MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	CTA	2	6	68	73	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017572	TCA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
3	NC_017572	ATC	2	6	221	226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
4	NC_017572	ATC	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
5	NC_017572	TCT	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
6	NC_017572	TGC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322373
7	NC_017572	CTA	2	6	343	348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322373
8	NC_017572	AGC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322373
9	NC_017572	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322373
10	NC_017572	TAA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322373
11	NC_017572	TCT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
12	NC_017572	CTT	2	6	733	738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322373
13	NC_017572	TGA	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322373
14	NC_017572	TCA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
15	NC_017572	ATT	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
16	NC_017572	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
17	NC_017572	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
18	NC_017572	TCA	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
19	NC_017572	ATC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
20	NC_017572	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
21	NC_017572	GTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
22	NC_017572	CAT	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
23	NC_017572	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
24	NC_017572	TCA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
25	NC_017572	TGA	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
26	NC_017572	TCA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
27	NC_017572	CTC	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322374
28	NC_017572	TGA	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
29	NC_017572	GAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
30	NC_017572	CTC	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322374
31	NC_017572	CAT	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
32	NC_017572	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
33	NC_017572	TGG	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322374
34	NC_017572	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
35	NC_017572	GAT	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
36	NC_017572	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
37	NC_017572	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
38	NC_017572	TGT	2	6	2600	2605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
39	NC_017572	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322374
40	NC_017572	GCT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
41	NC_017572	CTA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
42	NC_017572	TGT	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
43	NC_017572	AGT	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
44	NC_017572	AAT	2	6	3289	3294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
45	NC_017572	AGC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
46	NC_017572	GAA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322374
47	NC_017572	ATA	2	6	3758	3763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
48	NC_017572	TTG	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
49	NC_017572	GGT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322374
50	NC_017572	TAC	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
51	NC_017572	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
52	NC_017572	TCT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
53	NC_017572	CTT	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
54	NC_017572	GGA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322374
55	NC_017572	TCA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
56	NC_017572	ATG	3	9	4173	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
57	NC_017572	GCA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
58	NC_017572	TCA	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
59	NC_017572	TTC	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
60	NC_017572	AAC	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322374
61	NC_017572	TAA	2	6	4508	4513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
62	NC_017572	AAT	2	6	4609	4614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
63	NC_017572	TAA	2	6	4643	4648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
64	NC_017572	TTC	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
65	NC_017572	ATA	2	6	4754	4759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
66	NC_017572	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
67	NC_017572	CAG	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322374
68	NC_017572	TCT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
69	NC_017572	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
70	NC_017572	TGT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322374
71	NC_017572	CTG	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
72	NC_017572	TCT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322374
73	NC_017572	AGT	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
74	NC_017572	CTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322374
75	NC_017572	AAT	2	6	5949	5954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
76	NC_017572	AAT	2	6	6129	6134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
77	NC_017572	CAT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
78	NC_017572	TAT	2	6	6285	6290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
79	NC_017572	GGA	2	6	6306	6311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322374
80	NC_017572	TAG	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
81	NC_017572	ATC	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
82	NC_017572	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
83	NC_017572	TAA	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
84	NC_017572	TTA	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
85	NC_017572	AAT	2	6	6576	6581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
86	NC_017572	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322374
87	NC_017572	ATA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322374
88	NC_017572	TGA	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322374
89	NC_017572	TTA	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
90	NC_017572	ATT	3	9	6942	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322374
91	NC_017572	CTA	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322375
92	NC_017572	GCC	2	6	7175	7180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322375
93	NC_017572	TGT	2	6	7214	7219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322375
94	NC_017572	CGC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322375
95	NC_017572	GCT	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017572	ACC	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017572	CTC	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017572	TCA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017572	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017572	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017572	CAT	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017572	CCT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017572	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017572	AGA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017572	CAA	2	6	8334	8339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322376
106	NC_017572	CCA	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322376
107	NC_017572	TCA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
108	NC_017572	CTA	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
109	NC_017572	GGC	2	6	8663	8668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322376
110	NC_017572	CAA	3	9	8703	8711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322376
111	NC_017572	ATC	3	9	8965	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
112	NC_017572	ATA	2	6	8974	8979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322376
113	NC_017572	GCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322376
114	NC_017572	CAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322376
115	NC_017572	ATG	2	6	9144	9149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322376
116	NC_017572	ATG	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322376
117	NC_017572	CAT	2	6	9438	9443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017572	TTC	2	6	9685	9690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322377
119	NC_017572	TCT	2	6	9712	9717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322377
120	NC_017572	CTT	3	9	9800	9808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322377
121	NC_017572	CGG	2	6	9881	9886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322377
122	NC_017572	CTG	2	6	10121	10126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017572	AGA	2	6	10142	10147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017572	CGC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017572	GCC	2	6	10466	10471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322378
126	NC_017572	AAC	2	6	10773	10778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322378
127	NC_017572	AAT	2	6	10796	10801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322378
128	NC_017572	GGC	2	6	10975	10980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322378
129	NC_017572	CAG	2	6	11009	11014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322378
130	NC_017572	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322378
131	NC_017572	TGA	2	6	11299	11304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322378
132	NC_017572	AGC	2	6	11350	11355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322378
133	NC_017572	ATG	2	6	11409	11414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322378
134	NC_017572	GAC	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322378
135	NC_017572	ATG	2	6	11604	11609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322378
136	NC_017572	CGG	2	6	11652	11657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322378
137	NC_017572	GTC	2	6	11790	11795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322378
138	NC_017572	ATA	2	6	12021	12026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322378
139	NC_017572	GCC	2	6	12032	12037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322378
140	NC_017572	ACT	2	6	12078	12083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322378
141	NC_017572	CTT	2	6	12103	12108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322378
142	NC_017572	GCC	2	6	12179	12184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322378
143	NC_017572	CAG	2	6	12288	12293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322378
144	NC_017572	TAT	2	6	12396	12401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017572	TAA	2	6	12465	12470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322379
146	NC_017572	ATG	2	6	12685	12690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322379
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148	NC_017572	CAA	2	6	12868	12873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322380
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151	NC_017572	TGA	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322381
152	NC_017572	AGC	2	6	13319	13324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322381
153	NC_017572	CAT	2	6	13356	13361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322381
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155	NC_017572	CGC	2	6	13454	13459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_017572	ATA	2	6	13477	13482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017572	ACC	2	6	13705	13710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_017572	CAT	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017572	CAC	2	6	13833	13838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_017572	TGA	2	6	14955	14960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017572	GCC	2	6	15364	15369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_017572	GTT	2	6	15499	15504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017572	TAA	2	6	15689	15694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017572	TTA	2	6	15698	15703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_017572	ATG	2	6	33090	33095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322397
382	NC_017572	CGG	2	6	33151	33156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322397
383	NC_017572	GCA	2	6	33168	33173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322397
384	NC_017572	TGC	2	6	33187	33192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322397
385	NC_017572	CAC	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322397
386	NC_017572	GTT	3	9	33289	33297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322397
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389	NC_017572	GTG	2	6	33366	33371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322397
390	NC_017572	GGT	2	6	33398	33403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322397
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393	NC_017572	TGT	3	9	33517	33525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322397
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400	NC_017572	CAT	2	6	34057	34062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322397
401	NC_017572	CGG	2	6	34075	34080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322397
402	NC_017572	GTT	2	6	34202	34207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322397
403	NC_017572	GTA	2	6	34208	34213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322397
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405	NC_017572	TTG	2	6	34341	34346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322397
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407	NC_017572	ATT	2	6	34424	34429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322397
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410	NC_017572	TTG	2	6	34583	34588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322398
411	NC_017572	CAA	2	6	34599	34604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322398
412	NC_017572	TGC	2	6	34790	34795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322398
413	NC_017572	TGG	2	6	34800	34805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322398
414	NC_017572	CAG	2	6	35068	35073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322398
415	NC_017572	CTT	2	6	35190	35195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_017572	TGG	2	6	35293	35298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322399
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429	NC_017572	GTG	2	6	36658	36663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322400
430	NC_017572	GCA	2	6	36782	36787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322400
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440	NC_017572	ATC	2	6	37320	37325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322402
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444	NC_017572	GCC	2	6	37704	37709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322402
445	NC_017572	TGA	2	6	37739	37744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322402
446	NC_017572	CGC	2	6	37766	37771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322402
447	NC_017572	CTT	2	6	37787	37792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322402
448	NC_017572	TTG	2	6	37839	37844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322402
449	NC_017572	TCA	2	6	38158	38163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322402
450	NC_017572	TGG	2	6	38174	38179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322402
451	NC_017572	TCA	2	6	38236	38241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322402
452	NC_017572	CGC	2	6	38339	38344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322402
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454	NC_017572	GCC	2	6	38463	38468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322402
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457	NC_017572	CTG	2	6	38555	38560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322402
458	NC_017572	CAA	2	6	38579	38584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322402
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465	NC_017572	TGT	2	6	39131	39136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322402
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483	NC_017572	CAT	2	6	40164	40169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322403
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486	NC_017572	ATA	2	6	40264	40269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322403
487	NC_017572	TTG	2	6	40376	40381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322404
488	NC_017572	TGC	2	6	40389	40394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322404
489	NC_017572	TGC	2	6	40515	40520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322404
490	NC_017572	CTT	2	6	40528	40533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322404
491	NC_017572	AAT	2	6	40613	40618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322404
492	NC_017572	GGT	2	6	40621	40626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322404
493	NC_017572	GTA	2	6	40646	40651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322404
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497	NC_017572	GTA	2	6	41032	41037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322404
498	NC_017572	GCC	2	6	41111	41116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322404
499	NC_017572	GCC	2	6	41255	41260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322404
500	NC_017572	GGC	2	6	41310	41315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322404

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