111	NC_017584	CGGCC	2	10	138808	138817	0 %	0 %	40 %	60 %	386348140
112	NC_017584	TAAAG	2	10	139831	139840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017584	GCGCA	2	10	140802	140811	20 %	0 %	40 %	40 %	386348142
114	NC_017584	GGGCA	2	10	141896	141905	20 %	0 %	60 %	20 %	386348143
115	NC_017584	GATGG	2	10	144244	144253	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017584	CGGCG	2	10	145332	145341	0 %	0 %	60 %	40 %	386348146
117	NC_017584	GCGGG	2	10	146149	146158	0 %	0 %	80 %	20 %	386348147
118	NC_017584	GGCTG	2	10	147346	147355	0 %	20 %	60 %	20 %	386348148
119	NC_017584	CAGTC	2	10	147964	147973	20 %	20 %	20 %	40 %	386348149
120	NC_017584	GGGGC	2	10	149854	149863	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017584	GTCGC	2	10	150028	150037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017584	CGGCG	2	10	150378	150387	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017584	GCGAG	2	10	150549	150558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017584	GGGCA	2	10	150975	150984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017584	TCCCC	2	10	151321	151330	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_017584	TTAGC	2	10	151454	151463	20 %	40 %	20 %	20 %	386348151
127	NC_017584	GGCGG	2	10	154843	154852	0 %	0 %	80 %	20 %	386348153
128	NC_017584	GCCGG	2	10	155665	155674	0 %	0 %	60 %	40 %	386348153
129	NC_017584	CCGGC	2	10	156204	156213	0 %	0 %	40 %	60 %	386348154
130	NC_017584	TCGGG	2	10	156652	156661	0 %	20 %	60 %	20 %	386348154
131	NC_017584	GACCG	2	10	156848	156857	20 %	0 %	40 %	40 %	386348154
132	NC_017584	GGCCG	2	10	159773	159782	0 %	0 %	60 %	40 %	386348157
133	NC_017584	CGGCG	2	10	159902	159911	0 %	0 %	60 %	40 %	386348157
134	NC_017584	TGGCT	2	10	160105	160114	0 %	40 %	40 %	20 %	386348157
135	NC_017584	GGTGC	2	10	163077	163086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017584	GCGGG	2	10	165860	165869	0 %	0 %	80 %	20 %	386348163
137	NC_017584	AGGGC	2	10	168201	168210	20 %	0 %	60 %	20 %	386348165
138	NC_017584	GGCTG	2	10	168403	168412	0 %	20 %	60 %	20 %	386348165
139	NC_017584	CCCAG	2	10	169561	169570	20 %	0 %	20 %	60 %	386348167
140	NC_017584	CCCGA	2	10	172978	172987	20 %	0 %	20 %	60 %	386348169
141	NC_017584	AGCTT	2	10	173700	173709	20 %	40 %	20 %	20 %	386348170
142	NC_017584	AACCC	2	10	174902	174911	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_017584	GGGGC	2	10	176733	176742	0 %	0 %	80 %	20 %	386348173
144	NC_017584	CGGTC	2	10	178349	178358	0 %	20 %	40 %	40 %	386348174
145	NC_017584	TCTTG	2	10	178554	178563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017584	GGCCG	2	10	179802	179811	0 %	0 %	60 %	40 %	386348176
147	NC_017584	TCGTC	2	10	179960	179969	0 %	40 %	20 %	40 %	386348176
148	NC_017584	AGTTT	2	10	180373	180382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017584	GGGCG	2	10	181989	181998	0 %	0 %	80 %	20 %	386348178
150	NC_017584	GGGCG	2	10	182868	182877	0 %	0 %	80 %	20 %	386348178
151	NC_017584	GCGGT	2	10	184869	184878	0 %	20 %	60 %	20 %	386348179
152	NC_017584	CCAGA	2	10	186221	186230	40 %	0 %	20 %	40 %	386348180
153	NC_017584	GCGCG	2	10	187007	187016	0 %	0 %	60 %	40 %	386348181
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155	NC_017584	TGGGC	2	10	190051	190060	0 %	20 %	60 %	20 %	386348185
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157	NC_017584	CTCGA	2	10	191474	191483	20 %	20 %	20 %	40 %	386348185
158	NC_017584	TCGTG	2	10	193532	193541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_017584	GGGCT	2	10	193678	193687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017584	AGAGG	2	10	196493	196502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017584	ACACA	2	10	197605	197614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_017584	ATCCC	2	10	197678	197687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_017584	CGGGG	2	10	200271	200280	0 %	0 %	80 %	20 %	386348187
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165	NC_017584	CCCCG	2	10	203135	203144	0 %	0 %	20 %	80 %	386348191
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169	NC_017584	CGGGG	2	10	208177	208186	0 %	0 %	80 %	20 %	386348194
170	NC_017584	GGGCC	2	10	208218	208227	0 %	0 %	60 %	40 %	386348194
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172	NC_017584	GTCCC	2	10	210103	210112	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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174	NC_017584	TCCGG	2	10	211058	211067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_017584	GCGGG	2	10	211219	211228	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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178	NC_017584	CCCGC	2	10	213950	213959	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
179	NC_017584	GGCGG	2	10	214626	214635	0 %	0 %	80 %	20 %	386348199
180	NC_017584	GGGAG	2	10	215293	215302	20 %	0 %	80 %	0 %	386348200
181	NC_017584	TTTCA	2	10	215930	215939	20 %	60 %	0 %	20 %	386348200
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183	NC_017584	CGGGG	2	10	219234	219243	0 %	0 %	80 %	20 %	386348202
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189	NC_017584	CGTGG	2	10	223951	223960	0 %	20 %	60 %	20 %	386348204
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192	NC_017584	GGATG	2	10	226127	226136	20 %	20 %	60 %	0 %	386348206
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197	NC_017584	GGCTT	2	10	233171	233180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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217	NC_017584	GCGCC	2	10	254468	254477	0 %	0 %	40 %	60 %	386348224
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224	NC_017584	CGCCC	2	10	259671	259680	0 %	0 %	20 %	80 %	386348227
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234	NC_017584	CCGGC	2	10	269938	269947	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
235	NC_017584	GGCCC	2	10	270467	270476	0 %	0 %	40 %	60 %	386348238
236	NC_017584	TTCTT	2	10	273068	273077	0 %	80 %	0 %	20 %	386348241
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239	NC_017584	GCGGG	2	10	277818	277827	0 %	0 %	80 %	20 %	386348245
240	NC_017584	GATCA	2	10	277916	277925	40 %	20 %	20 %	20 %	386348245
241	NC_017584	CGCCT	2	10	280613	280622	0 %	20 %	20 %	60 %	386348248
242	NC_017584	GCGAG	2	10	282090	282099	20 %	0 %	60 %	20 %	386348249
243	NC_017584	CGCGA	2	10	282224	282233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
244	NC_017584	GCCGG	2	10	282312	282321	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
245	NC_017584	GGGCC	2	10	284745	284754	0 %	0 %	60 %	40 %	386348251
246	NC_017584	CGGGG	2	10	285212	285221	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
247	NC_017584	TCGGG	2	10	285296	285305	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
248	NC_017584	GCCGC	2	10	285821	285830	0 %	0 %	40 %	60 %	386348252
249	NC_017584	AAGGC	2	10	286890	286899	40 %	0 %	40 %	20 %	386348252
250	NC_017584	CGGCC	2	10	287220	287229	0 %	0 %	40 %	60 %	386348252
251	NC_017584	ACGCC	2	10	287731	287740	20 %	0 %	20 %	60 %	386348252
252	NC_017584	GAGGT	2	10	289211	289220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017584	TTCCG	2	10	290210	290219	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_017584	ACGCC	2	10	291813	291822	20 %	0 %	20 %	60 %	386348256
255	NC_017584	GGCGA	2	10	292085	292094	20 %	0 %	60 %	20 %	386348256
256	NC_017584	CCAGG	2	10	293884	293893	20 %	0 %	40 %	40 %	386348258
257	NC_017584	CGCGC	2	10	294527	294536	0 %	0 %	40 %	60 %	386348260
258	NC_017584	GGCTT	2	10	296921	296930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_017584	TGCAC	2	10	297572	297581	20 %	20 %	20 %	40 %	386348263
260	NC_017584	TCAGG	2	10	300187	300196	20 %	20 %	40 %	20 %	386348264
261	NC_017584	GGGGC	2	10	301623	301632	0 %	0 %	80 %	20 %	386348265
262	NC_017584	CCAGG	2	10	302687	302696	20 %	0 %	40 %	40 %	386348265
263	NC_017584	CGGCG	2	10	302704	302713	0 %	0 %	60 %	40 %	386348265
264	NC_017584	TGGCG	2	10	304762	304771	0 %	20 %	60 %	20 %	386348267
265	NC_017584	GCGCC	2	10	305152	305161	0 %	0 %	40 %	60 %	386348267
266	NC_017584	CGGCC	2	10	306073	306082	0 %	0 %	40 %	60 %	386348268
267	NC_017584	TGGGG	2	10	306659	306668	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017584	CGCGG	2	10	307199	307208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017584	GACCA	2	10	310066	310075	40 %	0 %	20 %	40 %	386348271
270	NC_017584	CGCGC	2	10	312734	312743	0 %	0 %	40 %	60 %	386348273
271	NC_017584	GGTCC	2	10	313673	313682	0 %	20 %	40 %	40 %	386348274
272	NC_017584	CCCCG	2	10	315612	315621	0 %	0 %	20 %	80 %	386348275
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382	NC_017584	CGCCC	2	10	426219	426228	0 %	0 %	20 %	80 %	386348377
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400	NC_017584	ATCCG	2	10	444410	444419	20 %	20 %	20 %	40 %	386348397
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