MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017575	TGAAGC	2	12	23953	23964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017575	CATTCA	2	12	44711	44722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017575	TTATCG	2	12	61459	61470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017575	GCGCGG	2	12	93026	93037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017575	TCCCTC	2	12	107776	107787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017575	GCAGCG	2	12	107909	107920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017575	GGTACG	2	12	130978	130989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017575	CGGCCC	2	12	136423	136434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017575	CGGCCA	2	12	163428	163439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017575	ATCCGC	2	12	163795	163806	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017575	GGCACG	2	12	163885	163896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017575	GCCAGG	2	12	164234	164245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017575	GCTGGT	2	12	166344	166355	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017575	TGAATT	2	12	166562	166573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017575	GCCGTG	2	12	210647	210658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017575	AATGGC	2	12	230468	230479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017575	TTTTGG	2	12	262502	262513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017575	GTTTTG	3	18	262543	262560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017575	AGGGCA	2	12	262777	262788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017575	GGCGGG	2	12	283874	283885	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017575	CGCCCG	2	12	321273	321284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017575	CGGCGC	2	12	329462	329473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017575	TGCGCG	2	12	333773	333784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017575	GAAAAT	2	12	334624	334635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017575	TAGATA	2	12	361306	361317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017575	CCCGCT	2	12	369353	369364	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017575	TCGCGT	2	12	430079	430090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017575	GTTGGA	2	12	461348	461359	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017575	TGCGCG	2	12	463402	463413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017575	TCGATC	2	12	515922	515933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017575	GGGACA	2	12	525853	525864	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017575	TGGCGC	3	18	525896	525913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017575	CGCGCC	2	12	531694	531705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017575	TCTTGA	2	12	534429	534440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017575	TTGATG	2	12	543906	543917	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017575	CCGCGC	2	12	552174	552185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017575	TTGTCG	5	30	555317	555346	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017575	TCGATG	7	42	555347	555388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017575	TCCCTT	2	12	566163	566174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017575	ATGCCG	2	12	614176	614187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017575	TTGGGG	2	12	629760	629771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017575	CGATCG	2	12	633533	633544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017575	GCATCA	2	12	633647	633658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017575	GATACG	2	12	644782	644793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017575	CACCGC	2	12	665173	665184	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017575	GCACCG	2	12	679254	679265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017575	GGAAAA	2	12	680022	680033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017575	TGGAGG	2	12	682604	682615	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017575	CGGGCT	2	12	687248	687259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017575	CCGATG	2	12	726362	726373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017575	CTGTCC	3	18	726628	726645	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017575	AAGGGG	2	12	734082	734093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017575	CGGTGG	2	12	741757	741768	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017575	AACGTA	2	12	751118	751129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017575	TTCGGC	2	12	753957	753968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017575	ACGGCG	2	12	773643	773654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017575	GGGGCC	2	12	787789	787800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017575	CGACCC	2	12	814872	814883	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017575	TCGATA	2	12	831597	831608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017575	TGCCGC	2	12	833285	833296	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017575	ACGGGA	2	12	833504	833515	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017575	TGGTCG	2	12	834143	834154	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017575	GCGGGG	2	12	850097	850108	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017575	CAGCCG	2	12	850361	850372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017575	AGCGGC	2	12	873877	873888	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017575	GCGGGC	2	12	1094929	1094940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017575	CAGCGG	3	18	1095825	1095842	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017575	TGTGCG	2	12	1096615	1096626	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017575	GACCCG	2	12	1217761	1217772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017575	CAATGC	2	12	1272003	1272014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017575	ACACTG	2	12	1291865	1291876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017575	TGTTCG	2	12	1328271	1328282	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017575	CGTTCG	2	12	1397754	1397765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017575	GATTTC	2	12	1411021	1411032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017575	CCGAAC	2	12	1433315	1433326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017575	GCAGCG	2	12	1450430	1450441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017575	GCCGTC	2	12	1474958	1474969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017575	AATGAT	2	12	1512197	1512208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017575	GCGCCT	2	12	1538532	1538543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017575	AAGATC	2	12	1616936	1616947	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017575	GGTCGT	2	12	1640814	1640825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017575	AGCGCG	2	12	1665179	1665190	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017575	GTTCGC	2	12	1680968	1680979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017575	TCGCTG	2	12	1683902	1683913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017575	CAAAAA	2	12	1686364	1686375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017575	CCCTCC	2	12	1725055	1725066	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_017575	CACTTT	6	36	1736266	1736301	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017575	CCGATC	2	12	1744035	1744046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017575	CATCCG	2	12	1763096	1763107	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017575	AGCAAT	2	12	1763961	1763972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017575	CATCCT	2	12	1772886	1772897	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017575	CCCGCA	2	12	1820836	1820847	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017575	TGCCCG	2	12	1862954	1862965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017575	ATGGCC	2	12	1862974	1862985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017575	GTCGAA	2	12	1888361	1888372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017575	ATCATT	2	12	1914731	1914742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.