MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 72903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017584	TCG	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348021
2	NC_017584	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348021
3	NC_017584	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
4	NC_017584	TGA	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348021
5	NC_017584	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
6	NC_017584	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348021
7	NC_017584	TCG	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348021
8	NC_017584	CGG	3	9	601	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
9	NC_017584	CGC	2	6	644	649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348021
10	NC_017584	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
11	NC_017584	GAC	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348021
12	NC_017584	GCG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
13	NC_017584	GGC	2	6	867	872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348021
14	NC_017584	CGC	2	6	931	936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348021
15	NC_017584	TCA	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348021
16	NC_017584	GAA	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348021
17	NC_017584	TTC	2	6	1101	1106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348021
18	NC_017584	CAC	2	6	1241	1246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348021
19	NC_017584	CTG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348021
20	NC_017584	CGA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348021
21	NC_017584	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348021
22	NC_017584	CGC	2	6	1545	1550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348021
23	NC_017584	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348021
24	NC_017584	CTG	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348021
25	NC_017584	CGT	2	6	2048	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348022
26	NC_017584	GCG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348022
27	NC_017584	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348022
28	NC_017584	ACC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348022
29	NC_017584	ACG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348022
30	NC_017584	CTA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348022
31	NC_017584	GCC	2	6	2568	2573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348022
32	NC_017584	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348022
33	NC_017584	CGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348022
34	NC_017584	GCC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348022
35	NC_017584	GAG	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348022
36	NC_017584	GGC	2	6	2930	2935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348022
37	NC_017584	CGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348022
38	NC_017584	GAC	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348022
39	NC_017584	CGT	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
40	NC_017584	GCT	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
41	NC_017584	CTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
42	NC_017584	GGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
43	NC_017584	GCC	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
44	NC_017584	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
45	NC_017584	CGG	2	6	3375	3380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
46	NC_017584	GCC	2	6	3398	3403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
47	NC_017584	CGG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
48	NC_017584	GCG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
49	NC_017584	CGG	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
50	NC_017584	GGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
51	NC_017584	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348023
52	NC_017584	CGG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
53	NC_017584	CCG	2	6	3663	3668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
54	NC_017584	TGC	2	6	3702	3707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
55	NC_017584	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
56	NC_017584	GCG	2	6	3815	3820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348023
57	NC_017584	GCC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
58	NC_017584	GCC	2	6	3908	3913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
59	NC_017584	GAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348023
60	NC_017584	CCG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348023
61	NC_017584	AGG	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348023
62	NC_017584	GCT	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348023
63	NC_017584	CGA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348023
64	NC_017584	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
65	NC_017584	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
66	NC_017584	CAC	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348024
67	NC_017584	GGT	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
68	NC_017584	CGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
69	NC_017584	GAG	2	6	4617	4622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348024
70	NC_017584	GCC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
71	NC_017584	CGG	2	6	4664	4669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
72	NC_017584	GGT	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
73	NC_017584	GGT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
74	NC_017584	GGT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
75	NC_017584	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
76	NC_017584	CAC	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348024
77	NC_017584	GCT	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
78	NC_017584	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348024
79	NC_017584	ACG	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
80	NC_017584	CCG	2	6	5085	5090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
81	NC_017584	CAA	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348024
82	NC_017584	GGC	2	6	5202	5207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
83	NC_017584	CGG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
84	NC_017584	TGA	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348024
85	NC_017584	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
86	NC_017584	GTC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
87	NC_017584	GGA	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348024
88	NC_017584	AGG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348024
89	NC_017584	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348024
90	NC_017584	GGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348024
91	NC_017584	GCC	4	12	5502	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
92	NC_017584	GCC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
93	NC_017584	CGC	2	6	5526	5531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
94	NC_017584	TCG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
95	NC_017584	CCG	2	6	5650	5655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
96	NC_017584	CGG	2	6	5761	5766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
97	NC_017584	CGC	2	6	5783	5788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
98	NC_017584	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348024
99	NC_017584	ATC	3	9	5847	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348024
100	NC_017584	CTG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
101	NC_017584	CTT	3	9	5906	5914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348024
102	NC_017584	GTC	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
103	NC_017584	GCC	2	6	5963	5968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
104	NC_017584	GAC	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
105	NC_017584	CTG	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
106	NC_017584	ACC	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348024
107	NC_017584	GCC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
108	NC_017584	CGC	2	6	6149	6154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
109	NC_017584	GGC	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
110	NC_017584	GAC	2	6	6231	6236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
111	NC_017584	GCC	2	6	6255	6260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
112	NC_017584	GCC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
113	NC_017584	GGC	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
114	NC_017584	CCG	2	6	6416	6421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
115	NC_017584	GGC	2	6	6434	6439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348024
116	NC_017584	AGC	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
117	NC_017584	ATC	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348024
118	NC_017584	GCC	2	6	6537	6542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
119	NC_017584	AGC	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348024
120	NC_017584	ACC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348024
121	NC_017584	GCC	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
122	NC_017584	TGC	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
123	NC_017584	TCG	2	6	6706	6711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348024
124	NC_017584	CGC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348024
125	NC_017584	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348025
126	NC_017584	ACG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348025
127	NC_017584	CCG	2	6	7337	7342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348025
128	NC_017584	AGG	2	6	7367	7372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348025
129	NC_017584	GAT	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348026
130	NC_017584	ATC	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348026
131	NC_017584	CGC	2	6	7835	7840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348026
132	NC_017584	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348026
133	NC_017584	TTC	2	6	7908	7913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348026
134	NC_017584	CGG	2	6	7977	7982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348026
135	NC_017584	GAT	2	6	8286	8291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348026
136	NC_017584	TTC	2	6	8307	8312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348026
137	NC_017584	CTG	2	6	8331	8336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348026
138	NC_017584	AAG	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348026
139	NC_017584	ACC	2	6	8436	8441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348026
140	NC_017584	ATC	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348026
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142	NC_017584	CGG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348027
143	NC_017584	CGG	2	6	8861	8866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348027
144	NC_017584	CGG	3	9	8885	8893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348027
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148	NC_017584	GTC	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348028
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152	NC_017584	AGC	2	6	9830	9835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348030
153	NC_017584	ATC	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348030
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156	NC_017584	GCA	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348030
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159	NC_017584	GCG	2	6	10557	10562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348031
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164	NC_017584	CCG	2	6	10741	10746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348031
165	NC_017584	CGG	2	6	10748	10753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348031
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242	NC_017584	CAC	2	6	14625	14630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348034
243	NC_017584	CCA	2	6	14648	14653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348034
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249	NC_017584	GGC	2	6	14902	14907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348035
250	NC_017584	TGA	2	6	14923	14928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348035
251	NC_017584	GGC	2	6	14938	14943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348035
252	NC_017584	CGA	2	6	14953	14958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348035
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500	NC_017584	CGC	2	6	30548	30553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348047

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