MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 1349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	AAAGG	2	10	1965	1974	60 %	0 %	40 %	0 %	386343610
2	NC_017581	CAAAT	2	10	2302	2311	60 %	20 %	0 %	20 %	386343610
3	NC_017581	TGATT	2	10	2588	2597	20 %	60 %	20 %	0 %	386343610
4	NC_017581	GAGAT	2	10	5556	5565	40 %	20 %	40 %	0 %	386343614
5	NC_017581	TTATG	2	10	7363	7372	20 %	60 %	20 %	0 %	386343614
6	NC_017581	CTTTT	2	10	8512	8521	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017581	GGAAA	2	10	8635	8644	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017581	TCAGA	2	10	9146	9155	40 %	20 %	20 %	20 %	386343616
9	NC_017581	CAGTA	2	10	12684	12693	40 %	20 %	20 %	20 %	386343621
10	NC_017581	GGTAA	2	10	12764	12773	40 %	20 %	40 %	0 %	386343621
11	NC_017581	TCGTG	2	10	18802	18811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017581	GTTAA	2	10	19548	19557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017581	GGGAG	2	10	20066	20075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017581	AGGGA	2	10	22275	22284	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017581	TTGAG	2	10	22509	22518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017581	CTAGT	2	10	25442	25451	20 %	40 %	20 %	20 %	386343628
17	NC_017581	CAATC	2	10	25778	25787	40 %	20 %	0 %	40 %	386343629
18	NC_017581	ATTCA	2	10	26981	26990	40 %	40 %	0 %	20 %	386343629
19	NC_017581	TGATT	2	10	28200	28209	20 %	60 %	20 %	0 %	386343630
20	NC_017581	ACCTT	2	10	28943	28952	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017581	TTTTG	2	10	29828	29837	0 %	80 %	20 %	0 %	386343631
22	NC_017581	ATGAA	2	10	31181	31190	60 %	20 %	20 %	0 %	386343632
23	NC_017581	GTAGA	2	10	32546	32555	40 %	20 %	40 %	0 %	386343634
24	NC_017581	AACAA	2	10	32984	32993	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017581	AAATG	2	10	38658	38667	60 %	20 %	20 %	0 %	386343637
26	NC_017581	AAAAT	2	10	40833	40842	80 %	20 %	0 %	0 %	386343640
27	NC_017581	TCAAA	2	10	42087	42096	60 %	20 %	0 %	20 %	386343640
28	NC_017581	ACTAT	2	10	44706	44715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017581	TTGAT	2	10	45057	45066	20 %	60 %	20 %	0 %	386343645
30	NC_017581	GAAGC	2	10	48015	48024	40 %	0 %	40 %	20 %	386343647
31	NC_017581	ATTTT	2	10	48325	48334	20 %	80 %	0 %	0 %	386343648
32	NC_017581	GCTTG	2	10	49633	49642	0 %	40 %	40 %	20 %	386343650
33	NC_017581	CTTTT	2	10	51643	51652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017581	TAGCT	2	10	62861	62870	20 %	40 %	20 %	20 %	386343662
35	NC_017581	TTCTT	2	10	64540	64549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017581	TTTGA	2	10	64550	64559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017581	GATAA	2	10	64655	64664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017581	TTGAT	2	10	64932	64941	20 %	60 %	20 %	0 %	386343664
39	NC_017581	TCGTG	2	10	66583	66592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017581	GTTAA	2	10	67330	67339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017581	GGGAG	2	10	67848	67857	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017581	AGGGA	2	10	70057	70066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017581	TTGAG	2	10	70291	70300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017581	GTTTT	2	10	72290	72299	0 %	80 %	20 %	0 %	386343665
45	NC_017581	GATTA	2	10	72870	72879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017581	CAAAT	2	10	80106	80115	60 %	20 %	0 %	20 %	386343673
47	NC_017581	GAATC	2	10	82445	82454	40 %	20 %	20 %	20 %	386343674
48	NC_017581	AGAAA	2	10	82499	82508	80 %	0 %	20 %	0 %	386343674
49	NC_017581	TCAAA	2	10	83379	83388	60 %	20 %	0 %	20 %	386343674
50	NC_017581	AATTT	2	10	83941	83950	40 %	60 %	0 %	0 %	386343676
51	NC_017581	AAGAT	2	10	84682	84691	60 %	20 %	20 %	0 %	386343677
52	NC_017581	GGGGC	2	10	88447	88456	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017581	CAGCC	2	10	88458	88467	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017581	AAAAG	2	10	89561	89570	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017581	TCAGC	2	10	90637	90646	20 %	20 %	20 %	40 %	386343683
56	NC_017581	TTTTA	2	10	100174	100183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017581	GCTTC	2	10	101207	101216	0 %	40 %	20 %	40 %	386343692
58	NC_017581	AAGCC	2	10	101336	101345	40 %	0 %	20 %	40 %	386343692
59	NC_017581	CTGTT	2	10	101416	101425	0 %	60 %	20 %	20 %	386343692
60	NC_017581	AAATA	2	10	104389	104398	80 %	20 %	0 %	0 %	386343697
61	NC_017581	AAATG	2	10	105622	105631	60 %	20 %	20 %	0 %	386343700
62	NC_017581	AACAA	2	10	107370	107379	80 %	0 %	0 %	20 %	386343702
63	NC_017581	CACAC	2	10	107504	107513	40 %	0 %	0 %	60 %	386343702
64	NC_017581	TTAAA	2	10	112162	112171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017581	ATAAA	2	10	113303	113312	80 %	20 %	0 %	0 %	386343709
66	NC_017581	ATGGA	2	10	114137	114146	40 %	20 %	40 %	0 %	386343709
67	NC_017581	ATCTG	2	10	116038	116047	20 %	40 %	20 %	20 %	386343711
68	NC_017581	TTAAA	2	10	116391	116400	60 %	40 %	0 %	0 %	386343711
69	NC_017581	TATTC	2	10	118518	118527	20 %	60 %	0 %	20 %	386343711
70	NC_017581	CAAAA	2	10	118699	118708	80 %	0 %	0 %	20 %	386343711
71	NC_017581	TAATT	2	10	118789	118798	40 %	60 %	0 %	0 %	386343711
72	NC_017581	AAAAT	2	10	119862	119871	80 %	20 %	0 %	0 %	386343711
73	NC_017581	TTATA	2	10	122705	122714	40 %	60 %	0 %	0 %	386343714
74	NC_017581	TTTTA	2	10	123569	123578	20 %	80 %	0 %	0 %	386343715
75	NC_017581	ACAGC	2	10	123979	123988	40 %	0 %	20 %	40 %	386343716
76	NC_017581	TCAAT	2	10	125170	125179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017581	AAAAT	2	10	132113	132122	80 %	20 %	0 %	0 %	386343726
78	NC_017581	AAGGT	2	10	133098	133107	40 %	20 %	40 %	0 %	386343727
79	NC_017581	AGAAA	2	10	133812	133821	80 %	0 %	20 %	0 %	386343729
80	NC_017581	AAGAA	2	10	134343	134352	80 %	0 %	20 %	0 %	386343729
81	NC_017581	AAATT	2	10	134881	134890	60 %	40 %	0 %	0 %	386343731
82	NC_017581	ATTAA	2	10	139467	139476	60 %	40 %	0 %	0 %	386343737
83	NC_017581	GAAAA	2	10	141818	141827	80 %	0 %	20 %	0 %	386343737
84	NC_017581	TTTGT	2	10	145891	145900	0 %	80 %	20 %	0 %	386343742
85	NC_017581	ATTGT	2	10	149877	149886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017581	TCTGT	2	10	151423	151432	0 %	60 %	20 %	20 %	386343748
87	NC_017581	CGGTT	2	10	152074	152083	0 %	40 %	40 %	20 %	386343749
88	NC_017581	CAGTT	2	10	154218	154227	20 %	40 %	20 %	20 %	386343753
89	NC_017581	AAGGT	2	10	154440	154449	40 %	20 %	40 %	0 %	386343753
90	NC_017581	TTAGT	2	10	154689	154698	20 %	60 %	20 %	0 %	386343753
91	NC_017581	GTATC	2	10	156918	156927	20 %	40 %	20 %	20 %	386343755
92	NC_017581	AAGTG	2	10	157623	157632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017581	TTCGT	2	10	157652	157661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017581	AAATA	2	10	157665	157674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017581	AAAGG	2	10	158748	158757	60 %	0 %	40 %	0 %	386343756
96	NC_017581	TGATA	2	10	159039	159048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017581	TCGTG	2	10	162475	162484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017581	GTTAA	2	10	163221	163230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017581	GGGAG	2	10	163739	163748	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017581	AGGGA	2	10	165948	165957	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017581	TTGAG	2	10	166182	166191	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017581	TCGTG	2	10	168281	168290	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017581	GTTAA	2	10	169027	169036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017581	GGGAG	2	10	169545	169554	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017581	AGGGA	2	10	171754	171763	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017581	TTGAG	2	10	171988	171997	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017581	GGATG	2	10	173660	173669	20 %	20 %	60 %	0 %	386343761
108	NC_017581	TATTT	2	10	175820	175829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017581	AAATT	2	10	177301	177310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017581	TAAAC	2	10	177437	177446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017581	GGTTT	2	10	181832	181841	0 %	60 %	40 %	0 %	386343768
112	NC_017581	TTTGG	2	10	185112	185121	0 %	60 %	40 %	0 %	386343772
113	NC_017581	AAGGT	2	10	185138	185147	40 %	20 %	40 %	0 %	386343772
114	NC_017581	CTGGT	2	10	186719	186728	0 %	40 %	40 %	20 %	386343772
115	NC_017581	ATAAA	2	10	187409	187418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017581	TGATT	2	10	188238	188247	20 %	60 %	20 %	0 %	386343774
117	NC_017581	GAGAT	2	10	189290	189299	40 %	20 %	40 %	0 %	386343774
118	NC_017581	ATTGA	2	10	189595	189604	40 %	40 %	20 %	0 %	386343774
119	NC_017581	CTTTT	2	10	193642	193651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017581	AATGA	2	10	193984	193993	60 %	20 %	20 %	0 %	386343781
121	NC_017581	GGTTG	2	10	195671	195680	0 %	40 %	60 %	0 %	386343782
122	NC_017581	TATTT	2	10	195760	195769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017581	AAGTA	2	10	198746	198755	60 %	20 %	20 %	0 %	386343786
124	NC_017581	CACAA	2	10	199736	199745	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017581	CGTAG	2	10	203060	203069	20 %	20 %	40 %	20 %	386343792
126	NC_017581	AGATA	2	10	203415	203424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017581	TTTTA	2	10	203792	203801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017581	GTCTT	2	10	207128	207137	0 %	60 %	20 %	20 %	386343796
129	NC_017581	AAGTT	2	10	207479	207488	40 %	40 %	20 %	0 %	386343796
130	NC_017581	CTCAG	2	10	210274	210283	20 %	20 %	20 %	40 %	386343799
131	NC_017581	CTTTA	2	10	211525	211534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017581	TTGAT	2	10	213295	213304	20 %	60 %	20 %	0 %	386343806
133	NC_017581	TCATC	2	10	213382	213391	20 %	40 %	0 %	40 %	386343806
134	NC_017581	AGCTT	2	10	217117	217126	20 %	40 %	20 %	20 %	386343816
135	NC_017581	TCCAA	2	10	219525	219534	40 %	20 %	0 %	40 %	386343819
136	NC_017581	TTGGT	2	10	221688	221697	0 %	60 %	40 %	0 %	386343822
137	NC_017581	TTGCC	2	10	222119	222128	0 %	40 %	20 %	40 %	386343823
138	NC_017581	GAAAT	2	10	223067	223076	60 %	20 %	20 %	0 %	386343824
139	NC_017581	CAAGT	2	10	224756	224765	40 %	20 %	20 %	20 %	386343825
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271	NC_017581	TCAGA	2	10	419747	419756	40 %	20 %	20 %	20 %	386344040
272	NC_017581	TTTAC	2	10	421814	421823	20 %	60 %	0 %	20 %	386344045
273	NC_017581	GTCAA	2	10	422417	422426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_017581	TATTT	2	10	590085	590094	20 %	80 %	0 %	0 %	386344227
392	NC_017581	GTTTG	2	10	590782	590791	0 %	60 %	40 %	0 %	386344227
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401	NC_017581	TTGAT	2	10	604829	604838	20 %	60 %	20 %	0 %	386344241
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