MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	TAGCCT	2	12	2700	2711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017571	TATTAA	2	12	19150	19161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017571	AATATT	2	12	21607	21618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017571	TGAAGG	2	12	47623	47634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017571	AAACGC	2	12	49520	49531	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017571	GCAATT	2	12	106078	106089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017571	GGAACC	2	12	157123	157134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017571	TGATTA	2	12	160904	160915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017571	CCATTA	2	12	195208	195219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017571	ACGTTA	2	12	217342	217353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017571	TGAAGG	2	12	262526	262537	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017571	AAACGC	2	12	264423	264434	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017571	CTTTAA	2	12	297600	297611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017571	TGAAGG	2	12	322850	322861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017571	AAACGC	2	12	324747	324758	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017571	GCTATT	2	12	325053	325064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017571	ACGCTC	2	12	381409	381420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017571	TTTGAT	2	12	440756	440767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017571	ACTATC	2	12	483468	483479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017571	TGATGG	2	12	553027	553038	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017571	CACTGG	2	12	570811	570822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017571	GTTTAG	2	12	570835	570846	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017571	TGAAGG	2	12	583577	583588	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017571	AAACGC	2	12	585474	585485	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017571	CAAAGT	2	12	620726	620737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017571	CTCGTT	2	12	632258	632269	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017571	GGCTTG	2	12	678669	678680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017571	TATATC	2	12	692670	692681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017571	TTATTT	2	12	692949	692960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017571	TTGAGC	2	12	701854	701865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017571	ATTTTT	2	12	707837	707848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017571	GCTTTA	2	12	709652	709663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017571	AAAGTC	2	12	710689	710700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017571	ATTAGC	2	12	768520	768531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017571	TTTAAA	2	12	776503	776514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017571	TAGATA	2	12	779950	779961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017571	ATAAAA	2	12	807689	807700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017571	TTTTAT	2	12	822003	822014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017571	TCTGTT	4	24	829017	829040	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017571	TTTGTT	2	12	831954	831965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017571	TTTGTT	2	12	849809	849820	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017571	GTCTAA	2	12	872744	872755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017571	TAAGTG	2	12	905560	905571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017571	AATCAA	2	12	908756	908767	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017571	TTGAAT	2	12	914871	914882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017571	GTGGTT	2	12	914898	914909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017571	AGCTCA	2	12	940538	940549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017571	TTAGCA	2	12	944507	944518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017571	AGGATT	2	12	993253	993264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017571	TGAAGG	2	12	1014322	1014333	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017571	AAACGC	2	12	1016220	1016231	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017571	CTTTAT	2	12	1016629	1016640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017571	ATTGTT	2	12	1066414	1066425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017571	CTAAAT	2	12	1072534	1072545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017571	CTAAGT	2	12	1072546	1072557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017571	TTTGAT	2	12	1087421	1087432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017571	TTTTGA	2	12	1150078	1150089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017571	AAATGT	2	12	1187448	1187459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017571	TTTGAT	2	12	1201798	1201809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017571	TATCAC	2	12	1203475	1203486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017571	TTTGAT	2	12	1204019	1204030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017571	CTTTAT	2	12	1216878	1216889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017571	GCCCCT	2	12	1257905	1257916	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017571	TCCTTA	2	12	1279180	1279191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017571	AGCATT	2	12	1292535	1292546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017571	TTGAAA	2	12	1324616	1324627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017571	TTTGTG	2	12	1352602	1352613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017571	AATCAA	2	12	1381893	1381904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017571	CTTGTT	2	12	1426414	1426425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017571	GACAGA	2	12	1490385	1490396	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017571	TGAAAT	2	12	1519993	1520004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017571	TTTTTG	2	12	1534065	1534076	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017571	GTTTTT	2	12	1594190	1594201	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017571	GTTTTT	2	12	1724415	1724426	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017571	TTCGAA	2	12	1727184	1727195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017571	CTATTT	2	12	1750219	1750230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017571	ACGTTA	2	12	1773144	1773155	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017571	GTAAAG	2	12	1801238	1801249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017571	TGATAT	2	12	1817211	1817222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017571	GCCGAA	2	12	1835127	1835138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017571	CTAGCC	2	12	1835267	1835278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017571	GTTAAG	2	12	1841914	1841925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017571	GCGAAT	2	12	1860183	1860194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017571	AAAACA	2	12	1893015	1893026	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017571	TGCGAT	2	12	1913168	1913179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017571	ACCTAA	3	18	1929416	1929433	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017571	GAATAT	2	12	1973134	1973145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017571	TTTATT	2	12	1993538	1993549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017571	TTAAAA	2	12	2012503	2012514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017571	TGAAGG	2	12	2025170	2025181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017571	AAACGC	2	12	2027068	2027079	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017571	TATTTA	2	12	2030359	2030370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017571	GTAACT	2	12	2045685	2045696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017571	AAGCCG	2	12	2046543	2046554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017571	ATGCTG	2	12	2046569	2046580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017571	GCCAAA	2	12	2066152	2066163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017571	CACTGT	2	12	2070331	2070342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017571	ATTTTT	2	12	2074498	2074509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017571	AACTAA	2	12	2081584	2081595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017571	TAGAAA	2	12	2107548	2107559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017571	GCCCTT	2	12	2121605	2121616	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017571	ATTGCT	2	12	2152373	2152384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017571	CTAGGC	2	12	2160782	2160793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017571	GACACT	4	24	2172529	2172552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017571	GTTAAT	2	12	2179397	2179408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017571	AGCGTT	2	12	2179688	2179699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017571	TATTTG	2	12	2214850	2214861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017571	ACGTAA	2	12	2244535	2244546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017571	ACTTCC	2	12	2254421	2254432	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017571	AAATAA	2	12	2273159	2273170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017571	TTTTAG	2	12	2373378	2373389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017571	GAAAAA	2	12	2377730	2377741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017571	AAAGTT	2	12	2381035	2381046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017571	GTCATA	2	12	2381479	2381490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017571	TAAAGC	2	12	2404927	2404938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017571	ATTTAA	2	12	2415114	2415125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017571	CTTTGT	2	12	2499621	2499632	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017571	GATCGC	2	12	2508327	2508338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017571	CGTGAT	2	12	2519975	2519986	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017571	TTTAAG	2	12	2543297	2543308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017571	TAACCA	2	12	2577842	2577853	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017571	TGAAAG	2	12	2592673	2592684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017571	TTCATT	2	12	2593848	2593859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017571	GCGCTT	2	12	2622146	2622157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017571	TTCAAA	2	12	2624776	2624787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017571	AAATGG	2	12	2643405	2643416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017571	CTTATA	2	12	2652121	2652132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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130	NC_017571	CAGCTG	2	12	2691486	2691497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_017571	TTATTT	2	12	3189552	3189563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.