MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	CTTTT	2	10	8512	8521	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017581	GGAAA	2	10	8635	8644	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017581	TCGTG	2	10	18802	18811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017581	GTTAA	2	10	19548	19557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017581	GGGAG	2	10	20066	20075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017581	AGGGA	2	10	22275	22284	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017581	TTGAG	2	10	22509	22518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017581	ACCTT	2	10	28943	28952	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017581	AACAA	2	10	32984	32993	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017581	ACTAT	2	10	44706	44715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017581	CTTTT	2	10	51643	51652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017581	TTCTT	2	10	64540	64549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017581	TTTGA	2	10	64550	64559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017581	GATAA	2	10	64655	64664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017581	TCGTG	2	10	66583	66592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017581	GTTAA	2	10	67330	67339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017581	GGGAG	2	10	67848	67857	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017581	AGGGA	2	10	70057	70066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017581	TTGAG	2	10	70291	70300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017581	GATTA	2	10	72870	72879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017581	GGGGC	2	10	88447	88456	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017581	CAGCC	2	10	88458	88467	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017581	AAAAG	2	10	89561	89570	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017581	TTTTA	2	10	100174	100183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017581	TTAAA	2	10	112162	112171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017581	TCAAT	2	10	125170	125179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017581	ATTGT	2	10	149877	149886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017581	AAGTG	2	10	157623	157632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017581	TTCGT	2	10	157652	157661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017581	AAATA	2	10	157665	157674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017581	TGATA	2	10	159039	159048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017581	TCGTG	2	10	162475	162484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017581	GTTAA	2	10	163221	163230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017581	GGGAG	2	10	163739	163748	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017581	AGGGA	2	10	165948	165957	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017581	TTGAG	2	10	166182	166191	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017581	TCGTG	2	10	168281	168290	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017581	GTTAA	2	10	169027	169036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017581	GGGAG	2	10	169545	169554	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017581	AGGGA	2	10	171754	171763	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017581	TTGAG	2	10	171988	171997	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017581	TATTT	2	10	175820	175829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017581	AAATT	2	10	177301	177310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017581	TAAAC	2	10	177437	177446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017581	ATAAA	2	10	187409	187418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017581	CTTTT	2	10	193642	193651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017581	TATTT	2	10	195760	195769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017581	CACAA	2	10	199736	199745	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017581	AGATA	2	10	203415	203424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017581	TTTTA	2	10	203792	203801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017581	CTTTA	2	10	211525	211534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017581	ATAAA	2	10	234482	234491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017581	TAGTA	2	10	249144	249153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017581	GAACA	2	10	262555	262564	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017581	GTTAC	2	10	271754	271763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017581	TATAA	2	10	282109	282118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017581	ATGTA	2	10	282433	282442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017581	GAGAA	2	10	308351	308360	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017581	AATTT	2	10	330954	330963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017581	TAAAA	2	10	340851	340860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017581	TAAAA	2	10	341308	341317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017581	TTAAG	2	10	349785	349794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017581	TTTAA	2	10	349831	349840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017581	ATTAA	2	10	349852	349861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017581	GCTAT	2	10	352226	352235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017581	CTGGC	2	10	357542	357551	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017581	CTTAA	2	10	369416	369425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017581	TCGTG	2	10	380827	380836	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017581	GTTAA	2	10	381573	381582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017581	GGGAG	2	10	382091	382100	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017581	AGGGA	2	10	384300	384309	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017581	TTGAG	2	10	384534	384543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017581	TGATT	2	10	393194	393203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017581	TTGAG	2	10	406368	406377	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017581	ATAAG	2	10	407447	407456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017581	GTCAA	2	10	422417	422426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017581	AAGAA	2	10	432098	432107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017581	CAAGA	2	10	437070	437079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017581	TTTGC	2	10	438731	438740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017581	AATCA	2	10	438856	438865	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017581	TTTTA	2	10	443079	443088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017581	AAGTA	2	10	443151	443160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017581	TAGAA	2	10	446872	446881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017581	GTTTA	2	10	450103	450112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017581	ATAAA	2	10	489406	489415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017581	TTTTA	2	10	499878	499887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017581	ATTTT	2	10	501154	501163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017581	AGGAA	2	10	502352	502361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017581	GGAAT	2	10	528224	528233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017581	TTATC	2	10	563787	563796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017581	TAAAA	2	10	567770	567779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017581	GAGTA	2	10	568522	568531	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017581	ATTGT	2	10	568928	568937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017581	TCCGT	2	10	572798	572807	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017581	AGTTG	2	10	574208	574217	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017581	TTTTA	2	10	583883	583892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017581	AAACT	2	10	584177	584186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017581	AAGCT	2	10	584336	584345	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017581	TAATT	2	10	589104	589113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017581	AAACT	2	10	589174	589183	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017581	TAGAT	2	10	610447	610456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017581	TATAA	2	10	618280	618289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017581	AGCTA	2	10	624909	624918	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017581	TAAAA	2	10	631205	631214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017581	ATATA	2	10	655049	655058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017581	TATGA	2	10	661085	661094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017581	TAAAA	2	10	666782	666791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017581	AAATA	2	10	684582	684591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017581	ATATA	2	10	703267	703276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017581	AAAAT	2	10	706208	706217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017581	TATCA	2	10	742169	742178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017581	TATAA	2	10	761584	761593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017581	TATTT	2	10	766955	766964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017581	ATTTA	2	10	780486	780495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017581	AAAAC	2	10	781605	781614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017581	AATGA	2	10	784863	784872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017581	CCATA	2	10	787515	787524	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017581	TAAGA	2	10	790426	790435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017581	TTTAT	2	10	815779	815788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017581	GATGT	2	10	825090	825099	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017581	TGATT	2	10	825149	825158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017581	ATATG	2	10	843780	843789	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017581	ATATA	2	10	856715	856724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017581	AAAAG	2	10	856729	856738	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017581	TTCTT	2	10	860110	860119	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017581	TTCTT	2	10	860588	860597	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017581	TTAGA	2	10	862564	862573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017581	CTATA	2	10	884470	884479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017581	AAAAT	2	10	886369	886378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017581	TAAAA	2	10	888072	888081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017581	TAAAA	2	10	888678	888687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017581	GTTAA	2	10	888714	888723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017581	TATAA	2	10	921700	921709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017581	AAAGC	2	10	921712	921721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017581	AAGGA	2	10	928502	928511	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017581	TAACT	2	10	934741	934750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017581	GAAAG	2	10	943163	943172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017581	TATCA	2	10	948069	948078	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017581	TATTT	2	10	953526	953535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017581	AGAGA	2	10	954393	954402	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017581	ATAAA	2	10	959853	959862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017581	ATATA	2	10	968347	968356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017581	TGAAC	2	10	979759	979768	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017581	AAAAG	2	10	983757	983766	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017581	TAAAA	2	10	987884	987893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017581	TTTTG	2	10	993701	993710	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017581	TAAAT	2	10	1019010	1019019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017581	AATTT	2	10	1029851	1029860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_017581	TATCT	2	10	1915768	1915777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_017581	AAATT	2	10	1926113	1926122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.