MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	GAAGTG	2	12	22386	22397	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017581	ACTAAT	2	12	22416	22427	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017581	TGCTTA	2	12	51139	51150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017581	TTTCAA	2	12	64707	64718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017581	GAAGTG	2	12	70168	70179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017581	ACTAAT	2	12	70198	70209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017581	TTCGGG	2	12	71084	71095	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017581	TTATCT	2	12	77419	77430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017581	TTTATA	2	12	84283	84294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017581	CTAAAA	2	12	136268	136279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017581	TAAAAA	2	12	145447	145458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017581	GAAGTG	2	12	166059	166070	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017581	ACTAAT	2	12	166089	166100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017581	GAAGTG	2	12	171865	171876	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017581	ACTAAT	2	12	171895	171906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017581	TGAAAA	2	12	172592	172603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017581	TACAGC	2	12	174631	174642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017581	ATTTAT	2	12	175874	175885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017581	CAAATA	2	12	190358	190369	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017581	CAAAAA	2	12	221965	221976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017581	AGATAA	2	12	340948	340959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017581	ATGATA	2	12	341027	341038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017581	ATTTTT	2	12	349944	349955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017581	GAAGTG	2	12	384411	384422	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017581	ACTAAT	2	12	384441	384452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017581	TTTCTT	2	12	385204	385215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017581	AAAAGG	2	12	416031	416042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017581	TCAAGC	2	12	445811	445822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017581	AGTGGG	2	12	449885	449896	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017581	TAGTAA	2	12	489384	489395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017581	CAAAAA	2	12	507278	507289	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017581	CCCCTA	2	12	515365	515376	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017581	TCTATA	2	12	523480	523491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017581	ATAATG	2	12	576132	576143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017581	TTGTCA	2	12	579429	579440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017581	ATTTTT	2	12	582736	582747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017581	TTCGGG	2	12	645668	645679	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017581	ATTTGA	2	12	677791	677802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017581	CTTAGG	2	12	737075	737086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017581	AACTAT	2	12	863469	863480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017581	TATTGC	2	12	869444	869455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017581	AGTATG	2	12	884308	884319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017581	AAAGAA	2	12	907017	907028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017581	TATGTT	2	12	969947	969958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017581	CTGTTT	2	12	970217	970228	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017581	CTGTTT	2	12	970653	970664	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017581	AAATGA	2	12	987463	987474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017581	CCAAAA	2	12	998279	998290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017581	CTTATA	2	12	1035428	1035439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017581	CTAGCC	2	12	1043497	1043508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017581	CTACCA	2	12	1048512	1048523	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017581	TTTTTC	2	12	1053461	1053472	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017581	ACAAAA	2	12	1056518	1056529	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017581	ATTTTT	2	12	1058649	1058660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017581	ATTAAA	2	12	1077670	1077681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017581	ATTTTT	2	12	1077898	1077909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017581	TAAAAA	2	12	1078743	1078754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017581	TTTATC	2	12	1085205	1085216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017581	ATATTC	2	12	1102731	1102742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017581	CTATAT	2	12	1114807	1114818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017581	CTTTTT	2	12	1150679	1150690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017581	ATATAA	2	12	1157534	1157545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017581	TAGTTG	2	12	1170021	1170032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017581	GTTTTC	2	12	1193664	1193675	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017581	GCTTTT	2	12	1275885	1275896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017581	AAGATT	2	12	1309153	1309164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017581	TCTTTT	2	12	1311670	1311681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017581	TTATCG	2	12	1338988	1338999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017581	TTTTTA	2	12	1438526	1438537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017581	AAAAAC	2	12	1501605	1501616	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017581	ATCTCA	2	12	1521752	1521763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017581	CAAAAT	2	12	1540555	1540566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017581	TTTTTC	2	12	1555227	1555238	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017581	ATCAAA	2	12	1573260	1573271	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017581	TTGTAT	2	12	1574712	1574723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017581	TTTTAT	2	12	1575038	1575049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017581	ATTATC	2	12	1575163	1575174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017581	ACACAA	2	12	1584184	1584195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017581	TCATAA	2	12	1604569	1604580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017581	AAAAAG	2	12	1609220	1609231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017581	GATTTT	2	12	1616775	1616786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017581	CTTTTA	2	12	1625408	1625419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017581	GAAAAA	2	12	1654245	1654256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017581	CCTCTA	2	12	1675015	1675026	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017581	CATAAA	2	12	1675145	1675156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017581	GCCACT	2	12	1678740	1678751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017581	GAACCA	2	12	1715946	1715957	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017581	GAAATA	2	12	1727148	1727159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017581	TATTAG	2	12	1728080	1728091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017581	TATTTA	2	12	1758911	1758922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017581	CGATAA	2	12	1860256	1860267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017581	GACTAT	2	12	1865308	1865319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017581	CAAGGG	2	12	1865363	1865374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017581	TAAAAT	2	12	1885077	1885088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017581	TTCCTT	2	12	1885835	1885846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017581	TCAACT	2	12	1890464	1890475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017581	TATCTT	2	12	1890526	1890537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017581	AATAAA	2	12	1921473	1921484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.