MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017579	TAGCCT	2	12	3208	3219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017579	AATATT	2	12	22105	22116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017579	AGATTA	2	12	25949	25960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017579	TGAAGG	2	12	48087	48098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017579	AAACGC	2	12	49985	49996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017579	AATTTT	2	12	85608	85619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017579	AGCAGG	2	12	98906	98917	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017579	ATTTAG	2	12	147266	147277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017579	CCATAA	2	12	212064	212075	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017579	TTTTAA	2	12	215128	215139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017579	ATTGAT	2	12	263323	263334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017579	GATAAA	2	12	315486	315497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017579	TCGGGT	2	12	316223	316234	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017579	TGAAGG	2	12	377871	377882	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017579	AAACGC	2	12	379769	379780	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017579	CTGTAC	2	12	397587	397598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017579	AATGAA	2	12	408364	408375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017579	GATTTT	2	12	450813	450824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017579	ATGACG	2	12	490357	490368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017579	TGATAT	4	24	546254	546277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017579	AGGAAA	2	12	560023	560034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017579	TGAAGG	2	12	572879	572890	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017579	AAACGC	2	12	574778	574789	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017579	AAACGC	2	12	575042	575053	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017579	TCAAAG	2	12	608262	608273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017579	TGCACT	2	12	609531	609542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017579	AATTAT	2	12	627408	627419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017579	AAGCTT	2	12	632014	632025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017579	ACAATG	2	12	662938	662949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017579	CCTTCG	2	12	668610	668621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017579	TAACAA	2	12	670172	670183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017579	TAGCCT	2	12	714732	714743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017579	GATGTG	2	12	715289	715300	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017579	TGATAT	2	12	716068	716079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017579	TGACTT	2	12	719089	719100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017579	GTTATT	2	12	723701	723712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017579	TTCGTC	2	12	731034	731045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017579	ACTAAA	2	12	739721	739732	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017579	CGATAA	2	12	771978	771989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017579	TCGCGA	2	12	790342	790353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017579	TTTATT	2	12	795717	795728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017579	CTATTT	2	12	799440	799451	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017579	GTTAAT	2	12	860907	860918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017579	ATTTAA	2	12	863623	863634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017579	TCAAAC	2	12	873584	873595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017579	AAGTTG	2	12	907956	907967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017579	GTTCTT	2	12	909324	909335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017579	GGTTTT	2	12	909339	909350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017579	TCCATA	2	12	976259	976270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017579	AAAGTC	2	12	1000071	1000082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017579	AAAGTC	2	12	1000086	1000097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017579	AACCAA	2	12	1007616	1007627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017579	TGGTTT	2	12	1010427	1010438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017579	CATCTA	2	12	1031226	1031237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017579	ATTCTA	2	12	1053317	1053328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017579	AAGATT	2	12	1084365	1084376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017579	TTTGAT	2	12	1133267	1133278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017579	TGAGAA	2	12	1144141	1144152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017579	AACTTA	2	12	1147729	1147740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017579	ATGTTC	2	12	1177437	1177448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017579	GCTCTT	2	12	1184931	1184942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017579	AATGAT	2	12	1193228	1193239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017579	TGTTAT	2	12	1204651	1204662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017579	AGCACC	2	12	1265315	1265326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017579	AGCACC	2	12	1265488	1265499	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017579	ATTTAT	2	12	1268504	1268515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017579	TGAAGG	2	12	1276785	1276796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017579	AAACGC	2	12	1278683	1278694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017579	GAGTTA	2	12	1286165	1286176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017579	AATAAA	2	12	1304722	1304733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017579	TTTATT	2	12	1315621	1315632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017579	TATAGT	2	12	1334116	1334127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017579	TTTGTT	2	12	1334726	1334737	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017579	TTTGAC	2	12	1338017	1338028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017579	CAACTT	2	12	1340625	1340636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017579	TATCAA	2	12	1353043	1353054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017579	ATTGTC	2	12	1366348	1366359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017579	GTTATC	2	12	1372254	1372265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017579	TGATAT	2	12	1389041	1389052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017579	TGAATG	2	12	1412223	1412234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017579	GTCTCT	2	12	1419619	1419630	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017579	TTTTTG	2	12	1431695	1431706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017579	CCGATA	2	12	1451933	1451944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017579	AGGGCT	2	12	1506025	1506036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017579	AAAACT	2	12	1506375	1506386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017579	TGTTTA	2	12	1506971	1506982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017579	CTTCAT	2	12	1517674	1517685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017579	CAGCGA	2	12	1586678	1586689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017579	ATGGTG	2	12	1598447	1598458	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017579	ATTGTG	2	12	1602082	1602093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017579	ACAGTC	2	12	1644208	1644219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017579	TACCCG	2	12	1644354	1644365	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017579	GTTAAT	2	12	1646222	1646233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017579	AAGCTT	2	12	1668287	1668298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017579	AGCATT	2	12	1696327	1696338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017579	ATTAGC	2	12	1703519	1703530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017579	ATTTTG	2	12	1730820	1730831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017579	TTGCAG	2	12	1735540	1735551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017579	CTGGCT	2	12	1798430	1798441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017579	ATTTTT	2	12	1821372	1821383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017579	TTTACG	2	12	1826240	1826251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017579	CATAAA	2	12	1877232	1877243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017579	TCAAAG	2	12	1879904	1879915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017579	GACTTT	2	12	1896934	1896945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017579	TAGTGA	2	12	1902983	1902994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017579	TTTTAT	2	12	1924803	1924814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017579	ATTAAT	2	12	1924956	1924967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017579	AAGATA	2	12	1925308	1925319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017579	AGCATG	2	12	1926745	1926756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017579	TAAAAA	2	12	2009460	2009471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017579	GGTAAT	2	12	2012310	2012321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017579	TTTGAA	2	12	2027640	2027651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017579	GTTAAG	2	12	2051034	2051045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017579	ACCTTT	2	12	2054146	2054157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017579	AAGCCG	2	12	2054340	2054351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017579	GCTAAA	2	12	2070596	2070607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017579	ATAGTT	2	12	2086832	2086843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017579	TGTTTT	2	12	2103341	2103352	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017579	AATAAA	2	12	2115849	2115860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017579	ATGTTT	2	12	2117792	2117803	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017579	CTCAAC	4	24	2128025	2128048	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017579	ACTTTC	2	12	2147316	2147327	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017579	TTGCAA	2	12	2149049	2149060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017579	GTTTTC	2	12	2160848	2160859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017579	TAAGTA	2	12	2185729	2185740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017579	ATTAAA	2	12	2186324	2186335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017579	AGCAAA	2	12	2221452	2221463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017579	TAATGA	2	12	2304244	2304255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017579	GCTTTA	2	12	2321297	2321308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017579	TTGCTT	2	12	2325972	2325983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017579	TTAGCA	2	12	2341353	2341364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017579	TGTTTT	2	12	2343005	2343016	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.