MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	AATG	2	8	841	848	50 %	25 %	25 %	0 %	386343410
2	NC_017577	CGAG	2	8	2178	2185	25 %	0 %	50 %	25 %	386343411
3	NC_017577	TTGC	2	8	2442	2449	0 %	50 %	25 %	25 %	386343411
4	NC_017577	GAAT	2	8	2953	2960	50 %	25 %	25 %	0 %	386343411
5	NC_017577	GTGC	2	8	3009	3016	0 %	25 %	50 %	25 %	386343411
6	NC_017577	AGTT	2	8	3469	3476	25 %	50 %	25 %	0 %	386343411
7	NC_017577	AATG	2	8	4034	4041	50 %	25 %	25 %	0 %	386343412
8	NC_017577	AAAC	2	8	4574	4581	75 %	0 %	0 %	25 %	386343412
9	NC_017577	ACGA	2	8	5346	5353	50 %	0 %	25 %	25 %	386343413
10	NC_017577	CCCA	2	8	6157	6164	25 %	0 %	0 %	75 %	386343413
11	NC_017577	TCCA	2	8	6186	6193	25 %	25 %	0 %	50 %	386343413
12	NC_017577	ATTT	2	8	6682	6689	25 %	75 %	0 %	0 %	386343413
13	NC_017577	GTAC	2	8	7937	7944	25 %	25 %	25 %	25 %	386343413
14	NC_017577	TCTT	2	8	8781	8788	0 %	75 %	0 %	25 %	386343413
15	NC_017577	TAAA	2	8	8998	9005	75 %	25 %	0 %	0 %	386343413
16	NC_017577	TTCG	2	8	9528	9535	0 %	50 %	25 %	25 %	386343414
17	NC_017577	AAAC	2	8	9726	9733	75 %	0 %	0 %	25 %	386343414
18	NC_017577	TGTT	2	8	10190	10197	0 %	75 %	25 %	0 %	386343415
19	NC_017577	TTGA	2	8	10813	10820	25 %	50 %	25 %	0 %	386343415
20	NC_017577	TCGC	2	8	10987	10994	0 %	25 %	25 %	50 %	386343415
21	NC_017577	TGCT	2	8	11291	11298	0 %	50 %	25 %	25 %	386343415
22	NC_017577	ACAT	2	8	11475	11482	50 %	25 %	0 %	25 %	386343415
23	NC_017577	TTTG	2	8	12371	12378	0 %	75 %	25 %	0 %	386343417
24	NC_017577	TAAC	2	8	13183	13190	50 %	25 %	0 %	25 %	386343417
25	NC_017577	AGAC	2	8	13221	13228	50 %	0 %	25 %	25 %	386343417
26	NC_017577	TAGC	2	8	13459	13466	25 %	25 %	25 %	25 %	386343417
27	NC_017577	TTGA	2	8	13778	13785	25 %	50 %	25 %	0 %	386343417
28	NC_017577	AATG	2	8	14166	14173	50 %	25 %	25 %	0 %	386343417
29	NC_017577	TACC	2	8	14297	14304	25 %	25 %	0 %	50 %	386343417
30	NC_017577	AAAT	2	8	15094	15101	75 %	25 %	0 %	0 %	386343417
31	NC_017577	GATT	2	8	15341	15348	25 %	50 %	25 %	0 %	386343417
32	NC_017577	TAGC	2	8	15406	15413	25 %	25 %	25 %	25 %	386343417
33	NC_017577	AATA	2	8	16016	16023	75 %	25 %	0 %	0 %	386343417
34	NC_017577	CCCA	2	8	17226	17233	25 %	0 %	0 %	75 %	386343419
35	NC_017577	CCAC	2	8	17281	17288	25 %	0 %	0 %	75 %	386343419
36	NC_017577	CAAG	2	8	17364	17371	50 %	0 %	25 %	25 %	386343419
37	NC_017577	ATTT	2	8	17850	17857	25 %	75 %	0 %	0 %	386343421
38	NC_017577	AACC	2	8	18507	18514	50 %	0 %	0 %	50 %	386343421
39	NC_017577	AAAT	2	8	18667	18674	75 %	25 %	0 %	0 %	386343421
40	NC_017577	TGAT	2	8	19149	19156	25 %	50 %	25 %	0 %	386343422
41	NC_017577	ATTA	2	8	19269	19276	50 %	50 %	0 %	0 %	386343422
42	NC_017577	TAAA	2	8	19539	19546	75 %	25 %	0 %	0 %	386343423
43	NC_017577	CTAA	2	8	19995	20002	50 %	25 %	0 %	25 %	386343424
44	NC_017577	CAAT	2	8	20195	20202	50 %	25 %	0 %	25 %	386343425
45	NC_017577	GACT	2	8	20598	20605	25 %	25 %	25 %	25 %	386343425
46	NC_017577	TTTC	2	8	20713	20720	0 %	75 %	0 %	25 %	386343425
47	NC_017577	TTGC	2	8	21181	21188	0 %	50 %	25 %	25 %	386343425
48	NC_017577	TCGT	2	8	23165	23172	0 %	50 %	25 %	25 %	386343426
49	NC_017577	TTGA	2	8	23288	23295	25 %	50 %	25 %	0 %	386343426
50	NC_017577	ATTG	2	8	23566	23573	25 %	50 %	25 %	0 %	386343426
51	NC_017577	TGCT	2	8	24808	24815	0 %	50 %	25 %	25 %	386343428
52	NC_017577	TTGG	2	8	25600	25607	0 %	50 %	50 %	0 %	386343428
53	NC_017577	TTGC	2	8	26602	26609	0 %	50 %	25 %	25 %	386343429
54	NC_017577	TCAG	2	8	26916	26923	25 %	25 %	25 %	25 %	386343429
55	NC_017577	TTAG	2	8	27129	27136	25 %	50 %	25 %	0 %	386343429
56	NC_017577	TTTA	2	8	27137	27144	25 %	75 %	0 %	0 %	386343429
57	NC_017577	AAGT	2	8	27811	27818	50 %	25 %	25 %	0 %	386343430
58	NC_017577	TGAA	2	8	28863	28870	50 %	25 %	25 %	0 %	386343432
59	NC_017577	CTGC	2	8	29017	29024	0 %	25 %	25 %	50 %	386343432
60	NC_017577	AACT	2	8	29110	29117	50 %	25 %	0 %	25 %	386343432
61	NC_017577	ACCA	2	8	29382	29389	50 %	0 %	0 %	50 %	386343432
62	NC_017577	TAAA	2	8	29397	29404	75 %	25 %	0 %	0 %	386343432
63	NC_017577	ATGT	2	8	29922	29929	25 %	50 %	25 %	0 %	386343433
64	NC_017577	ATTA	2	8	31571	31578	50 %	50 %	0 %	0 %	386343435
65	NC_017577	CCAA	2	8	31727	31734	50 %	0 %	0 %	50 %	386343436
66	NC_017577	GACA	2	8	31907	31914	50 %	0 %	25 %	25 %	386343436
67	NC_017577	TGAA	2	8	31960	31967	50 %	25 %	25 %	0 %	386343436
68	NC_017577	TTCT	2	8	32900	32907	0 %	75 %	0 %	25 %	386343437
69	NC_017577	TGTT	2	8	32996	33003	0 %	75 %	25 %	0 %	386343438
70	NC_017577	ACTA	2	8	33004	33011	50 %	25 %	0 %	25 %	386343438
71	NC_017577	ACTT	2	8	33621	33628	25 %	50 %	0 %	25 %	386343438
72	NC_017577	TTTG	2	8	33842	33849	0 %	75 %	25 %	0 %	386343438
73	NC_017577	CAAT	2	8	34474	34481	50 %	25 %	0 %	25 %	386343439
74	NC_017577	CATT	2	8	35003	35010	25 %	50 %	0 %	25 %	386343439
75	NC_017577	CTAG	2	8	35755	35762	25 %	25 %	25 %	25 %	386343440
76	NC_017577	AAGT	2	8	36483	36490	50 %	25 %	25 %	0 %	386343440
77	NC_017577	CACT	2	8	38550	38557	25 %	25 %	0 %	50 %	386343441
78	NC_017577	CAAT	2	8	38604	38611	50 %	25 %	0 %	25 %	386343441
79	NC_017577	CAAA	2	8	40889	40896	75 %	0 %	0 %	25 %	386343444
80	NC_017577	CATT	2	8	41215	41222	25 %	50 %	0 %	25 %	386343445
81	NC_017577	TTGT	2	8	42281	42288	0 %	75 %	25 %	0 %	386343448
82	NC_017577	TTTC	2	8	43602	43609	0 %	75 %	0 %	25 %	386343450
83	NC_017577	TTCA	2	8	43777	43784	25 %	50 %	0 %	25 %	386343450
84	NC_017577	ACTG	2	8	43859	43866	25 %	25 %	25 %	25 %	386343450
85	NC_017577	CATT	2	8	44053	44060	25 %	50 %	0 %	25 %	386343451
86	NC_017577	AATC	2	8	44461	44468	50 %	25 %	0 %	25 %	386343451
87	NC_017577	GTTT	2	8	44525	44532	0 %	75 %	25 %	0 %	386343451
88	NC_017577	GCTT	2	8	44767	44774	0 %	50 %	25 %	25 %	386343451
89	NC_017577	TAAC	2	8	45539	45546	50 %	25 %	0 %	25 %	386343452
90	NC_017577	TGGT	2	8	45733	45740	0 %	50 %	50 %	0 %	386343452
91	NC_017577	GCTC	2	8	45814	45821	0 %	25 %	25 %	50 %	386343452
92	NC_017577	ACTA	2	8	46179	46186	50 %	25 %	0 %	25 %	386343452
93	NC_017577	TGAT	2	8	46771	46778	25 %	50 %	25 %	0 %	386343453
94	NC_017577	ATAG	2	8	46781	46788	50 %	25 %	25 %	0 %	386343453
95	NC_017577	TCAC	2	8	46809	46816	25 %	25 %	0 %	50 %	386343453
96	NC_017577	CATT	2	8	47005	47012	25 %	50 %	0 %	25 %	386343453
97	NC_017577	CTTA	2	8	47195	47202	25 %	50 %	0 %	25 %	386343454
98	NC_017577	TGGC	2	8	47216	47223	0 %	25 %	50 %	25 %	386343454
99	NC_017577	CTTA	2	8	47566	47573	25 %	50 %	0 %	25 %	386343455
100	NC_017577	ATAG	2	8	47721	47728	50 %	25 %	25 %	0 %	386343455
101	NC_017577	ATCC	2	8	48343	48350	25 %	25 %	0 %	50 %	386343456
102	NC_017577	TTGA	2	8	48503	48510	25 %	50 %	25 %	0 %	386343456
103	NC_017577	ATAG	2	8	48680	48687	50 %	25 %	25 %	0 %	386343456
104	NC_017577	TCGC	2	8	48889	48896	0 %	25 %	25 %	50 %	386343457
105	NC_017577	CAAA	2	8	49030	49037	75 %	0 %	0 %	25 %	386343457
106	NC_017577	GAAT	2	8	49783	49790	50 %	25 %	25 %	0 %	386343457
107	NC_017577	TGTT	2	8	50675	50682	0 %	75 %	25 %	0 %	386343458
108	NC_017577	ACTG	2	8	51021	51028	25 %	25 %	25 %	25 %	386343458
109	NC_017577	ACTG	2	8	51084	51091	25 %	25 %	25 %	25 %	386343458
110	NC_017577	TGAT	2	8	51128	51135	25 %	50 %	25 %	0 %	386343458
111	NC_017577	TGGA	2	8	51254	51261	25 %	25 %	50 %	0 %	386343458
112	NC_017577	TTTG	2	8	51808	51815	0 %	75 %	25 %	0 %	386343458
113	NC_017577	TGCT	2	8	52010	52017	0 %	50 %	25 %	25 %	386343458
114	NC_017577	CGAG	2	8	53064	53071	25 %	0 %	50 %	25 %	386343458
115	NC_017577	TTCG	2	8	53284	53291	0 %	50 %	25 %	25 %	386343458
116	NC_017577	CACC	2	8	53478	53485	25 %	0 %	0 %	75 %	386343459
117	NC_017577	TCAA	2	8	53909	53916	50 %	25 %	0 %	25 %	386343459
118	NC_017577	GTCA	2	8	54196	54203	25 %	25 %	25 %	25 %	386343459
119	NC_017577	CCCT	2	8	54390	54397	0 %	25 %	0 %	75 %	386343460
120	NC_017577	CAGA	2	8	56838	56845	50 %	0 %	25 %	25 %	386343462
121	NC_017577	ACAA	2	8	57049	57056	75 %	0 %	0 %	25 %	386343463
122	NC_017577	ATTT	2	8	57468	57475	25 %	75 %	0 %	0 %	386343463
123	NC_017577	TAAC	2	8	57679	57686	50 %	25 %	0 %	25 %	386343463
124	NC_017577	GTTG	2	8	57719	57726	0 %	50 %	50 %	0 %	386343463
125	NC_017577	AGCA	2	8	57761	57768	50 %	0 %	25 %	25 %	386343463
126	NC_017577	TGAC	2	8	57829	57836	25 %	25 %	25 %	25 %	386343463
127	NC_017577	ATCA	2	8	58061	58068	50 %	25 %	0 %	25 %	386343464
128	NC_017577	TATG	2	8	58270	58277	25 %	50 %	25 %	0 %	386343464
129	NC_017577	AAGT	2	8	58561	58568	50 %	25 %	25 %	0 %	386343464
130	NC_017577	ATGA	2	8	59039	59046	50 %	25 %	25 %	0 %	386343464
131	NC_017577	ATTT	2	8	59110	59117	25 %	75 %	0 %	0 %	386343464
132	NC_017577	ATTG	2	8	60054	60061	25 %	50 %	25 %	0 %	386343465
133	NC_017577	GAAA	2	8	60093	60100	75 %	0 %	25 %	0 %	386343465
134	NC_017577	TCCC	2	8	60556	60563	0 %	25 %	0 %	75 %	386343465
135	NC_017577	TGGA	2	8	60886	60893	25 %	25 %	50 %	0 %	386343465
136	NC_017577	AAGC	2	8	61022	61029	50 %	0 %	25 %	25 %	386343465
137	NC_017577	GACA	2	8	61202	61209	50 %	0 %	25 %	25 %	386343465
138	NC_017577	CTGT	2	8	61261	61268	0 %	50 %	25 %	25 %	386343465
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.