MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	AC	3	6	928	933	50 %	0 %	0 %	50 %	386343410
2	NC_017577	TG	3	6	2689	2694	0 %	50 %	50 %	0 %	386343411
3	NC_017577	TA	3	6	2715	2720	50 %	50 %	0 %	0 %	386343411
4	NC_017577	CT	3	6	2779	2784	0 %	50 %	0 %	50 %	386343411
5	NC_017577	AT	3	6	3029	3034	50 %	50 %	0 %	0 %	386343411
6	NC_017577	CA	3	6	6202	6207	50 %	0 %	0 %	50 %	386343413
7	NC_017577	CA	3	6	7009	7014	50 %	0 %	0 %	50 %	386343413
8	NC_017577	TC	3	6	7559	7564	0 %	50 %	0 %	50 %	386343413
9	NC_017577	TG	4	8	7760	7767	0 %	50 %	50 %	0 %	386343413
10	NC_017577	TG	3	6	8211	8216	0 %	50 %	50 %	0 %	386343413
11	NC_017577	CA	3	6	9081	9086	50 %	0 %	0 %	50 %	386343414
12	NC_017577	AC	3	6	10089	10094	50 %	0 %	0 %	50 %	386343414
13	NC_017577	AG	3	6	11608	11613	50 %	0 %	50 %	0 %	386343416
14	NC_017577	CA	3	6	12383	12388	50 %	0 %	0 %	50 %	386343417
15	NC_017577	AT	3	6	13364	13369	50 %	50 %	0 %	0 %	386343417
16	NC_017577	AC	3	6	13490	13495	50 %	0 %	0 %	50 %	386343417
17	NC_017577	GT	3	6	13721	13726	0 %	50 %	50 %	0 %	386343417
18	NC_017577	TA	3	6	14532	14537	50 %	50 %	0 %	0 %	386343417
19	NC_017577	GA	3	6	16873	16878	50 %	0 %	50 %	0 %	386343418
20	NC_017577	TA	3	6	17062	17067	50 %	50 %	0 %	0 %	386343418
21	NC_017577	AT	3	6	20134	20139	50 %	50 %	0 %	0 %	386343424
22	NC_017577	AC	4	8	20609	20616	50 %	0 %	0 %	50 %	386343425
23	NC_017577	GT	3	6	20993	20998	0 %	50 %	50 %	0 %	386343425
24	NC_017577	TA	4	8	21244	21251	50 %	50 %	0 %	0 %	386343425
25	NC_017577	TA	3	6	21533	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	386343425
26	NC_017577	AT	3	6	22667	22672	50 %	50 %	0 %	0 %	386343425
27	NC_017577	AT	4	8	22768	22775	50 %	50 %	0 %	0 %	386343425
28	NC_017577	TG	3	6	22778	22783	0 %	50 %	50 %	0 %	386343425
29	NC_017577	AG	3	6	23062	23067	50 %	0 %	50 %	0 %	386343426
30	NC_017577	TG	3	6	24301	24306	0 %	50 %	50 %	0 %	386343427
31	NC_017577	AG	3	6	25448	25453	50 %	0 %	50 %	0 %	386343428
32	NC_017577	TG	4	8	26688	26695	0 %	50 %	50 %	0 %	386343429
33	NC_017577	TG	3	6	26870	26875	0 %	50 %	50 %	0 %	386343429
34	NC_017577	AT	3	6	27767	27772	50 %	50 %	0 %	0 %	386343430
35	NC_017577	TA	3	6	27825	27830	50 %	50 %	0 %	0 %	386343430
36	NC_017577	TA	3	6	29350	29355	50 %	50 %	0 %	0 %	386343432
37	NC_017577	AG	3	6	29689	29694	50 %	0 %	50 %	0 %	386343433
38	NC_017577	TA	3	6	29706	29711	50 %	50 %	0 %	0 %	386343433
39	NC_017577	CT	3	6	30958	30963	0 %	50 %	0 %	50 %	386343434
40	NC_017577	AC	3	6	31003	31008	50 %	0 %	0 %	50 %	386343434
41	NC_017577	AT	3	6	33223	33228	50 %	50 %	0 %	0 %	386343438
42	NC_017577	TG	3	6	33243	33248	0 %	50 %	50 %	0 %	386343438
43	NC_017577	TA	3	6	34954	34959	50 %	50 %	0 %	0 %	386343439
44	NC_017577	AT	3	6	41276	41281	50 %	50 %	0 %	0 %	386343445
45	NC_017577	CT	3	6	43411	43416	0 %	50 %	0 %	50 %	386343450
46	NC_017577	CT	3	6	43785	43790	0 %	50 %	0 %	50 %	386343450
47	NC_017577	TC	3	6	45019	45024	0 %	50 %	0 %	50 %	386343451
48	NC_017577	CG	5	10	45335	45344	0 %	0 %	50 %	50 %	386343452
49	NC_017577	TC	3	6	45382	45387	0 %	50 %	0 %	50 %	386343452
50	NC_017577	AT	4	8	46440	46447	50 %	50 %	0 %	0 %	386343452
51	NC_017577	CT	3	6	46604	46609	0 %	50 %	0 %	50 %	386343453
52	NC_017577	CT	3	6	47157	47162	0 %	50 %	0 %	50 %	386343453
53	NC_017577	AC	3	6	47327	47332	50 %	0 %	0 %	50 %	386343454
54	NC_017577	TC	3	6	49002	49007	0 %	50 %	0 %	50 %	386343457
55	NC_017577	AT	3	6	51200	51205	50 %	50 %	0 %	0 %	386343458
56	NC_017577	TG	3	6	51584	51589	0 %	50 %	50 %	0 %	386343458
57	NC_017577	AG	3	6	53731	53736	50 %	0 %	50 %	0 %	386343459
58	NC_017577	AG	3	6	55954	55959	50 %	0 %	50 %	0 %	386343461
59	NC_017577	TG	4	8	56241	56248	0 %	50 %	50 %	0 %	386343461
60	NC_017577	AT	3	6	57323	57328	50 %	50 %	0 %	0 %	386343463
61	NC_017577	GT	3	6	57862	57867	0 %	50 %	50 %	0 %	386343463
62	NC_017577	TA	4	8	58776	58783	50 %	50 %	0 %	0 %	386343464
63	NC_017577	TG	3	6	58826	58831	0 %	50 %	50 %	0 %	386343464
64	NC_017577	TA	3	6	59321	59326	50 %	50 %	0 %	0 %	386343464
65	NC_017577	AG	3	6	59912	59917	50 %	0 %	50 %	0 %	386343465
66	NC_017577	GA	3	6	61338	61343	50 %	0 %	50 %	0 %	386343465
67	NC_017577	GA	3	6	62473	62478	50 %	0 %	50 %	0 %	386343465
68	NC_017577	GA	3	6	63464	63469	50 %	0 %	50 %	0 %	386343465
69	NC_017577	AT	3	6	63527	63532	50 %	50 %	0 %	0 %	386343465
70	NC_017577	AT	3	6	65076	65081	50 %	50 %	0 %	0 %	386343466
71	NC_017577	CA	3	6	67537	67542	50 %	0 %	0 %	50 %	386343469
72	NC_017577	TC	3	6	67947	67952	0 %	50 %	0 %	50 %	386343469
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75	NC_017577	AC	3	6	68738	68743	50 %	0 %	0 %	50 %	386343470
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81	NC_017577	AT	3	6	74085	74090	50 %	50 %	0 %	0 %	386343476
82	NC_017577	TA	3	6	74516	74521	50 %	50 %	0 %	0 %	386343476
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84	NC_017577	AT	3	6	76168	76173	50 %	50 %	0 %	0 %	386343477
85	NC_017577	AT	3	6	78672	78677	50 %	50 %	0 %	0 %	386343482
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91	NC_017577	CT	3	6	89038	89043	0 %	50 %	0 %	50 %	386343491
92	NC_017577	AT	3	6	89157	89162	50 %	50 %	0 %	0 %	386343491
93	NC_017577	TA	3	6	89349	89354	50 %	50 %	0 %	0 %	386343491
94	NC_017577	AG	3	6	89607	89612	50 %	0 %	50 %	0 %	386343492
95	NC_017577	TC	3	6	89617	89622	0 %	50 %	0 %	50 %	386343492
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102	NC_017577	TA	3	6	98115	98120	50 %	50 %	0 %	0 %	386343501
103	NC_017577	AT	3	6	98188	98193	50 %	50 %	0 %	0 %	386343501
104	NC_017577	TG	3	6	99091	99096	0 %	50 %	50 %	0 %	386343503
105	NC_017577	GT	3	6	101136	101141	0 %	50 %	50 %	0 %	386343506
106	NC_017577	TA	3	6	102468	102473	50 %	50 %	0 %	0 %	386343507
107	NC_017577	CA	3	6	102681	102686	50 %	0 %	0 %	50 %	386343508
108	NC_017577	CT	3	6	102881	102886	0 %	50 %	0 %	50 %	386343508
109	NC_017577	CT	3	6	104480	104485	0 %	50 %	0 %	50 %	386343513
110	NC_017577	TC	3	6	104933	104938	0 %	50 %	0 %	50 %	386343514
111	NC_017577	AT	4	8	104947	104954	50 %	50 %	0 %	0 %	386343514
112	NC_017577	GT	3	6	106308	106313	0 %	50 %	50 %	0 %	386343516
113	NC_017577	AC	3	6	106561	106566	50 %	0 %	0 %	50 %	386343517
114	NC_017577	GA	4	8	107585	107592	50 %	0 %	50 %	0 %	386343518
115	NC_017577	AG	3	6	107744	107749	50 %	0 %	50 %	0 %	386343518
116	NC_017577	AT	3	6	108657	108662	50 %	50 %	0 %	0 %	386343520
117	NC_017577	AC	3	6	109875	109880	50 %	0 %	0 %	50 %	386343522
118	NC_017577	TG	3	6	110094	110099	0 %	50 %	50 %	0 %	386343523
119	NC_017577	TC	3	6	112198	112203	0 %	50 %	0 %	50 %	386343526
120	NC_017577	CA	3	6	119753	119758	50 %	0 %	0 %	50 %	386343533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.