MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	TATC	2	8	102	109	25 %	50 %	0 %	25 %	386343536
2	NC_017578	TTCG	2	8	362	369	0 %	50 %	25 %	25 %	386343537
3	NC_017578	ATAA	2	8	1126	1133	75 %	25 %	0 %	0 %	386343538
4	NC_017578	TGAT	2	8	1886	1893	25 %	50 %	25 %	0 %	386343538
5	NC_017578	AACG	2	8	1934	1941	50 %	0 %	25 %	25 %	386343538
6	NC_017578	TGAA	2	8	2393	2400	50 %	25 %	25 %	0 %	386343538
7	NC_017578	CAAG	2	8	4513	4520	50 %	0 %	25 %	25 %	386343539
8	NC_017578	CTTG	2	8	4682	4689	0 %	50 %	25 %	25 %	386343539
9	NC_017578	GTTA	2	8	5303	5310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017578	TTCA	2	8	5647	5654	25 %	50 %	0 %	25 %	386343541
11	NC_017578	TGAT	2	8	5666	5673	25 %	50 %	25 %	0 %	386343541
12	NC_017578	TGAA	2	8	5699	5706	50 %	25 %	25 %	0 %	386343541
13	NC_017578	CAAA	2	8	6127	6134	75 %	0 %	0 %	25 %	386343543
14	NC_017578	AAGT	2	8	6293	6300	50 %	25 %	25 %	0 %	386343543
15	NC_017578	TGAT	2	8	6824	6831	25 %	50 %	25 %	0 %	386343544
16	NC_017578	ATCA	2	8	7415	7422	50 %	25 %	0 %	25 %	386343544
17	NC_017578	TTCC	2	8	7426	7433	0 %	50 %	0 %	50 %	386343544
18	NC_017578	GGTG	2	8	8043	8050	0 %	25 %	75 %	0 %	386343544
19	NC_017578	ATTC	2	8	8372	8379	25 %	50 %	0 %	25 %	386343544
20	NC_017578	GACT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	386343544
21	NC_017578	CGTT	2	8	9154	9161	0 %	50 %	25 %	25 %	386343545
22	NC_017578	ATCA	2	8	9484	9491	50 %	25 %	0 %	25 %	386343546
23	NC_017578	ATGG	2	8	9671	9678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017578	GTAA	2	8	9711	9718	50 %	25 %	25 %	0 %	386343547
25	NC_017578	TCTG	2	8	10578	10585	0 %	50 %	25 %	25 %	386343548
26	NC_017578	TTTC	2	8	10776	10783	0 %	75 %	0 %	25 %	386343548
27	NC_017578	TTAT	2	8	10798	10805	25 %	75 %	0 %	0 %	386343548
28	NC_017578	TAAA	2	8	11172	11179	75 %	25 %	0 %	0 %	386343549
29	NC_017578	TAAA	2	8	11489	11496	75 %	25 %	0 %	0 %	386343549
30	NC_017578	CAAT	2	8	11748	11755	50 %	25 %	0 %	25 %	386343550
31	NC_017578	GATA	2	8	12212	12219	50 %	25 %	25 %	0 %	386343551
32	NC_017578	CAAA	2	8	12456	12463	75 %	0 %	0 %	25 %	386343552
33	NC_017578	CAAG	2	8	12782	12789	50 %	0 %	25 %	25 %	386343553
34	NC_017578	ATTA	2	8	13042	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	386343553
35	NC_017578	ATGA	2	8	13058	13065	50 %	25 %	25 %	0 %	386343553
36	NC_017578	CCAA	2	8	13300	13307	50 %	0 %	0 %	50 %	386343553
37	NC_017578	TCGT	2	8	13331	13338	0 %	50 %	25 %	25 %	386343553
38	NC_017578	TTAA	2	8	13472	13479	50 %	50 %	0 %	0 %	386343553
39	NC_017578	CTAA	2	8	13612	13619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017578	TTAA	2	8	13718	13725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017578	AATA	2	8	14763	14770	75 %	25 %	0 %	0 %	386343555
42	NC_017578	TAAG	2	8	15041	15048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017578	GATT	2	8	15070	15077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017578	CCAT	2	8	15410	15417	25 %	25 %	0 %	50 %	386343556
45	NC_017578	TTAA	2	8	15879	15886	50 %	50 %	0 %	0 %	386343557
46	NC_017578	ATGA	2	8	15906	15913	50 %	25 %	25 %	0 %	386343557
47	NC_017578	ATCC	2	8	16020	16027	25 %	25 %	0 %	50 %	386343557
48	NC_017578	GGGT	2	8	16350	16357	0 %	25 %	75 %	0 %	386343558
49	NC_017578	GGTC	2	8	16834	16841	0 %	25 %	50 %	25 %	386343558
50	NC_017578	CAGA	2	8	16876	16883	50 %	0 %	25 %	25 %	386343558
51	NC_017578	TAAT	2	8	17851	17858	50 %	50 %	0 %	0 %	386343559
52	NC_017578	TTTA	2	8	17985	17992	25 %	75 %	0 %	0 %	386343559
53	NC_017578	TTTC	2	8	18109	18116	0 %	75 %	0 %	25 %	386343559
54	NC_017578	CTTT	2	8	18163	18170	0 %	75 %	0 %	25 %	386343559
55	NC_017578	TGAA	2	8	18515	18522	50 %	25 %	25 %	0 %	386343559
56	NC_017578	GTAA	2	8	18968	18975	50 %	25 %	25 %	0 %	386343559
57	NC_017578	TTAT	2	8	20101	20108	25 %	75 %	0 %	0 %	386343559
58	NC_017578	CTTG	2	8	20167	20174	0 %	50 %	25 %	25 %	386343559
59	NC_017578	CCTT	2	8	20703	20710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017578	GTTA	2	8	20716	20723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017578	GTTT	2	8	21558	21565	0 %	75 %	25 %	0 %	386343560
62	NC_017578	ATTC	2	8	22297	22304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017578	TAAT	2	8	22650	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017578	ATTG	2	8	23671	23678	25 %	50 %	25 %	0 %	386343562
65	NC_017578	GAGT	2	8	24351	24358	25 %	25 %	50 %	0 %	386343562
66	NC_017578	CAGC	2	8	24499	24506	25 %	0 %	25 %	50 %	386343562
67	NC_017578	GAAA	2	8	24593	24600	75 %	0 %	25 %	0 %	386343562
68	NC_017578	ATTC	2	8	26747	26754	25 %	50 %	0 %	25 %	386343563
69	NC_017578	CATT	2	8	26959	26966	25 %	50 %	0 %	25 %	386343563
70	NC_017578	CTTT	2	8	26989	26996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017578	TTTA	2	8	27161	27168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017578	AAGG	2	8	27929	27936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017578	TCGT	2	8	27957	27964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017578	ACGA	2	8	28950	28957	50 %	0 %	25 %	25 %	386343564
75	NC_017578	CCTT	2	8	28978	28985	0 %	50 %	0 %	50 %	386343564
76	NC_017578	TTTC	2	8	29242	29249	0 %	75 %	0 %	25 %	386343564
77	NC_017578	TTCC	2	8	29345	29352	0 %	50 %	0 %	50 %	386343564
78	NC_017578	ATTA	2	8	29820	29827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017578	CTTT	2	8	29975	29982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017578	ACAT	2	8	30349	30356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017578	ATGG	2	8	30495	30502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017578	CAAC	2	8	30520	30527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017578	AAAC	2	8	30534	30541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017578	TCAT	2	8	30992	30999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017578	TTTA	2	8	31105	31112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017578	ACAA	2	8	31190	31197	75 %	0 %	0 %	25 %	386343565
87	NC_017578	GTTA	2	8	31446	31453	25 %	50 %	25 %	0 %	386343565
88	NC_017578	TTAA	2	8	31657	31664	50 %	50 %	0 %	0 %	386343565
89	NC_017578	CCTA	2	8	32038	32045	25 %	25 %	0 %	50 %	386343566
90	NC_017578	ACTG	2	8	32381	32388	25 %	25 %	25 %	25 %	386343566
91	NC_017578	TGAT	2	8	32395	32402	25 %	50 %	25 %	0 %	386343566
92	NC_017578	CTTA	2	8	32576	32583	25 %	50 %	0 %	25 %	386343566
93	NC_017578	GAGC	2	8	32621	32628	25 %	0 %	50 %	25 %	386343566
94	NC_017578	TATT	2	8	32791	32798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017578	GCTA	2	8	32935	32942	25 %	25 %	25 %	25 %	386343567
96	NC_017578	GATA	2	8	33123	33130	50 %	25 %	25 %	0 %	386343567
97	NC_017578	CAAC	2	8	34004	34011	50 %	0 %	0 %	50 %	386343568
98	NC_017578	CCAA	2	8	34032	34039	50 %	0 %	0 %	50 %	386343568
99	NC_017578	AAAG	2	8	36114	36121	75 %	0 %	25 %	0 %	386343569
100	NC_017578	AAAG	2	8	36313	36320	75 %	0 %	25 %	0 %	386343569
101	NC_017578	TAGC	2	8	37242	37249	25 %	25 %	25 %	25 %	386343570
102	NC_017578	CAAC	2	8	37327	37334	50 %	0 %	0 %	50 %	386343570
103	NC_017578	CAAG	2	8	37396	37403	50 %	0 %	25 %	25 %	386343570
104	NC_017578	TATT	2	8	37601	37608	25 %	75 %	0 %	0 %	386343570
105	NC_017578	CAAC	2	8	37897	37904	50 %	0 %	0 %	50 %	386343570
106	NC_017578	CAAG	2	8	37936	37943	50 %	0 %	25 %	25 %	386343570
107	NC_017578	ATTA	2	8	38423	38430	50 %	50 %	0 %	0 %	386343571
108	NC_017578	GCAA	2	8	39050	39057	50 %	0 %	25 %	25 %	386343571
109	NC_017578	ATGA	2	8	39567	39574	50 %	25 %	25 %	0 %	386343571
110	NC_017578	AATG	2	8	40307	40314	50 %	25 %	25 %	0 %	386343571
111	NC_017578	AGTT	2	8	40315	40322	25 %	50 %	25 %	0 %	386343571
112	NC_017578	CTAA	2	8	41360	41367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017578	TTTC	2	8	41497	41504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017578	ATTG	2	8	41616	41623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017578	ATTC	2	8	42786	42793	25 %	50 %	0 %	25 %	386343572
116	NC_017578	ATCC	2	8	43189	43196	25 %	25 %	0 %	50 %	386343572
117	NC_017578	GTCT	2	8	43416	43423	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
118	NC_017578	GCTT	2	8	43463	43470	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
119	NC_017578	CTGT	2	8	43536	43543	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
120	NC_017578	ATAA	2	8	43802	43809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017578	TCTT	2	8	44523	44530	0 %	75 %	0 %	25 %	386343573
122	NC_017578	GCTT	2	8	44554	44561	0 %	50 %	25 %	25 %	386343573
123	NC_017578	TCAT	2	8	45171	45178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017578	GCTT	2	8	45209	45216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017578	TCAA	2	8	46372	46379	50 %	25 %	0 %	25 %	386343579
126	NC_017578	ATTT	2	8	46628	46635	25 %	75 %	0 %	0 %	386343579
127	NC_017578	AAGC	2	8	47103	47110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017578	GCAT	2	8	47130	47137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017578	ATTC	2	8	47335	47342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017578	GGAA	2	8	47367	47374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017578	TTCC	2	8	47713	47720	0 %	50 %	0 %	50 %	386343580
132	NC_017578	CCAA	2	8	48259	48266	50 %	0 %	0 %	50 %	386343581
133	NC_017578	TACT	2	8	48464	48471	25 %	50 %	0 %	25 %	386343581
134	NC_017578	TTAT	2	8	48641	48648	25 %	75 %	0 %	0 %	386343581
135	NC_017578	TTAT	2	8	49075	49082	25 %	75 %	0 %	0 %	386343581
136	NC_017578	AAAG	2	8	49117	49124	75 %	0 %	25 %	0 %	386343581
137	NC_017578	ACTT	2	8	49341	49348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017578	GCTT	2	8	49494	49501	0 %	50 %	25 %	25 %	386343582
139	NC_017578	CCCA	2	8	49678	49685	25 %	0 %	0 %	75 %	386343582
140	NC_017578	GCTT	2	8	49743	49750	0 %	50 %	25 %	25 %	386343582
141	NC_017578	CCAA	2	8	49865	49872	50 %	0 %	0 %	50 %	386343582
142	NC_017578	GGCC	2	8	50185	50192	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
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144	NC_017578	AACT	2	8	51211	51218	50 %	25 %	0 %	25 %	386343583
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.