MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 1327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	ACAGT	2	10	373	382	40 %	20 %	20 %	20 %	414562957
2	NC_017582	TGAAA	2	10	2804	2813	60 %	20 %	20 %	0 %	414562959
3	NC_017582	TGGTA	2	10	3669	3678	20 %	40 %	40 %	0 %	414562961
4	NC_017582	TTAGC	2	10	5748	5757	20 %	40 %	20 %	20 %	414562963
5	NC_017582	GTGAT	2	10	6069	6078	20 %	40 %	40 %	0 %	414562963
6	NC_017582	AGCAA	2	10	7081	7090	60 %	0 %	20 %	20 %	414562963
7	NC_017582	TTATC	2	10	12373	12382	20 %	60 %	0 %	20 %	414562967
8	NC_017582	GGATT	2	10	14208	14217	20 %	40 %	40 %	0 %	414562969
9	NC_017582	GTATG	2	10	15920	15929	20 %	40 %	40 %	0 %	414562970
10	NC_017582	GATTT	2	10	16505	16514	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
11	NC_017582	TATTG	2	10	16927	16936	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
12	NC_017582	GTATT	2	10	17202	17211	20 %	60 %	20 %	0 %	414562971
13	NC_017582	CTTTT	2	10	25752	25761	0 %	80 %	0 %	20 %	414562973
14	NC_017582	TTTTG	2	10	26178	26187	0 %	80 %	20 %	0 %	414562973
15	NC_017582	TTGAT	2	10	29283	29292	20 %	60 %	20 %	0 %	414562976
16	NC_017582	GATGT	2	10	30447	30456	20 %	40 %	40 %	0 %	414562977
17	NC_017582	AGTTG	2	10	32185	32194	20 %	40 %	40 %	0 %	414562980
18	NC_017582	GCTTG	2	10	34402	34411	0 %	40 %	40 %	20 %	414562980
19	NC_017582	AGGCA	2	10	34635	34644	40 %	0 %	40 %	20 %	414562980
20	NC_017582	CAGCT	2	10	34764	34773	20 %	20 %	20 %	40 %	414562980
21	NC_017582	AAATG	2	10	36875	36884	60 %	20 %	20 %	0 %	414562981
22	NC_017582	ACAAG	2	10	39753	39762	60 %	0 %	20 %	20 %	414562984
23	NC_017582	GTGGA	2	10	41283	41292	20 %	20 %	60 %	0 %	414562985
24	NC_017582	AAGCA	2	10	43899	43908	60 %	0 %	20 %	20 %	414562987
25	NC_017582	AGCAG	2	10	45324	45333	40 %	0 %	40 %	20 %	414562989
26	NC_017582	AGAAA	2	10	48979	48988	80 %	0 %	20 %	0 %	414562992
27	NC_017582	CTTGT	2	10	51581	51590	0 %	60 %	20 %	20 %	414562996
28	NC_017582	TTGGT	2	10	51800	51809	0 %	60 %	40 %	0 %	414562996
29	NC_017582	CTTTC	2	10	51964	51973	0 %	60 %	0 %	40 %	414562996
30	NC_017582	TTTTC	2	10	52350	52359	0 %	80 %	0 %	20 %	414562996
31	NC_017582	ATCCA	2	10	52766	52775	40 %	20 %	0 %	40 %	414562996
32	NC_017582	TGGTA	2	10	53021	53030	20 %	40 %	40 %	0 %	414562996
33	NC_017582	ATGGT	2	10	54306	54315	20 %	40 %	40 %	0 %	414562998
34	NC_017582	ATTCA	2	10	54990	54999	40 %	40 %	0 %	20 %	414562998
35	NC_017582	AACCA	2	10	57968	57977	60 %	0 %	0 %	40 %	414563001
36	NC_017582	AAGCT	2	10	62390	62399	40 %	20 %	20 %	20 %	414563003
37	NC_017582	GAAAA	2	10	66154	66163	80 %	0 %	20 %	0 %	414563010
38	NC_017582	TTTGG	2	10	66568	66577	0 %	60 %	40 %	0 %	414563011
39	NC_017582	TTCAC	2	10	66924	66933	20 %	40 %	0 %	40 %	414563012
40	NC_017582	TGAAA	2	10	68004	68013	60 %	20 %	20 %	0 %	414563014
41	NC_017582	AAATA	2	10	73358	73367	80 %	20 %	0 %	0 %	414563024
42	NC_017582	TTCCT	2	10	73462	73471	0 %	60 %	0 %	40 %	414563024
43	NC_017582	TCCAA	2	10	74039	74048	40 %	20 %	0 %	40 %	414563024
44	NC_017582	AGAAT	2	10	74609	74618	60 %	20 %	20 %	0 %	414563024
45	NC_017582	TTTTA	2	10	81124	81133	20 %	80 %	0 %	0 %	414563032
46	NC_017582	TTTAG	2	10	81347	81356	20 %	60 %	20 %	0 %	414563032
47	NC_017582	CAACC	2	10	89831	89840	40 %	0 %	0 %	60 %	414563034
48	NC_017582	GAAAA	2	10	91667	91676	80 %	0 %	20 %	0 %	414563035
49	NC_017582	AAGGA	2	10	92550	92559	60 %	0 %	40 %	0 %	414563036
50	NC_017582	TGTTT	2	10	96661	96670	0 %	80 %	20 %	0 %	414563041
51	NC_017582	TTCCT	2	10	102940	102949	0 %	60 %	0 %	40 %	414563044
52	NC_017582	ATTGA	2	10	109998	110007	40 %	40 %	20 %	0 %	414563049
53	NC_017582	ATAAA	2	10	112060	112069	80 %	20 %	0 %	0 %	414563052
54	NC_017582	ACGCA	2	10	112108	112117	40 %	0 %	20 %	40 %	414563052
55	NC_017582	TTAGC	2	10	115102	115111	20 %	40 %	20 %	20 %	414563054
56	NC_017582	TTTGG	2	10	116821	116830	0 %	60 %	40 %	0 %	414563056
57	NC_017582	AACAC	2	10	118205	118214	60 %	0 %	0 %	40 %	414563056
58	NC_017582	ATCAA	2	10	121320	121329	60 %	20 %	0 %	20 %	414563059
59	NC_017582	CAAAG	2	10	122370	122379	60 %	0 %	20 %	20 %	414563062
60	NC_017582	AATCG	2	10	124143	124152	40 %	20 %	20 %	20 %	414563065
61	NC_017582	TGATT	2	10	124524	124533	20 %	60 %	20 %	0 %	414563066
62	NC_017582	TCACT	2	10	126400	126409	20 %	40 %	0 %	40 %	414563067
63	NC_017582	TTTAT	2	10	127679	127688	20 %	80 %	0 %	0 %	414563069
64	NC_017582	ATCAG	2	10	127957	127966	40 %	20 %	20 %	20 %	414563069
65	NC_017582	ACGAT	2	10	128372	128381	40 %	20 %	20 %	20 %	414563069
66	NC_017582	GCTTT	2	10	128556	128565	0 %	60 %	20 %	20 %	414563069
67	NC_017582	GCCTT	2	10	129991	130000	0 %	40 %	20 %	40 %	414563071
68	NC_017582	AAGGA	2	10	132122	132131	60 %	0 %	40 %	0 %	414563073
69	NC_017582	ACATC	2	10	136416	136425	40 %	20 %	0 %	40 %	414563076
70	NC_017582	TTTCC	2	10	139252	139261	0 %	60 %	0 %	40 %	414563078
71	NC_017582	CATGT	2	10	139271	139280	20 %	40 %	20 %	20 %	414563078
72	NC_017582	CAATC	2	10	140000	140009	40 %	20 %	0 %	40 %	414563079
73	NC_017582	GATTC	2	10	140578	140587	20 %	40 %	20 %	20 %	414563080
74	NC_017582	GCTTG	2	10	141887	141896	0 %	40 %	40 %	20 %	414563081
75	NC_017582	AAGTT	2	10	144768	144777	40 %	40 %	20 %	0 %	414563083
76	NC_017582	TTGAA	2	10	148542	148551	40 %	40 %	20 %	0 %	414563088
77	NC_017582	AAAAG	2	10	153894	153903	80 %	0 %	20 %	0 %	414563094
78	NC_017582	TTTTG	2	10	154426	154435	0 %	80 %	20 %	0 %	414563096
79	NC_017582	TGGAG	2	10	157184	157193	20 %	20 %	60 %	0 %	414563100
80	NC_017582	AAAAT	2	10	160616	160625	80 %	20 %	0 %	0 %	414563104
81	NC_017582	AAAGG	2	10	161107	161116	60 %	0 %	40 %	0 %	414563105
82	NC_017582	GCAGC	2	10	161117	161126	20 %	0 %	40 %	40 %	414563105
83	NC_017582	GAGCA	2	10	161690	161699	40 %	0 %	40 %	20 %	414563105
84	NC_017582	CAGCT	2	10	162259	162268	20 %	20 %	20 %	40 %	414563105
85	NC_017582	CAAGC	2	10	162377	162386	40 %	0 %	20 %	40 %	414563105
86	NC_017582	GGTCA	2	10	164291	164300	20 %	20 %	40 %	20 %	414563107
87	NC_017582	GTCGT	2	10	164565	164574	0 %	40 %	40 %	20 %	414563107
88	NC_017582	ATTAT	2	10	165795	165804	40 %	60 %	0 %	0 %	414563108
89	NC_017582	CTTGT	2	10	166486	166495	0 %	60 %	20 %	20 %	414563108
90	NC_017582	GTATT	2	10	166637	166646	20 %	60 %	20 %	0 %	414563108
91	NC_017582	GCAAA	2	10	168430	168439	60 %	0 %	20 %	20 %	414563109
92	NC_017582	GCCTA	2	10	169613	169622	20 %	20 %	20 %	40 %	414563111
93	NC_017582	AAAGG	2	10	171511	171520	60 %	0 %	40 %	0 %	414563111
94	NC_017582	TTGGA	2	10	176205	176214	20 %	40 %	40 %	0 %	414563118
95	NC_017582	CTGTG	2	10	179096	179105	0 %	40 %	40 %	20 %	414563120
96	NC_017582	TTTGA	2	10	179337	179346	20 %	60 %	20 %	0 %	414563120
97	NC_017582	TTGGT	2	10	181036	181045	0 %	60 %	40 %	0 %	414563122
98	NC_017582	AAGGA	2	10	181655	181664	60 %	0 %	40 %	0 %	414563123
99	NC_017582	TTGGC	2	10	181910	181919	0 %	40 %	40 %	20 %	414563123
100	NC_017582	TGGAT	2	10	182728	182737	20 %	40 %	40 %	0 %	414563124
101	NC_017582	TGGCT	2	10	183380	183389	0 %	40 %	40 %	20 %	414563124
102	NC_017582	GATTG	2	10	185543	185552	20 %	40 %	40 %	0 %	414563125
103	NC_017582	AATTG	2	10	186737	186746	40 %	40 %	20 %	0 %	414563125
104	NC_017582	GCAGC	2	10	187165	187174	20 %	0 %	40 %	40 %	414563125
105	NC_017582	GCTTG	2	10	187966	187975	0 %	40 %	40 %	20 %	414563127
106	NC_017582	CTACA	2	10	190075	190084	40 %	20 %	0 %	40 %	414563129
107	NC_017582	CAATC	2	10	193188	193197	40 %	20 %	0 %	40 %	414563130
108	NC_017582	CTATT	2	10	193275	193284	20 %	60 %	0 %	20 %	414563130
109	NC_017582	ACAAA	2	10	201296	201305	80 %	0 %	0 %	20 %	414563137
110	NC_017582	AGATT	2	10	205225	205234	40 %	40 %	20 %	0 %	414563143
111	NC_017582	TATTT	2	10	205541	205550	20 %	80 %	0 %	0 %	414563143
112	NC_017582	AAGGG	2	10	206400	206409	40 %	0 %	60 %	0 %	414563146
113	NC_017582	ATCAA	2	10	208074	208083	60 %	20 %	0 %	20 %	414563147
114	NC_017582	ATTCA	2	10	209098	209107	40 %	40 %	0 %	20 %	414563148
115	NC_017582	CCAAG	2	10	209220	209229	40 %	0 %	20 %	40 %	414563148
116	NC_017582	TATCA	2	10	210405	210414	40 %	40 %	0 %	20 %	414563149
117	NC_017582	AAGGA	2	10	212493	212502	60 %	0 %	40 %	0 %	414563150
118	NC_017582	ACGTC	2	10	213650	213659	20 %	20 %	20 %	40 %	414563151
119	NC_017582	CAAGC	2	10	217045	217054	40 %	0 %	20 %	40 %	414563155
120	NC_017582	AGGTA	2	10	217822	217831	40 %	20 %	40 %	0 %	414563156
121	NC_017582	GCTTA	2	10	218711	218720	20 %	40 %	20 %	20 %	414563157
122	NC_017582	CTTGG	2	10	225634	225643	0 %	40 %	40 %	20 %	414563165
123	NC_017582	TGAAT	2	10	225756	225765	40 %	40 %	20 %	0 %	414563165
124	NC_017582	AATCA	2	10	226175	226184	60 %	20 %	0 %	20 %	414563166
125	NC_017582	TTTTG	2	10	226908	226917	0 %	80 %	20 %	0 %	414563166
126	NC_017582	AGCGA	2	10	227186	227195	40 %	0 %	40 %	20 %	414563167
127	NC_017582	AAGAG	2	10	227497	227506	60 %	0 %	40 %	0 %	414563167
128	NC_017582	TTTTA	2	10	229307	229316	20 %	80 %	0 %	0 %	414563169
129	NC_017582	AGCTG	2	10	229411	229420	20 %	20 %	40 %	20 %	414563169
130	NC_017582	TTGGT	2	10	230172	230181	0 %	60 %	40 %	0 %	414563169
131	NC_017582	CGTTA	2	10	233848	233857	20 %	40 %	20 %	20 %	414563172
132	NC_017582	GCAGA	2	10	234410	234419	40 %	0 %	40 %	20 %	414563173
133	NC_017582	GCTCA	2	10	237204	237213	20 %	20 %	20 %	40 %	414563177
134	NC_017582	AAGGC	2	10	238553	238562	40 %	0 %	40 %	20 %	414563178
135	NC_017582	CTTTA	2	10	240745	240754	20 %	60 %	0 %	20 %	414563179
136	NC_017582	AGAGT	2	10	241486	241495	40 %	20 %	40 %	0 %	414563179
137	NC_017582	GAAAA	2	10	245175	245184	80 %	0 %	20 %	0 %	414563184
138	NC_017582	GAAAA	2	10	251544	251553	80 %	0 %	20 %	0 %	414563191
139	NC_017582	GGCCA	2	10	252277	252286	20 %	0 %	40 %	40 %	414563192
140	NC_017582	GAAAA	2	10	258498	258507	80 %	0 %	20 %	0 %	414563201
141	NC_017582	TGAGA	2	10	259511	259520	40 %	20 %	40 %	0 %	414563201
142	NC_017582	TTTTC	2	10	259985	259994	0 %	80 %	0 %	20 %	414563202
143	NC_017582	GCTTT	2	10	262442	262451	0 %	60 %	20 %	20 %	414563205
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148	NC_017582	GCGTG	2	10	267548	267557	0 %	20 %	60 %	20 %	414563211
149	NC_017582	AAGGC	2	10	269065	269074	40 %	0 %	40 %	20 %	414563213
150	NC_017582	TGGTG	2	10	270561	270570	0 %	40 %	60 %	0 %	414563215
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152	NC_017582	ATTTG	2	10	271384	271393	20 %	60 %	20 %	0 %	414563216
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155	NC_017582	TCAGG	2	10	276241	276250	20 %	20 %	40 %	20 %	414563220
156	NC_017582	CAATT	2	10	279280	279289	40 %	40 %	0 %	20 %	414563223
157	NC_017582	AAGAT	2	10	280054	280063	60 %	20 %	20 %	0 %	414563223
158	NC_017582	ACAGC	2	10	280578	280587	40 %	0 %	20 %	40 %	414563223
159	NC_017582	GCAAG	2	10	283354	283363	40 %	0 %	40 %	20 %	414563226
160	NC_017582	TGAAG	2	10	284714	284723	40 %	20 %	40 %	0 %	414563227
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162	NC_017582	TGCTA	2	10	290823	290832	20 %	40 %	20 %	20 %	414563235
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165	NC_017582	GATCG	2	10	296852	296861	20 %	20 %	40 %	20 %	414563240
166	NC_017582	TGACT	2	10	298018	298027	20 %	40 %	20 %	20 %	414563242
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168	NC_017582	ATTAT	2	10	299340	299349	40 %	60 %	0 %	0 %	414563243
169	NC_017582	GCCTT	2	10	299684	299693	0 %	40 %	20 %	40 %	414563243
170	NC_017582	TAGCT	2	10	300715	300724	20 %	40 %	20 %	20 %	414563245
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174	NC_017582	TTTTA	2	10	311747	311756	20 %	80 %	0 %	0 %	414563257
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193	NC_017582	ATCAA	2	10	338139	338148	60 %	20 %	0 %	20 %	414563282
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199	NC_017582	GTTGA	2	10	351849	351858	20 %	40 %	40 %	0 %	414563299
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241	NC_017582	TCTTG	2	10	438055	438064	0 %	60 %	20 %	20 %	414563378
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247	NC_017582	AGAAA	2	10	448259	448268	80 %	0 %	20 %	0 %	414563390
248	NC_017582	TTTGA	2	10	450455	450464	20 %	60 %	20 %	0 %	414563392
249	NC_017582	GTCTG	2	10	451734	451743	0 %	40 %	40 %	20 %	414563394
250	NC_017582	GCTTG	2	10	451787	451796	0 %	40 %	40 %	20 %	414563394
251	NC_017582	TGTCT	2	10	451808	451817	0 %	60 %	20 %	20 %	414563394
252	NC_017582	GCTAA	2	10	455174	455183	40 %	20 %	20 %	20 %	414563396
253	NC_017582	ATTGC	2	10	458699	458708	20 %	40 %	20 %	20 %	414563402
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255	NC_017582	ATCAC	2	10	464065	464074	40 %	20 %	0 %	40 %	414563408
256	NC_017582	TAAGC	2	10	468447	468456	40 %	20 %	20 %	20 %	414563412
257	NC_017582	CCAAT	2	10	468739	468748	40 %	20 %	0 %	40 %	414563413
258	NC_017582	CCAGC	2	10	469458	469467	20 %	0 %	20 %	60 %	414563413
259	NC_017582	AAAAT	2	10	469705	469714	80 %	20 %	0 %	0 %	414563414
260	NC_017582	CTAGC	2	10	470373	470382	20 %	20 %	20 %	40 %	414563415
261	NC_017582	ATTAC	2	10	471313	471322	40 %	40 %	0 %	20 %	414563416
262	NC_017582	CATTT	2	10	472878	472887	20 %	60 %	0 %	20 %	414563418
263	NC_017582	AATCA	2	10	473214	473223	60 %	20 %	0 %	20 %	414563418
264	NC_017582	GATCG	2	10	473452	473461	20 %	20 %	40 %	20 %	414563418
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379	NC_017582	ATTAC	2	10	655908	655917	40 %	40 %	0 %	20 %	414563595
380	NC_017582	ATAAA	2	10	659541	659550	80 %	20 %	0 %	0 %	414563597
381	NC_017582	TTGAT	2	10	662838	662847	20 %	60 %	20 %	0 %	414563600
382	NC_017582	AAAGA	2	10	664024	664033	80 %	0 %	20 %	0 %	414563601
383	NC_017582	GGCAG	2	10	666862	666871	20 %	0 %	60 %	20 %	414563603
384	NC_017582	TTAAT	2	10	666919	666928	40 %	60 %	0 %	0 %	414563603
385	NC_017582	TCAGA	2	10	670018	670027	40 %	20 %	20 %	20 %	414563607
386	NC_017582	AGCCA	2	10	670879	670888	40 %	0 %	20 %	40 %	414563608
387	NC_017582	ACCAG	2	10	675958	675967	40 %	0 %	20 %	40 %	414563612
388	NC_017582	TGCTC	2	10	676573	676582	0 %	40 %	20 %	40 %	414563613
389	NC_017582	GACCA	2	10	676709	676718	40 %	0 %	20 %	40 %	414563613
390	NC_017582	ATTTG	2	10	682744	682753	20 %	60 %	20 %	0 %	414563621
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499	NC_017582	ATTTG	2	10	845286	845295	20 %	60 %	20 %	0 %	414563774
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