MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	ACTGG	2	10	2768	2777	20 %	20 %	40 %	20 %	386343538
2	NC_017578	GGTCA	2	10	3091	3100	20 %	20 %	40 %	20 %	386343538
3	NC_017578	ACTCA	2	10	3197	3206	40 %	20 %	0 %	40 %	386343538
4	NC_017578	GGCTG	2	10	3639	3648	0 %	20 %	60 %	20 %	386343538
5	NC_017578	CTGGG	2	10	3874	3883	0 %	20 %	60 %	20 %	386343538
6	NC_017578	AGTTC	2	10	4636	4645	20 %	40 %	20 %	20 %	386343539
7	NC_017578	CTTCA	2	10	4665	4674	20 %	40 %	0 %	40 %	386343539
8	NC_017578	ACCAA	2	10	4879	4888	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017578	TTGCC	2	10	7124	7133	0 %	40 %	20 %	40 %	386343544
10	NC_017578	TTCAT	2	10	7722	7731	20 %	60 %	0 %	20 %	386343544
11	NC_017578	CTTGG	2	10	9171	9180	0 %	40 %	40 %	20 %	386343545
12	NC_017578	GATAT	2	10	10307	10316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017578	GATGG	2	10	10557	10566	20 %	20 %	60 %	0 %	386343548
14	NC_017578	ATTTC	2	10	11439	11448	20 %	60 %	0 %	20 %	386343549
15	NC_017578	AGTCC	2	10	11822	11831	20 %	20 %	20 %	40 %	386343550
16	NC_017578	AGAGA	2	10	13532	13541	60 %	0 %	40 %	0 %	386343553
17	NC_017578	AGCAG	2	10	14019	14028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017578	TGAAC	2	10	14215	14224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017578	TAGAT	2	10	18328	18337	40 %	40 %	20 %	0 %	386343559
20	NC_017578	ATTTA	2	10	19518	19527	40 %	60 %	0 %	0 %	386343559
21	NC_017578	TTGCA	2	10	21596	21605	20 %	40 %	20 %	20 %	386343560
22	NC_017578	TAACC	2	10	22493	22502	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017578	AAATC	2	10	23527	23536	60 %	20 %	0 %	20 %	386343561
24	NC_017578	TAAGA	2	10	27119	27128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017578	GTGAC	2	10	28106	28115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017578	GTCAC	2	10	28798	28807	20 %	20 %	20 %	40 %	386343564
27	NC_017578	ACCAC	2	10	30271	30280	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017578	TCTAC	2	10	30281	30290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017578	TCATA	2	10	30509	30518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017578	ATAAA	2	10	30836	30845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017578	CAAAA	2	10	31499	31508	80 %	0 %	0 %	20 %	386343565
32	NC_017578	TTAAT	2	10	32748	32757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017578	TAATG	2	10	32778	32787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017578	GGCGA	2	10	38404	38413	20 %	0 %	60 %	20 %	386343571
35	NC_017578	AAATC	2	10	42569	42578	60 %	20 %	0 %	20 %	386343572
36	NC_017578	TCTGC	2	10	44282	44291	0 %	40 %	20 %	40 %	386343573
37	NC_017578	CCAAG	2	10	44857	44866	40 %	0 %	20 %	40 %	386343574
38	NC_017578	TAAAA	2	10	45585	45594	80 %	20 %	0 %	0 %	386343577
39	NC_017578	TCTTT	2	10	47047	47056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017578	GGTTG	2	10	48520	48529	0 %	40 %	60 %	0 %	386343581
41	NC_017578	ACAAA	2	10	54779	54788	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017578	CATTC	2	10	56382	56391	20 %	40 %	0 %	40 %	386343586
43	NC_017578	TAAAA	2	10	56973	56982	80 %	20 %	0 %	0 %	386343588
44	NC_017578	ACTTT	2	10	59759	59768	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017578	TTCCA	2	10	62480	62489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017578	GGTTA	2	10	64307	64316	20 %	40 %	40 %	0 %	386343597
47	NC_017578	TGCAA	2	10	65204	65213	40 %	20 %	20 %	20 %	386343598
48	NC_017578	CTGGG	2	10	65440	65449	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017578	CTAAA	2	10	67439	67448	60 %	20 %	0 %	20 %	386343601
50	NC_017578	TTTTC	2	10	68496	68505	0 %	80 %	0 %	20 %	386343604
51	NC_017578	CTTTA	2	10	70429	70438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.