MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia sp. AS13 chromosome

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017573	TTCTT	2	10	90	99	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017573	CGGGC	2	10	10688	10697	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017573	TGACG	2	10	25970	25979	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017573	ATAAA	2	10	34851	34860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017573	AGGTG	2	10	63355	63364	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017573	AACGC	2	10	72751	72760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017573	TGAAA	2	10	76116	76125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017573	GTTTT	2	10	76425	76434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017573	ATCAA	2	10	84646	84655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017573	CGCTG	2	10	95259	95268	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017573	CAGCA	2	10	100729	100738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017573	TCACC	2	10	110702	110711	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017573	ATCAC	2	10	111165	111174	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017573	ACGCC	2	10	144593	144602	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017573	AATAG	2	10	160578	160587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017573	TGCGC	2	10	193737	193746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017573	CAATG	2	10	193773	193782	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017573	AGGGT	2	10	210993	211002	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017573	GCATG	2	10	216190	216199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017573	GAGGG	2	10	227192	227201	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017573	AGGCT	2	10	256298	256307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017573	TTTGC	2	10	258040	258049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017573	CATTA	2	10	258261	258270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017573	GGTTT	2	10	264617	264626	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017573	GTTTG	2	10	280859	280868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017573	AAGGA	2	10	294855	294864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017573	AGGCT	2	10	298981	298990	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017573	GATTC	2	10	306170	306179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017573	TTCTT	2	10	306311	306320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017573	TTTTA	2	10	321408	321417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017573	CGGCT	2	10	322370	322379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017573	CTGAC	2	10	335451	335460	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017573	CCCCT	2	10	353007	353016	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_017573	GCAGA	2	10	363050	363059	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017573	ATGAC	2	10	363656	363665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017573	GCACT	2	10	363716	363725	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017573	GGCAG	2	10	372934	372943	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017573	GCCAT	2	10	373149	373158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017573	GGTGA	2	10	373900	373909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017573	CGATC	2	10	374060	374069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017573	GTGGC	2	10	374357	374366	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017573	GCGAG	2	10	390145	390154	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017573	AACGA	2	10	394399	394408	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017573	GTAAT	2	10	398596	398605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017573	GAAAT	2	10	411220	411229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017573	CGGTT	2	10	444098	444107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017573	ATTTA	2	10	457267	457276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017573	TTTGA	2	10	499468	499477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017573	TTAAT	2	10	501800	501809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017573	AAAGT	2	10	554072	554081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017573	GCAGG	2	10	556787	556796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017573	AATTA	2	10	556977	556986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017573	ATACT	2	10	557042	557051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017573	TTTCG	2	10	569755	569764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017573	TAATT	2	10	580997	581006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017573	GCGCT	2	10	583060	583069	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017573	GTTAG	2	10	605502	605511	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017573	GGCAT	2	10	611037	611046	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017573	AGGGT	2	10	652817	652826	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017573	GCGCG	2	10	659603	659612	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017573	TTTCC	2	10	661329	661338	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017573	CGGGG	2	10	664900	664909	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017573	GATAG	2	10	671937	671946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017573	GGCGG	2	10	690073	690082	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017573	TAGCT	2	10	697611	697620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017573	TTCAT	2	10	697702	697711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017573	CAGGG	2	10	697851	697860	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017573	GGTAT	2	10	708278	708287	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017573	ATGAA	2	10	718882	718891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017573	GTCTT	2	10	763779	763788	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017573	GGCGG	2	10	771043	771052	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017573	GGAAA	2	10	796439	796448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017573	TAATT	2	10	823190	823199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017573	GATGT	2	10	832727	832736	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017573	ATGCG	2	10	840253	840262	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017573	TTATC	2	10	864591	864600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017573	ACAAA	2	10	868404	868413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017573	CTTCT	2	10	868700	868709	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017573	GCAAT	2	10	893693	893702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017573	AGGCT	2	10	911044	911053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017573	CATGG	2	10	995431	995440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017573	TTTTA	2	10	995595	995604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017573	CGGCG	2	10	1013467	1013476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017573	ACTTT	2	10	1013480	1013489	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017573	TCTTT	2	10	1023953	1023962	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017573	AATTT	2	10	1036781	1036790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017573	TTATC	2	10	1039703	1039712	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017573	ATAAA	2	10	1040182	1040191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017573	TGTCC	2	10	1041532	1041541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017573	TCGCG	2	10	1069254	1069263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017573	GTTTG	2	10	1082761	1082770	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017573	TCGCT	2	10	1112035	1112044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017573	CTTTT	2	10	1113581	1113590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017573	GGTAA	2	10	1119092	1119101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017573	AGTAA	2	10	1131787	1131796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017573	ATACT	2	10	1137537	1137546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017573	TAATT	2	10	1138165	1138174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017573	GCGCT	2	10	1143837	1143846	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017573	CAAAC	2	10	1143924	1143933	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017573	ATGCA	2	10	1148925	1148934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017573	GTATT	2	10	1151471	1151480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017573	TATTT	2	10	1151537	1151546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017573	GCGCG	2	10	1166492	1166501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017573	CTGGG	2	10	1167153	1167162	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017573	ATGGT	2	10	1172931	1172940	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017573	TTCAT	2	10	1193409	1193418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017573	GGAAG	2	10	1197148	1197157	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017573	CGGCC	2	10	1200287	1200296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017573	CTGGG	2	10	1203099	1203108	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017573	CGATG	2	10	1203125	1203134	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017573	GCAAA	2	10	1203155	1203164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017573	TTATA	2	10	1206370	1206379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017573	TAGGG	2	10	1230456	1230465	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017573	TGCCG	2	10	1230515	1230524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017573	GTTTT	2	10	1230997	1231006	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017573	AAATA	2	10	1231298	1231307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017573	ATGAA	2	10	1231325	1231334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017573	ATTTT	2	10	1231385	1231394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017573	CTCAT	2	10	1232765	1232774	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017573	TTTTC	2	10	1232823	1232832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017573	CGCAG	2	10	1269149	1269158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017573	CTGTA	2	10	1270648	1270657	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017573	GCATA	2	10	1289319	1289328	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017573	GGCTG	2	10	1290114	1290123	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017573	TGACT	2	10	1291905	1291914	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017573	GCTGT	2	10	1291952	1291961	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017573	ATCGC	2	10	1294329	1294338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017573	TTGAT	2	10	1295693	1295702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017573	TAAAT	2	10	1307718	1307727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017573	TCGCG	2	10	1316514	1316523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017573	CGGTT	2	10	1327485	1327494	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017573	TAGAT	2	10	1331116	1331125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017573	CTGCC	2	10	1340435	1340444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_017573	CTCGC	2	10	1340934	1340943	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017573	GGGTA	2	10	1351016	1351025	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017573	ACAAT	2	10	1363605	1363614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017573	ATTGC	2	10	1367366	1367375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017573	ACGTT	2	10	1390998	1391007	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017573	GGTGA	2	10	1404625	1404634	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017573	CTGCG	2	10	1412791	1412800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017573	TGTGG	2	10	1444826	1444835	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017573	GTGAA	2	10	1457975	1457984	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017573	TTTGC	2	10	1467179	1467188	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017573	TTAAT	2	10	1488656	1488665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017573	AAATA	2	10	1533922	1533931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017573	GGGTT	2	10	1581131	1581140	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017573	ATATT	2	10	1764517	1764526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017573	GTGAT	2	10	1876334	1876343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017573	TAGCG	2	10	1991462	1991471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_017573	TCATA	2	10	2052149	2052158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_017573	GGTCA	2	10	2848256	2848265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_017573	CTAGC	2	10	5259407	5259416	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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