MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017578	AG	3	6	1297	1302	50 %	0 %	50 %	0 %	386343538
2	NC_017578	AG	3	6	1608	1613	50 %	0 %	50 %	0 %	386343538
3	NC_017578	GC	3	6	3001	3006	0 %	0 %	50 %	50 %	386343538
4	NC_017578	GA	4	8	3561	3568	50 %	0 %	50 %	0 %	386343538
5	NC_017578	TA	4	8	3794	3801	50 %	50 %	0 %	0 %	386343538
6	NC_017578	AC	4	8	4256	4263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017578	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	386343539
8	NC_017578	AC	3	6	6545	6550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017578	AG	3	6	6699	6704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017578	CA	3	6	10384	10389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017578	AT	3	6	11588	11593	50 %	50 %	0 %	0 %	386343550
12	NC_017578	CA	3	6	12679	12684	50 %	0 %	0 %	50 %	386343552
13	NC_017578	CT	3	6	12922	12927	0 %	50 %	0 %	50 %	386343553
14	NC_017578	AG	3	6	13196	13201	50 %	0 %	50 %	0 %	386343553
15	NC_017578	CA	3	6	14328	14333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017578	GA	3	6	15178	15183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017578	GT	3	6	15668	15673	0 %	50 %	50 %	0 %	386343557
18	NC_017578	AC	3	6	16725	16730	50 %	0 %	0 %	50 %	386343558
19	NC_017578	GC	3	6	17119	17124	0 %	0 %	50 %	50 %	386343558
20	NC_017578	TA	3	6	18309	18314	50 %	50 %	0 %	0 %	386343559
21	NC_017578	AT	4	8	18599	18606	50 %	50 %	0 %	0 %	386343559
22	NC_017578	CT	3	6	19087	19092	0 %	50 %	0 %	50 %	386343559
23	NC_017578	TG	3	6	19127	19132	0 %	50 %	50 %	0 %	386343559
24	NC_017578	AT	3	6	19537	19542	50 %	50 %	0 %	0 %	386343559
25	NC_017578	CG	3	6	21271	21276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017578	GT	4	8	23865	23872	0 %	50 %	50 %	0 %	386343562
27	NC_017578	CT	3	6	26472	26477	0 %	50 %	0 %	50 %	386343563
28	NC_017578	CT	4	8	26722	26729	0 %	50 %	0 %	50 %	386343563
29	NC_017578	GA	3	6	27703	27708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017578	TC	3	6	29208	29213	0 %	50 %	0 %	50 %	386343564
31	NC_017578	AT	4	8	30386	30393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017578	TA	3	6	31954	31959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017578	CA	3	6	34802	34807	50 %	0 %	0 %	50 %	386343569
34	NC_017578	AG	3	6	35160	35165	50 %	0 %	50 %	0 %	386343569
35	NC_017578	CT	3	6	36280	36285	0 %	50 %	0 %	50 %	386343569
36	NC_017578	AG	3	6	37664	37669	50 %	0 %	50 %	0 %	386343570
37	NC_017578	TC	3	6	39006	39011	0 %	50 %	0 %	50 %	386343571
38	NC_017578	AT	3	6	39070	39075	50 %	50 %	0 %	0 %	386343571
39	NC_017578	AC	3	6	40010	40015	50 %	0 %	0 %	50 %	386343571
40	NC_017578	CA	3	6	40207	40212	50 %	0 %	0 %	50 %	386343571
41	NC_017578	TC	3	6	40773	40778	0 %	50 %	0 %	50 %	386343571
42	NC_017578	GC	3	6	41418	41423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017578	AC	3	6	42069	42074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017578	TA	3	6	42468	42473	50 %	50 %	0 %	0 %	386343572
45	NC_017578	GT	3	6	45353	45358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017578	TG	3	6	45552	45557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017578	CA	3	6	46495	46500	50 %	0 %	0 %	50 %	386343579
48	NC_017578	AT	3	6	48104	48109	50 %	50 %	0 %	0 %	386343581
49	NC_017578	AC	3	6	48268	48273	50 %	0 %	0 %	50 %	386343581
50	NC_017578	AC	4	8	48598	48605	50 %	0 %	0 %	50 %	386343581
51	NC_017578	AT	3	6	48628	48633	50 %	50 %	0 %	0 %	386343581
52	NC_017578	AT	3	6	49043	49048	50 %	50 %	0 %	0 %	386343581
53	NC_017578	CG	4	8	49296	49303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017578	CT	3	6	49784	49789	0 %	50 %	0 %	50 %	386343582
55	NC_017578	CG	4	8	50196	50203	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
56	NC_017578	CG	3	6	50640	50645	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
57	NC_017578	CG	3	6	51687	51692	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
58	NC_017578	CG	3	6	52209	52214	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
59	NC_017578	CG	3	6	52470	52475	0 %	0 %	50 %	50 %	386343583
60	NC_017578	AC	3	6	52674	52679	50 %	0 %	0 %	50 %	386343583
61	NC_017578	AC	3	6	52932	52937	50 %	0 %	0 %	50 %	386343583
62	NC_017578	AT	3	6	54455	54460	50 %	50 %	0 %	0 %	386343584
63	NC_017578	GT	3	6	54605	54610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017578	CT	3	6	55043	55048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017578	TA	3	6	55092	55097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017578	CG	3	6	55519	55524	0 %	0 %	50 %	50 %	386343585
67	NC_017578	AT	3	6	55687	55692	50 %	50 %	0 %	0 %	386343585
68	NC_017578	TA	3	6	55958	55963	50 %	50 %	0 %	0 %	386343586
69	NC_017578	TC	3	6	56674	56679	0 %	50 %	0 %	50 %	386343587
70	NC_017578	TG	3	6	56940	56945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017578	CA	3	6	57883	57888	50 %	0 %	0 %	50 %	386343591
72	NC_017578	TA	3	6	58830	58835	50 %	50 %	0 %	0 %	386343593
73	NC_017578	CT	3	6	59293	59298	0 %	50 %	0 %	50 %	386343593
74	NC_017578	TA	3	6	59548	59553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017578	AC	3	6	60371	60376	50 %	0 %	0 %	50 %	386343594
76	NC_017578	CA	4	8	61758	61765	50 %	0 %	0 %	50 %	386343596
77	NC_017578	AG	3	6	62018	62023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017578	AT	3	6	62662	62667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017578	AC	3	6	62921	62926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017578	TA	4	8	65360	65367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017578	TA	3	6	65875	65880	50 %	50 %	0 %	0 %	386343599
82	NC_017578	AC	3	6	67364	67369	50 %	0 %	0 %	50 %	386343601
83	NC_017578	AG	3	6	67510	67515	50 %	0 %	50 %	0 %	386343601
84	NC_017578	AC	3	6	68466	68471	50 %	0 %	0 %	50 %	386343604
85	NC_017578	AG	4	8	69138	69145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017578	GT	3	6	69259	69264	0 %	50 %	50 %	0 %	386343605
87	NC_017578	AC	3	6	69525	69530	50 %	0 %	0 %	50 %	386343605
88	NC_017578	CG	3	6	69797	69802	0 %	0 %	50 %	50 %	386343605
89	NC_017578	AC	3	6	69992	69997	50 %	0 %	0 %	50 %	386343605
90	NC_017578	TA	3	6	70277	70282	50 %	50 %	0 %	0 %	386343606
91	NC_017578	AC	4	8	70706	70713	50 %	0 %	0 %	50 %	386343607

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.