MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	CT	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	386322373
2	NC_017572	GA	3	6	769	774	50 %	0 %	50 %	0 %	386322374
3	NC_017572	CA	3	6	1362	1367	50 %	0 %	0 %	50 %	386322374
4	NC_017572	AG	3	6	1891	1896	50 %	0 %	50 %	0 %	386322374
5	NC_017572	CA	3	6	2361	2366	50 %	0 %	0 %	50 %	386322374
6	NC_017572	GT	3	6	2729	2734	0 %	50 %	50 %	0 %	386322374
7	NC_017572	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
8	NC_017572	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
9	NC_017572	AT	3	6	5824	5829	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
10	NC_017572	TC	3	6	6146	6151	0 %	50 %	0 %	50 %	386322374
11	NC_017572	CT	3	6	6183	6188	0 %	50 %	0 %	50 %	386322374
12	NC_017572	CT	3	6	7543	7548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017572	GA	3	6	8642	8647	50 %	0 %	50 %	0 %	386322376
14	NC_017572	AT	3	6	8838	8843	50 %	50 %	0 %	0 %	386322376
15	NC_017572	TC	3	6	9811	9816	0 %	50 %	0 %	50 %	386322377
16	NC_017572	GC	3	6	10342	10347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017572	GC	3	6	10897	10902	0 %	0 %	50 %	50 %	386322378
18	NC_017572	CG	3	6	11365	11370	0 %	0 %	50 %	50 %	386322378
19	NC_017572	GC	3	6	13870	13875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017572	AC	3	6	13960	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	386322382
21	NC_017572	GT	3	6	14164	14169	0 %	50 %	50 %	0 %	386322382
22	NC_017572	AC	3	6	14677	14682	50 %	0 %	0 %	50 %	386322382
23	NC_017572	TA	3	6	14830	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	386322382
24	NC_017572	AG	3	6	16227	16232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017572	AT	3	6	16237	16242	50 %	50 %	0 %	0 %	386322385
26	NC_017572	AG	3	6	16378	16383	50 %	0 %	50 %	0 %	386322385
27	NC_017572	CG	4	8	17399	17406	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
28	NC_017572	CG	3	6	17978	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
29	NC_017572	TG	3	6	18122	18127	0 %	50 %	50 %	0 %	386322386
30	NC_017572	GC	5	10	18996	19005	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
31	NC_017572	GT	3	6	19190	19195	0 %	50 %	50 %	0 %	386322386
32	NC_017572	TG	3	6	19236	19241	0 %	50 %	50 %	0 %	386322386
33	NC_017572	GC	3	6	19552	19557	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
34	NC_017572	AT	3	6	19927	19932	50 %	50 %	0 %	0 %	386322386
35	NC_017572	GT	3	6	20586	20591	0 %	50 %	50 %	0 %	386322386
36	NC_017572	CT	3	6	21237	21242	0 %	50 %	0 %	50 %	386322386
37	NC_017572	CG	3	6	21455	21460	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
38	NC_017572	GC	3	6	21803	21808	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
39	NC_017572	GC	4	8	21910	21917	0 %	0 %	50 %	50 %	386322386
40	NC_017572	CG	3	6	22535	22540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017572	CA	3	6	24526	24531	50 %	0 %	0 %	50 %	386322388
42	NC_017572	TG	3	6	25029	25034	0 %	50 %	50 %	0 %	386322389
43	NC_017572	TG	3	6	25086	25091	0 %	50 %	50 %	0 %	386322389
44	NC_017572	GT	3	6	25388	25393	0 %	50 %	50 %	0 %	386322389
45	NC_017572	CG	3	6	25424	25429	0 %	0 %	50 %	50 %	386322389
46	NC_017572	TA	3	6	25435	25440	50 %	50 %	0 %	0 %	386322389
47	NC_017572	GC	3	6	27620	27625	0 %	0 %	50 %	50 %	386322391
48	NC_017572	CG	3	6	28027	28032	0 %	0 %	50 %	50 %	386322391
49	NC_017572	CG	3	6	29598	29603	0 %	0 %	50 %	50 %	386322392
50	NC_017572	CA	3	6	29705	29710	50 %	0 %	0 %	50 %	386322392
51	NC_017572	TG	3	6	29840	29845	0 %	50 %	50 %	0 %	386322392
52	NC_017572	TG	3	6	30950	30955	0 %	50 %	50 %	0 %	386322394
53	NC_017572	GA	3	6	31817	31822	50 %	0 %	50 %	0 %	386322396
54	NC_017572	GC	3	6	32089	32094	0 %	0 %	50 %	50 %	386322396
55	NC_017572	GC	3	6	32824	32829	0 %	0 %	50 %	50 %	386322397
56	NC_017572	GC	3	6	32849	32854	0 %	0 %	50 %	50 %	386322397
57	NC_017572	AC	3	6	32897	32902	50 %	0 %	0 %	50 %	386322397
58	NC_017572	TG	3	6	34975	34980	0 %	50 %	50 %	0 %	386322398
59	NC_017572	AG	3	6	35105	35110	50 %	0 %	50 %	0 %	386322398
60	NC_017572	CG	3	6	35911	35916	0 %	0 %	50 %	50 %	386322399
61	NC_017572	CG	3	6	36347	36352	0 %	0 %	50 %	50 %	386322400
62	NC_017572	CG	3	6	36560	36565	0 %	0 %	50 %	50 %	386322400
63	NC_017572	CG	3	6	37186	37191	0 %	0 %	50 %	50 %	386322401
64	NC_017572	GC	3	6	37432	37437	0 %	0 %	50 %	50 %	386322402
65	NC_017572	CA	3	6	37797	37802	50 %	0 %	0 %	50 %	386322402
66	NC_017572	GT	3	6	39149	39154	0 %	50 %	50 %	0 %	386322402
67	NC_017572	AC	3	6	40133	40138	50 %	0 %	0 %	50 %	386322403
68	NC_017572	CG	3	6	42435	42440	0 %	0 %	50 %	50 %	386322405
69	NC_017572	GC	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	386322405
70	NC_017572	GC	3	6	42773	42778	0 %	0 %	50 %	50 %	386322406
71	NC_017572	GT	3	6	43187	43192	0 %	50 %	50 %	0 %	386322406
72	NC_017572	AG	3	6	44209	44214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017572	TG	3	6	44341	44346	0 %	50 %	50 %	0 %	386322410
74	NC_017572	GT	3	6	45447	45452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017572	GT	3	6	45914	45919	0 %	50 %	50 %	0 %	386322412
76	NC_017572	TC	3	6	46300	46305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017572	GT	3	6	46973	46978	0 %	50 %	50 %	0 %	386322413
78	NC_017572	CT	3	6	47508	47513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017572	TC	3	6	47626	47631	0 %	50 %	0 %	50 %	386322414
80	NC_017572	TA	3	6	47683	47688	50 %	50 %	0 %	0 %	386322414
81	NC_017572	TG	3	6	47794	47799	0 %	50 %	50 %	0 %	386322414
82	NC_017572	CT	3	6	48217	48222	0 %	50 %	0 %	50 %	386322416
83	NC_017572	GA	3	6	48752	48757	50 %	0 %	50 %	0 %	386322417
84	NC_017572	TA	3	6	49747	49752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017572	TA	3	6	50765	50770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017572	AT	3	6	51617	51622	50 %	50 %	0 %	0 %	386322420
87	NC_017572	TC	3	6	52105	52110	0 %	50 %	0 %	50 %	386322420
88	NC_017572	GA	3	6	52589	52594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017572	CT	3	6	53594	53599	0 %	50 %	0 %	50 %	386322421
90	NC_017572	TG	3	6	54159	54164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017572	TG	3	6	54670	54675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017572	CT	3	6	54712	54717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017572	GT	3	6	55550	55555	0 %	50 %	50 %	0 %	386322422
94	NC_017572	CT	3	6	55582	55587	0 %	50 %	0 %	50 %	386322422
95	NC_017572	TC	3	6	56803	56808	0 %	50 %	0 %	50 %	386322423
96	NC_017572	TG	3	6	57096	57101	0 %	50 %	50 %	0 %	386322423
97	NC_017572	GT	3	6	58211	58216	0 %	50 %	50 %	0 %	386322424
98	NC_017572	CA	3	6	58333	58338	50 %	0 %	0 %	50 %	386322424
99	NC_017572	GA	3	6	58805	58810	50 %	0 %	50 %	0 %	386322425
100	NC_017572	GA	3	6	59051	59056	50 %	0 %	50 %	0 %	386322425
101	NC_017572	TA	3	6	60007	60012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.