MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	AAC	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017577	AAT	2	6	1215	1220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017577	CAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017577	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017577	AAC	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017577	ATG	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017577	ATT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017577	CAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017577	GAC	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017577	CAA	3	9	11858	11866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017577	AAC	2	6	16555	16560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017577	AGT	2	6	16673	16678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017577	TGA	2	6	16703	16708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017577	CCA	2	6	18746	18751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017577	AAT	2	6	18752	18757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017577	TAA	2	6	18848	18853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017577	GTT	2	6	19443	19448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017577	ATG	2	6	24548	24553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017577	GTT	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017577	CTA	2	6	26086	26091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017577	CTA	2	6	26124	26129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017577	CTA	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017577	AAT	2	6	27208	27213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017577	ACA	2	6	27278	27283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017577	TAT	2	6	27915	27920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017577	ACT	2	6	28476	28481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017577	CGC	2	6	28511	28516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017577	CGT	2	6	28536	28541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017577	ATT	2	6	28602	28607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017577	TTA	2	6	29449	29454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017577	AAG	2	6	29517	29522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017577	CAA	2	6	30245	30250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017577	CGC	2	6	30382	30387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017577	TGA	2	6	30434	30439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017577	CAT	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017577	CAG	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017577	ATC	2	6	31058	31063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017577	AGA	2	6	32341	32346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017577	CGT	2	6	32359	32364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017577	CTT	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017577	CAC	3	9	35323	35331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017577	CTA	2	6	35373	35378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017577	TTG	2	6	35399	35404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017577	TAT	3	9	35503	35511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017577	ATC	2	6	35515	35520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017577	ACT	2	6	36682	36687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017577	CAA	2	6	37017	37022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017577	TTG	2	6	37175	37180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017577	ACC	2	6	37193	37198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017577	AGT	2	6	37268	37273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017577	CTT	2	6	37313	37318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017577	AGA	2	6	37393	37398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017577	ACC	2	6	37436	37441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017577	ACA	2	6	37508	37513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017577	ACC	2	6	38950	38955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017577	GCT	2	6	38995	39000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017577	TAT	2	6	39058	39063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017577	AGT	2	6	39191	39196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017577	TCA	2	6	39214	39219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017577	GGC	2	6	39351	39356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017577	ATT	2	6	39989	39994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017577	GCG	2	6	40024	40029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017577	AAT	2	6	40697	40702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017577	ATT	2	6	40711	40716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017577	GGT	2	6	40744	40749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017577	TTG	2	6	41360	41365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017577	ACT	2	6	41379	41384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017577	ATT	2	6	41484	41489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017577	AGA	2	6	41994	41999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017577	ATA	2	6	42027	42032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017577	ATA	3	9	42515	42523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017577	TTA	3	9	42538	42546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017577	AAT	2	6	42553	42558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017577	TTA	2	6	42585	42590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017577	TAT	2	6	42633	42638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017577	GGC	2	6	42670	42675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017577	TTG	2	6	42961	42966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017577	CAT	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017577	GGT	2	6	43252	43257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017577	CTT	2	6	47492	47497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017577	GCA	2	6	54757	54762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017577	TCA	2	6	55040	55045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017577	TTG	2	6	55113	55118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017577	TGC	2	6	55180	55185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017577	ATC	2	6	55188	55193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017577	ATA	2	6	55222	55227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017577	ATT	2	6	55232	55237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017577	TAT	2	6	55264	55269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017577	TAG	2	6	56578	56583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017577	TAG	2	6	56587	56592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017577	ATT	2	6	56607	56612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017577	CGC	2	6	56875	56880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017577	GCG	2	6	56888	56893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017577	CTA	2	6	56899	56904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017577	ATT	2	6	67026	67031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017577	ATT	2	6	68036	68041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017577	TAA	2	6	68821	68826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017577	GTG	2	6	68834	68839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017577	TCA	2	6	69992	69997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017577	TAT	2	6	70859	70864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017577	CAT	2	6	76284	76289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017577	TCA	2	6	77319	77324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017577	GCT	2	6	77374	77379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017577	AAT	2	6	77538	77543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017577	ATA	2	6	77568	77573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017577	AAT	2	6	77618	77623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017577	AGG	2	6	77625	77630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017577	ACT	2	6	78047	78052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017577	TTG	2	6	78841	78846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017577	GCA	2	6	78866	78871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017577	ATT	2	6	78925	78930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017577	ATT	2	6	78982	78987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017577	TGA	2	6	79065	79070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017577	ATT	2	6	79076	79081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017577	TTA	2	6	79101	79106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017577	CAA	2	6	79546	79551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017577	AAT	2	6	79554	79559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017577	ATT	2	6	80069	80074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017577	AAG	2	6	84131	84136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017577	TCA	2	6	84169	84174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017577	AAG	2	6	84232	84237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017577	CTA	2	6	84447	84452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017577	CAC	2	6	84578	84583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017577	CTT	2	6	84606	84611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017577	TGT	2	6	84618	84623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017577	TGT	3	9	85515	85523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017577	TTC	2	6	85565	85570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017577	CTT	2	6	85633	85638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017577	TCA	2	6	85692	85697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017577	TAG	2	6	85703	85708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017577	TTC	2	6	85719	85724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017577	TGA	2	6	85833	85838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017577	ATT	2	6	85844	85849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017577	CGA	2	6	85945	85950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017577	ATA	2	6	86091	86096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017577	GAC	2	6	86114	86119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017577	TCA	2	6	86121	86126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017577	GAT	2	6	86207	86212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017577	AAT	2	6	86314	86319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017577	AGC	2	6	86343	86348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017577	CCG	2	6	86440	86445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017577	GTT	2	6	86512	86517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017577	TCG	2	6	86640	86645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017577	TTC	2	6	86688	86693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017577	ACG	2	6	86755	86760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017577	CGC	2	6	86883	86888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017577	TTG	2	6	86934	86939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017577	AAT	2	6	87106	87111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017577	GTA	2	6	87164	87169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017577	TAA	2	6	87210	87215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017577	TGA	2	6	87488	87493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017577	TGT	2	6	88339	88344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017577	TGC	2	6	88351	88356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017577	AAT	2	6	90005	90010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017577	AAT	2	6	90635	90640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017577	GTT	2	6	90661	90666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017577	AGT	2	6	91350	91355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017577	TAG	2	6	91547	91552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017577	ATA	2	6	91557	91562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017577	TAG	2	6	91568	91573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017577	ATA	2	6	91578	91583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017577	GGA	2	6	91625	91630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017577	AAC	2	6	91646	91651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017577	CTT	2	6	91698	91703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017577	TAT	2	6	93788	93793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017577	CTC	2	6	94839	94844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_017577	AAC	2	6	95804	95809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_017577	CTG	2	6	95816	95821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017577	AGA	2	6	95836	95841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017577	CAT	2	6	95944	95949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_017577	CAA	2	6	96013	96018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_017577	ACA	2	6	96114	96119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017577	GTC	2	6	97463	97468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_017577	AAT	2	6	97479	97484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017577	GTT	2	6	97558	97563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017577	TGA	2	6	99506	99511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017577	ATC	2	6	99589	99594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017577	TAT	2	6	99603	99608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017577	ATG	2	6	99648	99653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017577	CAA	2	6	99696	99701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017577	TGC	2	6	99833	99838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_017577	ATC	2	6	99871	99876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_017577	ATC	2	6	104597	104602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017577	TAC	2	6	104629	104634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_017577	GCT	2	6	107799	107804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017577	ATG	2	6	108885	108890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017577	TTA	2	6	111055	111060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017577	TAC	2	6	111191	111196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_017577	AAT	2	6	111207	111212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017577	TGG	2	6	111281	111286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017577	TCA	2	6	111289	111294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_017577	CAG	2	6	112117	112122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_017577	ACA	2	6	112752	112757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_017577	AAG	2	6	113382	113387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017577	TTG	2	6	119297	119302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017577	CAA	2	6	119315	119320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_017577	AAT	2	6	119324	119329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017577	GCA	2	6	119337	119342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_017577	TCA	2	6	119366	119371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_017577	ATT	2	6	119384	119389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017577	ACA	2	6	119411	119416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
202	NC_017577	GTT	2	6	119484	119489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.