MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 6587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017584	TGT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017584	GTC	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017584	GCC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017584	CCG	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017584	GCC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017584	ACA	2	6	4342	4347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017584	AGA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017584	CGA	3	9	6801	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017584	CGG	2	6	6925	6930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017584	GGC	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017584	TGG	3	9	7009	7017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017584	TCG	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017584	TCC	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017584	CGC	2	6	8673	8678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017584	GAG	2	6	9158	9163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017584	CCG	2	6	9176	9181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017584	TTC	2	6	9454	9459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017584	GAA	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017584	AAG	2	6	9561	9566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017584	GTG	2	6	10204	10209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017584	TGC	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017584	CGG	2	6	10515	10520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017584	GCG	2	6	15758	15763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017584	CGG	2	6	15965	15970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017584	CAT	2	6	16008	16013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017584	CGG	2	6	16026	16031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017584	TGG	2	6	16051	16056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017584	GAC	2	6	16197	16202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017584	GCG	2	6	16865	16870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017584	CGG	2	6	16891	16896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017584	CGC	3	9	16953	16961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017584	CGG	2	6	16988	16993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017584	GCT	2	6	17107	17112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017584	TCC	2	6	17272	17277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017584	GTT	2	6	17284	17289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017584	GCG	2	6	17304	17309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017584	GCG	2	6	18410	18415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017584	GCG	2	6	18471	18476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017584	AAG	2	6	19419	19424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017584	TCT	2	6	19528	19533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017584	CGA	2	6	19537	19542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017584	GCC	2	6	19599	19604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017584	GCC	2	6	19618	19623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017584	GGC	2	6	19624	19629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017584	CCG	2	6	19645	19650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017584	CCA	2	6	19676	19681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017584	CCG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017584	CGC	2	6	25765	25770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017584	CCT	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017584	CGT	2	6	25809	25814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017584	GCG	2	6	26893	26898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017584	ATA	2	6	26926	26931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017584	GCG	3	9	26960	26968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017584	GCG	2	6	27078	27083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017584	CGT	3	9	27784	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017584	CCG	2	6	27831	27836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017584	GGA	2	6	27923	27928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017584	GCC	2	6	28347	28352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017584	GGT	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017584	CGC	2	6	28399	28404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017584	GAG	2	6	28439	28444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017584	CCA	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017584	CGC	2	6	32378	32383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017584	CCG	3	9	32423	32431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017584	CGC	2	6	32444	32449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017584	GCG	2	6	32450	32455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017584	ATG	2	6	32513	32518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017584	CGC	2	6	32608	32613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017584	TGA	2	6	32641	32646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017584	GAC	2	6	32679	32684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017584	AGA	2	6	32693	32698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017584	TGT	2	6	32724	32729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017584	TCC	3	9	32743	32751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017584	TCA	2	6	32776	32781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017584	CTC	2	6	32837	32842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017584	CCG	2	6	32843	32848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017584	GGT	2	6	34777	34782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017584	GGC	2	6	40436	40441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017584	GCG	2	6	40485	40490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017584	CGC	2	6	41008	41013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017584	GGC	2	6	41037	41042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017584	GGC	2	6	41251	41256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017584	GGT	2	6	42025	42030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017584	CCG	2	6	43536	43541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017584	GGA	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017584	GGC	2	6	43620	43625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017584	GCC	2	6	43663	43668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017584	GAA	2	6	43694	43699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017584	GCC	2	6	43700	43705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017584	AAG	2	6	43748	43753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017584	GGC	2	6	44343	44348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017584	TTC	2	6	44350	44355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017584	CAC	2	6	44386	44391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017584	GCG	2	6	44554	44559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017584	CGC	2	6	44565	44570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017584	CCG	2	6	44571	44576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017584	CGG	2	6	44605	44610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017584	CGC	2	6	45251	45256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017584	CAA	2	6	46523	46528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017584	ATC	2	6	46541	46546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017584	AGC	2	6	46821	46826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017584	CCG	2	6	46844	46849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017584	AGC	2	6	50415	50420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017584	CGG	2	6	51188	51193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017584	ACC	2	6	53773	53778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017584	CCG	3	9	53801	53809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017584	GGT	2	6	53868	53873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017584	TGG	2	6	55919	55924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017584	CGG	2	6	55933	55938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017584	GGC	2	6	57513	57518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017584	CTT	2	6	57596	57601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017584	ACG	2	6	57620	57625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017584	TTA	2	6	57894	57899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017584	CTC	2	6	57912	57917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017584	CCG	2	6	57918	57923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017584	CGA	2	6	57985	57990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017584	TCG	3	9	58034	58042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017584	GAG	2	6	58102	58107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017584	CCG	2	6	58112	58117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017584	CGC	2	6	58136	58141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017584	AAG	2	6	60122	60127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017584	GCG	2	6	61113	61118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017584	GCT	2	6	61181	61186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017584	CGG	2	6	61209	61214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017584	GTT	2	6	61256	61261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017584	GCC	2	6	61357	61362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017584	AGG	2	6	62181	62186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017584	AGG	2	6	62219	62224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017584	CGG	2	6	67501	67506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017584	CGG	2	6	67508	67513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017584	GCC	2	6	67545	67550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017584	TCC	2	6	67552	67557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017584	CGG	2	6	67613	67618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017584	TCC	2	6	69519	69524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017584	GAA	2	6	75901	75906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017584	TGT	2	6	75911	75916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017584	CGG	2	6	76006	76011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017584	CGG	3	9	80985	80993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017584	ATC	2	6	81032	81037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_017584	GGT	2	6	82347	82352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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