MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	CTA	2	6	68	73	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017572	GCT	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017572	ACC	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017572	CTC	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017572	TCA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017572	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017572	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017572	CAT	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017572	CCT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017572	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017572	AGA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017572	CAT	2	6	9438	9443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017572	CTG	2	6	10121	10126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017572	AGA	2	6	10142	10147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017572	CGC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017572	TAT	2	6	12396	12401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017572	GCG	2	6	13444	13449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017572	CGC	2	6	13454	13459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017572	ATA	2	6	13477	13482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017572	GTG	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017572	GCT	2	6	13544	13549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017572	TGA	2	6	13576	13581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017572	ACC	2	6	13697	13702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017572	ACC	2	6	13705	13710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017572	CAT	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017572	CAC	2	6	13833	13838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017572	GAT	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017572	TTA	2	6	14941	14946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017572	TGA	2	6	14955	14960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017572	GCC	2	6	15279	15284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017572	GCC	2	6	15364	15369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017572	GTT	2	6	15499	15504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017572	TTA	2	6	15607	15612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017572	TAA	2	6	15689	15694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017572	TTA	2	6	15698	15703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017572	TTG	2	6	16465	16470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017572	GCC	2	6	16530	16535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017572	CTT	2	6	35190	35195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017572	CAT	2	6	43276	43281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017572	GAT	2	6	44229	44234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017572	TAT	2	6	45049	45054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017572	CTA	2	6	45094	45099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017572	TCT	2	6	45105	45110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017572	AGC	2	6	45297	45302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017572	GCA	2	6	45356	45361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017572	TCT	2	6	45417	45422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017572	GGC	2	6	46268	46273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017572	AAG	2	6	46403	46408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017572	TAG	2	6	46449	46454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017572	ATT	2	6	46465	46470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017572	CAG	2	6	46614	46619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017572	TAG	2	6	46903	46908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017572	AGG	2	6	46922	46927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017572	GGA	2	6	47100	47105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017572	TTA	2	6	47918	47923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017572	GGT	2	6	49287	49292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017572	ACC	2	6	50405	50410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017572	GAG	2	6	50580	50585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017572	ATT	2	6	50614	50619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017572	TGA	2	6	50785	50790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017572	AAT	2	6	52295	52300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017572	GAG	2	6	52362	52367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017572	ATT	2	6	52403	52408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017572	TCC	2	6	52599	52604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017572	ATG	2	6	52641	52646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017572	TAT	2	6	52677	52682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017572	AGG	2	6	52882	52887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017572	GCT	2	6	53771	53776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017572	TGA	2	6	54112	54117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017572	GAT	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017572	CAA	2	6	54224	54229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017572	CTC	2	6	54351	54356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017572	ATA	2	6	54370	54375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017572	CGG	2	6	54376	54381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017572	GAC	2	6	54393	54398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017572	TCA	2	6	54400	54405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017572	GAT	2	6	54485	54490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017572	CTT	2	6	54647	54652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017572	CCA	2	6	54718	54723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017572	AAT	2	6	54772	54777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017572	CCT	2	6	54878	54883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017572	TTC	2	6	54966	54971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017572	GAC	2	6	55032	55037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017572	GCA	2	6	55148	55153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017572	GAT	2	6	55164	55169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017572	TTG	2	6	55198	55203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017572	CTG	2	6	55380	55385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017572	AAC	2	6	55482	55487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017572	TAT	2	6	56206	56211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017572	CTT	2	6	56268	56273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017572	GTA	2	6	56302	56307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017572	CCA	2	6	56345	56350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017572	TCA	2	6	56445	56450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017572	TTG	2	6	57987	57992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017572	CCT	2	6	59350	59355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017572	AAT	2	6	59410	59415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017572	TTG	2	6	59505	59510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017572	GGT	2	6	59712	59717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017572	ATT	2	6	59806	59811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017572	AAT	2	6	59913	59918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017572	GTT	2	6	59939	59944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017572	AGT	2	6	60628	60633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.