MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 3318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017579	AGCCG	2	10	926	935	20 %	0 %	40 %	40 %	386338938
2	NC_017579	AGTGA	2	10	5423	5432	40 %	20 %	40 %	0 %	386338941
3	NC_017579	ACCCA	2	10	6096	6105	40 %	0 %	0 %	60 %	386338941
4	NC_017579	AATTG	2	10	9177	9186	40 %	40 %	20 %	0 %	386338944
5	NC_017579	TGAAT	2	10	11246	11255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017579	ATGGC	2	10	14710	14719	20 %	20 %	40 %	20 %	386338950
7	NC_017579	TGATG	2	10	16233	16242	20 %	40 %	40 %	0 %	386338951
8	NC_017579	CATTC	2	10	19509	19518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017579	GCATC	2	10	23415	23424	20 %	20 %	20 %	40 %	386338955
10	NC_017579	ACATC	2	10	23799	23808	40 %	20 %	0 %	40 %	386338955
11	NC_017579	AGTTT	2	10	25100	25109	20 %	60 %	20 %	0 %	386338955
12	NC_017579	CTATT	2	10	29063	29072	20 %	60 %	0 %	20 %	386338957
13	NC_017579	CATGG	2	10	32006	32015	20 %	20 %	40 %	20 %	386338961
14	NC_017579	TTGTC	2	10	34133	34142	0 %	60 %	20 %	20 %	386338963
15	NC_017579	GCGCC	2	10	34686	34695	0 %	0 %	40 %	60 %	386338963
16	NC_017579	GCGAG	2	10	35391	35400	20 %	0 %	60 %	20 %	386338964
17	NC_017579	GTGAT	2	10	37462	37471	20 %	40 %	40 %	0 %	386338966
18	NC_017579	CTGGG	2	10	38151	38160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017579	CGAAA	2	10	38739	38748	60 %	0 %	20 %	20 %	386338967
20	NC_017579	TTCGT	2	10	39411	39420	0 %	60 %	20 %	20 %	386338968
21	NC_017579	GGTCA	2	10	44471	44480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017579	TTGAA	2	10	44605	44614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017579	AGTCG	2	10	47984	47993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017579	AGGCT	2	10	48311	48320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017579	ATCCC	2	10	49962	49971	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017579	TTGAT	2	10	50793	50802	20 %	60 %	20 %	0 %	386338976
27	NC_017579	TTTTG	2	10	51730	51739	0 %	80 %	20 %	0 %	386338976
28	NC_017579	CCATT	2	10	51827	51836	20 %	40 %	0 %	40 %	386338976
29	NC_017579	GCGCC	2	10	51922	51931	0 %	0 %	40 %	60 %	386338976
30	NC_017579	TGGCT	2	10	53714	53723	0 %	40 %	40 %	20 %	386338977
31	NC_017579	GATCT	2	10	55262	55271	20 %	40 %	20 %	20 %	386338978
32	NC_017579	ATCTT	2	10	55290	55299	20 %	60 %	0 %	20 %	386338978
33	NC_017579	TCCAT	2	10	55856	55865	20 %	40 %	0 %	40 %	386338979
34	NC_017579	GCAAC	2	10	56767	56776	40 %	0 %	20 %	40 %	386338979
35	NC_017579	TTTTG	2	10	57511	57520	0 %	80 %	20 %	0 %	386338980
36	NC_017579	TGCCA	2	10	61581	61590	20 %	20 %	20 %	40 %	386338984
37	NC_017579	TGCGC	2	10	63595	63604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017579	CTTAA	2	10	63745	63754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017579	GAGTC	2	10	65765	65774	20 %	20 %	40 %	20 %	386338986
40	NC_017579	CGAAT	2	10	67642	67651	40 %	20 %	20 %	20 %	386338987
41	NC_017579	ATATT	2	10	72417	72426	40 %	60 %	0 %	0 %	386338993
42	NC_017579	GATAA	2	10	73858	73867	60 %	20 %	20 %	0 %	386338994
43	NC_017579	GAATT	2	10	77928	77937	40 %	40 %	20 %	0 %	386338998
44	NC_017579	TGCAG	2	10	80139	80148	20 %	20 %	40 %	20 %	386339000
45	NC_017579	AATTA	2	10	83935	83944	60 %	40 %	0 %	0 %	386339003
46	NC_017579	ATCAC	2	10	84352	84361	40 %	20 %	0 %	40 %	386339004
47	NC_017579	ATAAC	2	10	85474	85483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017579	CAGCG	2	10	87891	87900	20 %	0 %	40 %	40 %	386339006
49	NC_017579	TTCAC	2	10	89828	89837	20 %	40 %	0 %	40 %	386339009
50	NC_017579	CAATT	2	10	91015	91024	40 %	40 %	0 %	20 %	386339009
51	NC_017579	CTGAA	2	10	92380	92389	40 %	20 %	20 %	20 %	386339011
52	NC_017579	CTGCG	2	10	94828	94837	0 %	20 %	40 %	40 %	386339014
53	NC_017579	ATTGG	2	10	95738	95747	20 %	40 %	40 %	0 %	386339014
54	NC_017579	AACGT	2	10	97256	97265	40 %	20 %	20 %	20 %	386339015
55	NC_017579	TTAGC	2	10	98055	98064	20 %	40 %	20 %	20 %	386339015
56	NC_017579	TCTTG	2	10	99003	99012	0 %	60 %	20 %	20 %	386339017
57	NC_017579	ACAGG	2	10	100543	100552	40 %	0 %	40 %	20 %	386339018
58	NC_017579	ATGGC	2	10	105050	105059	20 %	20 %	40 %	20 %	386339021
59	NC_017579	ATCTG	2	10	106693	106702	20 %	40 %	20 %	20 %	386339023
60	NC_017579	TGCCT	2	10	106814	106823	0 %	40 %	20 %	40 %	386339023
61	NC_017579	TGCGC	2	10	107314	107323	0 %	20 %	40 %	40 %	386339024
62	NC_017579	CATTT	2	10	109291	109300	20 %	60 %	0 %	20 %	386339026
63	NC_017579	CAGTG	2	10	110460	110469	20 %	20 %	40 %	20 %	386339028
64	NC_017579	CGATG	2	10	117873	117882	20 %	20 %	40 %	20 %	386339034
65	NC_017579	TAGTC	2	10	118961	118970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017579	GCGTG	2	10	119851	119860	0 %	20 %	60 %	20 %	386339036
67	NC_017579	TAAAA	2	10	122073	122082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017579	GATTC	2	10	122544	122553	20 %	40 %	20 %	20 %	386339039
69	NC_017579	CTCGA	2	10	126601	126610	20 %	20 %	20 %	40 %	386339041
70	NC_017579	TGTGG	2	10	128841	128850	0 %	40 %	60 %	0 %	386339043
71	NC_017579	TCTGT	2	10	131505	131514	0 %	60 %	20 %	20 %	386339044
72	NC_017579	GCATC	2	10	135251	135260	20 %	20 %	20 %	40 %	386339047
73	NC_017579	CTTAC	2	10	135814	135823	20 %	40 %	0 %	40 %	386339047
74	NC_017579	GAGAT	2	10	136081	136090	40 %	20 %	40 %	0 %	386339048
75	NC_017579	TCTGC	2	10	136302	136311	0 %	40 %	20 %	40 %	386339049
76	NC_017579	AAATG	2	10	136870	136879	60 %	20 %	20 %	0 %	386339049
77	NC_017579	TTGCC	2	10	138536	138545	0 %	40 %	20 %	40 %	386339050
78	NC_017579	GCTGA	2	10	142118	142127	20 %	20 %	40 %	20 %	386339054
79	NC_017579	TGAGC	2	10	143120	143129	20 %	20 %	40 %	20 %	386339055
80	NC_017579	AAGCC	2	10	143303	143312	40 %	0 %	20 %	40 %	386339055
81	NC_017579	GCGCT	2	10	143841	143850	0 %	20 %	40 %	40 %	386339055
82	NC_017579	ATTGT	2	10	145529	145538	20 %	60 %	20 %	0 %	386339056
83	NC_017579	GTTGC	2	10	146096	146105	0 %	40 %	40 %	20 %	386339057
84	NC_017579	CATCA	2	10	147800	147809	40 %	20 %	0 %	40 %	386339059
85	NC_017579	GATTT	2	10	148957	148966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017579	TCGAA	2	10	150026	150035	40 %	20 %	20 %	20 %	386339060
87	NC_017579	CGCTC	2	10	150272	150281	0 %	20 %	20 %	60 %	386339061
88	NC_017579	ATGCG	2	10	150740	150749	20 %	20 %	40 %	20 %	386339061
89	NC_017579	TAACT	2	10	150783	150792	40 %	40 %	0 %	20 %	386339061
90	NC_017579	GAGTT	2	10	150995	151004	20 %	40 %	40 %	0 %	386339061
91	NC_017579	CTAAA	2	10	153343	153352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017579	TATTT	2	10	153661	153670	20 %	80 %	0 %	0 %	386339062
93	NC_017579	CATAG	2	10	153822	153831	40 %	20 %	20 %	20 %	386339063
94	NC_017579	GCGCA	2	10	155810	155819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017579	CTCAG	2	10	156575	156584	20 %	20 %	20 %	40 %	386339065
96	NC_017579	GGGCT	2	10	161005	161014	0 %	20 %	60 %	20 %	386339069
97	NC_017579	GCGCC	2	10	162684	162693	0 %	0 %	40 %	60 %	386339070
98	NC_017579	GGGCT	2	10	163235	163244	0 %	20 %	60 %	20 %	386339071
99	NC_017579	TTCTG	2	10	163494	163503	0 %	60 %	20 %	20 %	386339071
100	NC_017579	CTGTG	2	10	165298	165307	0 %	40 %	40 %	20 %	386339074
101	NC_017579	TGGCT	2	10	165651	165660	0 %	40 %	40 %	20 %	386339074
102	NC_017579	CAAAG	2	10	166065	166074	60 %	0 %	20 %	20 %	386339075
103	NC_017579	ATAAA	2	10	166659	166668	80 %	20 %	0 %	0 %	386339076
104	NC_017579	GCCAA	2	10	171349	171358	40 %	0 %	20 %	40 %	386339079
105	NC_017579	GTGAA	2	10	171517	171526	40 %	20 %	40 %	0 %	386339079
106	NC_017579	ATATT	2	10	173549	173558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017579	TCTGG	2	10	176545	176554	0 %	40 %	40 %	20 %	386339084
108	NC_017579	TAACT	2	10	177434	177443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017579	AGGCA	2	10	180247	180256	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017579	TTCCA	2	10	180711	180720	20 %	40 %	0 %	40 %	386339089
111	NC_017579	TCAGT	2	10	182102	182111	20 %	40 %	20 %	20 %	386339090
112	NC_017579	GTGCA	2	10	182439	182448	20 %	20 %	40 %	20 %	386339090
113	NC_017579	CGAGT	2	10	183307	183316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017579	TCAGG	2	10	183333	183342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017579	CCTGA	2	10	183348	183357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017579	TTAAT	2	10	184111	184120	40 %	60 %	0 %	0 %	386339091
117	NC_017579	CTAAG	2	10	186043	186052	40 %	20 %	20 %	20 %	386339094
118	NC_017579	GCCAT	2	10	186566	186575	20 %	20 %	20 %	40 %	386339095
119	NC_017579	TCCAG	2	10	189519	189528	20 %	20 %	20 %	40 %	386339097
120	NC_017579	ATAAA	2	10	190711	190720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017579	TGCTG	2	10	192513	192522	0 %	40 %	40 %	20 %	386339099
122	NC_017579	GCAAT	2	10	194368	194377	40 %	20 %	20 %	20 %	386339099
123	NC_017579	TTGAG	2	10	195418	195427	20 %	40 %	40 %	0 %	386339101
124	NC_017579	GGCTT	2	10	196750	196759	0 %	40 %	40 %	20 %	386339101
125	NC_017579	AAGGC	2	10	196818	196827	40 %	0 %	40 %	20 %	386339101
126	NC_017579	GATTT	2	10	197189	197198	20 %	60 %	20 %	0 %	386339102
127	NC_017579	CCTTG	2	10	199195	199204	0 %	40 %	20 %	40 %	386339104
128	NC_017579	AGTTT	2	10	203075	203084	20 %	60 %	20 %	0 %	386339108
129	NC_017579	ATTTG	2	10	203403	203412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017579	GATTG	2	10	205930	205939	20 %	40 %	40 %	0 %	386339111
131	NC_017579	AAACC	2	10	207349	207358	60 %	0 %	0 %	40 %	386339111
132	NC_017579	GAATG	2	10	208226	208235	40 %	20 %	40 %	0 %	386339111
133	NC_017579	TCGAG	2	10	211538	211547	20 %	20 %	40 %	20 %	386339112
134	NC_017579	TTTCC	2	10	212823	212832	0 %	60 %	0 %	40 %	386339114
135	NC_017579	TGAGC	2	10	212992	213001	20 %	20 %	40 %	20 %	386339114
136	NC_017579	TTACT	2	10	213284	213293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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