MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	ATTG	2	8	162	169	25 %	50 %	25 %	0 %	386322373
2	NC_017572	TTCT	2	8	184	191	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
3	NC_017572	TTTC	2	8	585	592	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
4	NC_017572	AGCC	2	8	1162	1169	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
5	NC_017572	TCTT	2	8	1203	1210	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
6	NC_017572	CAGC	2	8	1461	1468	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
7	NC_017572	TAAA	2	8	1647	1654	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
8	NC_017572	CATT	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
9	NC_017572	GACT	2	8	1952	1959	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
10	NC_017572	TTTC	2	8	2008	2015	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
11	NC_017572	AAAT	2	8	2339	2346	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
12	NC_017572	CTAT	2	8	3220	3227	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
13	NC_017572	AATT	2	8	3272	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
14	NC_017572	GACT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
15	NC_017572	AATG	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
16	NC_017572	TGAA	2	8	4147	4154	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
17	NC_017572	TAAA	2	8	4283	4290	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
18	NC_017572	ATCA	2	8	5244	5251	50 %	25 %	0 %	25 %	386322374
19	NC_017572	CTTA	2	8	5430	5437	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
20	NC_017572	GAAC	2	8	5640	5647	50 %	0 %	25 %	25 %	386322374
21	NC_017572	CTTT	2	8	5779	5786	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
22	NC_017572	GCTT	2	8	5832	5839	0 %	50 %	25 %	25 %	386322374
23	NC_017572	GTTT	2	8	5844	5851	0 %	75 %	25 %	0 %	386322374
24	NC_017572	TATC	2	8	5987	5994	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
25	NC_017572	ACTC	2	8	6347	6354	25 %	25 %	0 %	50 %	386322374
26	NC_017572	TACA	2	8	6590	6597	50 %	25 %	0 %	25 %	386322374
27	NC_017572	CCCA	2	8	6951	6958	25 %	0 %	0 %	75 %	386322374
28	NC_017572	GATC	2	8	7291	7298	25 %	25 %	25 %	25 %	386322375
29	NC_017572	AAAC	2	8	8943	8950	75 %	0 %	0 %	25 %	386322376
30	NC_017572	GCAA	2	8	10447	10454	50 %	0 %	25 %	25 %	386322378
31	NC_017572	ACCT	2	8	10810	10817	25 %	25 %	0 %	50 %	386322378
32	NC_017572	ACTG	2	8	10837	10844	25 %	25 %	25 %	25 %	386322378
33	NC_017572	CTGA	2	8	10880	10887	25 %	25 %	25 %	25 %	386322378
34	NC_017572	AAGC	2	8	11117	11124	50 %	0 %	25 %	25 %	386322378
35	NC_017572	CTTG	2	8	11311	11318	0 %	50 %	25 %	25 %	386322378
36	NC_017572	AGTT	2	8	11394	11401	25 %	50 %	25 %	0 %	386322378
37	NC_017572	TCTG	2	8	11750	11757	0 %	50 %	25 %	25 %	386322378
38	NC_017572	AGAA	2	8	11967	11974	75 %	0 %	25 %	0 %	386322378
39	NC_017572	GAAT	2	8	12499	12506	50 %	25 %	25 %	0 %	386322379
40	NC_017572	TTAA	2	8	12593	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	386322379
41	NC_017572	TTTG	2	8	12753	12760	0 %	75 %	25 %	0 %	386322380
42	NC_017572	ACTG	2	8	12856	12863	25 %	25 %	25 %	25 %	386322380
43	NC_017572	CAAT	2	8	13046	13053	50 %	25 %	0 %	25 %	386322381
44	NC_017572	TTGA	2	8	13270	13277	25 %	50 %	25 %	0 %	386322381
45	NC_017572	TAGA	2	8	14705	14712	50 %	25 %	25 %	0 %	386322382
46	NC_017572	ATTT	2	8	15010	15017	25 %	75 %	0 %	0 %	386322383
47	NC_017572	TTAT	2	8	17151	17158	25 %	75 %	0 %	0 %	386322386
48	NC_017572	GTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	25 %	0 %	386322386
49	NC_017572	CTTG	2	8	17332	17339	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
50	NC_017572	GCGA	2	8	17355	17362	25 %	0 %	50 %	25 %	386322386
51	NC_017572	GTTC	2	8	17488	17495	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
52	NC_017572	GTTA	2	8	17990	17997	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
53	NC_017572	GAAA	2	8	18304	18311	75 %	0 %	25 %	0 %	386322386
54	NC_017572	TGAT	2	8	18720	18727	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
55	NC_017572	ATTG	2	8	18911	18918	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
56	NC_017572	TCAA	2	8	19014	19021	50 %	25 %	0 %	25 %	386322386
57	NC_017572	GTCT	2	8	19465	19472	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
58	NC_017572	TTTG	2	8	20164	20171	0 %	75 %	25 %	0 %	386322386
59	NC_017572	TTTG	2	8	20680	20687	0 %	75 %	25 %	0 %	386322386
60	NC_017572	CTTG	2	8	20758	20765	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
61	NC_017572	CTTT	2	8	21148	21155	0 %	75 %	0 %	25 %	386322386
62	NC_017572	CAAA	2	8	21751	21758	75 %	0 %	0 %	25 %	386322386
63	NC_017572	GTGA	2	8	21951	21958	25 %	25 %	50 %	0 %	386322386
64	NC_017572	CATC	2	8	23595	23602	25 %	25 %	0 %	50 %	386322388
65	NC_017572	CCAT	2	8	24957	24964	25 %	25 %	0 %	50 %	386322389
66	NC_017572	GGGT	2	8	25124	25131	0 %	25 %	75 %	0 %	386322389
67	NC_017572	GCAA	2	8	25170	25177	50 %	0 %	25 %	25 %	386322389
68	NC_017572	AACA	2	8	26105	26112	75 %	0 %	0 %	25 %	386322390
69	NC_017572	TTGA	2	8	26212	26219	25 %	50 %	25 %	0 %	386322391
70	NC_017572	GTTG	2	8	26873	26880	0 %	50 %	50 %	0 %	386322391
71	NC_017572	ACAT	2	8	27102	27109	50 %	25 %	0 %	25 %	386322391
72	NC_017572	GCTT	2	8	27308	27315	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
73	NC_017572	CTTG	2	8	27487	27494	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
74	NC_017572	GTGA	2	8	27936	27943	25 %	25 %	50 %	0 %	386322391
75	NC_017572	CATA	2	8	28660	28667	50 %	25 %	0 %	25 %	386322391
76	NC_017572	GCAA	2	8	28782	28789	50 %	0 %	25 %	25 %	386322391
77	NC_017572	CTTG	2	8	28948	28955	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
78	NC_017572	AAGG	2	8	29677	29684	50 %	0 %	50 %	0 %	386322392
79	NC_017572	TCTT	2	8	29750	29757	0 %	75 %	0 %	25 %	386322392
80	NC_017572	CCGC	2	8	29786	29793	0 %	0 %	25 %	75 %	386322392
81	NC_017572	GCAA	2	8	30464	30471	50 %	0 %	25 %	25 %	386322393
82	NC_017572	ATGC	2	8	30485	30492	25 %	25 %	25 %	25 %	386322393
83	NC_017572	GGAA	2	8	30758	30765	50 %	0 %	50 %	0 %	386322394
84	NC_017572	GAAA	2	8	30889	30896	75 %	0 %	25 %	0 %	386322394
85	NC_017572	GGCG	2	8	31426	31433	0 %	0 %	75 %	25 %	386322395
86	NC_017572	TTGA	2	8	31513	31520	25 %	50 %	25 %	0 %	386322395
87	NC_017572	AGCG	2	8	31833	31840	25 %	0 %	50 %	25 %	386322396
88	NC_017572	TAAC	2	8	31865	31872	50 %	25 %	0 %	25 %	386322396
89	NC_017572	TGGC	2	8	31931	31938	0 %	25 %	50 %	25 %	386322396
90	NC_017572	TGCT	2	8	32403	32410	0 %	50 %	25 %	25 %	386322396
91	NC_017572	CGGT	2	8	32420	32427	0 %	25 %	50 %	25 %	386322396
92	NC_017572	AAGT	2	8	34498	34505	50 %	25 %	25 %	0 %	386322398
93	NC_017572	ATCT	2	8	35693	35700	25 %	50 %	0 %	25 %	386322399
94	NC_017572	AACG	2	8	36110	36117	50 %	0 %	25 %	25 %	386322399
95	NC_017572	GTTT	2	8	36207	36214	0 %	75 %	25 %	0 %	386322400
96	NC_017572	GCTT	2	8	36274	36281	0 %	50 %	25 %	25 %	386322400
97	NC_017572	CTCG	2	8	36905	36912	0 %	25 %	25 %	50 %	386322401
98	NC_017572	ATTG	2	8	37236	37243	25 %	50 %	25 %	0 %	386322401
99	NC_017572	GCCC	2	8	37475	37482	0 %	0 %	25 %	75 %	386322402
100	NC_017572	TGAG	2	8	38353	38360	25 %	25 %	50 %	0 %	386322402
101	NC_017572	TGCC	2	8	38732	38739	0 %	25 %	25 %	50 %	386322402
102	NC_017572	GATT	2	8	39107	39114	25 %	50 %	25 %	0 %	386322402
103	NC_017572	TCAA	2	8	39298	39305	50 %	25 %	0 %	25 %	386322402
104	NC_017572	ATAG	2	8	39498	39505	50 %	25 %	25 %	0 %	386322402
105	NC_017572	GACT	2	8	39981	39988	25 %	25 %	25 %	25 %	386322403
106	NC_017572	CACT	2	8	40238	40245	25 %	25 %	0 %	50 %	386322403
107	NC_017572	ATCA	2	8	41642	41649	50 %	25 %	0 %	25 %	386322404
108	NC_017572	TGTT	2	8	41902	41909	0 %	75 %	25 %	0 %	386322405
109	NC_017572	CAAT	2	8	42494	42501	50 %	25 %	0 %	25 %	386322405
110	NC_017572	CCAT	2	8	43121	43128	25 %	25 %	0 %	50 %	386322406
111	NC_017572	CGTT	2	8	43315	43322	0 %	50 %	25 %	25 %	386322407
112	NC_017572	CATC	2	8	43506	43513	25 %	25 %	0 %	50 %	386322407
113	NC_017572	GTTT	2	8	44158	44165	0 %	75 %	25 %	0 %	386322409
114	NC_017572	AACC	2	8	44486	44493	50 %	0 %	0 %	50 %	386322411
115	NC_017572	GGTT	2	8	44544	44551	0 %	50 %	50 %	0 %	386322411
116	NC_017572	GCTC	2	8	45834	45841	0 %	25 %	25 %	50 %	386322412
117	NC_017572	CAAG	2	8	45903	45910	50 %	0 %	25 %	25 %	386322412
118	NC_017572	AAGC	2	8	46051	46058	50 %	0 %	25 %	25 %	386322412
119	NC_017572	TTTA	2	8	47564	47571	25 %	75 %	0 %	0 %	386322414
120	NC_017572	TTGA	2	8	47585	47592	25 %	50 %	25 %	0 %	386322414
121	NC_017572	ATTC	2	8	47725	47732	25 %	50 %	0 %	25 %	386322414
122	NC_017572	TACC	2	8	48102	48109	25 %	25 %	0 %	50 %	386322415
123	NC_017572	TGAT	2	8	48200	48207	25 %	50 %	25 %	0 %	386322416
124	NC_017572	TGTT	2	8	48479	48486	0 %	75 %	25 %	0 %	386322417
125	NC_017572	ATAC	2	8	48970	48977	50 %	25 %	0 %	25 %	386322417
126	NC_017572	TGAG	2	8	48987	48994	25 %	25 %	50 %	0 %	386322417
127	NC_017572	AATC	2	8	50106	50113	50 %	25 %	0 %	25 %	386322419
128	NC_017572	ATTC	2	8	50277	50284	25 %	50 %	0 %	25 %	386322419
129	NC_017572	TTTG	2	8	50316	50323	0 %	75 %	25 %	0 %	386322419
130	NC_017572	TAGA	2	8	50935	50942	50 %	25 %	25 %	0 %	386322420
131	NC_017572	CTCC	2	8	55711	55718	0 %	25 %	0 %	75 %	386322422
132	NC_017572	TTGT	2	8	55776	55783	0 %	75 %	25 %	0 %	386322422
133	NC_017572	TCTT	2	8	57152	57159	0 %	75 %	0 %	25 %	386322423
134	NC_017572	TTAG	2	8	58086	58093	25 %	50 %	25 %	0 %	386322424
135	NC_017572	TTGA	2	8	58354	58361	25 %	50 %	25 %	0 %	386322424
136	NC_017572	GCTC	2	8	58506	58513	0 %	25 %	25 %	50 %	386322424
137	NC_017572	GTTA	2	8	58766	58773	25 %	50 %	25 %	0 %	386322425
138	NC_017572	ATAG	2	8	58860	58867	50 %	25 %	25 %	0 %	386322425
139	NC_017572	AACT	2	8	59145	59152	50 %	25 %	0 %	25 %	386322425

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.