MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 megaplasmid

Total Repeats: 1619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017575	AAGAC	2	10	3468	3477	60 %	0 %	20 %	20 %	386335012
2	NC_017575	GTCCA	2	10	5391	5400	20 %	20 %	20 %	40 %	386335014
3	NC_017575	CGGTT	2	10	6469	6478	0 %	40 %	40 %	20 %	386335015
4	NC_017575	CGCTG	2	10	7783	7792	0 %	20 %	40 %	40 %	386335016
5	NC_017575	TGGCC	2	10	9836	9845	0 %	20 %	40 %	40 %	386335017
6	NC_017575	ATCGA	2	10	10380	10389	40 %	20 %	20 %	20 %	386335017
7	NC_017575	TAGCG	2	10	11082	11091	20 %	20 %	40 %	20 %	386335018
8	NC_017575	CCGCA	2	10	11276	11285	20 %	0 %	20 %	60 %	386335018
9	NC_017575	ACGCC	2	10	11488	11497	20 %	0 %	20 %	60 %	386335018
10	NC_017575	GCCAG	2	10	11767	11776	20 %	0 %	40 %	40 %	386335018
11	NC_017575	CCGGC	2	10	12432	12441	0 %	0 %	40 %	60 %	386335019
12	NC_017575	CGGGG	2	10	13138	13147	0 %	0 %	80 %	20 %	386335020
13	NC_017575	ATGCG	2	10	13440	13449	20 %	20 %	40 %	20 %	386335020
14	NC_017575	GCAGC	2	10	14413	14422	20 %	0 %	40 %	40 %	386335020
15	NC_017575	GATGC	2	10	14447	14456	20 %	20 %	40 %	20 %	386335020
16	NC_017575	TGGCG	2	10	15016	15025	0 %	20 %	60 %	20 %	386335020
17	NC_017575	CGATC	2	10	16141	16150	20 %	20 %	20 %	40 %	386335022
18	NC_017575	CCGGT	2	10	18634	18643	0 %	20 %	40 %	40 %	386335024
19	NC_017575	CGGCG	2	10	21224	21233	0 %	0 %	60 %	40 %	386335027
20	NC_017575	GTCCG	2	10	21377	21386	0 %	20 %	40 %	40 %	386335027
21	NC_017575	GCCGG	2	10	21639	21648	0 %	0 %	60 %	40 %	386335028
22	NC_017575	TGCGG	2	10	22729	22738	0 %	20 %	60 %	20 %	386335029
23	NC_017575	GATGA	2	10	25554	25563	40 %	20 %	40 %	0 %	386335031
24	NC_017575	CCAGG	2	10	26424	26433	20 %	0 %	40 %	40 %	386335032
25	NC_017575	ATCGA	2	10	27879	27888	40 %	20 %	20 %	20 %	386335034
26	NC_017575	GGCGC	2	10	28056	28065	0 %	0 %	60 %	40 %	386335034
27	NC_017575	GCGCC	2	10	30458	30467	0 %	0 %	40 %	60 %	386335037
28	NC_017575	CCAGC	2	10	34629	34638	20 %	0 %	20 %	60 %	386335040
29	NC_017575	CGCGC	2	10	36424	36433	0 %	0 %	40 %	60 %	386335041
30	NC_017575	GCGCG	2	10	36823	36832	0 %	0 %	60 %	40 %	386335041
31	NC_017575	GAGGC	2	10	37846	37855	20 %	0 %	60 %	20 %	386335042
32	NC_017575	CCAGC	2	10	38051	38060	20 %	0 %	20 %	60 %	386335042
33	NC_017575	GCGAT	2	10	38107	38116	20 %	20 %	40 %	20 %	386335042
34	NC_017575	GGGCT	2	10	38997	39006	0 %	20 %	60 %	20 %	386335042
35	NC_017575	GCCGG	2	10	39612	39621	0 %	0 %	60 %	40 %	386335043
36	NC_017575	CCGAT	2	10	39791	39800	20 %	20 %	20 %	40 %	386335043
37	NC_017575	CGGCG	2	10	40325	40334	0 %	0 %	60 %	40 %	386335043
38	NC_017575	GTGTT	2	10	44462	44471	0 %	60 %	40 %	0 %	386335049
39	NC_017575	CGTTG	2	10	45079	45088	0 %	40 %	40 %	20 %	386335050
40	NC_017575	GCGCA	2	10	45139	45148	20 %	0 %	40 %	40 %	386335050
41	NC_017575	CAGCG	2	10	45457	45466	20 %	0 %	40 %	40 %	386335050
42	NC_017575	AGCAC	2	10	45582	45591	40 %	0 %	20 %	40 %	386335050
43	NC_017575	GCCGC	2	10	46661	46670	0 %	0 %	40 %	60 %	386335050
44	NC_017575	GGCCG	2	10	47495	47504	0 %	0 %	60 %	40 %	386335051
45	NC_017575	CACCG	2	10	48459	48468	20 %	0 %	20 %	60 %	386335052
46	NC_017575	GCGAC	2	10	49715	49724	20 %	0 %	40 %	40 %	386335053
47	NC_017575	CCTGG	2	10	49961	49970	0 %	20 %	40 %	40 %	386335053
48	NC_017575	CGGCG	2	10	55356	55365	0 %	0 %	60 %	40 %	386335058
49	NC_017575	CGTGG	2	10	55998	56007	0 %	20 %	60 %	20 %	386335058
50	NC_017575	CGGCG	2	10	56019	56028	0 %	0 %	60 %	40 %	386335058
51	NC_017575	GGCGC	2	10	56609	56618	0 %	0 %	60 %	40 %	386335059
52	NC_017575	GGGCT	2	10	57828	57837	0 %	20 %	60 %	20 %	386335061
53	NC_017575	TGCGC	2	10	58619	58628	0 %	20 %	40 %	40 %	386335061
54	NC_017575	TGCCG	2	10	59291	59300	0 %	20 %	40 %	40 %	386335061
55	NC_017575	TCGTC	2	10	60130	60139	0 %	40 %	20 %	40 %	386335061
56	NC_017575	TCGCC	2	10	60151	60160	0 %	20 %	20 %	60 %	386335061
57	NC_017575	GCGAC	2	10	62096	62105	20 %	0 %	40 %	40 %	386335065
58	NC_017575	TGCTG	2	10	62165	62174	0 %	40 %	40 %	20 %	386335065
59	NC_017575	CGGTG	2	10	63480	63489	0 %	20 %	60 %	20 %	386335066
60	NC_017575	CGTCA	2	10	66575	66584	20 %	20 %	20 %	40 %	386335070
61	NC_017575	GGGAT	2	10	66683	66692	20 %	20 %	60 %	0 %	386335070
62	NC_017575	GCTGA	2	10	67416	67425	20 %	20 %	40 %	20 %	386335071
63	NC_017575	CGGCT	2	10	71326	71335	0 %	20 %	40 %	40 %	386335074
64	NC_017575	GTGCG	2	10	75104	75113	0 %	20 %	60 %	20 %	386335078
65	NC_017575	TGCGT	2	10	75466	75475	0 %	40 %	40 %	20 %	386335078
66	NC_017575	GCCGC	2	10	78992	79001	0 %	0 %	40 %	60 %	386335080
67	NC_017575	AGCGC	2	10	79640	79649	20 %	0 %	40 %	40 %	386335080
68	NC_017575	GCGCA	2	10	80373	80382	20 %	0 %	40 %	40 %	386335080
69	NC_017575	GCGAT	2	10	81162	81171	20 %	20 %	40 %	20 %	386335081
70	NC_017575	GCGAC	2	10	84890	84899	20 %	0 %	40 %	40 %	386335085
71	NC_017575	TGCCG	2	10	85468	85477	0 %	20 %	40 %	40 %	386335086
72	NC_017575	ACGTC	2	10	87244	87253	20 %	20 %	20 %	40 %	386335088
73	NC_017575	CGGCC	2	10	87853	87862	0 %	0 %	40 %	60 %	386335088
74	NC_017575	GCACG	2	10	88592	88601	20 %	0 %	40 %	40 %	386335088
75	NC_017575	CGATG	2	10	88823	88832	20 %	20 %	40 %	20 %	386335088
76	NC_017575	CGGCG	2	10	90684	90693	0 %	0 %	60 %	40 %	386335089
77	NC_017575	TGGCC	2	10	91368	91377	0 %	20 %	40 %	40 %	386335089
78	NC_017575	CGGCG	2	10	91408	91417	0 %	0 %	60 %	40 %	386335089
79	NC_017575	GGCGC	2	10	93789	93798	0 %	0 %	60 %	40 %	386335090
80	NC_017575	TCGGC	2	10	95682	95691	0 %	20 %	40 %	40 %	386335093
81	NC_017575	GCGCT	2	10	96803	96812	0 %	20 %	40 %	40 %	386335095
82	NC_017575	GCGCC	2	10	97294	97303	0 %	0 %	40 %	60 %	386335096
83	NC_017575	GCGCG	2	10	98040	98049	0 %	0 %	60 %	40 %	386335097
84	NC_017575	TGACC	2	10	98202	98211	20 %	20 %	20 %	40 %	386335097
85	NC_017575	TCCAG	2	10	98868	98877	20 %	20 %	20 %	40 %	386335098
86	NC_017575	CGGCG	2	10	100409	100418	0 %	0 %	60 %	40 %	386335099
87	NC_017575	GCGCG	2	10	102110	102119	0 %	0 %	60 %	40 %	386335101
88	NC_017575	GCGCC	2	10	104031	104040	0 %	0 %	40 %	60 %	386335102
89	NC_017575	CAGGC	2	10	104480	104489	20 %	0 %	40 %	40 %	386335102
90	NC_017575	CGGCG	2	10	104668	104677	0 %	0 %	60 %	40 %	386335102
91	NC_017575	CGCAC	2	10	106966	106975	20 %	0 %	20 %	60 %	386335105
92	NC_017575	TGTTC	2	10	108865	108874	0 %	60 %	20 %	20 %	386335107
93	NC_017575	CCGGT	2	10	110558	110567	0 %	20 %	40 %	40 %	386335109
94	NC_017575	CGCTG	2	10	113237	113246	0 %	20 %	40 %	40 %	386335111
95	NC_017575	ATCGC	2	10	114715	114724	20 %	20 %	20 %	40 %	386335111
96	NC_017575	GCATC	2	10	115704	115713	20 %	20 %	20 %	40 %	386335112
97	NC_017575	CCGCG	2	10	116509	116518	0 %	0 %	40 %	60 %	386335113
98	NC_017575	GCCGG	2	10	116810	116819	0 %	0 %	60 %	40 %	386335113
99	NC_017575	CCGGC	2	10	118901	118910	0 %	0 %	40 %	60 %	386335114
100	NC_017575	CGCGG	2	10	119226	119235	0 %	0 %	60 %	40 %	386335114
101	NC_017575	CAAGG	2	10	119707	119716	40 %	0 %	40 %	20 %	386335115
102	NC_017575	CCGCA	2	10	120635	120644	20 %	0 %	20 %	60 %	386335118
103	NC_017575	TCAGG	2	10	120694	120703	20 %	20 %	40 %	20 %	386335118
104	NC_017575	TTCGA	2	10	120704	120713	20 %	40 %	20 %	20 %	386335118
105	NC_017575	CGTCG	2	10	121387	121396	0 %	20 %	40 %	40 %	386335121
106	NC_017575	GCGCA	2	10	123033	123042	20 %	0 %	40 %	40 %	386335123
107	NC_017575	AGGTC	2	10	123395	123404	20 %	20 %	40 %	20 %	386335123
108	NC_017575	GCCGC	2	10	125722	125731	0 %	0 %	40 %	60 %	386335126
109	NC_017575	GGCGA	2	10	126250	126259	20 %	0 %	60 %	20 %	386335126
110	NC_017575	CTGCG	2	10	126823	126832	0 %	20 %	40 %	40 %	386335127
111	NC_017575	GATGG	2	10	126901	126910	20 %	20 %	60 %	0 %	386335127
112	NC_017575	CCATG	2	10	128358	128367	20 %	20 %	20 %	40 %	386335129
113	NC_017575	GATCA	2	10	132400	132409	40 %	20 %	20 %	20 %	386335130
114	NC_017575	AGCGC	2	10	133993	134002	20 %	0 %	40 %	40 %	386335132
115	NC_017575	CGGGC	2	10	134024	134033	0 %	0 %	60 %	40 %	386335132
116	NC_017575	GGACA	2	10	134153	134162	40 %	0 %	40 %	20 %	386335132
117	NC_017575	TCGGA	2	10	135601	135610	20 %	20 %	40 %	20 %	386335133
118	NC_017575	GCGCC	2	10	135658	135667	0 %	0 %	40 %	60 %	386335133
119	NC_017575	TTCCC	2	10	139868	139877	0 %	40 %	0 %	60 %	386335141
120	NC_017575	TCGCG	2	10	140555	140564	0 %	20 %	40 %	40 %	386335142
121	NC_017575	GCGTG	2	10	140923	140932	0 %	20 %	60 %	20 %	386335143
122	NC_017575	CGGCA	2	10	141121	141130	20 %	0 %	40 %	40 %	386335143
123	NC_017575	CGGTC	2	10	143294	143303	0 %	20 %	40 %	40 %	386335144
124	NC_017575	GGGCG	2	10	143573	143582	0 %	0 %	80 %	20 %	386335145
125	NC_017575	GGCTG	2	10	143908	143917	0 %	20 %	60 %	20 %	386335145
126	NC_017575	GCAAT	2	10	144180	144189	40 %	20 %	20 %	20 %	386335146
127	NC_017575	AGCCG	2	10	146184	146193	20 %	0 %	40 %	40 %	386335149
128	NC_017575	CCGTA	2	10	157544	157553	20 %	20 %	20 %	40 %	386335157
129	NC_017575	GCGCC	2	10	158710	158719	0 %	0 %	40 %	60 %	386335158
130	NC_017575	GTGCT	2	10	160874	160883	0 %	40 %	40 %	20 %	386335159
131	NC_017575	CTGGC	2	10	161299	161308	0 %	20 %	40 %	40 %	386335159
132	NC_017575	CAGAC	2	10	167697	167706	40 %	0 %	20 %	40 %	386335164
133	NC_017575	CCTCA	2	10	169004	169013	20 %	20 %	0 %	60 %	386335164
134	NC_017575	CGTCA	2	10	170654	170663	20 %	20 %	20 %	40 %	386335165
135	NC_017575	CGGTG	2	10	173089	173098	0 %	20 %	60 %	20 %	386335168
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