MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	TATC	2	8	102	109	25 %	50 %	0 %	25 %	386343536
2	NC_017578	TTCG	2	8	362	369	0 %	50 %	25 %	25 %	386343537
3	NC_017578	ATAA	2	8	1126	1133	75 %	25 %	0 %	0 %	386343538
4	NC_017578	TGAT	2	8	1886	1893	25 %	50 %	25 %	0 %	386343538
5	NC_017578	AACG	2	8	1934	1941	50 %	0 %	25 %	25 %	386343538
6	NC_017578	TGAA	2	8	2393	2400	50 %	25 %	25 %	0 %	386343538
7	NC_017578	CAAG	2	8	4513	4520	50 %	0 %	25 %	25 %	386343539
8	NC_017578	CTTG	2	8	4682	4689	0 %	50 %	25 %	25 %	386343539
9	NC_017578	TTCA	2	8	5647	5654	25 %	50 %	0 %	25 %	386343541
10	NC_017578	TGAT	2	8	5666	5673	25 %	50 %	25 %	0 %	386343541
11	NC_017578	TGAA	2	8	5699	5706	50 %	25 %	25 %	0 %	386343541
12	NC_017578	CAAA	2	8	6127	6134	75 %	0 %	0 %	25 %	386343543
13	NC_017578	AAGT	2	8	6293	6300	50 %	25 %	25 %	0 %	386343543
14	NC_017578	TGAT	2	8	6824	6831	25 %	50 %	25 %	0 %	386343544
15	NC_017578	ATCA	2	8	7415	7422	50 %	25 %	0 %	25 %	386343544
16	NC_017578	TTCC	2	8	7426	7433	0 %	50 %	0 %	50 %	386343544
17	NC_017578	GGTG	2	8	8043	8050	0 %	25 %	75 %	0 %	386343544
18	NC_017578	ATTC	2	8	8372	8379	25 %	50 %	0 %	25 %	386343544
19	NC_017578	GACT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	386343544
20	NC_017578	CGTT	2	8	9154	9161	0 %	50 %	25 %	25 %	386343545
21	NC_017578	ATCA	2	8	9484	9491	50 %	25 %	0 %	25 %	386343546
22	NC_017578	GTAA	2	8	9711	9718	50 %	25 %	25 %	0 %	386343547
23	NC_017578	TCTG	2	8	10578	10585	0 %	50 %	25 %	25 %	386343548
24	NC_017578	TTTC	2	8	10776	10783	0 %	75 %	0 %	25 %	386343548
25	NC_017578	TTAT	2	8	10798	10805	25 %	75 %	0 %	0 %	386343548
26	NC_017578	TAAA	2	8	11172	11179	75 %	25 %	0 %	0 %	386343549
27	NC_017578	TAAA	2	8	11489	11496	75 %	25 %	0 %	0 %	386343549
28	NC_017578	CAAT	2	8	11748	11755	50 %	25 %	0 %	25 %	386343550
29	NC_017578	GATA	2	8	12212	12219	50 %	25 %	25 %	0 %	386343551
30	NC_017578	CAAA	2	8	12456	12463	75 %	0 %	0 %	25 %	386343552
31	NC_017578	CAAG	2	8	12782	12789	50 %	0 %	25 %	25 %	386343553
32	NC_017578	ATTA	2	8	13042	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	386343553
33	NC_017578	ATGA	2	8	13058	13065	50 %	25 %	25 %	0 %	386343553
34	NC_017578	CCAA	2	8	13300	13307	50 %	0 %	0 %	50 %	386343553
35	NC_017578	TCGT	2	8	13331	13338	0 %	50 %	25 %	25 %	386343553
36	NC_017578	TTAA	2	8	13472	13479	50 %	50 %	0 %	0 %	386343553
37	NC_017578	AATA	2	8	14763	14770	75 %	25 %	0 %	0 %	386343555
38	NC_017578	CCAT	2	8	15410	15417	25 %	25 %	0 %	50 %	386343556
39	NC_017578	TTAA	2	8	15879	15886	50 %	50 %	0 %	0 %	386343557
40	NC_017578	ATGA	2	8	15906	15913	50 %	25 %	25 %	0 %	386343557
41	NC_017578	ATCC	2	8	16020	16027	25 %	25 %	0 %	50 %	386343557
42	NC_017578	GGGT	2	8	16350	16357	0 %	25 %	75 %	0 %	386343558
43	NC_017578	GGTC	2	8	16834	16841	0 %	25 %	50 %	25 %	386343558
44	NC_017578	CAGA	2	8	16876	16883	50 %	0 %	25 %	25 %	386343558
45	NC_017578	TAAT	2	8	17851	17858	50 %	50 %	0 %	0 %	386343559
46	NC_017578	TTTA	2	8	17985	17992	25 %	75 %	0 %	0 %	386343559
47	NC_017578	TTTC	2	8	18109	18116	0 %	75 %	0 %	25 %	386343559
48	NC_017578	CTTT	2	8	18163	18170	0 %	75 %	0 %	25 %	386343559
49	NC_017578	TGAA	2	8	18515	18522	50 %	25 %	25 %	0 %	386343559
50	NC_017578	GTAA	2	8	18968	18975	50 %	25 %	25 %	0 %	386343559
51	NC_017578	TTAT	2	8	20101	20108	25 %	75 %	0 %	0 %	386343559
52	NC_017578	CTTG	2	8	20167	20174	0 %	50 %	25 %	25 %	386343559
53	NC_017578	GTTT	2	8	21558	21565	0 %	75 %	25 %	0 %	386343560
54	NC_017578	ATTG	2	8	23671	23678	25 %	50 %	25 %	0 %	386343562
55	NC_017578	GAGT	2	8	24351	24358	25 %	25 %	50 %	0 %	386343562
56	NC_017578	CAGC	2	8	24499	24506	25 %	0 %	25 %	50 %	386343562
57	NC_017578	GAAA	2	8	24593	24600	75 %	0 %	25 %	0 %	386343562
58	NC_017578	ATTC	2	8	26747	26754	25 %	50 %	0 %	25 %	386343563
59	NC_017578	CATT	2	8	26959	26966	25 %	50 %	0 %	25 %	386343563
60	NC_017578	ACGA	2	8	28950	28957	50 %	0 %	25 %	25 %	386343564
61	NC_017578	CCTT	2	8	28978	28985	0 %	50 %	0 %	50 %	386343564
62	NC_017578	TTTC	2	8	29242	29249	0 %	75 %	0 %	25 %	386343564
63	NC_017578	TTCC	2	8	29345	29352	0 %	50 %	0 %	50 %	386343564
64	NC_017578	ACAA	2	8	31190	31197	75 %	0 %	0 %	25 %	386343565
65	NC_017578	GTTA	2	8	31446	31453	25 %	50 %	25 %	0 %	386343565
66	NC_017578	TTAA	2	8	31657	31664	50 %	50 %	0 %	0 %	386343565
67	NC_017578	CCTA	2	8	32038	32045	25 %	25 %	0 %	50 %	386343566
68	NC_017578	ACTG	2	8	32381	32388	25 %	25 %	25 %	25 %	386343566
69	NC_017578	TGAT	2	8	32395	32402	25 %	50 %	25 %	0 %	386343566
70	NC_017578	CTTA	2	8	32576	32583	25 %	50 %	0 %	25 %	386343566
71	NC_017578	GAGC	2	8	32621	32628	25 %	0 %	50 %	25 %	386343566
72	NC_017578	GCTA	2	8	32935	32942	25 %	25 %	25 %	25 %	386343567
73	NC_017578	GATA	2	8	33123	33130	50 %	25 %	25 %	0 %	386343567
74	NC_017578	CAAC	2	8	34004	34011	50 %	0 %	0 %	50 %	386343568
75	NC_017578	CCAA	2	8	34032	34039	50 %	0 %	0 %	50 %	386343568
76	NC_017578	AAAG	2	8	36114	36121	75 %	0 %	25 %	0 %	386343569
77	NC_017578	AAAG	2	8	36313	36320	75 %	0 %	25 %	0 %	386343569
78	NC_017578	TAGC	2	8	37242	37249	25 %	25 %	25 %	25 %	386343570
79	NC_017578	CAAC	2	8	37327	37334	50 %	0 %	0 %	50 %	386343570
80	NC_017578	CAAG	2	8	37396	37403	50 %	0 %	25 %	25 %	386343570
81	NC_017578	TATT	2	8	37601	37608	25 %	75 %	0 %	0 %	386343570
82	NC_017578	CAAC	2	8	37897	37904	50 %	0 %	0 %	50 %	386343570
83	NC_017578	CAAG	2	8	37936	37943	50 %	0 %	25 %	25 %	386343570
84	NC_017578	ATTA	2	8	38423	38430	50 %	50 %	0 %	0 %	386343571
85	NC_017578	GCAA	2	8	39050	39057	50 %	0 %	25 %	25 %	386343571
86	NC_017578	ATGA	2	8	39567	39574	50 %	25 %	25 %	0 %	386343571
87	NC_017578	AATG	2	8	40307	40314	50 %	25 %	25 %	0 %	386343571
88	NC_017578	AGTT	2	8	40315	40322	25 %	50 %	25 %	0 %	386343571
89	NC_017578	ATTC	2	8	42786	42793	25 %	50 %	0 %	25 %	386343572
90	NC_017578	ATCC	2	8	43189	43196	25 %	25 %	0 %	50 %	386343572
91	NC_017578	GTCT	2	8	43416	43423	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
92	NC_017578	GCTT	2	8	43463	43470	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
93	NC_017578	CTGT	2	8	43536	43543	0 %	50 %	25 %	25 %	386343572
94	NC_017578	TCTT	2	8	44523	44530	0 %	75 %	0 %	25 %	386343573
95	NC_017578	GCTT	2	8	44554	44561	0 %	50 %	25 %	25 %	386343573
96	NC_017578	TCAA	2	8	46372	46379	50 %	25 %	0 %	25 %	386343579
97	NC_017578	ATTT	2	8	46628	46635	25 %	75 %	0 %	0 %	386343579
98	NC_017578	TTCC	2	8	47713	47720	0 %	50 %	0 %	50 %	386343580
99	NC_017578	CCAA	2	8	48259	48266	50 %	0 %	0 %	50 %	386343581
100	NC_017578	TACT	2	8	48464	48471	25 %	50 %	0 %	25 %	386343581
101	NC_017578	TTAT	2	8	48641	48648	25 %	75 %	0 %	0 %	386343581
102	NC_017578	TTAT	2	8	49075	49082	25 %	75 %	0 %	0 %	386343581
103	NC_017578	AAAG	2	8	49117	49124	75 %	0 %	25 %	0 %	386343581
104	NC_017578	GCTT	2	8	49494	49501	0 %	50 %	25 %	25 %	386343582
105	NC_017578	CCCA	2	8	49678	49685	25 %	0 %	0 %	75 %	386343582
106	NC_017578	GCTT	2	8	49743	49750	0 %	50 %	25 %	25 %	386343582
107	NC_017578	CCAA	2	8	49865	49872	50 %	0 %	0 %	50 %	386343582
108	NC_017578	GGCC	2	8	50185	50192	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
109	NC_017578	AGTT	2	8	50268	50275	25 %	50 %	25 %	0 %	386343583
110	NC_017578	AACT	2	8	51211	51218	50 %	25 %	0 %	25 %	386343583
111	NC_017578	GCTT	2	8	53309	53316	0 %	50 %	25 %	25 %	386343583
112	NC_017578	TGCC	2	8	53319	53326	0 %	25 %	25 %	50 %	386343583
113	NC_017578	ACTC	2	8	53341	53348	25 %	25 %	0 %	50 %	386343583
114	NC_017578	AGCA	2	8	53727	53734	50 %	0 %	25 %	25 %	386343584
115	NC_017578	GTTG	2	8	53929	53936	0 %	50 %	50 %	0 %	386343584
116	NC_017578	TCAA	2	8	54220	54227	50 %	25 %	0 %	25 %	386343584
117	NC_017578	GTTC	2	8	55236	55243	0 %	50 %	25 %	25 %	386343585
118	NC_017578	GGCA	2	8	55472	55479	25 %	0 %	50 %	25 %	386343585
119	NC_017578	TCAA	2	8	57760	57767	50 %	25 %	0 %	25 %	386343591
120	NC_017578	ATTT	2	8	58016	58023	25 %	75 %	0 %	0 %	386343591
121	NC_017578	ATTG	2	8	59458	59465	25 %	50 %	25 %	0 %	386343593
122	NC_017578	GCTT	2	8	60232	60239	0 %	50 %	25 %	25 %	386343594
123	NC_017578	GCTT	2	8	60379	60386	0 %	50 %	25 %	25 %	386343594
124	NC_017578	GAGC	2	8	60449	60456	25 %	0 %	50 %	25 %	386343594
125	NC_017578	CCAA	2	8	61139	61146	50 %	0 %	0 %	50 %	386343595
126	NC_017578	ACAA	2	8	61158	61165	75 %	0 %	0 %	25 %	386343595
127	NC_017578	TCAA	2	8	61287	61294	50 %	25 %	0 %	25 %	386343595
128	NC_017578	AATT	2	8	64151	64158	50 %	50 %	0 %	0 %	386343597
129	NC_017578	TGAA	2	8	64504	64511	50 %	25 %	25 %	0 %	386343597
130	NC_017578	AAAC	2	8	65244	65251	75 %	0 %	0 %	25 %	386343598
131	NC_017578	AATT	2	8	66187	66194	50 %	50 %	0 %	0 %	386343599
132	NC_017578	ATCA	2	8	66992	66999	50 %	25 %	0 %	25 %	386343600
133	NC_017578	GGTA	2	8	67158	67165	25 %	25 %	50 %	0 %	386343601
134	NC_017578	CAAT	2	8	67939	67946	50 %	25 %	0 %	25 %	386343602
135	NC_017578	TTAT	2	8	67953	67960	25 %	75 %	0 %	0 %	386343602
136	NC_017578	GCTT	2	8	69386	69393	0 %	50 %	25 %	25 %	386343605
137	NC_017578	GAGC	2	8	69603	69610	25 %	0 %	50 %	25 %	386343605
138	NC_017578	TTTG	2	8	70117	70124	0 %	75 %	25 %	0 %	386343606
139	NC_017578	TCTT	2	8	70499	70506	0 %	75 %	0 %	25 %	386343607
140	NC_017578	TTTG	2	8	70733	70740	0 %	75 %	25 %	0 %	386343607
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.