MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	ACCAA	2	10	4879	4888	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017578	GATAT	2	10	10307	10316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017578	AGCAG	2	10	14019	14028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017578	TGAAC	2	10	14215	14224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017578	TAACC	2	10	22493	22502	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017578	TAAGA	2	10	27119	27128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017578	GTGAC	2	10	28106	28115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017578	ACCAC	2	10	30271	30280	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017578	TCTAC	2	10	30281	30290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017578	TCATA	2	10	30509	30518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017578	ATAAA	2	10	30836	30845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017578	TTAAT	2	10	32748	32757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017578	TAATG	2	10	32778	32787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017578	TCTTT	2	10	47047	47056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017578	ACAAA	2	10	54779	54788	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017578	ACTTT	2	10	59759	59768	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017578	TTCCA	2	10	62480	62489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017578	CTGGG	2	10	65440	65449	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017578	CTTTA	2	10	70429	70438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.