MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017574	GCCTGC	2	12	19627	19638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017574	GCCGGC	2	12	19722	19733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017574	CCGGTG	2	12	68130	68141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017574	CGGTTG	2	12	68715	68726	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017574	TTCGCC	2	12	147823	147834	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017574	CCGCTG	2	12	166818	166829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017574	ATGAGC	2	12	209593	209604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017574	CCCTTT	2	12	277524	277535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017574	ACTAGG	2	12	287060	287071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017574	TGATGT	2	12	298279	298290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017574	TGCAAT	2	12	315100	315111	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017574	CGCGCA	2	12	321200	321211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017574	AGGTCG	2	12	340184	340195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017574	AGCGTC	2	12	340426	340437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017574	CAGAAA	2	12	343040	343051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017574	GTCGCT	2	12	359537	359548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017574	TCCTAT	2	12	363919	363930	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017574	GCACGC	2	12	420169	420180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017574	CGCGTT	2	12	460528	460539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017574	AGGCCG	2	12	482566	482577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017574	TACCGA	2	12	629251	629262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017574	GCCAGG	2	12	645559	645570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017574	CGGTAT	2	12	747700	747711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017574	GATGCC	2	12	758193	758204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017574	CCCGAC	2	12	770821	770832	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017574	TTTCTC	2	12	787481	787492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017574	CGTCAT	2	12	788393	788404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017574	GCCGGT	2	12	821931	821942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017574	GATGCC	2	12	847146	847157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017574	GCCTGC	2	12	847329	847340	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017574	CGGCTG	2	12	849892	849903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017574	CAGCCA	2	12	855587	855598	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017574	GTCGGC	2	12	878997	879008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017574	TGGCCT	2	12	924244	924255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017574	CGCTCA	2	12	949863	949874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017574	ACGTCA	2	12	957844	957855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017574	ATGCAT	2	12	1003330	1003341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017574	GCAAAT	2	12	1007686	1007697	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017574	GCGGTG	2	12	1021027	1021038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017574	GCGAGC	2	12	1063613	1063624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017574	GGTGAG	2	12	1164548	1164559	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017574	GAGCGC	2	12	1182975	1182986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017574	GCGGCT	2	12	1183245	1183256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017574	TCCGGC	2	12	1207766	1207777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017574	GCGCGA	2	12	1216527	1216538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017574	GAAACC	2	12	1234790	1234801	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017574	GCATAT	2	12	1238014	1238025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017574	TCCGTG	2	12	1254195	1254206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017574	GAAAGA	2	12	1275534	1275545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017574	TTGCCG	2	12	1303901	1303912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017574	CTGTTT	2	12	1318994	1319005	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017574	TCCATA	2	12	1341068	1341079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017574	TGAGGT	2	12	1358311	1358322	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017574	GGCTTC	2	12	1378937	1378948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017574	GCCGAC	2	12	1403580	1403591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017574	GGGAAG	2	12	1406874	1406885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017574	TCCCGA	2	12	1428857	1428868	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017574	ATCCAA	2	12	1473687	1473698	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017574	AACCGG	2	12	1539315	1539326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017574	CATCCG	2	12	1540580	1540591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017574	TGCCGT	2	12	1549213	1549224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017574	TGAGGC	2	12	1552433	1552444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017574	GCGTTT	2	12	1583867	1583878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017574	CGTGAT	2	12	1623222	1623233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017574	CGCTTT	2	12	1649841	1649852	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017574	GGGCGG	2	12	1679941	1679952	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017574	CGGGAG	2	12	1698508	1698519	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017574	GTCGCG	2	12	1703153	1703164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017574	CCAGCG	2	12	1728018	1728029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017574	TCGCGC	2	12	1783412	1783423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017574	ACGCCC	2	12	1800708	1800719	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017574	CCGGCA	2	12	1846509	1846520	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017574	TGCGCG	2	12	1849230	1849241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017574	AGCCGG	2	12	1885214	1885225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017574	GGCGGT	2	12	1888369	1888380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017574	GTTTCC	2	12	1928615	1928626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017574	AGATGC	2	12	1949102	1949113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017574	ATCGTG	2	12	1955756	1955767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017574	GGCCCG	2	12	1967375	1967386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017574	AGCGAG	2	12	1991193	1991204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017574	CGCGCA	2	12	2036495	2036506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017574	TGAGGG	2	12	2082111	2082122	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017574	AGCGCA	2	12	2088719	2088730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017574	GCTGGA	2	12	2098159	2098170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017574	CGGGCG	2	12	2149631	2149642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017574	CTCGAT	2	12	2157813	2157824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017574	CGCAGC	2	12	2190950	2190961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017574	GGTTCA	2	12	2192351	2192362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017574	CCCAAT	2	12	2192399	2192410	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017574	GATCTC	2	12	2209589	2209600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017574	CCTGCT	2	12	2214594	2214605	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017574	GCGCGG	2	12	2214982	2214993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017574	CTCGCC	2	12	2215498	2215509	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017574	GCCAGC	2	12	2215580	2215591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017574	TATTTT	2	12	2219880	2219891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017574	TCGGAA	2	12	2233906	2233917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017574	GAAATC	2	12	2250247	2250258	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017574	GCCGGC	2	12	2265792	2265803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017574	GCCCTG	2	12	2266614	2266625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017574	GTGTCA	2	12	2266911	2266922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017574	GCGCGG	2	12	2282531	2282542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017574	CGGCCA	2	12	2282618	2282629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017574	TGCGCA	2	12	2283104	2283115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017574	ATCGCC	2	12	2283438	2283449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017574	CGTAAA	2	12	2336575	2336586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017574	GAAAAA	2	12	2404849	2404860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017574	CGGCCC	2	12	2409361	2409372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017574	CCCAGG	2	12	2423074	2423085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017574	CGGAGC	2	12	2429276	2429287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017574	AGTCGA	2	12	2448574	2448585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017574	AACAGA	2	12	2464128	2464139	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017574	GGCAAC	2	12	2481276	2481287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017574	CGGAAA	2	12	2510913	2510924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017574	AATGTT	2	12	2590773	2590784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017574	ATCAGC	2	12	2645410	2645421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017574	CTCGAT	2	12	2645841	2645852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017574	GGAATG	2	12	2701398	2701409	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017574	CCGTTT	2	12	2748508	2748519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017574	CCCCCT	2	12	2833842	2833853	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_017574	GCGACT	2	12	2847226	2847237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017574	CAGAAG	2	12	2853931	2853942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017574	GCAAAA	2	12	2862759	2862770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017574	CCCCCG	2	12	2882175	2882186	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_017574	GGCAAG	2	12	2899252	2899263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017574	TCGCGT	2	12	2945473	2945484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017574	CCTTAC	2	12	2957238	2957249	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017574	CCAGCA	2	12	2958565	2958576	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017574	TTCCGT	2	12	2990006	2990017	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017574	TCGTTT	2	12	3015134	3015145	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017574	ACAAAA	2	12	3028916	3028927	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017574	CGCCGG	2	12	3062130	3062141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017574	CGACGC	2	12	3062320	3062331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017574	CGCGTG	2	12	3076372	3076383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017574	ATGGGT	2	12	3172870	3172881	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.