MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	TATT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017582	ATAA	2	8	2742	2749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017582	TGAG	2	8	2763	2770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017582	TTGG	2	8	9379	9386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017582	GCTG	2	8	9894	9901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017582	GCTG	2	8	10126	10133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017582	GCTT	2	8	10171	10178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017582	GTGA	2	8	18505	18512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017582	TAAC	2	8	18588	18595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017582	AGCG	2	8	18676	18683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017582	TGGT	2	8	19341	19348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017582	AGCC	2	8	19558	19565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017582	GTAA	2	8	20334	20341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017582	GAAG	2	8	20416	20423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017582	ATTC	2	8	21354	21361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017582	CTAA	2	8	21709	21716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017582	CTGA	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017582	TAGG	2	8	22364	22371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017582	TTGG	2	8	22547	22554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017582	AATC	2	8	22556	22563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017582	ATAG	2	8	23685	23692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017582	GCGT	2	8	24353	24360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017582	ATTG	2	8	27549	27556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017582	TAGC	2	8	28725	28732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017582	TAAA	2	8	31138	31145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017582	AAAG	2	8	31192	31199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017582	AAAT	2	8	31980	31987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017582	AAGA	2	8	42292	42299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017582	AGGC	2	8	42467	42474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017582	AATG	2	8	42481	42488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017582	CTTT	2	8	42574	42581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017582	TTAT	2	8	42591	42598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017582	GCGA	2	8	43973	43980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017582	TTGG	2	8	46590	46597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017582	ATTA	2	8	48063	48070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017582	GAAA	2	8	48087	48094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017582	TTTG	2	8	50509	50516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017582	AATT	2	8	59034	59041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017582	TAAC	2	8	59202	59209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017582	TATC	2	8	59226	59233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017582	TTTA	2	8	59639	59646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017582	TGAG	2	8	63293	63300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017582	AAAC	2	8	68709	68716	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017582	AAAC	2	8	69694	69701	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017582	GCTT	2	8	70677	70684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017582	CAAA	2	8	70686	70693	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017582	GCTT	2	8	71508	71515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017582	ATCA	2	8	76872	76879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017582	TGAT	2	8	78499	78506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017582	AGCA	2	8	78827	78834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017582	TAAC	2	8	79346	79353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017582	TAAA	2	8	82258	82265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017582	GTGA	2	8	82977	82984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017582	TAAC	2	8	83060	83067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017582	AGCG	2	8	83148	83155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017582	TGGT	2	8	83813	83820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017582	AGCC	2	8	84030	84037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017582	GTAA	2	8	84806	84813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017582	GAAG	2	8	84888	84895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017582	ATTC	2	8	85826	85833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017582	CTAA	2	8	86181	86188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017582	CTGA	2	8	86454	86461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017582	TAGG	2	8	86836	86843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017582	TTGG	2	8	87019	87026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017582	AATC	2	8	87028	87035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017582	GCGT	2	8	88238	88245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017582	ATTG	2	8	91710	91717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017582	TGAT	2	8	92860	92867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017582	TGCT	2	8	93865	93872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017582	TATT	2	8	93988	93995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017582	CTGT	2	8	97119	97126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017582	AGAA	2	8	100866	100873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017582	TGTA	2	8	108630	108637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017582	TTGT	2	8	108877	108884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017582	AATT	2	8	109475	109482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017582	AGGT	2	8	109599	109606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017582	GAAA	2	8	109735	109742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017582	TCTT	2	8	111074	111081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017582	AAGC	2	8	111787	111794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017582	TAAA	2	8	112749	112756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017582	TCTG	2	8	116239	116246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017582	AAAG	2	8	116415	116422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017582	GCTA	2	8	123100	123107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017582	CATT	2	8	125721	125728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017582	GAAT	2	8	126992	126999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017582	CTAT	2	8	132666	132673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017582	AATC	2	8	132782	132789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017582	CTTA	2	8	136035	136042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017582	ATCC	2	8	137058	137065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017582	CAGA	2	8	143300	143307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017582	TTGT	2	8	143842	143849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017582	TCAA	2	8	147010	147017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017582	TACC	2	8	147018	147025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017582	CAGG	2	8	151435	151442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017582	ATTG	2	8	153142	153149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017582	TCTT	2	8	154022	154029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017582	CTAT	2	8	155139	155146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017582	CTTT	2	8	155241	155248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017582	AAGG	2	8	155630	155637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017582	TGTC	2	8	158636	158643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017582	GAAA	2	8	160572	160579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017582	ATTG	2	8	164904	164911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017582	CAAC	2	8	164990	164997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017582	TGGC	2	8	165260	165267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017582	ACAA	2	8	167398	167405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017582	TGCA	2	8	169040	169047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017582	TTGC	2	8	169100	169107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017582	CTTT	2	8	171680	171687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017582	AGTA	2	8	172482	172489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017582	AAGC	2	8	180971	180978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017582	CGCT	2	8	184341	184348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017582	CTTC	2	8	184641	184648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017582	TAAT	2	8	190694	190701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017582	TGGT	2	8	190746	190753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017582	AAGC	2	8	194807	194814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017582	TAGC	2	8	199096	199103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017582	TTTC	2	8	199169	199176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017582	CAAA	2	8	199819	199826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017582	AGGT	2	8	200318	200325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017582	TGCT	2	8	200401	200408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017582	CTTA	2	8	200420	200427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017582	TAAC	2	8	200512	200519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017582	TAGC	2	8	200632	200639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017582	AGGT	2	8	200785	200792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017582	TGCT	2	8	200868	200875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017582	CTTA	2	8	200887	200894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017582	TGTC	2	8	203657	203664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017582	ATCT	2	8	206107	206114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017582	TGCT	2	8	206145	206152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017582	GGCT	2	8	209977	209984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017582	AGCT	2	8	212972	212979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017582	GGTC	2	8	213044	213051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017582	GTCT	2	8	213408	213415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017582	TGTC	2	8	220444	220451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017582	AAAG	2	8	220649	220656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017582	TAGC	2	8	220686	220693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017582	TAAT	2	8	220821	220828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017582	ATAA	2	8	220849	220856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017582	TAAT	2	8	220935	220942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017582	AAAT	2	8	221651	221658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017582	CTAT	2	8	222919	222926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017582	TGAT	2	8	222988	222995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017582	TGCT	2	8	223075	223082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017582	CCAA	2	8	224831	224838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017582	AGAC	2	8	231213	231220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017582	TTTG	2	8	235816	235823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017582	GCTG	2	8	235905	235912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017582	TGCT	2	8	235997	236004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017582	ATAA	2	8	239746	239753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017582	AAAT	2	8	239909	239916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017582	TCAA	2	8	243687	243694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017582	AAAG	2	8	249045	249052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017582	AAAG	2	8	253031	253038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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