MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 1720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	ACAGT	2	10	373	382	40 %	20 %	20 %	20 %	414562957
2	NC_017582	TGAAA	2	10	2804	2813	60 %	20 %	20 %	0 %	414562959
3	NC_017582	AAAGG	2	10	3079	3088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017582	TGGTA	2	10	3669	3678	20 %	40 %	40 %	0 %	414562961
5	NC_017582	TTAGC	2	10	5748	5757	20 %	40 %	20 %	20 %	414562963
6	NC_017582	GTGAT	2	10	6069	6078	20 %	40 %	40 %	0 %	414562963
7	NC_017582	AGCAA	2	10	7081	7090	60 %	0 %	20 %	20 %	414562963
8	NC_017582	TTTTA	2	10	9812	9821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017582	TTATC	2	10	12373	12382	20 %	60 %	0 %	20 %	414562967
10	NC_017582	GGATT	2	10	14208	14217	20 %	40 %	40 %	0 %	414562969
11	NC_017582	GTATG	2	10	15920	15929	20 %	40 %	40 %	0 %	414562970
12	NC_017582	GATTT	2	10	16505	16514	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
13	NC_017582	TATTG	2	10	16927	16936	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
14	NC_017582	GTATT	2	10	17202	17211	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
15	NC_017582	TCGTG	2	10	19172	19181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017582	GTTAA	2	10	20248	20257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017582	CTGTG	2	10	20545	20554	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017582	GGGAG	2	10	20767	20776	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017582	AGGGA	2	10	22975	22984	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017582	TAAGT	2	10	23227	23236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017582	GCTTA	2	10	23340	23349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017582	GCATA	2	10	23938	23947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017582	CTTTT	2	10	25752	25761	0 %	80 %	0 %	20 %	414562973
24	NC_017582	TTTTG	2	10	26178	26187	0 %	80 %	20 %	0 %	414562973
25	NC_017582	TTGAT	2	10	29283	29292	20 %	60 %	20 %	0 %	414562976
26	NC_017582	GATGT	2	10	30447	30456	20 %	40 %	40 %	0 %	414562977
27	NC_017582	TTTAT	2	10	31120	31129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017582	AGTTG	2	10	32185	32194	20 %	40 %	40 %	0 %	414562980
29	NC_017582	GCTTG	2	10	34402	34411	0 %	40 %	40 %	20 %	414562980
30	NC_017582	AGGCA	2	10	34635	34644	40 %	0 %	40 %	20 %	414562980
31	NC_017582	CAGCT	2	10	34764	34773	20 %	20 %	20 %	40 %	414562980
32	NC_017582	AAATG	2	10	36875	36884	60 %	20 %	20 %	0 %	414562981
33	NC_017582	ACAAG	2	10	39753	39762	60 %	0 %	20 %	20 %	414562984
34	NC_017582	GTGGA	2	10	41283	41292	20 %	20 %	60 %	0 %	414562985
35	NC_017582	AAGCA	2	10	43899	43908	60 %	0 %	20 %	20 %	414562987
36	NC_017582	AGCAG	2	10	45324	45333	40 %	0 %	40 %	20 %	414562989
37	NC_017582	TAGCC	2	10	47846	47855	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017582	AGAAA	2	10	48979	48988	80 %	0 %	20 %	0 %	414562992
39	NC_017582	TGAGG	2	10	50344	50353	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017582	CTTGT	2	10	51581	51590	0 %	60 %	20 %	20 %	414562996
41	NC_017582	TTGGT	2	10	51800	51809	0 %	60 %	40 %	0 %	414562996
42	NC_017582	CTTTC	2	10	51964	51973	0 %	60 %	0 %	40 %	414562996
43	NC_017582	TTTTC	2	10	52350	52359	0 %	80 %	0 %	20 %	414562996
44	NC_017582	ATCCA	2	10	52766	52775	40 %	20 %	0 %	40 %	414562996
45	NC_017582	TGGTA	2	10	53021	53030	20 %	40 %	40 %	0 %	414562996
46	NC_017582	ATGGT	2	10	54306	54315	20 %	40 %	40 %	0 %	414562998
47	NC_017582	ATTCA	2	10	54990	54999	40 %	40 %	0 %	20 %	414562998
48	NC_017582	TACAA	2	10	57885	57894	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017582	AACCA	2	10	57968	57977	60 %	0 %	0 %	40 %	414563001
50	NC_017582	TGCCA	2	10	59210	59219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017582	AAGCT	2	10	62390	62399	40 %	20 %	20 %	20 %	414563003
52	NC_017582	GAAAA	2	10	66154	66163	80 %	0 %	20 %	0 %	414563010
53	NC_017582	TTTGG	2	10	66568	66577	0 %	60 %	40 %	0 %	414563011
54	NC_017582	TTCAC	2	10	66924	66933	20 %	40 %	0 %	40 %	414563012
55	NC_017582	TGAAA	2	10	68004	68013	60 %	20 %	20 %	0 %	414563014
56	NC_017582	AAGGA	2	10	69092	69101	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017582	AAATA	2	10	73358	73367	80 %	20 %	0 %	0 %	414563024
58	NC_017582	TTCCT	2	10	73462	73471	0 %	60 %	0 %	40 %	414563024
59	NC_017582	TCCAA	2	10	74039	74048	40 %	20 %	0 %	40 %	414563024
60	NC_017582	AGAAT	2	10	74609	74618	60 %	20 %	20 %	0 %	414563024
61	NC_017582	ACTAG	2	10	75450	75459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017582	GTTTC	2	10	76694	76703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017582	TTTTA	2	10	81124	81133	20 %	80 %	0 %	0 %	414563032
64	NC_017582	TTTAG	2	10	81347	81356	20 %	60 %	20 %	0 %	414563032
65	NC_017582	TCGTG	2	10	83644	83653	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017582	GTTAA	2	10	84720	84729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017582	CTGTG	2	10	85017	85026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017582	GGGAG	2	10	85239	85248	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017582	AGGGA	2	10	87447	87456	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017582	TAAGT	2	10	87699	87708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017582	GCTTA	2	10	87812	87821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017582	AGTTT	2	10	88790	88799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017582	AAAAG	2	10	88905	88914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017582	TCTTT	2	10	88934	88943	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017582	CAACC	2	10	89831	89840	40 %	0 %	0 %	60 %	414563034
76	NC_017582	CTAAA	2	10	90737	90746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017582	GAAAA	2	10	91667	91676	80 %	0 %	20 %	0 %	414563035
78	NC_017582	GATAA	2	10	91800	91809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017582	GGTCT	2	10	91857	91866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017582	AAGGA	2	10	92550	92559	60 %	0 %	40 %	0 %	414563036
81	NC_017582	TGTTT	2	10	96661	96670	0 %	80 %	20 %	0 %	414563041
82	NC_017582	TTCCT	2	10	102940	102949	0 %	60 %	0 %	40 %	414563044
83	NC_017582	GACTA	2	10	104646	104655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017582	AATTT	2	10	108728	108737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017582	ATTGA	2	10	109998	110007	40 %	40 %	20 %	0 %	414563049
86	NC_017582	ATAAA	2	10	112060	112069	80 %	20 %	0 %	0 %	414563052
87	NC_017582	ACGCA	2	10	112108	112117	40 %	0 %	20 %	40 %	414563052
88	NC_017582	TTTAA	2	10	112824	112833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017582	TTAGC	2	10	115102	115111	20 %	40 %	20 %	20 %	414563054
90	NC_017582	TAAGG	2	10	116756	116765	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017582	TTTGG	2	10	116821	116830	0 %	60 %	40 %	0 %	414563056
92	NC_017582	AACAC	2	10	118205	118214	60 %	0 %	0 %	40 %	414563056
93	NC_017582	ATCAA	2	10	121320	121329	60 %	20 %	0 %	20 %	414563059
94	NC_017582	CAAAG	2	10	122370	122379	60 %	0 %	20 %	20 %	414563062
95	NC_017582	TTTCA	2	10	123271	123280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017582	TGATA	2	10	123290	123299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017582	AATCG	2	10	124143	124152	40 %	20 %	20 %	20 %	414563065
98	NC_017582	TGATT	2	10	124524	124533	20 %	60 %	20 %	0 %	414563066
99	NC_017582	TAATT	2	10	125706	125715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017582	TCACT	2	10	126400	126409	20 %	40 %	0 %	40 %	414563067
101	NC_017582	ATTAT	2	10	126605	126614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017582	TTTAT	2	10	127679	127688	20 %	80 %	0 %	0 %	414563069
103	NC_017582	ATCAG	2	10	127957	127966	40 %	20 %	20 %	20 %	414563069
104	NC_017582	ACGAT	2	10	128372	128381	40 %	20 %	20 %	20 %	414563069
105	NC_017582	GCTTT	2	10	128556	128565	0 %	60 %	20 %	20 %	414563069
106	NC_017582	GCCTT	2	10	129991	130000	0 %	40 %	20 %	40 %	414563071
107	NC_017582	AAGGA	2	10	132122	132131	60 %	0 %	40 %	0 %	414563073
108	NC_017582	ACATC	2	10	136416	136425	40 %	20 %	0 %	40 %	414563076
109	NC_017582	TTTCC	2	10	139252	139261	0 %	60 %	0 %	40 %	414563078
110	NC_017582	CATGT	2	10	139271	139280	20 %	40 %	20 %	20 %	414563078
111	NC_017582	CAATC	2	10	140000	140009	40 %	20 %	0 %	40 %	414563079
112	NC_017582	GATTC	2	10	140578	140587	20 %	40 %	20 %	20 %	414563080
113	NC_017582	GCTTG	2	10	141887	141896	0 %	40 %	40 %	20 %	414563081
114	NC_017582	AAGTT	2	10	144768	144777	40 %	40 %	20 %	0 %	414563083
115	NC_017582	TCTTT	2	10	147142	147151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017582	TTGAA	2	10	148542	148551	40 %	40 %	20 %	0 %	414563088
117	NC_017582	AAAAG	2	10	153894	153903	80 %	0 %	20 %	0 %	414563094
118	NC_017582	TTTTG	2	10	154426	154435	0 %	80 %	20 %	0 %	414563096
119	NC_017582	TGGAG	2	10	157184	157193	20 %	20 %	60 %	0 %	414563100
120	NC_017582	AAGAT	2	10	158611	158620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017582	AAAAT	2	10	160616	160625	80 %	20 %	0 %	0 %	414563104
122	NC_017582	AAAGG	2	10	161107	161116	60 %	0 %	40 %	0 %	414563105
123	NC_017582	GCAGC	2	10	161117	161126	20 %	0 %	40 %	40 %	414563105
124	NC_017582	GAGCA	2	10	161690	161699	40 %	0 %	40 %	20 %	414563105
125	NC_017582	CAGCT	2	10	162259	162268	20 %	20 %	20 %	40 %	414563105
126	NC_017582	CAAGC	2	10	162377	162386	40 %	0 %	20 %	40 %	414563105
127	NC_017582	GGTCA	2	10	164291	164300	20 %	20 %	40 %	20 %	414563107
128	NC_017582	GTCGT	2	10	164565	164574	0 %	40 %	40 %	20 %	414563107
129	NC_017582	GTGTT	2	10	165659	165668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017582	ATTAT	2	10	165795	165804	40 %	60 %	0 %	0 %	414563108
131	NC_017582	CTTGT	2	10	166486	166495	0 %	60 %	20 %	20 %	414563108
132	NC_017582	GTATT	2	10	166637	166646	20 %	60 %	20 %	0 %	414563108
133	NC_017582	GCAAA	2	10	168430	168439	60 %	0 %	20 %	20 %	414563109
134	NC_017582	TGCAA	2	10	169005	169014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017582	AGACT	2	10	169144	169153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017582	GCCTA	2	10	169613	169622	20 %	20 %	20 %	40 %	414563111
137	NC_017582	AAAGG	2	10	171511	171520	60 %	0 %	40 %	0 %	414563111
138	NC_017582	TAAAA	2	10	171803	171812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017582	TAAGC	2	10	174669	174678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017582	TTGGA	2	10	176205	176214	20 %	40 %	40 %	0 %	414563118
141	NC_017582	CTGTG	2	10	179096	179105	0 %	40 %	40 %	20 %	414563120
142	NC_017582	TTTGA	2	10	179337	179346	20 %	60 %	20 %	0 %	414563120
143	NC_017582	TTGGT	2	10	181036	181045	0 %	60 %	40 %	0 %	414563122
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147	NC_017582	TGGCT	2	10	183380	183389	0 %	40 %	40 %	20 %	414563124
148	NC_017582	GATTG	2	10	185543	185552	20 %	40 %	40 %	0 %	414563125
149	NC_017582	AATTG	2	10	186737	186746	40 %	40 %	20 %	0 %	414563125
150	NC_017582	GCAGC	2	10	187165	187174	20 %	0 %	40 %	40 %	414563125
151	NC_017582	GCTTG	2	10	187966	187975	0 %	40 %	40 %	20 %	414563127
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153	NC_017582	CAATC	2	10	193188	193197	40 %	20 %	0 %	40 %	414563130
154	NC_017582	CTATT	2	10	193275	193284	20 %	60 %	0 %	20 %	414563130
155	NC_017582	CTAAA	2	10	198999	199008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_017582	GCCAT	2	10	203634	203643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017582	AGATT	2	10	205225	205234	40 %	40 %	20 %	0 %	414563143
159	NC_017582	TATTT	2	10	205541	205550	20 %	80 %	0 %	0 %	414563143
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162	NC_017582	ATCAA	2	10	208074	208083	60 %	20 %	0 %	20 %	414563147
163	NC_017582	ATTCA	2	10	209098	209107	40 %	40 %	0 %	20 %	414563148
164	NC_017582	CCAAG	2	10	209220	209229	40 %	0 %	20 %	40 %	414563148
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171	NC_017582	TAAGC	2	10	218798	218807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_017582	CTTTT	2	10	221902	221911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017582	CTTGG	2	10	225634	225643	0 %	40 %	40 %	20 %	414563165
174	NC_017582	TGAAT	2	10	225756	225765	40 %	40 %	20 %	0 %	414563165
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176	NC_017582	TTTTG	2	10	226908	226917	0 %	80 %	20 %	0 %	414563166
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181	NC_017582	TTGGT	2	10	230172	230181	0 %	60 %	40 %	0 %	414563169
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185	NC_017582	TCTGC	2	10	237678	237687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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187	NC_017582	TAAGG	2	10	239972	239981	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017582	CTTTA	2	10	240745	240754	20 %	60 %	0 %	20 %	414563179
189	NC_017582	AGAGT	2	10	241486	241495	40 %	20 %	40 %	0 %	414563179
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191	NC_017582	TTCTT	2	10	246401	246410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017582	GAAAA	2	10	251544	251553	80 %	0 %	20 %	0 %	414563191
193	NC_017582	GGCCA	2	10	252277	252286	20 %	0 %	40 %	40 %	414563192
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195	NC_017582	ATTTT	2	10	256980	256989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017582	GAAAA	2	10	258498	258507	80 %	0 %	20 %	0 %	414563201
197	NC_017582	TGAGA	2	10	259511	259520	40 %	20 %	40 %	0 %	414563201
198	NC_017582	CCTTT	2	10	259689	259698	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_017582	TTTTC	2	10	259985	259994	0 %	80 %	0 %	20 %	414563202
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218	NC_017582	GCAAG	2	10	283354	283363	40 %	0 %	40 %	20 %	414563226
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221	NC_017582	ATAAA	2	10	287975	287984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_017582	TAATT	2	10	288033	288042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_017582	TGCTA	2	10	290823	290832	20 %	40 %	20 %	20 %	414563235
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231	NC_017582	GCCTT	2	10	299684	299693	0 %	40 %	20 %	40 %	414563243
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233	NC_017582	TAGCT	2	10	300715	300724	20 %	40 %	20 %	20 %	414563245
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237	NC_017582	ATGAG	2	10	309474	309483	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
238	NC_017582	TTTTA	2	10	311747	311756	20 %	80 %	0 %	0 %	414563257
239	NC_017582	TATCA	2	10	312434	312443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
240	NC_017582	TGATA	2	10	312459	312468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017582	TTTTC	2	10	312926	312935	0 %	80 %	0 %	20 %	414563258
242	NC_017582	GACTT	2	10	313035	313044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
243	NC_017582	TGAGA	2	10	313095	313104	40 %	20 %	40 %	0 %	414563259
244	NC_017582	TGCCT	2	10	314525	314534	0 %	40 %	20 %	40 %	414563261
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246	NC_017582	GGGGA	2	10	317553	317562	20 %	0 %	80 %	0 %	414563263
247	NC_017582	TTGGC	2	10	319153	319162	0 %	40 %	40 %	20 %	414563265
248	NC_017582	TCACC	2	10	320601	320610	20 %	20 %	0 %	60 %	414563266
249	NC_017582	CAAAG	2	10	322163	322172	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
250	NC_017582	GCTTA	2	10	322433	322442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
251	NC_017582	GTGTA	2	10	323278	323287	20 %	40 %	40 %	0 %	414563269
252	NC_017582	TGATG	2	10	323484	323493	20 %	40 %	40 %	0 %	414563269
253	NC_017582	CTGCT	2	10	325694	325703	0 %	40 %	20 %	40 %	414563270
254	NC_017582	ATGTT	2	10	328412	328421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017582	TGATT	2	10	328644	328653	20 %	60 %	20 %	0 %	414563274
256	NC_017582	AGCTA	2	10	330281	330290	40 %	20 %	20 %	20 %	414563274
257	NC_017582	CCATA	2	10	331800	331809	40 %	20 %	0 %	40 %	414563276
258	NC_017582	GTTTT	2	10	333450	333459	0 %	80 %	20 %	0 %	414563278
259	NC_017582	CAAAA	2	10	336032	336041	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_017582	CCTAG	2	10	336186	336195	20 %	20 %	20 %	40 %	414563280
261	NC_017582	CCAAG	2	10	336896	336905	40 %	0 %	20 %	40 %	414563281
262	NC_017582	CATAG	2	10	336930	336939	40 %	20 %	20 %	20 %	414563281
263	NC_017582	CCTGC	2	10	337343	337352	0 %	20 %	20 %	60 %	414563281
264	NC_017582	ATCAA	2	10	338139	338148	60 %	20 %	0 %	20 %	414563282
265	NC_017582	AGCTT	2	10	338735	338744	20 %	40 %	20 %	20 %	414563283
266	NC_017582	ATTTG	2	10	340252	340261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017582	GATAT	2	10	341659	341668	40 %	40 %	20 %	0 %	414563285
268	NC_017582	TATGC	2	10	342466	342475	20 %	40 %	20 %	20 %	414563288
269	NC_017582	GCTTT	2	10	342998	343007	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017582	CGTTT	2	10	344233	344242	0 %	60 %	20 %	20 %	414563292
271	NC_017582	GTCAT	2	10	346161	346170	20 %	40 %	20 %	20 %	414563295
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401	NC_017582	CGCCA	2	10	510752	510761	20 %	0 %	20 %	60 %	414563454
402	NC_017582	CTTAT	2	10	512996	513005	20 %	60 %	0 %	20 %	414563454
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404	NC_017582	ATGAA	2	10	516287	516296	60 %	20 %	20 %	0 %	414563458
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407	NC_017582	GAAGA	2	10	517162	517171	60 %	0 %	40 %	0 %	414563458
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414	NC_017582	AAAAT	2	10	524129	524138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_017582	TGCAA	2	10	572711	572720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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