MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	ATCTA	2	10	476	485	40 %	40 %	0 %	20 %	386322373
2	NC_017572	AATGT	2	10	647	656	40 %	40 %	20 %	0 %	386322373
3	NC_017572	TCATG	2	10	3371	3380	20 %	40 %	20 %	20 %	386322374
4	NC_017572	TTGTC	2	10	3392	3401	0 %	60 %	20 %	20 %	386322374
5	NC_017572	GTATG	2	10	4302	4311	20 %	40 %	40 %	0 %	386322374
6	NC_017572	GCAAT	2	10	4417	4426	40 %	20 %	20 %	20 %	386322374
7	NC_017572	CAAAT	2	10	9166	9175	60 %	20 %	0 %	20 %	386322376
8	NC_017572	CAGTT	2	10	9855	9864	20 %	40 %	20 %	20 %	386322377
9	NC_017572	AGCCA	2	10	10573	10582	40 %	0 %	20 %	40 %	386322378
10	NC_017572	CTTGT	2	10	12121	12130	0 %	60 %	20 %	20 %	386322378
11	NC_017572	CAAAA	2	10	14061	14070	80 %	0 %	0 %	20 %	386322382
12	NC_017572	TTTAT	2	10	16662	16671	20 %	80 %	0 %	0 %	386322386
13	NC_017572	CTGTT	2	10	18873	18882	0 %	60 %	20 %	20 %	386322386
14	NC_017572	GCTGT	2	10	20096	20105	0 %	40 %	40 %	20 %	386322386
15	NC_017572	GCTCT	2	10	22358	22367	0 %	40 %	20 %	40 %	386322386
16	NC_017572	TTCTT	2	10	22440	22449	0 %	80 %	0 %	20 %	386322386
17	NC_017572	GCCGC	2	10	22467	22476	0 %	0 %	40 %	60 %	386322386
18	NC_017572	GCTTC	2	10	22977	22986	0 %	40 %	20 %	40 %	386322388
19	NC_017572	TGGTT	2	10	23982	23991	0 %	60 %	40 %	0 %	386322388
20	NC_017572	ATAGC	2	10	24742	24751	40 %	20 %	20 %	20 %	386322388
21	NC_017572	TTTTG	2	10	28072	28081	0 %	80 %	20 %	0 %	386322391
22	NC_017572	GCCTT	2	10	30056	30065	0 %	40 %	20 %	40 %	386322392
23	NC_017572	TGGTT	2	10	32633	32642	0 %	60 %	40 %	0 %	386322396
24	NC_017572	CTTTG	2	10	34905	34914	0 %	60 %	20 %	20 %	386322398
25	NC_017572	AAATG	2	10	35996	36005	60 %	20 %	20 %	0 %	386322399
26	NC_017572	TGCCA	2	10	38101	38110	20 %	20 %	20 %	40 %	386322402
27	NC_017572	CTTCT	2	10	38781	38790	0 %	60 %	0 %	40 %	386322402
28	NC_017572	ATGCA	2	10	39047	39056	40 %	20 %	20 %	20 %	386322402
29	NC_017572	GATTG	2	10	41663	41672	20 %	40 %	40 %	0 %	386322404
30	NC_017572	ATGGC	2	10	42411	42420	20 %	20 %	40 %	20 %	386322405
31	NC_017572	GACGA	2	10	42816	42825	40 %	0 %	40 %	20 %	386322406
32	NC_017572	TGTTT	2	10	42872	42881	0 %	80 %	20 %	0 %	386322406
33	NC_017572	GAAAA	2	10	46939	46948	80 %	0 %	20 %	0 %	386322413
34	NC_017572	TTGCA	2	10	53049	53058	20 %	40 %	20 %	20 %	386322421
35	NC_017572	AAAGC	2	10	60107	60116	60 %	0 %	20 %	20 %	386322426

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.