MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum Po82 chromosome

Total Repeats: 3261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017574	GCATC	2	10	123	132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017574	ACCAC	2	10	1834	1843	40 %	0 %	0 %	60 %	386331672
3	NC_017574	ATCCG	2	10	1988	1997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017574	AGCGC	2	10	3777	3786	20 %	0 %	40 %	40 %	386331675
5	NC_017574	CGGCA	2	10	8297	8306	20 %	0 %	40 %	40 %	386331677
6	NC_017574	GAGCG	2	10	11692	11701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017574	TGCGC	2	10	12699	12708	0 %	20 %	40 %	40 %	386331679
8	NC_017574	CCCAG	2	10	14194	14203	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017574	GCCGC	2	10	17539	17548	0 %	0 %	40 %	60 %	386331683
10	NC_017574	GGCGA	2	10	18067	18076	20 %	0 %	60 %	20 %	386331683
11	NC_017574	TCTGC	2	10	18368	18377	0 %	40 %	20 %	40 %	386331684
12	NC_017574	ACGAT	2	10	19336	19345	40 %	20 %	20 %	20 %	386331684
13	NC_017574	ACGCT	2	10	19609	19618	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017574	CACCG	2	10	20055	20064	20 %	0 %	20 %	60 %	386331685
15	NC_017574	TTCCG	2	10	22001	22010	0 %	40 %	20 %	40 %	386331686
16	NC_017574	GCACG	2	10	22041	22050	20 %	0 %	40 %	40 %	386331686
17	NC_017574	CTCCG	2	10	23988	23997	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017574	AAGAC	2	10	24083	24092	60 %	0 %	20 %	20 %	386331688
19	NC_017574	GCGCC	2	10	25068	25077	0 %	0 %	40 %	60 %	386331689
20	NC_017574	ACCGC	2	10	25951	25960	20 %	0 %	20 %	60 %	386331689
21	NC_017574	GCAAT	2	10	26473	26482	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017574	ACGAT	2	10	28230	28239	40 %	20 %	20 %	20 %	386331693
23	NC_017574	GCGCC	2	10	29013	29022	0 %	0 %	40 %	60 %	386331694
24	NC_017574	GCTGC	2	10	29354	29363	0 %	20 %	40 %	40 %	386331694
25	NC_017574	CCGCC	2	10	31055	31064	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_017574	GAGGG	2	10	31065	31074	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017574	CAGCG	2	10	32453	32462	20 %	0 %	40 %	40 %	386331696
28	NC_017574	GCCAT	2	10	33059	33068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017574	TGCAG	2	10	33522	33531	20 %	20 %	40 %	20 %	386331697
30	NC_017574	TGCGC	2	10	33809	33818	0 %	20 %	40 %	40 %	386331697
31	NC_017574	CCGCA	2	10	35892	35901	20 %	0 %	20 %	60 %	386331700
32	NC_017574	GCCGC	2	10	36458	36467	0 %	0 %	40 %	60 %	386331701
33	NC_017574	CGGCA	2	10	36752	36761	20 %	0 %	40 %	40 %	386331701
34	NC_017574	GCGCG	2	10	36851	36860	0 %	0 %	60 %	40 %	386331701
35	NC_017574	CGGTG	2	10	39068	39077	0 %	20 %	60 %	20 %	386331703
36	NC_017574	GGGCT	2	10	39219	39228	0 %	20 %	60 %	20 %	386331703
37	NC_017574	GGCGC	2	10	39473	39482	0 %	0 %	60 %	40 %	386331703
38	NC_017574	CGGGG	2	10	39892	39901	0 %	0 %	80 %	20 %	386331704
39	NC_017574	CGCGC	2	10	40467	40476	0 %	0 %	40 %	60 %	386331705
40	NC_017574	CGGCG	2	10	41468	41477	0 %	0 %	60 %	40 %	386331705
41	NC_017574	GCGCC	2	10	41583	41592	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017574	CCGAC	2	10	44713	44722	20 %	0 %	20 %	60 %	386331707
43	NC_017574	CGTGC	2	10	47285	47294	0 %	20 %	40 %	40 %	386331707
44	NC_017574	TCGGT	2	10	47434	47443	0 %	40 %	40 %	20 %	386331707
45	NC_017574	CGCGG	2	10	48995	49004	0 %	0 %	60 %	40 %	386331707
46	NC_017574	CGGCG	2	10	50866	50875	0 %	0 %	60 %	40 %	386331709
47	NC_017574	CTGGG	2	10	50961	50970	0 %	20 %	60 %	20 %	386331709
48	NC_017574	CGGCG	2	10	52370	52379	0 %	0 %	60 %	40 %	386331710
49	NC_017574	GACGC	2	10	52783	52792	20 %	0 %	40 %	40 %	386331711
50	NC_017574	AGGGC	2	10	54508	54517	20 %	0 %	60 %	20 %	386331712
51	NC_017574	CACGC	2	10	55178	55187	20 %	0 %	20 %	60 %	386331713
52	NC_017574	TGACC	2	10	56069	56078	20 %	20 %	20 %	40 %	386331713
53	NC_017574	CCGCA	2	10	56765	56774	20 %	0 %	20 %	60 %	386331714
54	NC_017574	GCTGG	2	10	57828	57837	0 %	20 %	60 %	20 %	386331716
55	NC_017574	GGACA	2	10	58641	58650	40 %	0 %	40 %	20 %	386331716
56	NC_017574	AACGC	2	10	64528	64537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017574	GGCGC	2	10	68736	68745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017574	GCGCC	2	10	70390	70399	0 %	0 %	40 %	60 %	386331728
59	NC_017574	CGCGG	2	10	71470	71479	0 %	0 %	60 %	40 %	386331728
60	NC_017574	GGAGT	2	10	72598	72607	20 %	20 %	60 %	0 %	386331728
61	NC_017574	CAAAA	2	10	72812	72821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017574	GCCGA	2	10	73256	73265	20 %	0 %	40 %	40 %	386331729
63	NC_017574	GCTTG	2	10	78582	78591	0 %	40 %	40 %	20 %	386331733
64	NC_017574	CAACC	2	10	81224	81233	40 %	0 %	0 %	60 %	386331736
65	NC_017574	GAATC	2	10	81588	81597	40 %	20 %	20 %	20 %	386331736
66	NC_017574	ACCGG	2	10	83002	83011	20 %	0 %	40 %	40 %	386331737
67	NC_017574	GCCCA	2	10	83913	83922	20 %	0 %	20 %	60 %	386331738
68	NC_017574	GGGCG	2	10	84953	84962	0 %	0 %	80 %	20 %	386331738
69	NC_017574	TCGTT	2	10	85006	85015	0 %	60 %	20 %	20 %	386331738
70	NC_017574	CTGGC	2	10	85687	85696	0 %	20 %	40 %	40 %	386331741
71	NC_017574	CGGAT	2	10	85890	85899	20 %	20 %	40 %	20 %	386331741
72	NC_017574	CGTCC	2	10	86016	86025	0 %	20 %	20 %	60 %	386331741
73	NC_017574	CGTGA	2	10	87202	87211	20 %	20 %	40 %	20 %	386331742
74	NC_017574	GCCAG	2	10	87558	87567	20 %	0 %	40 %	40 %	386331742
75	NC_017574	GACCG	2	10	88741	88750	20 %	0 %	40 %	40 %	386331743
76	NC_017574	GGCGC	2	10	90157	90166	0 %	0 %	60 %	40 %	386331745
77	NC_017574	GTCCT	2	10	91904	91913	0 %	40 %	20 %	40 %	386331748
78	NC_017574	CGACC	2	10	93280	93289	20 %	0 %	20 %	60 %	386331748
79	NC_017574	CGCAG	2	10	93606	93615	20 %	0 %	40 %	40 %	386331748
80	NC_017574	TTCGT	2	10	93804	93813	0 %	60 %	20 %	20 %	386331749
81	NC_017574	TGCCG	2	10	95143	95152	0 %	20 %	40 %	40 %	386331750
82	NC_017574	CAGCG	2	10	95423	95432	20 %	0 %	40 %	40 %	386331750
83	NC_017574	ACCAG	2	10	96745	96754	40 %	0 %	20 %	40 %	386331751
84	NC_017574	GACAG	2	10	97700	97709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017574	ATCGC	2	10	97970	97979	20 %	20 %	20 %	40 %	386331753
86	NC_017574	CGGCG	2	10	98639	98648	0 %	0 %	60 %	40 %	386331754
87	NC_017574	GAGAG	2	10	100864	100873	40 %	0 %	60 %	0 %	386331755
88	NC_017574	GGGCC	2	10	100878	100887	0 %	0 %	60 %	40 %	386331755
89	NC_017574	CGATG	2	10	103757	103766	20 %	20 %	40 %	20 %	386331759
90	NC_017574	CGGGC	2	10	104085	104094	0 %	0 %	60 %	40 %	386331760
91	NC_017574	GCCGC	2	10	105556	105565	0 %	0 %	40 %	60 %	386331762
92	NC_017574	GGCGA	2	10	106084	106093	20 %	0 %	60 %	20 %	386331762
93	NC_017574	TCGGC	2	10	106341	106350	0 %	20 %	40 %	40 %	386331763
94	NC_017574	GCCGC	2	10	106869	106878	0 %	0 %	40 %	60 %	386331764
95	NC_017574	CGGTG	2	10	108668	108677	0 %	20 %	60 %	20 %	386331766
96	NC_017574	CGGCG	2	10	109301	109310	0 %	0 %	60 %	40 %	386331766
97	NC_017574	GCATG	2	10	110073	110082	20 %	20 %	40 %	20 %	386331768
98	NC_017574	CGCGG	2	10	111554	111563	0 %	0 %	60 %	40 %	386331769
99	NC_017574	AATGC	2	10	112594	112603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017574	GTGCT	2	10	116696	116705	0 %	40 %	40 %	20 %	386331774
101	NC_017574	CGGCG	2	10	117382	117391	0 %	0 %	60 %	40 %	386331774
102	NC_017574	CCGGG	2	10	117595	117604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017574	CGCCT	2	10	117610	117619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017574	GGCCC	2	10	117861	117870	0 %	0 %	40 %	60 %	386331775
105	NC_017574	TGCGC	2	10	119963	119972	0 %	20 %	40 %	40 %	386331778
106	NC_017574	GCGCG	2	10	121187	121196	0 %	0 %	60 %	40 %	386331780
107	NC_017574	GGCGC	2	10	121848	121857	0 %	0 %	60 %	40 %	386331780
108	NC_017574	GGGCG	2	10	123298	123307	0 %	0 %	80 %	20 %	386331783
109	NC_017574	CGCGG	2	10	124123	124132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017574	CCGGC	2	10	124260	124269	0 %	0 %	40 %	60 %	386331784
111	NC_017574	CGCTG	2	10	124696	124705	0 %	20 %	40 %	40 %	386331784
112	NC_017574	CCACA	2	10	125398	125407	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_017574	ACGCC	2	10	126757	126766	20 %	0 %	20 %	60 %	386331785
114	NC_017574	GTCGA	2	10	128094	128103	20 %	20 %	40 %	20 %	386331786
115	NC_017574	GAACG	2	10	130156	130165	40 %	0 %	40 %	20 %	386331789
116	NC_017574	GTTCG	2	10	130204	130213	0 %	40 %	40 %	20 %	386331789
117	NC_017574	AAGGC	2	10	132577	132586	40 %	0 %	40 %	20 %	386331794
118	NC_017574	CGAAG	2	10	133117	133126	40 %	0 %	40 %	20 %	386331795
119	NC_017574	GTGCA	2	10	136045	136054	20 %	20 %	40 %	20 %	386331798
120	NC_017574	CTCGA	2	10	137056	137065	20 %	20 %	20 %	40 %	386331798
121	NC_017574	GGCCG	2	10	139059	139068	0 %	0 %	60 %	40 %	386331800
122	NC_017574	CCACG	2	10	139299	139308	20 %	0 %	20 %	60 %	386331800
123	NC_017574	ACCGG	2	10	139402	139411	20 %	0 %	40 %	40 %	386331800
124	NC_017574	CGGCA	2	10	139554	139563	20 %	0 %	40 %	40 %	386331800
125	NC_017574	GCCGT	2	10	139819	139828	0 %	20 %	40 %	40 %	386331800
126	NC_017574	GGCGA	2	10	140633	140642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017574	GGCCA	2	10	141550	141559	20 %	0 %	40 %	40 %	386331801
128	NC_017574	GACCT	2	10	142783	142792	20 %	20 %	20 %	40 %	386331803
129	NC_017574	TGGCC	2	10	143418	143427	0 %	20 %	40 %	40 %	386331803
130	NC_017574	CGGGG	2	10	145307	145316	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017574	CGGCG	2	10	145674	145683	0 %	0 %	60 %	40 %	386331806
132	NC_017574	GGTGT	2	10	145953	145962	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017574	TGGGC	2	10	146763	146772	0 %	20 %	60 %	20 %	386331807
134	NC_017574	CGATG	2	10	147050	147059	20 %	20 %	40 %	20 %	386331808
135	NC_017574	GGCGA	2	10	148478	148487	20 %	0 %	60 %	20 %	386331809
136	NC_017574	GCGAT	2	10	148920	148929	20 %	20 %	40 %	20 %	386331809
137	NC_017574	GCGCA	2	10	149468	149477	20 %	0 %	40 %	40 %	386331809
138	NC_017574	GCGGG	2	10	150208	150217	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017574	TGGAC	2	10	152165	152174	20 %	20 %	40 %	20 %	386331813
140	NC_017574	CGACC	2	10	152235	152244	20 %	0 %	20 %	60 %	386331813
141	NC_017574	GGCAT	2	10	152345	152354	20 %	20 %	40 %	20 %	386331813
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143	NC_017574	GACTT	2	10	152636	152645	20 %	40 %	20 %	20 %	386331814
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145	NC_017574	GCTGC	2	10	154507	154516	0 %	20 %	40 %	40 %	386331816
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151	NC_017574	CGGGG	2	10	163992	164001	0 %	0 %	80 %	20 %	386331821
152	NC_017574	CGAGC	2	10	164233	164242	20 %	0 %	40 %	40 %	386331821
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155	NC_017574	ATGCC	2	10	169013	169022	20 %	20 %	20 %	40 %	386331824
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157	NC_017574	GCGCC	2	10	171262	171271	0 %	0 %	40 %	60 %	386331826
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159	NC_017574	TGCGA	2	10	171641	171650	20 %	20 %	40 %	20 %	386331826
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172	NC_017574	GCGAT	2	10	186838	186847	20 %	20 %	40 %	20 %	386331836
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185	NC_017574	CGGGC	2	10	199494	199503	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
186	NC_017574	TGCGC	2	10	199829	199838	0 %	20 %	40 %	40 %	386331850
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217	NC_017574	CAAGC	2	10	248335	248344	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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236	NC_017574	GCCCG	2	10	279912	279921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
237	NC_017574	CGAGG	2	10	280249	280258	20 %	0 %	60 %	20 %	386331949
238	NC_017574	GTGAA	2	10	280866	280875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
239	NC_017574	AATGC	2	10	284263	284272	40 %	20 %	20 %	20 %	386331951
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241	NC_017574	CGAGG	2	10	287092	287101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
242	NC_017574	GCGCC	2	10	288276	288285	0 %	0 %	40 %	60 %	386331956
243	NC_017574	ATCGA	2	10	289865	289874	40 %	20 %	20 %	20 %	386331956
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246	NC_017574	TCAGC	2	10	293158	293167	20 %	20 %	20 %	40 %	386331956
247	NC_017574	GACCA	2	10	293882	293891	40 %	0 %	20 %	40 %	386331956
248	NC_017574	GTGAC	2	10	294300	294309	20 %	20 %	40 %	20 %	386331956
249	NC_017574	CGCTG	2	10	294901	294910	0 %	20 %	40 %	40 %	386331956
250	NC_017574	CACTG	2	10	296410	296419	20 %	20 %	20 %	40 %	386331956
251	NC_017574	CCAGA	2	10	296684	296693	40 %	0 %	20 %	40 %	386331956
252	NC_017574	GGAAT	2	10	297245	297254	40 %	20 %	40 %	0 %	386331956
253	NC_017574	CCCAG	2	10	298728	298737	20 %	0 %	20 %	60 %	386331958
254	NC_017574	AGGCG	2	10	301121	301130	20 %	0 %	60 %	20 %	386331959
255	NC_017574	GCGAT	2	10	301578	301587	20 %	20 %	40 %	20 %	386331959
256	NC_017574	TTGTT	2	10	301721	301730	0 %	80 %	20 %	0 %	386331959
257	NC_017574	GCACA	2	10	301916	301925	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_017574	TAGGC	2	10	302468	302477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_017574	TCGCC	2	10	307267	307276	0 %	20 %	20 %	60 %	386331965
260	NC_017574	TGAAC	2	10	309570	309579	40 %	20 %	20 %	20 %	386331967
261	NC_017574	CTTCA	2	10	309799	309808	20 %	40 %	0 %	40 %	386331967
262	NC_017574	CGACG	2	10	311114	311123	20 %	0 %	40 %	40 %	386331969
263	NC_017574	CCGCG	2	10	312336	312345	0 %	0 %	40 %	60 %	386331970
264	NC_017574	GCGCC	2	10	313045	313054	0 %	0 %	40 %	60 %	386331971
265	NC_017574	CGCAT	2	10	319029	319038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_017574	TGCAC	2	10	320734	320743	20 %	20 %	20 %	40 %	386331975
267	NC_017574	CGCGC	2	10	321242	321251	0 %	0 %	40 %	60 %	386331976
268	NC_017574	AGCGC	2	10	323361	323370	20 %	0 %	40 %	40 %	386331978
269	NC_017574	CGCGG	2	10	324438	324447	0 %	0 %	60 %	40 %	386331979
270	NC_017574	ATTGC	2	10	327212	327221	20 %	40 %	20 %	20 %	386331983
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273	NC_017574	GCGCA	2	10	329902	329911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_017574	GGCGC	2	10	335345	335354	0 %	0 %	60 %	40 %	386331993
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283	NC_017574	GCGAT	2	10	339741	339750	20 %	20 %	40 %	20 %	386331997
284	NC_017574	CTTGG	2	10	340115	340124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_017574	CAGGC	2	10	342663	342672	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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359	NC_017574	GCGCC	2	10	410602	410611	0 %	0 %	40 %	60 %	386332063
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383	NC_017574	TGTCA	2	10	441793	441802	20 %	40 %	20 %	20 %	386332097
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390	NC_017574	CCGGC	2	10	446335	446344	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
391	NC_017574	GGGAC	2	10	447062	447071	20 %	0 %	60 %	20 %	386332100
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396	NC_017574	GCCGG	2	10	454492	454501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
397	NC_017574	TGACT	2	10	454555	454564	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_017574	CAGCG	2	10	456031	456040	20 %	0 %	40 %	40 %	386332108
400	NC_017574	CAGCG	2	10	456763	456772	20 %	0 %	40 %	40 %	386332108
401	NC_017574	CAGCG	2	10	456937	456946	20 %	0 %	40 %	40 %	386332108
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499	NC_017574	CGCAG	2	10	585881	585890	20 %	0 %	40 %	40 %	386332236
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