MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	TCATTT	2	12	1883	1894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386343411
2	NC_017577	AAAACA	2	12	3867	3878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386343412
3	NC_017577	TGGTGT	2	12	4133	4144	0 %	50 %	50 %	0 %	386343412
4	NC_017577	CATCTT	2	12	10624	10635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386343415
5	NC_017577	TCAAAC	2	12	15268	15279	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386343417
6	NC_017577	TCAGGT	2	12	23956	23967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386343427
7	NC_017577	TCCAAC	2	12	27676	27687	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386343430
8	NC_017577	TGCTCT	2	12	29796	29807	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386343433
9	NC_017577	TCAAGA	2	12	31388	31399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386343435
10	NC_017577	TATGAA	2	12	33437	33448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386343438
11	NC_017577	GAACGT	2	12	36448	36459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386343440
12	NC_017577	TCTACA	2	12	37704	37715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343441
13	NC_017577	ACCTAT	2	12	39957	39968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343442
14	NC_017577	ATACCC	2	12	43694	43705	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386343450
15	NC_017577	GCATTT	2	12	44929	44940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386343451
16	NC_017577	GCTTCG	2	12	46857	46868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343453
17	NC_017577	ATGTTG	2	12	47356	47367	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386343454
18	NC_017577	CACTGT	2	12	47597	47608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386343455
19	NC_017577	CCAAAA	2	12	48383	48394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343456
20	NC_017577	CTAAAA	2	12	50007	50018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386343457
21	NC_017577	CTTAGC	2	12	51950	51961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386343458
22	NC_017577	ATGCTA	2	12	61934	61945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386343465
23	NC_017577	GCACCA	2	12	63661	63672	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386343465
24	NC_017577	TTCGGC	2	12	63807	63818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343465
25	NC_017577	AGCACC	2	12	64080	64091	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386343465
26	NC_017577	TCCAGA	2	12	64134	64145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386343465
27	NC_017577	GTATCA	2	12	66917	66928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386343468
28	NC_017577	TATCAA	2	12	68229	68240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386343470
29	NC_017577	GAAACA	2	12	70666	70677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386343474
30	NC_017577	TTTGCC	2	12	71042	71053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386343475
31	NC_017577	TTTTAA	2	12	77644	77655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343481
32	NC_017577	CTGAAT	2	12	77838	77849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386343481
33	NC_017577	TGAAAT	2	12	79281	79292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386343483
34	NC_017577	GAGGCA	2	12	81926	81937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386343485
35	NC_017577	TTGCAT	2	12	89794	89805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386343492
36	NC_017577	TAATGC	2	12	94308	94319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386343496
37	NC_017577	TAGAGA	2	12	98554	98565	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386343502
38	NC_017577	CAAACG	2	12	105706	105717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386343516
39	NC_017577	CTGCCA	2	12	110400	110411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386343524

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.