MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	GTTA	2	8	5303	5310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017578	ATGG	2	8	9671	9678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017578	CTAA	2	8	13612	13619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017578	TTAA	2	8	13718	13725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017578	TAAG	2	8	15041	15048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017578	GATT	2	8	15070	15077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017578	CCTT	2	8	20703	20710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017578	GTTA	2	8	20716	20723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017578	ATTC	2	8	22297	22304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017578	TAAT	2	8	22650	22657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017578	CTTT	2	8	26989	26996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017578	TTTA	2	8	27161	27168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017578	AAGG	2	8	27929	27936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017578	TCGT	2	8	27957	27964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017578	ATTA	2	8	29820	29827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017578	CTTT	2	8	29975	29982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017578	ACAT	2	8	30349	30356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017578	ATGG	2	8	30495	30502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017578	CAAC	2	8	30520	30527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017578	AAAC	2	8	30534	30541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017578	TCAT	2	8	30992	30999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017578	TTTA	2	8	31105	31112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017578	TATT	2	8	32791	32798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017578	CTAA	2	8	41360	41367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017578	TTTC	2	8	41497	41504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017578	ATTG	2	8	41616	41623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017578	ATAA	2	8	43802	43809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017578	TCAT	2	8	45171	45178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017578	GCTT	2	8	45209	45216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017578	AAGC	2	8	47103	47110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017578	GCAT	2	8	47130	47137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017578	ATTC	2	8	47335	47342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017578	GGAA	2	8	47367	47374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017578	ACTT	2	8	49341	49348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017578	GGTA	2	8	54974	54981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017578	AATA	2	8	59634	59641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017578	AAAG	2	8	59902	59909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017578	CAAC	2	8	59981	59988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017578	AGGG	2	8	62036	62043	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017578	ATTG	2	8	65685	65692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017578	TTAA	3	12	66241	66252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017578	TATT	2	8	66367	66374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017578	AAAG	2	8	69012	69019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017578	GATT	2	8	69161	69168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017578	CTAA	2	8	71145	71152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.